西ニューギニア紛争

オランダ人が到着する前は、バカン王国、テルナテ王国、ティドレ王国などのインドネシアの諸侯国が西ニューギニアの一部に対する宗主権を主張していた。^{[ 6 ]}これらのスルタン国は、マソイ、ナツメグ、亀の甲羅、その他の香辛料、極楽鳥の羽、樹脂、奴隷、またはそれらに相当する他の物品の形で、地元の支配者から貢物を徴収し、それが履行されない場合は、通常、スルタンに代わって他の支配者が行うホンギ遠征によって罰せられた。 ^{[ 7 ]} 1828年、オランダは西ニューギニアに植民地を設立し、また、経度141度より西にある島の一部に対する主権を宣言した。ニューギニアはオランダにとって経済的価値がほとんどないことを考慮して、オランダはティドレをパプアの宗主国として昇格させた。 1849年までに、ティドレの国境はインドネシアとパプアニューギニアの現在の国際国境付近まで拡大した。^{[ 8 ]}ニューギニアにおけるオランダの活動は、1898年にオランダが行政中心地を設立し、その後宣教師や商人が続いたまで最小限であった。オランダの統治下で、西ニューギニアと東インドネシアの間で商業的なつながりが発展した。1883年、ニューギニアはオランダ、イギリス、ドイツに分割され、 1914年にオーストラリアがドイツ領を占領した。1901年、オランダはティドレのスルタン国から西ニューギニアを正式に購入し、オランダ領東インドに組み入れた。^{[ 9 ] [ 10 ]}第二次世界大戦中、西ニューギニアは日本軍に占領されたが、後に連合国によって奪還され、オランダの統治が回復された。

インドネシア国民革命の後、オランダは1949年12月27日に正式に主権をオランダ領東インドの後継国家であるインドネシア合衆国に移譲した。しかし、オランダはオランダ領ニューギニアを新しいインドネシア共和国に含めることを拒否し、独立国として独立するための準備を進めた。1949年末のオランダ・インドネシア円卓会議で西ニューギニアをめぐるオランダとインドネシアの意見の相違が解決できなかったため、領土の現状維持が決定され、主権移譲の1年後に二国間で交渉されることになった。^{[ 11 ]}しかし、1950年になっても両者の意見の相違は解決できず、インドネシアのスカルノ大統領はオランダが領土の引き渡し交渉の約束を反故にしたと非難した。1950年8月17日、スカルノはインドネシア合衆国を解散し、統一インドネシア共和国を宣言した。^{[ 12 ]}

オランダは、メラネシアのパプア人は他のインドネシア人とは民族的にも地理的にも異なり、常に別々に統治され、インドネシア革命に参加しておらず、パプア人はインドネシアの支配下に置かれることを望んでいないため、その領土はインドネシアに属していないと主張した。^{[ 14 ]}政治学者のアーレント・ライファートによれば、オランダのその他の動機としては、西ニューギニアの収益性の高い経済資源、オランダ海軍基地としての戦略的重要性、インドネシア革命によって追放されたユーラシア人を含むオランダの余剰人口を収容する可能性のある役割などが挙げられる。オランダはまた、インドネシアにおける地域的プレゼンスを維持し、経済的利益を確保したいと考えていた。^{[ 15 ]}

一方、インドネシアは、インドネシアがオランダ領東インドの後継国家であるという理由で、西ニューギニアを自国の本質的な一部とみなしていた。多くのパプア人が、インドネシア全土から多数の民族青年グループが参加した、象徴的な「インドネシア人のアイデンティティ」の最初の宣言である1928年の重要な青年誓約に参加した。 ^{[ 16 ]}インドネシアの領土回復主義感情は、第二次世界大戦前の1935年にメラウケの北にあるボーフェン・ディゴールと呼ばれる人里離れた刑務所に収容された数人のインドネシア人政治犯（主に1926年の蜂起の失敗による左翼と共産主義者）によっても煽られた。彼らはパプアでインドネシア革命グループを結成した多くのパプア人公務員と接触した。^{[ 17 ] [ 18 ]}ティドレ王国と広範な関係を持っていたボンベライ半島周辺の土着王国からも支援があり、これらの取り組みは同地域の西部のセカール王マフムド・シンギレイ・ルマゲサンによって主導された。 ^{[ 19 ]}これらの感情は、インドネシアの革命のスローガン「インドネシア・メルデカ ― サバンからメラウケまで」 （「自由なインドネシア ―サバンからメラウケまで」）にも反映されている。^{[ 20 ]} このスローガンは、スマトラ島最西端のサバンから西ニューギニアの小都市メラウケまで続くインドネシア領土を示している。スカルノはまた、西ニューギニアにおけるオランダの継続的な存在はインドネシアの国家建設の過程の障害であり、分離主義運動を助長するだろうと主張した。^{[ 21 ]}

