ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ジェミン5 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | GEMIN5、GEMIN-5、gem 核小器官関連タンパク質 5、NEDCAM |
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| 外部ID | オミム:607005; MGI : 2449311;ホモロジーン: 9155;ジーンカード:GEMIN5; OMA :GEMIN5 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 11番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 11|11 B1.3 | 始める | 58,010,828 bp [2] |
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| 終わり | 58,059,365 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 卵母細胞
- 二次卵母細胞
- 前脛骨筋
- 生殖腺
- 三角筋
- 心室帯
- 上腕二頭筋
- 上腕二頭筋の骨格筋組織
- 腓腹筋
- 大腿四頭筋
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| | トップの表現 | - 精母細胞
- 精子細胞
- 胚葉上層
- 胎児の尾
- 精細管
- 内頸動脈
- 桑実胚
- 桑実胚
- 性器結節
- 腸絨毛
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- snRNA結合
- タンパク質結合
- RNA 7-メチルグアノシンキャップ結合
- mRNA 3'-UTR結合
- U1 snRNA結合
- U4 snRNA結合
- U4atac snRNA結合
- リボソーム結合
- RNA結合
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- SMN複合体
- SMN-Smタンパク質複合体
- 細胞質
- 核体
- 膜
- コイル状の体の双子座
- 核質
- 核
- 細胞質大リボソームサブユニット
- SMN-Gemin2複合体
| | 生物学的プロセス |
- スプライソソームを介したmRNAスプライシング
- mRNA処理
- RNAスプライシング
- スプライソソーム snRNP アセンブリ
- 核にインポートする
- タンパク質生合成
- 翻訳の規制
- タンパク質を含む複合体アセンブリ
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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NM_001166669 NM_001166670 NM_001166671 NM_172558 NM_001374702 |
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| RefSeq (タンパク質) | | |
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NP_001160141 NP_001160142 NP_001160143 NP_766146 NP_001361631 |
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| 場所 (UCSC) | 5 章: 154.89 – 154.94 Mb | 11 章: 58.01 – 58.06 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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ジェム関連タンパク質5は、ヒトではGEMIN5遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
ジェム関連タンパク質5は、細胞質と核の両方に局在する大きなタンパク質複合体であるSMNの一部であり、小さな核リボ核タンパク質(snRNP)の細胞質アセンブリに役割を果たします。この複合体の他のメンバーには、SMN(MIM 600354)、ジェム関連タンパク質2(SIP1; MIM 602595)、GEMIN3(DDX20; MIM 606168)、およびGEMIN4(MIM 606969)があります。[6]
インタラクション
GEMIN5はDDX20 [5] [7]およびSMN1 [5]と相互作用することが示されている。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000082516 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000037275 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ abc Gubitz AK、Mourelatos Z、Abel L、Rappsilber J、Mann M、Dreyfuss G (2002年2月)。「Gemin5は、Smタンパク質に結合するSMN複合体の新規WDリピートタンパク質成分である」。J Biol Chem . 277 (7): 5631–6. doi : 10.1074/jbc.M109448200 . PMID 11714716。
- ^ ab "Entrez Gene: GEMIN5 gem (核小器官) 関連タンパク質 5"。
- ^ Mourelatos Z、Dostie J、Paushkin S、Sharma A、Charroux B、Abel L、Rappsilber J、Mann M、Dreyfuss G (2002 年 3 月)。「miRNP: 多数のマイクロ RNA を含む新しいクラスのリボ核タンパク質」。Genes Dev。16 ( 6 ) : 720–8。doi :10.1101/gad.974702。PMC 15536 5。PMID 11914277。
さらに読む
- Baccon J、Pellizzoni L、Rappsilber J、Mann M、Dreyfuss G (2002)。「運動ニューロン複合体の生存における新規成分、Gemin7 の同定と特性評価」。J . Biol. Chem . 277 (35): 31957–62. doi : 10.1074/jbc.M203478200 . PMID 12065586。
- Beausoleil SA、Jedrychowski M、Schwartz D、Elias JE、Villén J、Li J、Cohn MA、Cantley LC、Gygi SP (2004)。「HeLa 細胞核リン酸化タンパク質の大規模特性評価」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 101 ( 33 ): 12130–5。Bibcode : 2004PNAS..10112130B。doi : 10.1073/ pnas.0404720101。PMC 514446。PMID 15302935。
- 木村和也、若松A、鈴木裕、太田隆、西川隆、山下R、山本J、関根正、釣谷和、若栗博、石井S、杉山隆、斉藤和久、磯野裕、入江R、櫛田直、米山隆、大塚 R、神田 K、横井 T、近藤 H、我妻 M、村川 K、石田 S、石橋 T、高橋-藤井 A、棚瀬 T、永井 K、菊池 H、中井 K、磯貝 哲、菅野 S (2006) 「転写調節の多様化: ヒト遺伝子の推定上の代替プロモーターの大規模な同定と特性評価」。ゲノム解析16 (1): 55-65。土井:10.1101/gr.4039406。PMC 1356129。PMID 16344560。
- Battle DJ、Lau CK、Wan L、Deng H、Lotti F、Dreyfuss G (2006)。「SMN複合体のGemin5タンパク質はsnRNAを識別する」。Mol . Cell . 23 (2): 273–9. doi : 10.1016/j.molcel.2006.05.036 . PMID 16857593。
- Beausoleil SA、Villén J、Gerber SA、Rush J、Gygi SP (2006)。「高スループットタンパク質リン酸化分析および部位局在化のための確率ベースのアプローチ」Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92. doi :10.1038/nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
- Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、Macek B、Kumar C、Mortensen P、Mann M (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。
- Kim EK、Noh KT、Yoon JH、Cho JH、Yoon KW、Dreyfuss G、Choi EJ (2007)。「WDリピートタンパク質Gemin5によるASK1媒介c-Jun NH(2)末端キナーゼシグナル伝達経路の正の制御」。Cell Death Differ。14 ( 8): 1518–28。doi : 10.1038 / sj.cdd.4402157。PMID 17541429 。
- Hao le T、Fuller HR、Lam le T、Le TT、 Burghes AH、Morris GE (2007)。「核カハール体におけるSMN複合体からのgemin5の不在」 。BMC Cell Biol。8 : 28。doi : 10.1186 / 1471-2121-8-28。PMC 1939999。PMID 17640370。
- Battle DJ、Kasim M、Wang J、Dreyfuss G (2007)。「SMN複合体のSMN非依存サブユニット。小さな核リボ核タンパク質アセンブリ中間体の同定」。J . Biol. Chem . 282 (38): 27953–9. doi : 10.1074/jbc.M702317200 . PMID 17640873。