ＰＲＰＦ１９

ＰＲＰＦ１９
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	4LG8
識別子
エイリアス	PRPF19、NMP200、PRP19、PSO4、SNEV、UBOX4、hPSO4、pre-mRNAプロセッシングファクター19
外部ID	オミム：608330; MGI : 106247;ホモロジーン: 6421;ジーンカード：PRPF19; OMA :PRPF19 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体11（ヒト）
終わり	60,906,585 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	19番染色体（マウス）
終わり	10,886,923 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	ポンス; ; 右前頭葉; ; ブロードマン領域9; ; 心室帯; ; 神経節隆起; ; 前頭前皮質; ; 小脳半球; ; 小脳の右半球; ; 下垂体前葉; ; ランゲルハンス島;
	トップの表現
	大動脈弁; ; 原始的な線; ; 運動ニューロン; ; 上行大動脈; ; 窩; ; 右心室; ; 胚葉上層; ; パネートセル; ; 顔面運動核; ; 足首;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	ユビキチンタンパク質リガーゼ活性; ユビキチンタンパク質転移酵素活性; ユビキチン-ユビキチンリガーゼ活性; タンパク質結合; 同一のタンパク質結合; トランスフェラーゼ活性;
細胞成分	二本鎖切断部位; 核の粒; 触媒ステップ 2 スプライソソーム; 膜; 脂肪滴; スピンドル; Prp19複合体; DNA複製因子A複合体; スプライソソーム複合体; 細胞骨格; 核; 細胞質; 核質; U2型触媒ステップ1スプライソソーム; U2型触媒ステップ2スプライソソーム;
生物学的プロセス	スプライソソームを介したmRNAスプライシング; スプライソソームトリ-snRNP複合体の組み立て; 脂質生合成プロセス; ニューロン分化の負の調節; アストロサイト分化の正の調節; スプライソソームを介したmRNAスプライシングの正の調節; タンパク質K63結合ユビキチン化; mRNA処理; タンパク質ポリユビキチン化; 内部細胞塊細胞増殖; DNA損傷刺激に対する細胞反応; スプライソソーム複合体の組み立て; タンパク質のユビキチン化; プロテアソームタンパク質分解プロセス; 転写連動ヌクレオチド除去修復; 非相同末端結合による二本鎖切断の修復; DNA修復; RNAスプライシング; 最初のエステル交換反応段階のための触媒スプライソソームの生成; ニューロン分化の正の調節;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	27339
	28000
	ENSG00000110107
	ENSMUSG00000024735
	Q9UMS4
	Q99KP6
	NM_014502
	NM_001253843 ; NM_001253844 ; NM_134129
	NP_055317
	NP_001240772 ; NP_001240773 ; NP_598890
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

プレmRNA処理因子19は、ヒトではPRPF19遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]

S. cerevisiaeでは、Pso4はDNA組み換えとエラーを起こしやすい非相同末端結合DNA修復において多面的な機能を果たす。[OMIM提供] ^[6]

インタラクション

PRPF19はCDC5Lと相互作用することが示されている。^[7]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000110107 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000024735 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Mahajan KN、Mitchell BS (2003 年 9 月)。「哺乳類の DNA 修復におけるヒト Pso4 の役割と末端デオキシヌクレオチド転移酵素との関連」。Proc Natl Acad Sci USA。100 ( 19): 10746–51。Bibcode : 2003PNAS..10010746M。doi : 10.1073/ pnas.1631060100。PMC 196874。PMID 12960389。
^ ab "Entrez Gene: PRPF19 PRP19/PSO4 pre-mRNAプロセシング因子19ホモログ（S. cerevisiae）".
^ Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (2000年12月). 「ヒトCDC5L複合体の機能分析と質量分析によるその成分の同定」. EMBO J. 19 ( 23): 6569–81. doi :10.1093/emboj/19.23.6569. ISSN 0261-4189. PMC 305846. PMID 11101529 .