1944年、ヤン・ファン・イーホウドはホランディア（現在のジャヤプラ）に官僚養成学校を設立した。同校の初期の校長の一人は、タマン・シスワの卒業生で、ボフェン・ディゴール捕虜収容所の元囚人であり、日本占領後にオーストラリアに逃亡したインドネシア民族主義者のスゴロ・アトモプラソジョであった。彼は後に1945年12月31日に反乱を試みたが失敗に終わった。同校の初期の卒業生やスゴロの元仲間の多くは、西ニューギニアでインドネシア独立運動を立ち上げ、また一部はオランダ当局を支持してパプア独立運動に取り組んだ。^{[ 22 ]}インドネシア独立宣言のニュースは、主にオーストラリアとオランダの旗を掲げる船で働いていたインドネシア海運組合（Sarpelindo）に所属する海運労働者を通じてニューギニアに伝わった。^{[ 23 ]}これにより、1946 年 10 月にアベプラ (現在のジャヤプラ) でインドネシア独立委員会 (KIM) が結成された。当初は、当時アベプラ・ホランディアの病院を運営していた女性医師の JA ゲルンガンが率いていた。1946 年 12 月、ジャヤプラの KIM の指導部は、スゴロの元刑務所看守であった元植民地警察官のマーティン・インデイに交代した。副官はコリヌス・クレイ、書記はペトルス・ワレボンであった。KIM はニューギニアで最初のインドネシア民族主義グループの一つであり、そのメンバーのほとんどはスゴロの元仲間であった。^{[ 23 ]}同時に、ニューギニアでは別のインドネシア民族主義運動が結成された。1946年7月5日、 GSSJ ラトゥランギーが6人のスタッフとともにNICAによってセルイに追放された。この追放先で、彼は同じく1945年12月31日のスゴロの反乱に参加したために追放されていたサイラス・パパレと会った。この会談の結果、1946年11月29日にインドネシア・イリアン独立党（PKII）という組織が結成された。PKIIはサイラス・パパレが率い、アルウィ・ラフマンが幹部、アリ・カマレアとアンダリアス・サンベリが書記、トゥン・チン・エクが会計を務めた。^{[ 23 ]} 1年後の1947年8月17日、サイラス・パパレと、アルバート・カルブイ、マルテン・インデイ、ヨハンス・アリクス、ロデウェイク・マンダジャン、バレント・マンダジャン、セムエル・ダミアヌス・カワブ、フランツ・ジョセフ・ジョハリを含むスゴロの元学生たちと彼らの支持者たちは、インドネシア独立記念日を記念して赤と白の国旗掲揚式を行った。

KIMとPKIIのメンバーはニューギニアの他の地域で運動を始めたが、そのほとんどは失敗に終わり、実行犯は投獄されるか殺された。マノクワリでは、ペトルス・ワレボンとサミュエル・D・カワブが率いる赤白運動（GMP）と呼ばれる運動が設立された。^{[ 24 ]}この運動は後にバボ、コカス、ファクファク、ソロンに広がった。^{[ 25 ]}ビアクでは、KIMの地方支部がルカス・ルムコレムの指導の下、インドネシア独立党（PIM）に変わった。ルカスは地元住民の間で暴力を扇動した罪で捕らえられ、ホランディアに追放された。それでもビアクでは運動は消滅せず、ステバヌス・ヨセフはポロンバンケンのグループのペテロ・ジャンディ、テリアヌス・シンビアク、ホノク・ラムブラール、ペトルス・カイワイ、ヘルマヌス・ルメレと共に1948年3月19日に別の反乱を起こした。オランダ当局はジャヤプラから増援を送らなければならなかった。オランダはペテロ・ジャンディに死刑、ステバヌス・ヨセフに終身刑というより厳しい刑罰を科した。^{[ 23 ]}ソロンでは、1946年に独立組織の先駆者運動の下で反乱が起こった。この組織は元ヘイホによって結成され、サンガジ・マランが率いていた。^{[ 23 ] [ 24 ]}一方、独立組織の先駆者とPKIIグループの支部とは別に、1947年8月17日にはアブラハム・コロマトの指導の下、インドネシア青年協会（PPI）と呼ばれる別の組織が結成された。

ファクファクのボンベライ半島周辺、特にコカスでは、アル・アラム・ウガル・セカール王、マフムード・シンギレイ・ルマゲサンの下でインドネシア民族主義が台頭した。彼はオランダ当局に反抗した経歴があり、ホランディアで投獄された。獄中で、バタビアのフォルクスラートのメンバーであり、インドネシア民族主義の影響力のあるベテランメンバーであるフスニ・タムリンに手紙を書き、裁判所を説得して釈放させることに成功した。^{[ 25 ]} 1946年3月1日、彼はコカスにあるすべてのオランダの旗をインドネシアの旗に変更するよう命じた。その後、オランダ当局はソロンから来た部隊の支援を受けてルマゲサン王を逮捕し、死刑を宣告したが、後に民衆の要求により終身刑に減刑された。 1946年、カイマナで、スランの任命された王の息子であるムハンマド・アフマド・アイチュアラウは、西イリアンのカイマナ独立運動（MBKIB）という組織を設立した。^{[ 25 ]} MBKIBを通じて、人々は毎年8月31日のウィルヘルミナ女王の記念日の祝賀をボイコットした。この活動に対し、アイチュアラウはオランダ人に逮捕され、1948年にアヤマルに10年間追放された。^{[ 23 ]}地元のパプア王の下でオランダに反対する他の運動には、ルンバティ王イブラヒム・バウが率いるニューギニア・イスラム連合（KING）、マフムード・シンギレイ・ルマゲサンとアッバ​​ス・イハが率いる青年組織運動、ウスマン・サードとナマトタ王カシム・オンバイルが率いるカイマナ・イスラム協会（PIK）などがある。^{[ 26 ]}

