WDR57

SNRNP40
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	3JCR
識別子
エイリアス	SNRNP40、40K、HPRP8BP、PRP8BP、PRPF8BP、SPF38、WDR57、小核リボ核タンパク質U5サブユニット40
外部ID	OMIM : 607797; MGI : 1913835; HomoloGene : 3538; GeneCards : SNRNP40; OMA :SNRNP40 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体1（ヒト）
終わり	31,296,788 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	染色体4（マウス）
終わり	130,283,819 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	神経節隆起; ; 心室帯; ; 横行結腸粘膜; ; 小脳半球; ; C1セグメント; ; 下垂体前葉; ; 小脳の右半球; ; 子宮頸管; ; 右卵巣; ; 脛骨神経;
	トップの表現
	胚葉上層; ; 心室帯; ; 性器結節; ; 胎児の尾; ; 神経節隆起; ; 胚; ; 胚; ; 神経管; ; 中脳; ; 骨髄;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	タンパク質結合; RNA結合;
細胞成分	sno(s)RNA含有リボ核タンパク質複合体; U5 スナバ; 触媒ステップ 2 スプライソソーム; スプライソソーム複合体; 前触媒スプライソソーム; 核; 核質; 細胞質; 核の粒; U2型触媒ステップ2スプライソソーム;
生物学的プロセス	エステル交換反応によるRNAスプライシング; スプライソソームを介したmRNAスプライシング; mRNA処理; RNA処理; RNAスプライシング;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	9410
	66585
	ENSG00000060688
	ENSMUSG00000074088
	Q96DI7
	Q6PE01
	NM_004814
	NM_025645
	NP_004805
	NP_079921
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

WDリピートドメイン57（U5 snRNP特異的）はWDR57としても知られ、ホモ・サピエンス、ニホンザル、ネズミ、イヌ、ウシ、ハツカネズミ、ドブネズミなど多くの生物に見られる遺伝子である。^[5]

関数

この遺伝子は、U5小核リボ核タンパク質（snRNP）粒子の成分をコードしています。U5 snRNPは、プレメッセンジャーRNAからイントロンを除去する触媒作用を持つ多タンパク質複合体であるスプライソソームの一部です。^[5]

インタラクション

WDR57はPRPF8 ^[6]^[7]およびEFTUD2と相互作用することが示されている。^[6]^[7]

参考文献

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^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000074088 – Ensembl、2017 年 5 月
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さらに読む

Turner IA、Norman CM、 Churcher MJ、Newman AJ (2004 年 12 月)。「スプライソソームのダイナミクスと触媒作用における U5 snRNP の役割」。生化学協会論文集。32 (パート 6): 928–31。doi :10.1042/BST0320928。PMID 15506927 。
Neubauer G、King A、Rappsilber J、Calvio C、Watson M、Ajuh P、Sleeman J、Lamond A、Mann M (1998 年 9 月)。「質量分析と EST データベース検索により、多タンパク質スプライソソーム複合体の特性を解明」。Nature Genetics。20 ( 1 ) : 46–50。doi : 10.1038/1700。PMID 9731529。S2CID 585778。
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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000060688 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000074088 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[entrez-5] "Entrez Gene: WDR57 WD リピートドメイン 57 (U5 snRNP 固有)"。

[pmid17353931-6] Ewing RM、Chu P、Elisma F、Li H、Taylor P、Climie S、McBroom-Cerajewski L、Robinson MD、O'Connor L、Li M、Taylor R、Dharsee M、Ho Y、Heilbut A、Moore L、Zhang S、Ornatsky O、Bukhman YV、Ethier M、Sheng Y、Vasilescu J、Abu-Farha M、Lambert JP、Duewel HS、Stewart II、Kuehl B、Hogue K、Colwill K、Gladwish K、Muskat B、Kinach R、Adams SL、Moran MF、Morin GB、Topaloglou T、Figeys D (2007)。「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」。分子システム生物学。3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 .

[pmid9774689-7] Achsel T、Ahrens K、Brahms H、Teigelkamp S、Lührmann R (1998 年 11 月)。「ヒト U5-220kD タンパク質 (hPrp8) は、RNA アンワインダーゼ、リボソーム伸長因子 EF-2 の相同体、および新規 WD-40 タンパク質を含むいくつかの U5 特異的タンパク質と安定した RNA フリー複合体を形成する」。分子細胞生物学。18 ( 11): 6756–66。doi :10.1128/mcb.18.11.6756。PMC 109259。PMID 9774689 。