CSTF1

CSTF1
識別子
エイリアス	CSTF1、CstF-50、CstFp50、切断刺激因子サブユニット1
外部ID	オミム：600369; MGI : 1914587;ホモロジーン: 1012;ジーンカード：CSTF1; OMA :CSTF1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体20（ヒト）
終わり	56,406,362 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体2（マウス）
終わり	172,224,368 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	睾丸; ; 二次卵母細胞; ; アキレス腱; ; 生殖腺; ; ランゲルハンス島; ; 子宮内膜間質細胞; ; 心室帯; ; 直腸; ; 顆粒球; ; 膵臓の体;
	トップの表現
	精子細胞; ; 精細管; ; 精母細胞; ; 卵黄嚢; ; 胚葉上層; ; 心室帯; ; 二次卵母細胞; ; 回腸上皮; ; 胎児の尾; ; 胚;
	参照表現データの詳細
	; ;
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	タンパク質結合; RNA結合;
細胞成分	核; 核質; mRNA切断刺激因子複合体;
生物学的プロセス	スプライソソームを介したmRNAスプライシング; RNAポリメラーゼII転写の終結; mRNA処理; mRNA 3'末端処理;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	1477
	67337
	ENSG00000101138
	ENSMUSG00000027498
	Q05048
	Q99LC2
	NM_001033521 ; NM_001033522 ; NM_001324
	NM_024199
	NP_001028693 ; NP_001028694 ; NP_001315
	NP_077161
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

切断刺激因子50kDaサブユニットは、ヒトではCSTF1遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]^[7]

この遺伝子は、切断刺激因子（CSTF）を形成するために結合する3つのサブユニットのうちの1つをコードしています。CSTFは、プレmRNAのポリアデニル化と3'末端切断に関与しています。哺乳類のGタンパク質ベータサブユニットと同様に、このタンパク質にはトランスデューシン様反復が含まれています。この遺伝子には、異なる 5' UTRを持ちながら同じタンパク質をコードするいくつかの転写変異体が見つかっています。^[7]

インタラクション

CSTF1はBARD1と相互作用することが示されている。^[6]^[8]

参考文献

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外部リンク

UCSC ゲノムブラウザのヒト CSTF1 ゲノムの位置と CSTF1 遺伝子の詳細ページ。

さらに読む

Takagaki Y, MacDonald CC, Shenk T, Manley JL (1992 年 2 月)。「ヒト 64 kDa ポリアデニル化因子には、リボ核タンパク質型 RNA 結合ドメインと珍しい補助モチーフが含まれている」。米国科学アカデミー紀要。89 (4): 1403–7。Bibcode : 1992PNAS ... 89.1403T。doi : 10.1073 / pnas.89.4.1403。PMC 48459。PMID 1741396。
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[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000027498 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

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[entrez-7] 「Entrez Gene: CSTF1 切断刺激因子、3' pre-RNA、サブユニット 1、50kDa」。

[pmid10477523-8] ^ Kleiman FE、Manley JL (1999 年 9 月)。「 BRCA1関連 BARD1 とポリアデニル化因子 CstF-50 の機能的相互作用」。Science . 285 (5433): 1576–9. doi :10.1126/science.285.5433.1576. PMID 10477523。