1947年以降、パプアの地元住民や他の島民を含む多くの公務員が共和主義運動に同情的であったため、オランダ当局は彼らを投獄したり、寝返らせたりする努力を強化したが、後にインドネシア共和国の外で独立を追求するよう彼らを奨励した。この初期の努力で、最も著名なメンバーはマーティン・インデイで、ビアク出身のヘマヌス・ルメールとその仲間は捕らえられてホランディアに投獄され、一方、コリヌス・クレイはディグルに追放された。1949年、円卓会議はインドネシアがインドネシア共和国を構成国とするRISとして独立を認められ、ニューギニアは1年後にその運命を話し合うという条項付きでオランダ当局の管理下に置かれることで終了した。かつて共和主義に同情していると疑われた他のインドネシア諸島出身者で占められていた行政官僚は、ジャワ島から追放されたユーラシア人に取って代わられ、彼らは多くのポスト、特に中堅および下級中堅のポストを占めたため、結果としてパプア人の社会的上昇が阻害された。^{[ 27 ]}ビアク島のパプア人諮問評議会、カインカイン・カルカラ・ビアクは、1947年に選挙に基づいて設立されたが、慣習法の問題について地元の地区長に助言するだけの組織に堕落した。1950年には、いくつかの大きな町のために一種の市議会が構想されたが、その権限と構成についての議論は何年も続いた。一方、オランダはマルクス・カイセポ、アブドゥラ・アルファン、ヨハン・アリクスといった右派寄りのパプア人エリートや、ニコラース・ジョウウェといった左派寄りのエリートを説得することに成功したが、立場を変えることを拒否した他のエリート、主に左派寄りのエリートは、反体制活動の罪で告発され、ほとんどが投獄された。右派寄りのパプア人エリートはその後、島内のいくつかの町でニューギニア統一運動（GPNG）を設立した。GPNGの綱領は基本的に、インドネシアの領有権主張を否定し、オランダの統治を支持することであった。^{[ 27 ]}

1950年から1953年にかけて、オランダとインドネシアは二国間交渉を通じて紛争を解決しようと試みたが、1950年末までに連邦政府の構造が崩壊し、共和制政府に引き継がれたため、オランダはインドネシアの内政にあまり発言権を持てなくなったことから、対立が生じた。オランダは、この変化の後、円卓会議協定のニューギニア条項は無効であるとして、これに従うことを拒否した。これらの交渉は失敗に終わり、両政府は立場を硬化させた。1952年2月15日、オランダ議会はニューギニアをオランダ領に編入することを決議した。その後、オランダは主権問題に関するさらなる議論を拒否し、この問題は解決済みとみなした。^{[ 28 ] [ 29 ]} これに対し、スカルノ大統領はオランダに対してより強硬な姿勢をとった。当初、彼はインドネシア政府に円卓会議の協定を正式に破棄し、経済制裁を採用するよう強制しようと試みたが、ナツィル内閣に拒否され、失敗に終わった。この挫折にもめげず、スカルノは西イリアンの奪還を大統領としての重要な優先事項とし、1951年から1952年にかけての多くの演説で、この目標のためにインドネシア国民の支持を得ようと努めた。^{[ 30 ]}

ニューギニアでは、PKIIやKIM関連グループの活動は、指導者のほとんどが反体制法によって逮捕された後、大幅に縮小したが、後継グループがいくつか存在し、インドネシアとの統合を目指して闘っている。1951年のホランディアでは、ニューギニア西部のパプア人がインドネシア・イスラム党を結成したが、同党はオランダ当局に激しく反対し、その結果、投獄され、12年の刑を言い渡された。1952年2月3日には、今度は西ニューギニアのインドネシアとの統合を主張していたサイモン・ジェンタラ率いるグループが逮捕された。^{[ 24 ]} 1950年5月2日、RIS裁判所はセカール王マフムード・シンギレイ・ルマゲサンの釈放を決定し、彼は1953年にゲラカン・チェンドラワシ・レヴォルージネル・イリアン・バラット（GTRIB）を率いることになった。同年、オランダ領ニューギニア政府に対する2つの反乱があり、1つはコカスのアブタリブ・ビン・パリスが率いる彼の王国周辺地域での反乱、もう1つは1953年10月10日にワリス地区で起きた反乱である。^{[ 24 ]}

1953年までに、この紛争はインドネシア国内政治の中心問題となった。インドネシアの政治スペクトラム全体にわたるすべての政党、特にインドネシア共産党（PKI）は、西イリアンをインドネシアに統合しようとするスカルノの努力を支持した。歴史家のオードリーとジョージ・マクターナン・カヒンによれば、PKIの統合支持の姿勢は、党の政治基盤の再構築と、スカルノを支持する民族主義共産党としての資格の強化に役立った。^{[ 28 ]}同年、オランダ議会使節団の訪問中に、ホランディア、ビアク、マノクワリのGPNG指導者から請願書が届いた。これらの請願書には、通常の忠誠の表明に加えて、より多くの教育を求める強い願望が表明されていた。ただし、オランダ当局によってもたらされたユーラシア人入植者との土地紛争に対する地元の憤りも表明されていた。^{[ 27 ]}プロテスタントの労働組合であるChristelijk Werknemers Verbond Nieuw-Guinea-Perserikatan Sekerdia Kristen di Nieuw-Guinea (CWNG-Persekding) は1952年に設立されました。当時、主な関心事はオランダ人職員の給与とユーラシア人契約労働者の境遇でした。徐々にパプアの福祉に関する具体的な関心事を展開し、教育分野でも活動するようになりました。関連するkaum ibu (女性クラブ) が組織され、主に近代的な労働法制の制定のために闘いました。 1957 年以降、特にパプア人の会員数は急速に増加し、1960 年までに 3,000 人を超えた。これらのパプア人会員の多くは、パプア独立を主張する国民党 (Parna) に加入したが、^{[ 27 ] [ 22 ]}時が経つにつれ、Parna の EJ Bonay や Frits Kirihio のような一部の会員はインドネシアとの協力を主張し、Parna は Herman Wayoi が率いるインドネシア国民党 (PNI) の支部となった。これは、後に結成された Kena U Embay と対立するもので、Kena U Embay は Parna は官僚機構での地位のみを主張し、Kirihio を「パプアのヒトラー」と批判し、オランダとの統合を主張した。^{[ 31 ]}

