NBEAL1は、ヒトではNBEAL1遺伝子 によってコードされるタンパク質である。[ 1 ]これは、ヒトの2q33.2染色体上に存在する。
| ニューロビーチン様タンパク質1 | |||||||
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| 識別子 | |||||||
| シンボル | NBEAL1 | ||||||
| 別名 | ALS2CR16 ALS2CR17 | ||||||
| NCBI遺伝子 | 65065 | ||||||
| HGNC | 20681 | ||||||
| OMIM | 609816 | ||||||
| UniProt | Q6ZS30 | ||||||
| その他のデータ | |||||||
| 軌跡 | Chr. 2 q33.2 | ||||||
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このタンパク質のさまざまなドメインを通じて、NBEAL1 の機能は、小胞輸送、膜ダイナミクス、受容体シグナル伝達、pre-mRNA プロセシング、シグナル伝達、細胞骨格構築などの細胞メカニズムに関与すると予測されています。[ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] NBEAL1 は、筋萎縮性側索硬化症 2 染色体領域、ALS2CR16、ALS2CR17 としても知られています。[ 1 ]

このタンパク質のmRNAは、9058塩基対の直線配列からなり、コード配列は334番目の塩基対から始まり、8418番目の塩基対まで伸びています。[ 5 ] 翻訳されたタンパク質は、合計56個のエクソンからなり、最終的な長さは2694個のアミノ酸です。[ 6 ]現在、ヒトには9種類のアイソフォームが知られています。[ 3 ]
Neurobeachin-like1は、DUF4704、DUF4800、PH_BEACH、Beach、WD40リピートの5つのドメインを含んでいます。[ 6 ]
DUF4704は機能不明のドメインです。このドメインの機能は不明ですが、真核生物のニューロビーチンタンパク質内で保存されています。[ 4 ]アミノ酸859から始まり、1115まで続きます。[ 3 ]
DUF4800は機能が不明なドメインです。アミノ酸1580から始まり、1833まで続きます。[ 3 ]機能は不明ですが、真核生物内に存在します。[ 7 ]
アミノ酸1886からアミノ酸1983まで続くこのドメインは、BEACHドメイン内のプレクストリン相同性ドメインと呼ばれています。[ 8 ]このドメインの折り畳みがPHドメインに似ているためPHドメインと呼ばれますが、標準的なPHドメインの配列とは同一ではありません。PH_BEACHドメインはリン脂質に結合できません。[ 9 ]
Beige and Chediak-Higashi (BEACH) ドメインは、このタンパク質内で最も重要なドメインの 1 つです。このドメインは高度に保存された約 280 アミノ酸のドメインで、9 種類のヒト BEACH ドメインに存在します。[ 10 ]配列では PH_BEACH ドメインの後に位置しています。BEACH ドメイン内の BDCP タンパク質の正確な機能についてはあまり理解されていませんが、細胞機構内で多くの目的を果たしていることが知られています。小胞輸送、アポトーシス、膜ダイナミクス、受容体シグナル伝達などです。[ 10 ]このタンパク質ファミリーは、このドメインの変異が複数のヒト疾患で確認されているため、現在臨床的に非常に重要です。たとえば、neurobeachin-like1 はグリオーマで上方制御されています。グリオーマの病理学的グレードが上がるにつれて、neurobeachin-like1 の発現は減少します。[ 2 ] NBEAL1では、これはPH_BEACHドメインに続き、アミノ酸2005から始まり、アミノ酸2284で終わります。[ 3 ]
NBEAL1には、NBEAL1内に1つのWD40ドメインがあります。アミノ酸2409から2682までがWD40ドメイン全体です。ドメイン内の2406から2439までには、構造モチーフWD40リピートがあります。WD40ドメインは、複数の機能を持つ多くの真核生物タンパク質に見られます。これには、シグナル伝達、pre-mRNAプロセシング、細胞骨格構築におけるアダプター/調節モジュールなどが含まれますが、これらに限定されません。[ 3 ]
NBEAL1の二次構造は、 αヘリックス、βシート、ランダムコイルの組み合わせであると予測されている。[ 13 ]


I-TASSERはNBEAL1の3D構造を予測するために使用されました。[ 14 ] NBEAL1は入力可能なアミノ酸長よりも長いため、タンパク質全体の構造を予測するために半分に分割されました。
以下の文書は、翻訳後修飾の様々な例を示しています。

Unigene を介した EST 存在量プロファイルを使用して、NBEAL1 の発現は身体部位と健康状態の両方に基づいて発見されました。[ 15 ] NBEAL1 は、脳、胚組織、眼、腸、腎臓、肝臓、肺、乳腺、卵巣、膵臓、咽頭、胎盤、前立腺、皮膚、胃、精巣、甲状腺、気管で発現しています。転写産物数/百万に基づくと、発現は胃で最も高く、62 転写産物/百万であり、膵臓と気管がそれに続き、それぞれ 37 転写産物/百万と 38 転写産物/百万です。最も低い転写産物/百万は、脳、眼、胎盤、精巣で、すべて 4 転写産物/百万です。さまざまな健康状態による内訳を見ると、NBEAL1 は複数の腫瘍で高発現しています。[ 15 ]ここでも、存在量は胃腸腫瘍で最も高く、胃内の NBEAL1 の高発現と相関しています。しかし、NBEAL1の発現は膵臓腫瘍では見られないため、膵臓内での機能に何らかの意味があるのかもしれません。発現量は発生段階によって異なり、胎児期が最も多く100万転写産物あたり21転写産物、成人期は100万転写産物あたり14転写産物となっています。
NBEAL1の機能は科学界ではまだ十分に解明されていません。しかし、さまざまなドメインの機能と疾患との関連性を考慮すると、NBEAL1タンパク質はさまざまな機能に関与している可能性があると予測されます。現在までに、タンパク質間相互作用、小胞輸送、膜ダイナミクス、受容体シグナル伝達、アポトーシス、シグナル伝達におけるアダプター/調節モジュール、pre-mRNAプロセシング、細胞骨格構築などが含まれますが、これらに限定されません。[ 3 ] [ 2 ]
このタンパク質は、筋萎縮性側索硬化症、若年性腺癌[ 1 ]と関連付けられていますが、これらの疾患における機能はまだ特定されていません。
Neurobeachin-like1 は高度に保存されたタンパク質です。爬虫類、鳥類、両生類、哺乳類、魚類、および少数の無脊椎動物を含む多くの生物に相同体が存在します。以下の表は、BLAST [ 16 ]および BLAT [ 17 ]での検索を使用して見つかった相同体の一部を示しています。

GeneCardsによると、NBEAL1にはNBEAL2、WDFY3、NBEA、LRBA、リソソーム輸送調節因子(LYST)、およびWDFY3といういくつかのパラログがあります。 [ 19 ]下の表はNBEAL1のパラログをまとめたものです。

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