さらに読む

Gerner C, Holzmann K, Meissner M, et al. (1999). 「ヒト核マトリックスタンパク質分画におけるタンパク質およびシャペロンの再構築」J. Cell. Biochem . 74 (2): 145–51. doi :10.1002/(SICI)1097-4644(19990801)74:2<145::AID-JCB1>3.0.CO;2-#. PMID 10404385. S2CID 196598497.
Gotzmann J、Gerner C、Meissner M、et al. (2000)。「hNMP 200: 構造機能と調節機能を兼ね備えた新しいヒト共通核マトリックスタンパク質」。Exp . Cell Res . 261 (1): 166–79. doi :10.1006/excr.2000.5025. PMID 11082287。
Andersen JS、Lyon CE、Fox AH、et al. (2002)。「ヒト核小体の指向性プロテオーム解析」。Curr . Biol . 12 ( 1 ) : 1–11。Bibcode :2002CBio...12....1A。doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9。PMID 11790298。S2CID 14132033。
Jurica MS、Licklider LJ、Gygi SR 、 et al. (2002)。「3次元構造解析に適したネイティブスプライソソームの精製と特性評価」。RNA。8 ( 4 ) : 426–39。doi : 10.1017 /S1355838202021088。PMC 1370266。PMID 11991638。
Scherl A, Couté Y, Déon C, et al. (2003). 「ヒト核小体の機能的プロテオーム解析」Mol. Biol. Cell . 13 (11): 4100–9. doi :10.1091/mbc.E02-05-0271. PMC 133617 . PMID 12429849.
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
Makarova OV、Makarov EM、Urlaub H、et al. (2004)。「Prp19 を含むヒト 35S U5 タンパク質のサブセットは、スプライシングの触媒ステップ 1 の前に機能します。」EMBO J. 23 ( 12): 2381–91. doi :10.1038/sj.emboj.7600241. PMC 423283. PMID 15175653 。
Jin J、Smith FD、Stark C、他 (2004)。「細胞骨格調節と細胞組織化に関与する生体内 14-3-3 結合タンパク質のプロテオーム、機能、およびドメインベースの分析」。Curr . Biol . 14 ( 16 ): 1436–50。Bibcode : 2004CBio ...14.1436J。doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051。PMID 15324660。S2CID 2371325 。
Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
Andersen JS 、Lam YW、Leung AK 、他 (2005)。「核小体プロテオームダイナミクス」。Nature . 433 ( 7021 ): 77–83。Bibcode :2005Natur.433...77A。doi : 10.1038/nature03207。PMID 15635413。S2CID 4344740。
Löscher M、Fortschegger K、Ritter G、et al. (2005)。「U-box E3リガーゼSNEVと20Sプロテアソームのベータ7サブユニットPSMB4との相互作用」。Biochem . J. 388 ( Pt 2): 593–603. doi :10.1042/BJ20041517. PMC 1138967. PMID 15660529 。
Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
Zhang N、Kaur R、Lu X、et al. (2006)。「Pso4 mRNAスプライシングおよびDNA修復複合体は、DNA鎖間架橋の処理のためにWRNと相互作用する」。J . Biol. Chem . 280 (49): 40559–67. doi : 10.1074/jbc.M508453200 . PMID 16223718。
Grillari J、Ajuh P、Stadler G、et al. (2005)。「SNEV は進化的に保存されたスプライシング因子であり、そのオリゴマー化はスプライソソームの組み立てに必須である」。Nucleic Acids Res . 33 (21): 6868–83. doi :10.1093/nar/gki986. PMC 1310963 . PMID 16332694。
Voglauer R、Chang MW、Dampier B、et al. (2006)。「SNEV の過剰発現はヒト内皮細胞の寿命を延ばす」。Exp . Cell Res . 312 (6): 746–59. doi :10.1016/j.yexcr.2005.11.025. PMID 16388800。
Lu X、Legerski RJ (2007)。「Prp19/Pso4コア複合体はDNA損傷に反応してユビキチン化と構造変化を起こす」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 354 (4): 968–74. doi :10.1016/j.bbrc.2007.01.097. PMC 1810354. PMID 17276391 。
Fortschegger K、Wagner B、Voglauer R、他 (2007)。「必須タンパク質 SNEV を欠くマウスの早期胎児致死」。Mol . Cell. Biol . 27 (8): 3123–30. doi :10.1128/MCB.01188-06. PMC 1899945. PMID 17283042 。
Ewing RM、Chu P、Elisma F、他 (2007)。「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」。Mol . Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000110107 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000024735 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid12960389-5] ^ Mahajan KN、Mitchell BS (2003 年 9 月)。「哺乳類の DNA 修復におけるヒト Pso4 の役割と末端デオキシヌクレオチド転移酵素との関連」。Proc Natl Acad Sci USA。100 ( 19): 10746–51。Bibcode : 2003PNAS..10010746M。doi : 10.1073/ pnas.1631060100。PMC 196874。PMID 12960389。

[entrez-6] "Entrez Gene: PRPF19 PRP19/PSO4 pre-mRNAプロセシング因子19ホモログ（S. cerevisiae）".

[pmid11101529-7] Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (2000年12月). 「ヒトCDC5L複合体の機能分析と質量分析によるその成分の同定」. EMBO J. 19 ( 23): 6569–81. doi :10.1093/emboj/19.23.6569. ISSN 0261-4189. PMC 305846. PMID 11101529 .