スカルノ大統領の要請により、アリ・サストロアミジョジョ首相は 1952年に西ニューギニアへの限定的な侵攻を承認し始めた。^{[ 32 ]}しかし、これらの初期の侵攻は軍事的に失敗に終わり、インドネシアは1960年までそれ以上の軍事作戦を開始しなかった。^{[ 33 ]}ケン・コンボイによれば、最初の侵攻は「素人」であり、1952年のガグ島への最初の侵入は、数日のうちに侵入者の逮捕につながった。1年後の1953年の2回目の侵入の試みは、今度はカイマナを標的としたものであったが、同様にすぐに阻止され、侵入者は逮捕された。1954年のエトナ湾での3回目の侵入の試みはより深刻なもので、ヨハネス・アブラハム・ディマラ率いる42人の武装した侵入者グループが、オランダ人警察官のファン・クリーケン軍曹をインドネシア領に拉致することに成功した。潜入部隊はオランダ海兵隊と交戦し、インドネシア軍は11名の死傷者を出し、残りのインドネシア軍は捕虜となった。インドネシア政府は西ニューギニアでオランダ軍に対して有効な軍事的挑戦を行うことはできないと渋々認め、インドネシアが西ニューギニアで再びオランダ軍の立場を試すのは1960年までなかった。^{[ 33 ]}これと並行して、オランダ当局はソロン支部のイリアン解放機構（OPI）のパプア人青年メンバーの逮捕を開始し、ディマラは1950年に元議長であったため、1960年までディグルに追放された。 ^{[ 24 ]}

ディグル刑務所では、1955年にヨハネス・アブラハム・ディマラの助言の下、ベニャミン・フェルブンが率いるウントゥク・ペンベバサン・イリアン（UPI）という組織が結成され、その後、 C・タムンゲが率いるオカバ、ヤン・カメウブンが率いるムティン、メラウケ、 L・レンワリンが率いるミミカなど、他の地域にも広がっていった。ミミカ支部は主に、オランダ統治下でこの地域に配属されたケイ諸島出身の教師たちで構成され、この地域のRMS工作員に対抗する活動も行っていた。1960年2月までに、UPIはペルサトゥアン・セマンガット・ペムダ1945（PSP-45）に改組された。この組織のメンバーは主にインドネシアの情報工作員と連携して情報活動を行い、後にインドネシア軍による潜入工作に接触するための訓練と装備を受けていた。 1960年8月、オランダ当局はPSP-45の指導者を含む19人のメンバーを逮捕したが、彼らはUNTEAの下で1962年10月15日にようやく釈放された。^{[ 34 ]}

1954年、インドネシアは紛争を国連に持ち込むことを決定し、国連総会（UNGA）の第9回会期の議題に載せることに成功した。これに対し、オランダの国連大使ヘルマン・ファン・ロイエンは、オランダは紛争に関して国連が行ういかなる勧告も無視すると警告した。^{[ 35 ]} 1955年4月のバンドン会議で、インドネシアはアフロ・アジア諸国から西ニューギニアに対する自国の主張を支持する決議を得ることに成功した。^{[ 36 ]}アフロ・アジア諸国の他に、インドネシアはソビエト連邦とそのワルシャワ条約機構の同盟国からも支持された。^{[ 37 ]}

一方、オランダの立場は、米国、英国、オーストラリア、ニュージーランド、およびいくつかの西ヨーロッパ諸国とラテンアメリカ諸国によって支持された。しかし、これらの国々は、インドネシアとの紛争が発生した場合にオランダに軍事支援を提供するという約束をすることを望まなかった。^{[ 38 ]}アイゼンハワー政権は非暴力的な領土変更には寛容であったが、紛争解決のために軍事手段を用いることを拒否した。1961年まで、米国は厳格な中立政策を追求し、紛争に関するすべての投票で棄権した。^{[ 39 ]}歴史家のニコラス・ターリングによれば、英国政府は、領土の支配権がインドネシアに移ることは、政治的威信と地理的近接性に基づく領土変更を奨励する前例を作ることになるため、「戦略的に望ましくない」という立場をとった。^{[ 40 ]}

The Australian Menzies Government welcomed the Dutch presence in West New Guinea as an "essential link" in its national defence since it also administrated a trust territory in the eastern half of New Guinea. Unlike its Labor Party successor which had supported the Indonesian nationalists, Prime MinisterRobert Menzies viewed Indonesia as a potential threat to its national security and distrusted the Indonesian leadership for supporting the Japanese during World War II.^[41][42] In addition, New Zealand and South African governments also opposed the Indonesian claim to West New Guinea. The New Zealand government accepted the Dutch argument that the Papuans were culturally different from the Indonesians and thus supported maintaining Dutch sovereignty over the territory until the Papuans were ready for self-rule. By contrast, newly independent India, another Commonwealth member supported Indonesia's claim to West New Guinea.^[43][44]

Between 1954 and 1957, Indonesia and their Afro-Asian allies made three attempts to get the United Nations to intervene in the dispute. However, all these three resolutions failed to gain a two–thirds majority in the United Nations General Assembly. On 30 November 1954, the Indian representative Krishna Menon initiated a resolution calling for the Indonesians and Dutch to resume negotiations and to report to the 10th UNGA Session. This resolution was sponsored by eight countries (Argentina, Costa Rica, Cuba, Ecuador, El Salvador, India, Syria, and Yugoslavia) but failed to secure a two-thirds majority (34-23-3).^[45] In response to growing tensions between Jakarta and the Hague, the Indonesian government unilaterally dissolved the Netherlands-Indonesian Union on 13 February 1956, and also rescinded compensation claims to the Dutch. Undeterred by this setback, Indonesia resubmitted the West New Guinea issue to the UNGA's agenda in November 1956.^[46]

