ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
FBXW7 利用可能な構造 電子データ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2OVP、2OVQ、2OVR、5IBK
識別子 エイリアス FBXW7 、AGO、CDC4、FBW6、FBW7、FBX30、FBXO30、FBXW6、SEL-10、SEL10、hAgo、hCdc4、FボックスおよびWD繰り返しドメイン7を含む 外部ID オミム ：606278; MGI : 1354695; ホモロジーン : 117451; ジーンカード ：FBXW7; OMA :FBXW7 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体3（マウス） [2] バンド 3 F1|3 37.7 cM 始める 84,722,575 bp [2] 終わり 84,886,505 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 ブロードマン領域23 アキレス腱 結腸上皮 中側頭回 上前頭回 後頭葉 橋 頭頂葉 一次視覚野 中心後回
トップの表現 前頭前皮質 一次運動野 バレル皮質 視覚野 側頭葉 一次視覚野 扁桃体 球形嚢 上前頭回 海馬のI領域
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
タンパク質高分子アダプター活性 タンパク質結合 ユビキチンタンパク質転移酵素活性化活性 同一のタンパク質結合 ユビキチンタンパク質リガーゼ結合 サイクリン結合 ホスホトレオニン残基結合 ユビキチンタンパク質転移酵素活性 ユビキチン結合 細胞成分
細胞質 パーキン-FBXW7-Cul1 ユビキチンリガーゼ複合体 SCFユビキチンリガーゼ複合体 核質 核小体 核 細胞質 ミトコンドリア 小胞体 ゴルジ体 細胞質の核周囲領域 生物学的プロセス
上皮成長因子活性化受容体活性の正の調節 ミトコンドリアへのタンパク質標的化の正の制御 SREBPシグナル伝達経路の負の調節 紫外線に対する細胞反応 トリグリセリド生合成過程の負の調節 タンパク質の安定化 肝細胞増殖の抑制 姉妹染色分体凝集 DNA損傷刺激に対する細胞反応 タンパク質の局在の制御 酸化ストレス誘導性ニューロン内因性アポトーシスシグナル伝達経路の正の制御 SCF依存性プロテアソームユビキチン依存性タンパク質分解プロセス 血管の発達 ミトコンドリアのオートファジーの制御 DNAの重複に対する負の調節 ユビキチンタンパク質転移酵素活性の正の調節 ユビキチン依存性タンパク質分解プロセスの正の制御 タンパク質のユビキチン化 脂質恒常性 ERK1およびERK2カスケードの正の制御 細胞周期のG1/S期遷移の調節 脂質貯蔵の調節 ウイルスプロセス プロテアソームタンパク質分解過程の正の調節 タンパク質ユビキチン化の正の制御 Notchシグナル伝達経路の負の制御 タンパク質ポリユビキチン化 翻訳後タンパク質修飾 破骨細胞の発達の抑制 血管形成 ノッチシグナル伝達経路 遺伝子発現の負の調節 ユビキチンリサイクル 肺の発達 タンパク質の不安定化 プロテアソームを介したユビキチン依存性タンパク質分解プロセス 血管新生の芽生えに関わる細胞移動の調節 RNAポリメラーゼII調節領域の負の調節配列特異的DNA結合 概日リズムの調節 リズミカルなプロセス 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001013415 NM_001257069 NM_018315 NM_033632 NM_001349798
NM_001177773 NM_001177774 NM_080428
RefSeq (タンパク質) NP_001013433 NP_001243998 NP_060785 NP_361014 NP_001336727
NP_001171244 NP_001171245 NP_536353
場所 (UCSC) 4 章: 152.32 – 152.54 Mb 3 章: 84.72 – 84.89 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
F-ボックス/WDリピート含有タンパク質7 は、ヒトでは FBXW7 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6] [7]
関数 この遺伝子は、約 40 アミノ酸のモチーフである F ボックスを特徴とする F ボックス タンパク質ファミリーのメンバーをコードします。F ボックス タンパク質は、 SCF (SKP1-cullin-F ボックス) と呼ばれる ユビキチン タンパク質リガーゼ複合体 の 4 つのサブユニットの 1 つを構成し、リン酸化依存性ユビキチン化で機能します。F ボックス タンパク質は、WD-40 ドメインを含む Fbws、ロイシンに富むリピートを含む Fbl、および異なるタンパク質間相互作用モジュールまたは認識可能なモチーフを含まない Fbx の 3 つのクラスに分類されます。この遺伝子によってコードされるタンパク質は、以前は FBX30 と呼ばれ、Fbws クラスに属します。このタンパク質には、F ボックスに加えて、7 つのタンデム WD40 リピートが含まれます。このタンパク質は サイクリン E に直接結合し、サイクリン E をユビキチン媒介分解の標的とする可能性があります。 FBXW7 の増殖促進標的としてよく知られている他の遺伝子は、c-Myc と Notch1 です。この遺伝子の単一対立遺伝子変異は、散発性の癌で検出されています (例: 胆管癌 (35%)、T-ALL (31%)、子宮内膜癌 (16%)、大腸癌 (16%)、膀胱癌 (10%)、胃癌 (6%)、肺扁平上皮癌 (5%) など)。これらの知見は、ヒトの癌の発症におけるこの遺伝子の潜在的な役割を示唆しています。ハプロ不全腫瘍抑制因子として一般的に認識されているにもかかわらず、急性骨髄性白血病や多発性骨髄腫などの一部の癌では変異が見つかりません。1 つの可能性として、FBXW7 基質安定化がこれらの腫瘍に悪影響を及ぼしている可能性があります。例えば、FBXW7基質C/EBPαはAMLを抑制し [8] 、多発性骨髄腫は恒常的なNF-κBシグナル伝達を必要とするため、これらの腫瘍におけるFBXW7を介したIκBdのユビキチン化の阻害は細胞死をもたらす。 [9] [10]
