ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
SEC31A 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス SEC31A 、ABP125、ABP130、HSPC334、SEC31L1、HSPC275、SEC31ホモログA、COPIIコート複合体成分、NEDSOSB、HPBKS 外部ID オミム ：610257; MGI : 1916412; ホモロジーン : 42056; ジーンカード ：SEC31A; OMA :SEC31A - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 5番染色体（マウス） [2] バンド 5|5 E4 始める 100,509,508 bp [2] 終わり 100,564,093 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 小腸粘膜 膵管細胞 膵臓の体 脛骨 アキレス腱 子宮内膜間質細胞 結腸上皮 歯周繊維 左卵巣 右卵巣
トップの表現 頭蓋冠 胎児の尾 臼歯 性器結節 受精卵 十二指腸 卵黄嚢 リップ 耳下腺 二次卵母細胞
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
タンパク質結合 カルシウム依存性タンパク質結合 構造分子活性 細胞成分
COPII被覆ERからゴルジ体輸送小胞へ 細胞質小胞 ERからゴルジ体への輸送小胞膜 細胞内膜で囲まれた細胞小器官 細胞質の核周囲領域 膜 小胞体 細胞質 小胞体出口部位 小胞体膜 ベシクルコート ゴルジ膜 細胞質 COPII ベシクルコート 生物学的プロセス
IRE1を介した未折り畳みタンパク質応答 カルシウムイオンに対する反応 COPII小胞コーティング 小胞輸送 MHCクラスIIを介した抗原処理と外因性ペプチド抗原の提示 タンパク質輸送 MHCクラスIを介した抗原処理とペプチド抗原の提示 小胞体からゴルジ小胞を介した輸送 COPII被覆小胞貨物積載 細胞内タンパク質輸送 COPII被覆小胞の出芽 小胞体組織 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001077206 NM_001077207 NM_001077208 NM_001191049 NM_001300744 NM_001300745 NM_014933 NM_016211 NM_001318119 NM_001318120
NM_026969 NM_001359323 NM_001359332 NM_001359344 NM_001359348 NM_001359349 NM_001359350 NM_001400516 NM_001400517
RefSeq (タンパク質) NP_001070674 NP_001070675 NP_001070676 NP_001177978 NP_001287673 NP_001287674 NP_001305048 NP_001305049 NP_057295
NP_081245 NP_001346252 NP_001346261 NP_001346273 NP_001346277 NP_001346278 NP_001346279 NP_001387445 NP_001387446
場所 (UCSC) 4 章: 82.82 – 82.9 Mb 5 章: 100.51 – 100.56 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
タンパク質輸送タンパク質Sec31A は、ヒトでは SEC31A 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6] [7]
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、 酵母 の SEC31 タンパク質に類似している。酵母のSEC31タンパク質は、小胞体（ER）からの小胞出芽を担う COPII タンパク質複合体の成分であることが知られている。このタンパク質は、小胞輸送機能に対応する細胞内構造において、COPIIの他の成分の1つであるSEC13と共局在することが判明した。免疫除去実験により、このタンパク質がER-ゴルジ輸送に必要であることが確認された。 選択的スプライシング により、異なるアイソフォームをコードする複数の転写バリアントが生じる。 [7]
ハルペリン・バーク症候群 （HLBKS）は、SEC31A遺伝子のヌル変異によって引き起こされる、まれな常染色体劣性神経発達障害です。 [8]
参考文献
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さらに読む
Maruyama K, Sugano S (1994年1月). 「オリゴキャッピング: 真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」. Gene . 138 (1–2): 171–174. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298. Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997年10月). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–156. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149. Kim JH、Hong JA、Pih KT 、 Hwang I (2001 年 4 月)。「浸透圧ストレスを受けたヒト口腔ケラチノサイトで発現が異なる遺伝子の同定と分離」。Archives of Oral Biology。46 ( 4): 335–341。doi :10.1016/S0003-9969(00)00133-3。PMID 11269867 。 Wistow G、Bernstein SL、Wyatt MK、Fariss RN、Behal A、Touchman JW、他 (2002 年 6 月)。「NEIBank プロジェクトのためのヒト RPE/脈絡膜の発現配列タグ分析: 6000 を超える非冗長転写産物、新規遺伝子、スプライスバリアント」 。Molecular Vision。8 : 205–220。PMID 12107410 。 Gevaert K、Goethals M、Martens L、Van Damme J、Staes A、Thomas GR、Vandekerckhove J (2003 年 5 月)。「分類された N 末端ペプチドの質量分析によるプロテオームの探索とタンパク質処理の分析」。Nature Biotechnology。21 ( 5 ) : 566–569。doi : 10.1038/nbt810。PMID 12665801。S2CID 23783563。 Loïodice I、Alves A、Rabut G、Van Overbeek M、Ellenberg J、Sibarita JB、Doye V (2004 年 7 月)。「3 つの新しいメンバーを含む Nup107-160 複合体全体が、有糸分裂でキネトコアに 1 つの実体として標的化される」。Molecular Biology of the Cell。15 ( 7): 3333–3344。doi :10.1091/ mbc.E03-12-0878。PMC 452587。PMID 15146057 。 パナゴプロス I、ニルソン T、ドマンスキー HA、アイサクソン M、リンドブロム P、メルテンス F、マンダール N (2006 年 3 月)。 「炎症性筋線維芽細胞性腫瘍における SEC31L1 遺伝子と ALK 遺伝子の融合」。 国際がんジャーナル 。 118 (5): 1181–1186。 土井 ： 10.1002/ijc.21490 。 PMID 16161041。S2CID 6860211 。 Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, et al. (2006年1月). 「転写調節の多様化：ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模な同定と特徴付け」. Genome Research . 16 (1): 55–65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560 . Stagg SM、Gürkan C、Fowler DM、 LaPointe P、Foss TR、Potter CS、他 (2006 年 1 月)。「Sec13/31 COPII コートケージの構造」。Nature . 439 ( 7073 ): 234–238。Bibcode :2006Natur.439..234S。doi : 10.1038/nature04339。PMID 16407955。S2CID 2426465 。 Yamasaki A, Tani K, Yamamoto A, Kitamura N, Komada M (2006 年 11 月)。「Ca2+ 結合タンパク質 ALG-2 は Sec31A によって小胞体出口部位にリクルートされ、Sec31A の局在を安定化する」。Molecular Biology of the Cell。17 ( 11 ): 4876–4887。doi :10.1091/ mbc.E06-05-0444。PMC 1635383。PMID 16957052 。 柴田 秀、鈴木 秀、吉田 秀、牧 正 (2007 年 2 月)。「ALG-2 は Sec31A に直接結合し、Ca2+ 依存的に小胞体出口部位に局在する」。 生化学 および 生物物理学的研究通信 。353 (3): 756–763。doi :10.1016/j.bbrc.2006.12.101。PMID 17196169 。 la Cour JM、Mollerup J、 Berchtold MW (2007 年 2 月)。「ALG-2 は細胞内局在において、カルシウム振動と一時間的に振動する」。 生化学および生物物理学的研究通信 。353 (4): 1063–1067。doi : 10.1016/j.bbrc.2006.12.143。PMID 17214967 。