1957年2月23日、西ニューギニア問題に関して国連が「仲介委員会」を設置するよう求める13か国（ボリビア、ビルマ、セイロン、コスタリカ、エクアドル、インド、イラク、パキスタン、サウジアラビア、スーダン、シリア、ユーゴスラビア）による決議が国連総会に提出された。この決議は多数決（賛成40、反対25、棄権13）を得たものの、3分の2の賛成を得られなかった。しかし、国連のアジア・アフリカ議員連盟は諦めず、この紛争を国連総会の議題に加えるよう働きかけた。1957年10月4日、インドネシア外相スバンドリオは、国連がインドネシアに有利な解決策をもたらさなければ、インドネシアは「別の問題」に着手すると警告した。その月、インドネシア共産党と傘下の労働組合は、オランダに対する報復経済措置を求めてロビー活動を行った。1957年11月26日、3度目のインドネシア決議案が採決にかけられたが、3分の2の賛成多数（41対29対11）を得ることができなかった。これに対し、インドネシアはインドネシア国内のオランダの権益に対して報復措置を取った。^{[ 47 ]}

1956年、ファクファクのパプア人青年たちが反乱を起こし、いくつかの警察署を焼き払い、銃を盗んだ。^{[ 24 ]}ソロンのPPIとOPIの指導部が逮捕されたことを受けて、OPIはバスティアン・サモリ、ユリウス・ウォラバイ、ロデウィック・ウォシリ、ボブ・ワリヌシ、エリアス・パプリンデイによって率いられるようになった。1956年11月3日、300人からなるこの運動はソロンの石油タンクを爆破する破壊工作を計画した。しかし、この計画はオランダ当局によって阻止され、1959年11月にE・パプリンデイ、エリメレク・アヨニ、フランキー・コッサが逮捕された。^{[ 48 ]}

1952年から1954年にかけて、エナロタリでは激しい戦闘が何度も起こり、ウィッセル湖周辺はウェゲと呼ばれる救世主運動の中心地となった。この運動は、ジャワ島からラトゥ・アディルがやって来て幸福の王国を築くという信仰を中心としており、これは西へ、ジャワ島の方向へ旅をして、生と死と富の秘密をもたらすために再び戻ってくるという地元の民話「シトゥグミナ」に基づいていた。そのため、エカリは彼らの到来に備えなければならないとされた。地元の人々は森の真ん中に兵舎を建てて準備を始め、数週間にわたって儀式に参加した。この運動の指導者は、マカッサルで学んだボモウ出身の元司祭ザケウス・パカゲであった。彼は1954年半ばに捕らえられ投獄され、1962年にようやく釈放された。1956年11月3日、オバノで宣教師のセスナ機がエカリによって燃やされ、オランダの報復につながった別の事件も発生した。^{[ 49 ]}

1957年8月、ウィッセル湖周辺でオランダ人警官2人が殺害され、1959年に2度目の事件が発生した。これらの事件は「エナロタリ事件」として知られている。1959年7月6日、ホランディア近郊のゲニエムで、地元住民から旧日本軍の武器が数点没収された。しかし、これが反乱を引き起こし、オランダ警察と海軍部隊が反乱鎮圧のために派遣された。この事件と同時に、アスマト地方近郊でメシア運動にルーツを持つ反乱も勃発した。この運動は1956年に始まり、オランダ植民地当局による残忍な報復を招き、アヤン村で約700人が殺害された。1958年から1959年にかけて、オランダ当局がHNLMSピート・ハインを派遣し、アガツで約1,000人が死亡する別の反乱が始まった。^{[ 50 ]}これらの出来事は「アガツ事件」として知られることになる。^{[ 24 ]}

1960年には、特にコカスとファクファクで1960年8月と12月に相次いで反乱が起こり、ラパダンガが主導し、多くの実行犯が捕らえられ、ディグルに追放された。その後、1960年11月には、メラウケで約25人のパプアの若者がオランダ政府に対する運動を行ったとしてオランダ人に逮捕された。ホランディア（現在のジャヤプラ）でも同年激しい反乱があり、「バリエム渓谷事件」としてよく知られている。これらの複数の反乱を鎮圧する際、オランダ当局は残忍な行動を取り、オランダ国民と地元住民の抗議を招いた。^{[ 24 ]}

ビアク島でも多数の逮捕者が出ており、その中には、インドネシア共和国内イリアン党（Partai Irian Dalam Republik Indonesia Serikat、PIDRIS）を率いてオランダ人に対する活動を行っていたペトルス・ウェッテベシーという教師も含まれており、コリヌス・クレイと党の副党首であるマルテン・インデイはアンボンで別々に逮捕された。^{[ 51 ]}その後12月には、オランダ人職員がパプアの若者に対して恣意的な行動をとったため、生徒と教師の間で反乱が起きた。ソロンでは、バスティアン・サモリの指導の下、OPIのメンバーが関与する別の事件が発生し、最終的にサモリはオランダ当局に逮捕され投獄された。^{[ 24 ]}

