WD40リピート

WDドメイン、G-βリピート
7枚羽根のβプロペラフォールドを採用したTup1（酵母の転写コリプレッサー）のC末端WD40ドメインのリボン図。リボンは青（N末端）から赤（C末端）に色分けされています。[1]
識別子
シンボル	WD40
パム	PF00400
ファム一族	CL0186
インタープロ	著作権
プロサイト	PDOC00574
SCOP2	1gp2 / スコープ / SUPFAM
医療機器	cd00200
利用可能なタンパク質構造: パム   構造 / ECOD   ＰＤＢ RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBサム 構造の概要 ＰＤＢ 1b9x ​、1b9y ​、1erj ​、1gg2 ​、1got ​、1gp2 ​、1gxr ​、1nex ​、1nr0 ​、1omw ​、1p22 ​、1pev ​、1pgu ​、1pi6 ​、1s4u ​、1sq9 ​、1tbg ​、1u4c ​、1xhm ​、1yfq ​、2bcj ​、2ce8 ​、2ce9 ​、2trc

WD40リピート（ WDまたはベータトランスデューシンリピートとも呼ばれる）は、約40個のアミノ酸からなる短い構造モチーフで、多くの場合、トリプトファン-アスパラギン酸（WD）ジペプチドで終わっています。 ^[2]これらのリピートの直列コピーは通常、一緒に折り畳まれて、 WD40ドメインと呼ばれる一種の環状ソレノイドタンパク質ドメインを形成します。

WD40ドメインを含むタンパク質は4〜16個の繰り返し単位を持ち、それらはすべて環状のベータプロペラ構造を形成すると考えられています（右の図を参照）。^{[3] [4]} WD40ドメインはいくつかの繰り返しで構成されており、最初の約20残基の可変領域と、より一般的な残基の繰り返しセットが続きます。これらの繰り返しは通常、4本鎖の反平行ベータシートまたはブレードを形成します。これらのブレードは一緒になってプロペラを形成し、最も一般的なのは7ブレードのベータプロペラです。ブレードは連動して、1つの繰り返しの最後のベータストランドが次の繰り返しの最初の3つと形成され、3Dブレード構造を形成します。

WD40リピートタンパク質は、すべての真核生物に見られる大きなファミリーであり、シグナル伝達や転写調節から細胞周期制御、オートファジー、アポトーシスに至るまで、さまざまな機能に関与しています。^[5]すべてのWD40リピートタンパク質の根本的な共通機能は、繰り返しユニットがタンパク質相互作用の堅固な足場として機能する、複数のタンパク質複合体アセンブリを調整することです。タンパク質の特異性は、繰り返し自体の外側の配列によって決まります。このような複合体の例には、Gタンパク質（βサブユニットはβプロペラ）、TAFII転写因子、E3ユビキチンリガーゼなどがあります。^{[3] [4]}

ヒトゲノムの初期解析によると、WD40リピートは8番目に大きいタンパク質ファミリーです。全部で277個のタンパク質にWD40リピートが含まれていることが確認されています。^[6]このドメインを含むタンパク質をコードするヒト遺伝子には以下のものがあります。

