ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ARAP2 |
|---|
 |
| 利用可能な構造 |
|---|
| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
|---|
|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | ARAP2、CENTD1、PARX、RhoGAPドメイン、アンキリンリピート、PHドメイン2を含むArfGAP |
|---|
| 外部ID | オミム:606645; MGI : 2684416;ホモロジーン: 9064;ジーンカード:ARAP2; OMA :ARAP2 - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置(マウス) |
|---|
 | | クロ。 | 5番染色体(マウス)[2] |
|---|
| | バンド | 5|5 C3.1 | 始める | 62,759,788 bp [2] |
|---|
| 終わり | 62,923,502 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
|---|
| トップの表現 | - 内皮細胞
- 二次卵母細胞
- 脳梁
- 歯肉上皮
- 視神経
- 迷走神経背側運動核
- 羊水
- 内淡蒼球
- 中側頭回
- ブロードマン領域23
|
| | トップの表現 | - 二次卵母細胞
- 内側膝状体
- 受精卵
- 毛包
- 海馬の区分
- 海馬のI領域
- 一次運動野
- 外側膝状体
- 下丘
- 梨状皮質
|
| | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 |
- 金属イオン結合
- GTPase活性化活性
- ホスファチジルイノシトール-3,4,5-トリスリン酸結合
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- GTPase活性の正の調節
- 低分子量GTPaseを介したシグナル伝達の制御
- シグナル伝達
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
|
| ウィキデータ |
|
Rho-GAPドメイン、ANKリピート、PHドメイン含有タンパク質2を含むArf-GAPは、ヒトではARAP2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]
関数
この遺伝子によってコードされるタンパク質には、ARF-GAP、RHO-GAP、アンキリンリピート、RAS関連、およびプレクストリン相同ドメインが含まれています。このタンパク質は、RHO-GAPドメインに予測される触媒アルギニンを欠いているため、RHO-GAP活性を持つ可能性は低いです。コードされるタンパク質には、一部のシグナル伝達分子によく見られる不稔性アルファモチーフ(SAM)が含まれていますが、タンパク質の機能は決定されていません。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする2つの転写バリアントが見つかっています。[5]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000047365 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000037999 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab "Entrez Gene: CENTD1 centaurin、delta 1".
外部リンク
さらに読む
- Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、Macek B、Kumar C、Mortensen P、Mann M (2006 年 11 月)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 ( 3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。
- Yoon HY、Miura K、Cuthbert EJ、Davis KK、Ahvazi B、Casanova JE、Randazzo PA (2006 年 11 月)。「アクチン細胞骨格に対する ARAP2 の効果は、Arf6 特異的 GTPase 活性化タンパク質の活性と RhoA-GTP への結合に依存する」。Journal of Cell Science。119 ( Pt 22): 4650–66。doi : 10.1242/jcs.03237。PMID 17077126。
- 三浦 K、ジャック KM、シュタウファー S、久保崎 A、朱 K、ハーシュ DS、レソー J、鄭 Y、ランダッツォ PA (2002 年 1 月)。 「ARAP1: Arf と Rho のシグナリングの収束点」。分子細胞。9 (1): 109-19。土井:10.1016/S1097-2765(02)00428-8。PMID 11804590。
- Krugmann S、Anderson KE、Ridley SH、Risso N、McGregor A、Coadwell J、Davidson K、Eguinoa A、Ellson CD、Lipp P、Manifava M、Ktistakis N、Painter G、Thuring JW、Cooper MA、Lim ZY、Holmes AB、Dove SK、Michell RH、Grewal A、Nazarian A、Erdjument-Bromage H、Tempst P、Stephens LR、Hawkins PT (2002 年 1 月)。「ホスホイノシチド親和性マトリックスでの選択的捕捉による、Arf および Rho GTPase の両方を制御する新規 PI3K エフェクター ARAP3 の同定」。Molecular Cell。9 ( 1 ): 95–108。土井:10.1016/S1097-2765(02)00434-3。PMID 11804589。
- サンガーセンター、ワシントン大学ゲノムシーケンシングセンター (1998 年 11 月)。「完全なヒトゲノム配列に向けて」。 ゲノム研究。8 (11): 1097–108。doi : 10.1101/gr.8.11.1097。PMID 9847074。
- 長瀬 孝文、石川 健、宮島 直、田中 明、小谷 秀、野村 直、小原 修 (1998 年 2 月)。「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。IX. 試験管内で大きなタンパク質をコードできる脳由来の 100 個の新しい cDNA クローンの完全な配列」。DNA研究。5 ( 1): 31–9。doi : 10.1093/dnares/ 5.1.31。PMID 9628581 。