1957年11月に第3回アフロ・アジア決議が否決された後、インドネシア政府はインドネシアにおけるオランダの権益を標的とした全国的なキャンペーンを開始し、オランダのフラッグキャリアであるKLMの着陸権の撤回、オランダ所有企業での大規模なデモと労働者のストライキ、オランダの海運会社KPM、BPM、Borsumij、オランダ所有の銀行、その他の資産の接収につながった。 ^{[ 52 ] [ 24 ]}総額約15億ドルの評価額のオランダ所有企業700社が国有化された。^{[ 24 ]} 1958年1月までに1万人のオランダ国民がインドネシアを離れ、多くがオランダに帰国した。この自発的な国有化はインドネシア経済に悪影響を及ぼし、通信を混乱させ、輸出生産に影響を与えた。スカルノ大統領はまた、1958年の国連総会でこの問題を提起する努力を放棄し、理性と説得が失敗したと主張した。^{[ 53 ] [ 54 ]} 1960年6月までに、ニューギニア出身のユーラシア人を中心に約1万3千人のオランダ国民がオーストラリアへ移住し、約1千人がオランダへ移住した。^{[ 24 ]}ジャカルタのオランダ外交代表に対する嫌がらせが長期間続いた後、インドネシア政府は1960年8月にオランダとの国交を正式に断絶した。^{[ 52 ]}

インドネシアの侵略に対応し、現地の圧力に直面したオランダ政府は、1959年にパプア人の自決権獲得に向けた取り組みを強化した。これらの取り組みは、ホランディア（現在のRSUDジャヤプラ）に新しい病院、マノクワリに造船所、農業研究施設、プランテーション、そしてパプア義勇軍として知られる軍隊の設立という形で結実した。1960年末までに、立法、諮問、政策機能を併せ持つ立法ニューギニア評議会が設立された。そのメンバーの半数は選挙で選ばれることになっており、この評議会の選挙は翌年に行われた。 ^{[ 55 ] [ 56 ]}

これらには、地方政党の設立が含まれます。これらの政党は次のとおりです。国民党 ( Partai Nasional、Parna) はヘルマン・ワヨイが率い、民主人民党 ( Democratische Volks Partij、DVP) は A. ルントゥボイが率い、ケナ・ウ・エンベイ (KUD) はエッサウ・イタールが率い、パプア国民党 ( Nasional Partai Papua、Nappa)はモゼス・ルマイヌムが率い、パプア独立党 ( Partai Papua Merdeka 、PPM)はウィレム・イヌリーが率い、パプア国民委員会 ( Committee Nasional Papua 、CNP) はロデウィック・アヤミセバが率い、パプア国民戦線 ( Front Nasional Papua、FNP) はヨハン・アリクスが率い、ニューギニア党 ( Partai Orang Nieuw Guinea、PONG) はヨハン・アリクスが率い、ニューギニア統一党 ( Eenheidspartij Nieuw Guinea、EPANG) はロデウェイク・マンダジャン、平等な人間党（Sama-Sama Manusia、SSM）、MNマジャリビットが率いるラジャ・アンパット・キリスト教イスラム連合（ Persatuan Christen Islam Radja Ampat 、Perchisra）、AJF マレイが率いるパプア青年協会（ Persatuan Pemuda-Pemudi Papua、PERPEP）^{[ 22 ]}オランダ人は西パプアの国民的アイデンティティの意識を醸成しようともし、こうした努力の結果、国旗（モーニングスター旗）、国歌、紋章が作られた。オランダは1970年に西ニューギニアへの独立移管を計画していた。[ ^{57 ]ニューギニア}評議会で除外されたのは、KIM、PKII、J・ディマラとI・キリクラット率いるイリアン・インドネシア青年組織( NCクレイ率いるオルガニサシ・ペムダ・インドネシア・イリアン、OPII）、SKトゥメンコル率いるPPI、D・ウォシリ率いるイリアン青年組織（オルガニサシ・ペムダ・イリアン、OPI）、タン・ジュン・エク率いるインドネシア独立党（パルタイ・ケメルデカーン・インドネシア、PKI）、PIN、イスラム・インドネシア党（パルタイ・インドネシア・イスラム）、GMP、インドネシア青年運動（ゲラカン ペムダ インドネシア、GPI)ルンベワスと西イリアン人民運動 ( Gerakan Rakyat Irian Barat、GRIB) が主導。^{[ 25 ] [ 58 ]}

1962年、GRIBはファクファクへのオランダのボスト大臣の訪問中に、西イリアンをインドネシアに返還するよう公然と要求する抗議活動を行った。ニューギニアでのパプア人の反乱とは別に、多くのパプア人が捕獲を逃れてインドネシアに逃亡し、コリヌス・クレイ、A・コロマス、AB・カルブイ、ALマラニ、NL・スアゲス、ヘンキー・アンタリババ中尉、ラマンデイ中尉、HL・ルマセウ、ワンガイ中尉、ヌンベリ中尉など、後にトリコラ作戦中の軍事潜入の指導者となる人々がチェンドラワシ大隊に加わった。軍事訓練を受けた他の人物には、AJ・ディマラ、ベニー・トーレイ、マリヌス・インブリー、ザドラック・ルンボビア、メルキアヌス・トーレイ、メトゥサリム・フィンベイなどがいる。^{[ 59 ]}インドネシアの外交使節団に加わった者もおり、その中にはインドネシア領内に住んでいたS. パパレのほか、 M. インデイ、フリッツ キリヘオ、JA ディマラなどが含まれる。1949年から1961年までの脱出者の正確な人数は不明だが、イリアン バラット退役軍人協会は、パプア全土から154人の著名なインドネシア民族主義者をリストアップしており、そのほとんどは1959年から1961年の間に逃亡した。^{[ 24 ]}