この遺伝子には3つの異なるアイソフォームをコードする3つの転写変異体が見つかっている。 [7]
インタラクション FBXW7 は以下と相互作用する ことが示されています :
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000109670 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000028086 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Winston JT、Koepp DM、Zhu C、Elledge SJ、Harper JW (1999年12月)。「哺乳類のF-boxタンパク質ファミリー」。Curr Biol . 9 ( 20 ): 1180–2。Bibcode : 1999CBio ....9.1180W。doi : 10.1016/S0960-9822(00) 80021-4。PMID 10531037。S2CID 14341845 。 ^ Gupta-Rossi N, Le Bail O, Gonen H, Brou C, Logeat F, Six E, Ciechanover A, Israël A (2001 年 9 月). 「F ボックスタンパク質である SEL-10 と活性化 Notch1 受容体の核型との間の機能的相互作用」. J Biol Chem . 276 (37): 34371–8. doi : 10.1074/jbc.M101343200 . PMID 11425854. ^ ab "Entrez Gene: FBXW7 F ボックスおよび WD リピート ドメインを含む 7"。 ^ Bengoechea-Alonso MT、Ericsson J (2010 年 6 月)。「ユビキチンリガーゼ Fbxw7 は C/EBPalpha を分解の標的として脂肪細胞の分化を制御する」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。107 (26): 11817–22。Bibcode :2010PNAS..10711817B。doi : 10.1073 / pnas.0913367107。PMC 2900639。PMID 20534483 。 ^ Busino L、Millman SE、Scotto L、Kyratsous CA、Basrur V、O'Connor O、Hoffmann A、Elenitoba-Johnson KS、Pagano M (2012 年 3 月)。「Fbxw7α および GSK3 による p100 の分解は多発性骨髄腫における生存促進メカニズムである」。Nature Cell Biology。14 ( 4 ) : 375–85。doi : 10.1038/ncb2463。PMC 3339029。PMID 22388891 。 ^ Busino L、Millman SE、Pagano M (2012年12月)。「SCFを介したp100 (NF-κB2)の分解：多発性骨髄腫におけるメカニズムと関連性」。Science Signaling。5 ( 253 ): pt14。doi : 10.1126 / scisignal.2003408。PMC 3871187。PMID 23211527 。 ^ 寛栄・石井C、野村T、高木T、渡辺N、中山KI、石井S (2008年11月)。 「Fbxw7は、ネモ様キナーゼ（NLK）誘導性分解のためにc-Mybを標的とするE3ユビキチンリガーゼとして機能します。」 Ｊ．Ｂｉｏｌ．化学 。 283 (45): 30540–8。 土井 ： 10.1074/jbc.M804340200 。 PMC 2662147 。 PMID 18765672。 ^ Olson BL、Hock MB、Ekholm-Reed S、Wohlschlegel JA、Dev KK、Kralli A、Reed SI (2008 年 1 月)。「SCFCdc4 は、PGC-1alpha 転写コアクチベーターをユビキチン媒介タンパク質分解の標的として拮抗的に作用する」。Genes Dev . 22 (2): 252–64. doi :10.1101/gad.1624208. PMC 2192758 . PMID 18198341。 ^ ab Staropoli JF、McDermott C、Martinat C 、 Schulman B、Demireva E、Abeliovich A (2003 年 3 月)。「Parkin は SCF 様ユビキチンリガーゼ複合体の構成要素であり、カイニン酸興奮毒性から有糸分裂後のニューロンを保護する」。Neuron。37 ( 5 ) : 735–49。doi : 10.1016/s0896-6273(03) 00084-9。PMID 12628165。S2CID 17024826 。 ^ Wu G、Lyapina S、Das I、Li J、Gurney M、Pauley A、Chui I、Deshaies RJ、Kitajewski J (2001 年 11 月)。「SEL-10 は、ユビキチン媒介タンパク質分解のために notch を標的とする notch シグナル伝達の阻害剤です」。Mol . Cell. Biol . 21 (21): 7403–15. doi :10.1128/MCB.21.21.7403-7415.2001. PMC 99913. PMID 11585921 。
さらに読む