• AAAS、AAMP、AHI1、AMBRA1、APAF1、ARPC1A、ARPC1B、ATG16L1、
• BOP1、BRWD1、BRWD3、BTRC、BUB3、
• C6orf11、CDC20、CDC40、CDRT1、CHAF1B、CIAO1、CIRH1A、COPA、COPB2、CORO1A、CORO1B、CORO1C、CORO2A、CORO2B、CORO6、CORO7、CSTF1、
• DDB2、DENND3、DMWD、DMXL1、DMXL2、DNAI1、DNAI2、DNCI1、DTL、DYNC1I1、DYNC1I2、EDC4、
• EED、EIF3S2、ELP2、EML1、EML2、EML3、EML4、EML4-ALK、EML5、ERCC8、
• FBXW10、FBXW11、FBXW2、FBXW4、FBXW5、FBXW7、FBXW8、FBXW9、FZR1、
• GBL、GEMIN5、GNB1、GNB1L、GNB2、GNB2L1、GNB3、GNB4、GNB5、GRWD1、GTF3C2、
• HERC1、HIRA、HZGJ、
• IFT121、IFT122、IFT140、IFT172、IFT80、IQWD1、
• KATNB1、KIAA1336、KIF21A、KIF21B、KM-PA-2、
• KEAP1、
• LLGL1、LLGL2、LRBA、LRRK1、LRRK2、LRWD1、LYST、
• MAPKBP1、MED16、MORG1、
• NBEA、NBEAL1、NEDD1、NLE1、NSMAF、NUP37、NUP43、NWD1、
• PAAF1、PAFAH1B1、PAK1IP1、PEX7、 PHIP 、PIK3R4、PLAA、PLRG1、PPP2R2A、PPP2R2B、PPP2R2C、PPP2R2D、 PPWD1 、PREB、PRPF19、PRPF4、PWP1、PWP2、
• RAE1、RPTOR、RBBP4、RBBP5、RBBP7、RFWD2、RFWD3、RRP9、
• SCAP、SEC13、SEC31A、SEC31B、SEH1L、SHKBP1、SMU1、SPAG16、SPG、ストラップ、STRN、STRN3、STRN4、STXBP5、STXBP5L、
• TAF5、TAF5L、TBL1X、TBL1XR1、TBL1Y、TBL2、TBL3、TEP1、THOC3、THOC6、TLE1、TLE2、TLE3、TLE4、TLE6、TRAF7、TSSC1、TULP4、TUWD12、
• UTP15、UTP18、
• WAIT1、WDF3、WDFY1、WDFY2、WDFY3、WDFY4、WDHD1、WDR1、WDR10、WDR11、WDR12、WDR13、WDR16、WDR17、WDR18、WDR19 、 WDR20、WDR21A、WDR21C、WDR22、WDR23、WDR24、WDR25、WDR26 、WDR27、 WDR3、WDR31、WDR32、WDR33、WDR34、WDR35、WDR36、WDR37 、WDR38 、 WDR4 、 WDR40A、WDR40B、WDR40C、WDR41、WDR42A、WDR42B、WDR43、WDR44、WDR46、WDR47、WDR48、WDR49、WDR5、WDR51A、WDR51B、WDR52、WDR53、WDR54、WDR55、WDR57、WDR59、WDR5B 、 WDR6 、 WDR60、WDR61、WDR62、WDR63 、 WDR64、WDR65、WDR66、WDR67、WDR68、WDR69、WDR7、WDR70、WDR72、WDR73、WDR74、WDR75、WDR76、WDR77、WDR78、WDR79、WDR8 、 WDR81、WDR82、WDR85、WDR86、WDR88 、 WDR89、WDR90、WDR91、WDR92、WDSOF1、 WDSUB1、WDTC1、WSB1、WSB2、
• ZFP106

• ベータプロペラ
• トモシン、2つのWD40ドメインを持つタンパク質
• タンパク質タンデムリピート

• 真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス LIG_APCC_Dbox_1
• 真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス LIG_APCC_KENbox_2
• 真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス LIG_COP1
• 真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス LIG_CRL4_Cdt2_1
• 真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス LIG_CRL4_Cdt2_2
• 真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス LIG_EH1_1
• 真核生物線形モチーフリソースモチーフ クラス LIG_GLEBS_BUB3_1
• 真核生物線形モチーフリソースモチーフ クラス LIG_RAPTOR_TOS_1
• 真核生物線形モチーフリソースモチーフ クラス LIG_SCF_FBW7_1
• 真核生物線形モチーフリソースモチーフ クラス LIG_SCF_FBW7_2
• 真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス LIG_SCF-TrCP1_1
• 真核生物線形モチーフリソースモチーフ クラス LIG_WRPW_1
• 真核生物線形モチーフリソースモチーフクラス LIG_WRPW_2
• 真核生物線形モチーフリソースモチーフ クラス TRG_ER_diArg_1
• 真核生物線形モチーフリソースモチーフ クラス TRG_ER_diLys_1
• 真核生物線形モチーフリソースモチーフ クラス TRG_Golgi_diPhe_1
• 真核生物線形モチーフリソースモチーフ クラス TRG_PTS2