WDリピート含有タンパク質77

ＷＤＲ７７
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	4GQB、4X60、4X61、4X63、5EMJ、5EML、5EMM、5FA5、5EMK、5C9Z
識別子
エイリアス	WDR77、MEP-50、MEP50、Nbla10071、p44、p44/Mep50、HKMT1069、WD繰り返しドメイン77
外部ID	オミム：611734; MGI : 1917715;ホモロジーン: 11466;ジーンカード：WDR77; OMA :WDR77 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体1（ヒト）
終わり	111,449,256 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体3（マウス）
終わり	105,877,353 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	右子宮管; ; 心の頂点; ; 腓腹筋; ; 右副腎皮質; ; 太ももの筋肉; ; 食道粘膜; ; 胃の本体; ; 左心室; ; 左副腎; ; 直腸;
	トップの表現
	原始的な線; ; 胚葉上層; ; 体節; ; 胎児の尾; ; 腹壁; ; 心内膜クッション; ; 生殖腺隆起; ; 胚; ; 胚; ; 下顎突出;
	参照表現データの詳細
	; ;
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	メチルCpG結合; タンパク質結合; 核受容体コアクチベーター活性; タンパク質-アルギニンN-メチルトランスフェラーゼ活性;
細胞成分	細胞質; 細胞質; ゴルジ体; メチロソーム; 核質; 核;
生物学的プロセス	RNAポリメラーゼIIによる転写の調節; 前立腺腺房の発達に関与する分泌円柱管腔上皮細胞の分化; 前立腺の発達に関与する上皮細胞増殖の負の調節; 細胞集団増殖の正の調節; 細胞集団増殖の負の調節; ペプチジルアルギニンNメチル化; 核酸テンプレート転写の正の制御; スプライソソーム snRNP アセンブリ;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	79084
	70465
	ENSG00000116455
	ENSMUSG00000000561
	翻訳:
	Q99J09
	NM_024102 ; NM_001317062 ; NM_001317063 ; NM_001317064
	NM_027432
	NP_001303991 ; NP_001303992 ; NP_001303993 ; NP_077007
	NP_081708
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

メチロソームタンパク質50は、ヒトではWDR77遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]^[7]

インタラクション

WDリピート含有タンパク質77はCTDP1 ^[8]およびタンパク質アルギニンメチルトランスフェラーゼ5 ^[5]と相互作用することが示されている。

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000116455 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000000561 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ ab Friesen WJ、Wyce A、Paushkin S、Abel L、Rappsilber J、Mann M、Dreyfuss G (2002 年 3 月)。「メチロソームの新しい WD 繰り返しタンパク質成分が Sm タンパク質に結合する」。J Biol Chem . 277 (10): 8243–7。doi : 10.1074/ jbc.M109984200。PMID 11756452。
^ Andersson B、Wentland MA、Ricafrente JY、Liu W、Gibbs RA (1996 年 6 月)。「改良されたショットガンライブラリ構築のための「ダブルアダプター」法」。Anal Biochem . 236 (1): 107–13. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474。
^ 「Entrez Gene: WDR77 WD リピートドメイン 77」。
^ Licciardo P、Amente Stefano、Ruggiero Luca、Monti Maria、Pucci Piero、Lania Luigi、Majello Barbara (2003 年 2 月)。「FCP1 ホスファターゼは RNA ポリメラーゼ II および snRNP の組み立てに関与するメチロソーム複合体の構成要素である MEP50 と相互作用する」。Nucleic Acids Res . 31 ( 3 )。イギリス: 999–1005。doi :10.1093/nar/gkg197。PMC 149217。PMID 12560496。