Robertson NG、Khetarpal U、Gutiérrez-Espeleta GA、Bieber FR、Morton CC (1995)。「サブトラクティブハイブリダイゼーションとディファレンシャルスクリーニングを用いたヒト胎児蝸牛cDNAライブラリーからの新規遺伝子と既知遺伝子の分離」。Genomics . 23 ( 1): 42–50. doi :10.1006/geno.1994.1457. PMID 7829101。 Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」 Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298. Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149. Oberg C, Li J, Pauley A, Wolf E, Gurney M, Lendahl U (2001). 「Notch 細胞内ドメインはユビキチン化され、哺乳類の Sel-10 ホモログによって負に制御される」 J. Biol. Chem . 276 (38): 35847–53. doi : 10.1074/jbc.M103992200 . PMID 11461910. Koepp DM、Schaefer LK、Ye X、Keyomarsi K、Chu C、Harper JW、Elledge SJ (2001)。 「SCFFbw7ユビキチンリガーゼによるサイクリンEのリン酸化依存性ユビキチン化」。 科学 。 294 (5540): 173-7。 Bibcode :2001Sci...294..173K。 土井 ： 10.1126/science.1065203 。 PMID 11533444。S2CID 23404627 。 Moberg KH、Bell DW、Wahrer DC、 Haber DA、Hariharan IK (2001)。「Archipelago はショウジョウバエのサイクリン E レベルを制御し、ヒトの癌細胞株で変異する」。Nature . 413 ( 6853 ) : 311–6。Bibcode :2001Natur.413..311M。doi : 10.1038/35095068。PMID 11565033。S2CID 4372821。 Strohmaier H、Spruck CH、Kaiser P、Won KA、Sangfelt O、Reed SI (2001)。「ヒト F ボックス タンパク質 hCdc4 はサイクリン E を標的としてタンパク質分解を行い、乳がん細胞株で変異を起こしている」。Nature . 413 ( 6853 ) : 316–22。Bibcode : 2001Natur.413..316S。doi :10.1038/35095076。PMID 11565034。S2CID 478973。 Wu G、Lyapina S、Das I、Li J、Gurney M、Pauley A、Chui I、Deshaies RJ、Kitajewski J (2001)。「SEL-10 は、ユビキチン媒介タンパク質分解のために Notch を標的とする Notch シグナル伝達の阻害剤です」。Mol . Cell. Biol . 21 (21): 7403–15. doi :10.1128/MCB.21.21.7403-7415.2001. PMC 99913. PMID 11585921 。 Spruck CH、Strohmaier H、Sangfelt O、Müller HM、Hubalek M、Müller-Holzner E、Marth C、Widschwendter M、Reed SI (2002)。 「子宮内膜がんにおける hCDC4 遺伝子変異」。 がん 研究所 62 (16): 4535–9。 PMID 12183400。 Staropoli JF、McDermott C、Martinat C、 Schulman B、Demireva E、Abeliovich A (2003)。「Parkin は SCF 様ユビキチンリガーゼ複合体の構成要素であり、カイニン酸興奮毒性から有糸分裂後のニューロンを保護する」。 ニューロン 。37 ( 5 ): 735–49。doi : 10.1016/S0896-6273(03) 00084-9。PMID 12628165。S2CID 17024826 。 Calhoun ES、Jones JB、Ashfaq R、Adsay V、Baker SJ、Valentine V、Hempen PM、Hilgers W、Yeo CJ、Hruban RH、Kern SE (2003)。「膵臓がんの異なるサブセットにおけるBRAFおよびFBXW7（CDC4、FBW7、AGO、SEL10）変異：潜在的な治療ターゲット」。Am . J. Pathol . 163 （4）：1255–60。doi ： 10.1016 / S0002-9440（10）63485-2。PMC 1868306。PMID 14507635 。 Welcker M、Singer J、Loeb KR、Grim J、Bloecher A、Gurien-West M、Clurman BE、Roberts JM (2003)。「Cdk2 および GSK3 によるマルチサイトリン酸化がサイクリン E の分解を制御する」。Mol . Cell . 12 (2): 381–92. doi : 10.1016/S1097-2765(03)00287-9 . PMID 14536078。 Busino L、Donzelli M、Chiesa M、Guardavaccaro D、Ganoth D、Dorrello NV、Hershko A、Pagano M、Draetta GF (2003)。「S 期および DNA 損傷に対する応答における beta-TrCP による Cdc25A の分解」。Nature。426 ( 6962 ) : 87–91。Bibcode : 2003Natur.426 ...87B。doi : 10.1038/nature02082。PMID 14603323。S2CID 768783。 カシア R、モレノ-ブエノ G、ロドリゲス-ペラレス S、ハーディソン D、シグドーサ JC、パラシオス J (2004)。 「子宮内膜癌におけるサイクリン E 遺伝子 (CCNE) の増幅と hCDC4 変異」。 J.パソール 。 201 (4): 589–95。 土井 ：10.1002/path.1474。 PMID 14648662。S2CID 26390858 。 Nateri AS、Riera-Sans L、Da Costa C、 Behrens A (2004)。「ユビキチンリガーゼ SCFFbw7 はアポトーシス JNK シグナル伝達に拮抗する」。Science。303 ( 5662 ): 1374–8。Bibcode : 2004Sci ... 303.1374N。doi : 10.1126/science.1092880。PMID 14739463。S2CID 36368075 。
