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（参照：人体のタンパク質一覧）WDR75は、 WD40スーパーファミリードメインを含むWDR75遺伝子[1]によってコードされるヒトタンパク質です。 [2] WD40ドメインは多くの真核細胞型に見られ、 premRNAの処理や細胞骨格の組み立てなどの細胞調節機能に関与していることが知られています。 [3] WDR75タンパク質の機能は科学界では定義されていません。
タンパク質配列
アミノ酸配列は830残基から成り、酸性末端を含む。[4]
1 MVEENIRVV RCGGSELNFR RAVFSADSKY IFCVSGDFVK VYSTVTEECV HILHGHRNLV 61 TGIQLNPNNH LQLYSCSLDG TIKLWDYIDG ILIKTFIVGC KLHALFTLAQ AEDSVFVIVN 121 ケクPDIFQLV SVKLPKSSSQ EVEAKELSFV LDYINQSPKC IAFGNEGVYV AAVREFYLSV 181 YFFKKKTTSR FTLSSSRNKK HAKNNFTCVA CHPTEDCIAS GHMDGKIRLW RNFYDDKKYT 241 YTCLHWHHDM VMDLAFSVTG TSLLSGGRES VLVEWRDATE KNKEFLPRLG ATIEHISVSP 301 AGDLFCTSHS DNKIIIIHRN LEASAVIQGL VKDRSIFTGL MIDPRTKALV LNGKPGHLQF 361 YSLQSDKQLY NLDIIQQEYI NDYGLIQIEL TKAAFGCFGN WLATVEQRQE KETELELQMK 421 LWMYNKKTQG FILNTKINMP HEDCITALCF CNAEKSEQPT LVTASKDGYF KVWILTDDSD 481 IYKKAVGWTC DFVGSYHKYQ ATNCCFSEDG SLAVSFEEI VTIWDSVTWE LKCTFCQRAG 541 KIRHLCFGRL TCSKYLLGAT ENGILCCWNL LSCALEWNAK LNVRVMEPDP NSENIAAISQ 601 SSVGSDLFVF KPSEPRPLYI QKGISREKVQ WGVFVPRDVP ESFTSEAYQW LNRSQFYFLT 661 KSQSLLTFST KSPEEKLTPT SKQLLAEESL PTTPFYFILG KHRQQQDEKL NETLENELVQ 721 LPLTENIPAI SELLHTPAHV LPSAAFLCSM FVNSLLLSKE TKSAKEIPED VDMEEKESE 781 DSDEENDFTE KVQDTSNTGL GEDIIHQLSK SEEKELRKFR KIDYSWIAAL
二次構造
二次構造はαヘリックスとβストランドが交互に含まれると予測されている[4] 。ヘリックスターンヘリックス（HTH）領域は予測されていない。
相同性
ヒト遺伝子には既知の相同遺伝子は存在しない。WDR75のウシ、マウス、ラット相同遺伝子には相同遺伝子は見つかっていない。[5]ヒト遺伝子に対する哺乳類相同遺伝子間の保存性は高く、相同遺伝子間の最小同一性は76%であった。次の表は、脊椎動物および無脊椎動物相同遺伝子の一部をまとめたものである。位置340～390、430～450、および515～530の特定のアミノ酸の保存性はすべて、予測されるαヘリックスと相関している。[4]
参考文献
- ^ ab "Entrez Gene:WDR75 WD repeat domain 75" . 2009年5月3日閲覧。
- ^ 「BLAST」 。 2009年5月6日閲覧。
- ^ 「CDD:保存ドメインとタンパク質分類データベース」。
- ^ abc SDSC 生物学ワークベンチ 2.0
- ^ 「BLAT Search Genome」 。 2009年5月7日閲覧。
- ^ 「WDリピート含有タンパク質75 [Bos taurus] - タンパク質 - NCBI」。
- ^ 「WDリピート含有タンパク質75 [Mus musculus] - タンパク質 - NCBI」。
- ^ 「WDリピート含有タンパク質75 [Pan troglodytes] - タンパク質 - NCBI」。
- ^ 「WDリピート含有タンパク質75 [Rattus norvegicus] - タンパク質 - NCBI」。
- ^ 「WDリピート含有タンパク質75 [Canis lupus familiaris] - タンパク質 - NCBI」。
- ^ 「WDリピート含有タンパク質75 [アフリカツメガエル] - タンパク質 - NCBI」。
- ^ 「予測：WDリピート含有タンパク質75 [Gallus gallus] - タンパク質 - NCBI」。
- ^ 「U3 snoRNP関連タンパク質Nan1 [Schizosaccharomyces pombe 972h-] - タンパク質 - NCBI」。
- ^ 「AGAP007948-PA、部分的 [Anopheles gambiae STR. PEST] - タンパク質 - NCBI」。