ヒトで発見された遺伝子
| MC2L について |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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1KZ7、1KZG、1LB1、1RJ2 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | MCF2L、ARHGEF14、DBS、OST、MCF.2細胞株由来の形質転換配列のような |
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| 外部ID | オミム:609499; MGI : 103263;ホモロジーン:11804;ジーンカード:MCF2L; OMA :MCF2L - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体8(マウス)[2] |
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| | バンド | 8|8 A1.1 | 始める | 12,873,806 bp [2] |
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| 終わり | 13,020,905 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 小脳の右半球
- 右前頭葉
- 小脳の傍小葉
- 下垂体
- 心の頂点
- 下垂体前葉
- C1セグメント
- ブロードマン領域9
- 前頭前皮質
- 一次視覚野
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| | トップの表現 | - 嗅上皮
- 網膜の神経層
- 小脳皮質
- 一次視覚野
- 上前頭回
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 下垂体
- 小脳葉
- 小脳虫部
- ランゲルハンス島
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ホスファチジルイノシトール結合
- 脂質結合
- グアニルヌクレオチド交換因子活性
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- 細胞膜の細胞質側の外因性成分
- 細胞質
- 細胞膜
- 膜
- 内膜系
- 細胞外空間
| | 生物学的プロセス |
- Rhoタンパク質シグナル伝達の正の制御
- Rhoタンパク質シグナル伝達の制御
- 細胞内シグナル伝達
- 低分子量GTPaseを介したシグナル伝達の制御
- アポトーシス過程の正の調節
- Gタンパク質共役受容体シグナル伝達経路
- 分子機能の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_001112732 NM_024979 NM_001320815 NM_001320816 NM_001320817
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NM_001366644 NM_001366645 NM_001366646 |
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NM_001159485 NM_001159486 NM_178076 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_001106203 NP_001307744 NP_001307745 NP_001307746 NP_079255
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NP_001353573 NP_001353574 NP_001353575 |
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| 場所 (UCSC) | 13 章: 112.89 – 113.1 Mb | 8 章: 12.87 – 13.02 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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グアニンヌクレオチド交換因子DBSは、ヒトではMCF2L遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000126217 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031442 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Nagase T, Ishikawa K, Nakajima D, Ohira M, Seki N, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (1997年4月). 「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。VII. 試験管内で大きなタンパク質をコードできる脳由来の100個の新しいcDNAクローンの完全な配列」。DNA 研究。4 ( 2 ): 141–50。doi : 10.1093/dnares/4.2.141。PMID 9205841。
- ^ 「Entrez Gene: MCF2L MCF.2 細胞株由来の形質転換配列様」。
さらに読む
- Horii Y, Beeler JF, Sakaguchi K, Tachibana M, Miki T (1994 年 10 月)。「新規癌遺伝子 ost は、Rho および Rac シグナル伝達経路を潜在的にリンクするグアニンヌクレオチド交換因子をコードしている」。EMBO Journal。13 ( 20 ) : 4776–86。doi : 10.1002/j.1460-2075.1994.tb06803.x。PMC 395416。PMID 7957046。
- Rossman KL、Worthylake DK、Snyder JT、Siderovski DP、Campbell SL、Sondek J (2002 年 3 月)。「Dbs と Cdc42 の相互作用の結晶学的考察: PH ドメイン支援グアニンヌクレオチド交換」。EMBOジャーナル。21 ( 6 ) : 1315–26。doi :10.1093/emboj/21.6.1315。PMC 125919。PMID 11889037。
- Snyder JT、Worthylake DK、Rossman KL、Betts L、Pruitt WM、Siderovski DP、Der CJ、Sondek J (2002 年 6 月)。「Dbl 交換因子による Rho GTPase の選択的活性化の構造的基礎」。Nature Structural Biology。9 ( 6 ) : 468–75。doi :10.1038/nsb796。PMID 12006984。S2CID 13161854 。
- Yamauchi J, Hirasawa A, Miyamoto Y, Kokubu H, Nishii H, Okamoto M, Sugawara Y, Tsujimoto G, Itoh H (2002 年 8 月)。「α1B アドレナリン受容体から c-Jun N 末端キナーゼへの抗分裂促進経路における Dbl の姉妹分子の役割」。生化学および生物物理学的研究通信。296 (1): 85–92。doi : 10.1016 /S0006-291X(02)00839-2。PMID 12147231 。
- Wennerberg K、Ellerbroek SM、Liu RY、Karnoub AE、Burridge K、Der CJ (2002 年 12 月)。「RhoG シグナルは Rac1 および Cdc42 と並行して伝達される」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 49): 47810–7。doi : 10.1074/ jbc.M203816200。PMID 12376551。
- Cheng L、Mahon GM、Kostenko EV、Whitehead IP (2004 年 3 月)。「Pleckstrin 相同ドメインを介した rho 特異的グアニンヌクレオチド交換因子 Dbs の Rac1 による活性化」。The Journal of Biological Chemistry。279 ( 13): 12786–93。doi : 10.1074/ jbc.M313099200。PMID 14701795。
- Ueda S, Kataoka T, Satoh T (2004年8月). 「異なる細胞内部位におけるRhoファミリーGTPaseの調節におけるDblファミリー交換因子のSec14様ドメインの役割」(PDF) . Cellular Signalling . 16 (8): 899–906. doi :10.1016/j.cellsig.2004.01.007. hdl :20.500.14094/D1002967. PMID 15157669. 2020-07-21に オリジナル(PDF)からアーカイブ。 2020-07-21に取得。
- Kostenko EV、Mahon GM、Cheng L、Whitehead IP (2005 年 1 月)。「Sec14 相同ドメインは Rho 特異的グアニンヌクレオチド交換因子 Dbs の細胞分布と形質転換活性を制御します」。The Journal of Biological Chemistry。280 ( 4): 2807–17。doi : 10.1074/ jbc.M411139200。PMID 15531584。
- 木村和也、若松A、鈴木裕、太田隆、西川隆、山下R、山本J、関根正、釣谷和、若栗博、石井S、杉山隆、斉藤和久、磯野裕、入江R、櫛田直、米山隆、大塚 R、神田 K、横井 T、近藤 H、我妻 M、村川 K、石田 S、石橋 T、高橋-藤井 A、棚瀬 T、永井 K、菊池 H、中井 K、磯貝 哲、菅野 S (2006 年 1 月)。 「転写調節の多様化: ヒト遺伝子の推定上の代替プロモーターの大規模な同定と特性評価」。ゲノム研究。16 (1): 55-65。土井:10.1101/gr.4039406。PMC 1356129。PMID 16344560。
- 家口 功、上田 聡、片岡 剛、佐藤 孝 (2007 年 8 月)。「小型 GTPase Rac1 による受容体エンドサイトーシスの負の制御におけるグアニンヌクレオチド交換因子 Ost の役割」。The Journal of Biological Chemistry。282 ( 32): 23296–305。doi : 10.1074 /jbc.M700950200。hdl : 20.500.14094 /D1004143。PMID 17562712。