1960年までに、アジア太平洋地域の他の国々は西イリアン紛争に注目し、紛争終結に向けたイニシアチブを提案し始めた。オランダを訪問したニュージーランドのウォルター・ナッシュ首相は 、オランダ領とオーストラリア領の両方からなる統一ニューギニア国家の構想を提案した。この構想はインドネシアや他の西側諸国政府からほとんど支持を得られなかった。同年後半、マラヤのトゥンク・アブドゥル・ラーマン首相は、西ニューギニアを国連信託統治下に置くという3段階のイニシアチブを提案した。共同管理者は、西イリアン問題でインドネシアの立場を支持する非同盟国であるセイロン、インド、マラヤの3カ国となる予定だった。この解決策には、紛争当事国であるインドネシアとオランダが二国間関係を再構築し、オランダの資産と投資を所有者に返還することが含まれていた。しかし、この構想は1961年4月にインドネシア外務大臣スバンドリオの反対により頓挫した。スバンドリオはトゥンクの提案を公然と非難した。^{[ 60 ]}

1961年までに、オランダ政府は、西ニューギニアをオランダの指導の下で独立させるという政策に対する十分な国際的支援を得るのに苦労していた。オランダの伝統的な西側同盟国である米国、英国、オーストラリア、ニュージーランドはオランダの政策に同情的であったが、インドネシアとの紛争が発生した場合に軍事支援を提供する意思はなかった。^{[ 61 ]} 1961年9月26日、オランダ外相ジョセフ・ルンスは、西ニューギニアを国連信託統治下に置くことを提案した。この提案は、インドネシア外相スバンドリオによってきっぱりと拒否され、スバンドリオは西ニューギニア紛争をコンゴ危機におけるカタンガのコンゴ共和国からの分離独立の試みになぞらえた。1961年10月までに、英国は西ニューギニアをインドネシアに移管することに前向きになり、米国は同地域に対する共同管理信託統治の構想を打ち出した。^{[ 62 ]}

1961年11月23日、インド代表団は国連において、インドネシアに有利な条件でオランダとインドネシアの協議を再開するよう求める決議案を提出した。1961年11月25日、フランス語圏アフリカ諸国は、西ニューギニアの独立を支持する対抗決議案を提出した。インドネシアはインドの決議案を支持したが、オランダ、イギリス、オーストラリア、ニュージーランドはフランス語圏アフリカの決議案を支持した。1961年11月27日、フランス語圏アフリカ（賛成52票、反対41票、棄権9票）とインド（賛成41票、反対40票、棄権21票）の決議案はともに国連総会で採決にかけられたが、いずれも3分の2の賛成を得られなかった。国連におけるこの最後の外交交渉の失敗により、インドネシアは西イリアンへの軍事侵攻の準備を始めた。^{[ 63 ] [ 64 ]}

As the dispute began to escalate, Sukarno also developed closer relations with the Soviet Union, which shared Indonesia's anti-colonial outlook. In July 1959, the Indonesian government adopted a policy of Confrontation (Konfrontasi) against the Dutch. According to the Indonesian political scientist J. Soedjati Djiwandono, Indonesia's Confrontation policy involved the use of political, economic, and military force to induce an opponent to reach a diplomatic solution on Indonesian terms.^[65] Later that year, the Soviet government decided to supply warships and other military hardware directly to the Indonesians. By 1965, the Indonesian Navy had grown to 103 combat vessels and other auxiliaries (including a cruiser, twelve submarines, and sixteen destroyers and frigates). Due to Soviet military aid, the Indonesian Navy became the second most potent force in East Asia after China. The Indonesian Air Force also benefited from an infusion of Soviet military hardware and training, developing a long-range capability.^[66]

Bolstered by Soviet military weapons and equipment, Indonesia had begun to reconsider the viability of renewing military operations against Dutch forces in West New Guinea. On 9 November 1960, Indonesia launched a seaborne incursion into the territory, but this operation proved to be a failure. Of the twenty-three infiltrators, seven were killed, and the remaining sixteen were captured within four months.^[67] On 14 September 1961, a new infiltration attempt was launched, but once again the infiltration party was promptly intercepted and defeated by Dutch forces.^[68]

Following the failure of diplomacy in the United Nations and persisted Dutch efforts to prepare the West Papuans for self-rule, Indonesia's Confrontation against the Dutch in West New Guinea reached a new crescendo. On 19 December 1961, President Sukarno gave orders for the Indonesian military to prepare for a full–scale military invasion of the territory; codenamed Operation Trikora. He also ordered the creation of a special People's Triple Command or Tri Komando Rakyat (Trikora) with the objective of 'liberating' West New Guinea by 1 January 1963. Trikora's operational command was to be called the Mandala Command for the Liberation of West Irian (Komando Mandala Pembebasan Irian Barat) and was led by Major-General Suharto, the future President of Indonesia. In preparation for the planned invasion, the Mandala command began making land, air, and sea incursions into West Irian. General Suharto also planned to launch a full-scale amphibious operation invasion of West Irian known as Operation Jayawijaya (or Operation Djajawidjaja).^[69][70][71]

In response to Indonesian aggression, the Netherlands increased its military presence and intelligence-gathering efforts in West New Guinea. Since 15 April 1954, the Royal Netherlands Navy had been responsible for the territorial defence of West New Guinea.^[72] A signals intelligence agency known as Marid 6 Netherlands New Guinea (NNG) was also established in April 1955 to provide the Netherlands New Guinea authorities with intelligence on Indonesian intentions towards West Irian. One of Marid 6 NNG's successes was providing early warning of Indonesian plans to seize all KPM ships and facilities in December 1957. This enabled the Dutch authorities to evacuate 45 of these 83 ships. Later, Marid 6 NNG helped Dutch naval units to recapture the KPM ships.^[73] In 1962, the Royal Netherlands Navy deployed a sizeable naval task group including the aircraft carrier HNLMS Karel Doorman to West New Guinea.^[74]