さらに読む

Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Yu W, Andersson B, Worley KC, et al. (1997). 「大規模連結cDNAシークエンシング」Genome Res . 7 (4): 353–8. doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). 「全長濃縮および5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
Licciardo P、Amente S、Ruggiero L、他 (2003)。「FCP1 ホスファターゼは RNA ポリメラーゼ II および snRNP の組み立てに関与するメチロソーム複合体の構成要素である MEP50 と相互作用する」。Nucleic Acids Res . 31 (3): 999–1005. doi :10.1093/nar/gkg197. PMC 149217. PMID 12560496 。
太田孝文、鈴木勇、西川孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
Yamada S, Ohira M, Horie H, et al. (2004). 「肝芽腫とそれに対応する正常肝臓の発現プロファイリングと差別的スクリーニング：肝芽腫の予後不良指標としての PLK1 オンコジーンの高発現の特定」。Oncogene . 23 ( 35): 5901–11. doi :10.1038/sj.onc.1207782. PMID 15221005. S2CID 3114318.
Jin J、Smith FD、Stark C、他 (2004)。「細胞骨格調節と細胞組織化に関与する生体内 14-3-3 結合タンパク質のプロテオーム、機能、およびドメインベースの分析」。Curr . Biol . 14 (16): 1436–50. doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660. S2CID 2371325。
Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
Amente S、Napolitano G、Licciardo P、他 (2005)。「RNAPII FCP1 ホスファターゼと相互作用するタンパク質の同定: FCP1 はアルギニンメチルトランスフェラーゼ PRMT5 と複合体を形成し、PRMT5 媒介メチル化の基質となる」。FEBS Lett . 579 (3): 683–9. doi : 10.1016/j.febslet.2004.12.045 . PMID 15670829。
Gregory SG、 Barlow KF、 McLay KE、他 (2006)。「ヒト染色体 1 の DNA 配列と生物学的注釈」。Nature . 441 ( 7091 ): 315–21。Bibcode :2006Natur.441..315G。doi : 10.1038/nature04727。PMID 16710414。
Furuno K, Masatsugu T, Sonoda M, et al. (2006). 「in vitro でヒストン H2A に選択的に結合する WD リピートタンパク質 MEP50 とポリコームグループ SUZ12 の関連」Biochem. Biophys. Res. Commun . 345 (3): 1051–8. doi :10.1016/j.bbrc.2006.05.014. PMID 16712789.
Zhou L, Wu H, Lee P, Wang Z (2007). 「前立腺上皮細胞の成長におけるアンドロゲン受容体補因子p44の役割」J. Mol. Endocrinol . 37 (2): 283–300. doi : 10.1677/jme.1.02062 . PMID 17032745.
Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、et al. (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。
Liang JJ、Wang Z、Chiriboga L、他 (2007)。「発達中の精巣および精巣腫瘍におけるアンドロゲン受容体コアクチベーター p44 およびタンパク質アルギニンメチルトランスフェラーゼ 5 の発現と機能」。J . Urol . 177 (5): 1918–22. doi :10.1016/j.juro.2007.01.017. PMID 17437848。

Rengasamy, M, Zhang, F, Vashisht, A, Song, WM, et al. (2017). 「PRMT5/WDR77 複合体は乳がんにおいて ZNF326 を介して選択的スプライシングを制御する」。Nucleic Acids Res . 45 (19): 11106–11120. doi : 10.1093/nar/gkx727 . PMC 5737218 . PMID 28977470.

外部リンク

PDBe-KBの UniProt : Q9BQA1 (メチロソームタンパク質 50)のPDBで入手可能なすべての構造情報の概要。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000116455 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000000561 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid11756452-5] Friesen WJ、Wyce A、Paushkin S、Abel L、Rappsilber J、Mann M、Dreyfuss G (2002 年 3 月)。「メチロソームの新しい WD 繰り返しタンパク質成分が Sm タンパク質に結合する」。J Biol Chem . 277 (10): 8243–7。doi : 10.1074/ jbc.M109984200。PMID 11756452。

[pmid8619474-6] Andersson B、Wentland MA、Ricafrente JY、Liu W、Gibbs RA (1996 年 6 月)。「改良されたショットガンライブラリ構築のための「ダブルアダプター」法」。Anal Biochem . 236 (1): 107–13. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474。

[entrez-7] 「Entrez Gene: WDR77 WD リピートドメイン 77」。

[pmid12560496-8] Licciardo P、Amente Stefano、Ruggiero Luca、Monti Maria、Pucci Piero、Lania Luigi、Majello Barbara (2003 年 2 月)。「FCP1 ホスファターゼは RNA ポリメラーゼ II および snRNP の組み立てに関与するメチロソーム複合体の構成要素である MEP50 と相互作用する」。Nucleic Acids Res . 31 ( 3 )。イギリス: 999–1005。doi :10.1093/nar/gkg197。PMC 149217。PMID 12560496。