1962年1月15日、インドネシア海軍は西イリアン南岸のフラッケフック付近に海兵隊員150名を上陸させようと試みた。インドネシア側は、ニューヨークで進行中の交渉中にオランダの立場を弱めるため、オランダ領内にインドネシア国旗を掲げるつもりだった。しかし、Marid 6 NNGはインドネシアの無線メッセージを傍受し、インドネシアの計画を知った。これに対し、オランダ当局はロッキード・ネプチューン哨戒機1機と駆逐艦3隻を派遣し、インドネシアの魚雷艇3隻を迎撃した（4隻目はエンジン故障を起こし参加しなかった）。その後のフラッケフック事件で、インドネシアの魚雷艇1隻が撃沈され、残りの2隻は撤退を余儀なくされた。^{[ 75 ]}この作戦はインドネシアにとって悲惨な結果に終わり、多くの乗組員と乗船していた海兵隊員が死亡し、生存者55名が捕虜となった。犠牲者の中には、インドネシア海軍参謀次長のヨス・スダルソ准将も含まれていた。 ^{[ 76 ]}

1962年6月24日、インドネシア空軍のC-130ハーキュリーズ輸送機4機がメラウケ近郊に213名の空挺兵を降下させた。同年、合計1,200名のインドネシア空挺兵と340名の海軍潜入者が西ニューギニアに上陸した。1962年半ばまでに、インドネシア軍は1962年8月頃にジャヤウィジャヤ作戦を開始する準備を開始した。この作戦は4段階で実施され、オランダの飛行場に対する空軍と海軍の共同攻撃、ビアクとセンタニへの空挺部隊と水陸両用部隊の上陸、そして同地域の首都ホランディアへの地上攻撃が含まれる予定だった。インドネシア軍は知らなかったが、Marid 6 NNGはインドネシアの通信を傍受し、インドネシアの戦闘計画に関する情報を入手していた。しかし、 1963年までに西ニューギニアをインドネシアの支配下に移管することを容易にしたニューヨーク協定として知られる停戦協定が、1962年8月15日にオランダとインドネシアによって署名された。その結果、トリコラ司令部は1962年8月17日にジャヤウィジャヤ作戦を中止した。^{[ 77 ]}

1961年までに、米国政府はインドネシア軍が西ニューギニア侵攻計画のためにソ連の武器や装備を購入していることに懸念を抱くようになった。ケネディ政権はインドネシアが共産主義に傾倒することを恐れ、スカルノをソ連圏や共産主義中国から引き離すために彼に接近しようとした。米国政府はまた、アイゼンハワー政権がスマトラ島とスラウェシ島でのペルメスタ/ PRRIの地域蜂起を秘密裏に支援したことで悪化したジャカルタとの関係を修復したいと考えていた。これらの要因により、ケネディ政権はインドネシアに有利な平和的解決をもたらすために外交的に介入することを決意した。^{[ 78 ] [ 79 ]}

1962年を通して、アメリカの外交官エルズワース・バンカーは、オランダ政府とインドネシア政府間の極秘のハイレベル交渉を仲介した。これらの長期にわたる交渉の結果、 1962年8月15日にニューヨーク協定として知られる和平合意が成立した。面子を保つための措置として、オランダは1962年10月1日に西ニューギニアを国連暫定執行機関（UNTEA）に引き渡し、UNTEAは1963年5月1日にその領土をインドネシアに割譲し、正式に紛争は終結した。ニューヨーク協定の一部として、パプア人がインドネシアに留まるか、自決権を求めるかを決定するために、1969年に住民投票を実施することが規定された。^{[ 80 ]}

米国の外交努力により、この紛争がインドネシアとオランダ間の全面戦争にエスカレートすることは回避されたものの、ワシントンはスカルノ大統領を説得することに失敗した。西ニューギニア作戦での成功に勢いづいたスカルノは、旧イギリス植民地のマレーシアに目を向け、インドネシア・マレーシア対立を引き起こし、インドネシアと西側諸国との関係悪化を招いた。最終的に、スカルノ大統領は1965年のインドネシアのクーデター未遂で失脚し、その後、親西側派のスハルトが後任となった。^{[ 69 ] [ 81 ]}さらに、米国の鉱山会社フリーポート・マクモランは、西ニューギニアの銅と金の鉱床の開発に関心を持っていた。^{[ 82 ]}

Following the Act of Free Choice plebiscite in 1969, Western New Guinea was formally integrated into the Republic of Indonesia. Instead of a referendum of the 816,000 Papuans, only 1,022 Papuan tribal representatives were allowed to vote, and they were coerced into voting in favour of integration. While several international observers including journalists and diplomats criticised the referendum as being rigged, the U.S. and Australia supported Indonesia's efforts to secure acceptance in the United Nations for the pro-integration vote. That same year, 84 member states voted in favour for the United Nations to accept the result, with 30 others abstaining.^[83]

A number of Papuans refused to accept the territory's integration into Indonesia, which anti-independence supporters and foreign observers attributed to the Netherlands' efforts to promote a West Papuan national identity among right-leaning Papuans and suppressed left-leaning Papuans pro-Indonesian sympathies.^[27] These formed the separatist Organisasi Papua Merdeka (Free Papua Movement) and have waged an insurgency against the Indonesian authorities, which continues to this day.^[84][85] In 2017, a petition smuggled and claimed to be signed by 1.8 million West Papuans^{[Note 1]} was presented to the United Nations demanding a new independence referendum and a UN representative to investigate suspected human rights violations by Indonesian security forces.^[88] Signing of the petition was made illegal under threat of prison by Indonesian authorities. Australia continued to support Indonesia's sovereignty over West Papua, citing the Lombok treaty.^[88]