TAF5 利用可能な構造物 PDB オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 別名 TAF5 、TAF2D、TAFII100、TAF(II)100、TAFII-100、TATAボックス結合タンパク質関連因子5外部ID オミム : 601787 ; MGI : 2442144 ;ホモロジーン : 5064 ;ジーンカード :TAF5 ; OMA : TAF5 - オルソログRNA発現 パターンBgee 人間 マウス (相同体)トップは 二次卵母細胞 生殖腺 睾丸 羊水 心室帯 胚 頬粘膜細胞 神経節隆起 ブロードマン地区23 中側頭回
トップは 接合子 二次卵母細胞 一次卵母細胞 内側神経節隆起 手 原始的な筋 胚の尾 パネート細胞 精子細胞 卵丘細胞
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遺伝子オントロジー 分子機能 タンパク質二量体化活性 DNA結合転写因子活性 ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性 タンパク質結合 同一のタンパク質結合 RNAポリメラーゼII一般転写開始因子活性 細胞成分 核小体 アクチン細胞骨格 核 転写因子TFTC複合体 転写因子TFIID複合体 核質 生物学的プロセス 転写、DNA鋳型 DNAを鋳型とした転写、開始 転写の調節、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによる転写 RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写開始 snRNAのRNAポリメラーゼIIによる転写 p53クラスメディエーターによるシグナル伝達の調節 ヒストンアセチル化 ウイルスプロセス クロマチン構造 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
転写開始因子TFIIDサブユニット5 は、ヒトではTAF5 遺伝子によってコードされる タンパク質 である。[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
関数 RNAポリメラーゼIIによる転写開始には、70種類以上のポリペプチドの活性が必要です。これらの活性を調整するタンパク質は転写因子IID(TFIID)であり、コアプロモーターに結合してポリメラーゼを適切な位置に配置し、転写複合体の残りの部分の組み立てのための足場として機能し、調節シグナルのチャネルとして機能します。TFIIDは、TATA結合タンパク質(TBP)と、TBP関連因子(TAF)として知られる進化的に保存されたタンパク質のグループから構成されています。TAFは、基本転写に関与したり、共活性化因子として機能したり、プロモーター認識に関与したり、一般的な転写因子(GTF)を修飾して複合体の組み立てと転写開始を促進したりする可能性があります。この遺伝子は、TFIID複合体のすべての転写活性型に結合しているTFIIDの必須サブユニットをコードしています。このサブユニットは、ヒストンH3およびH4に類似性を示す2つのTFIIDサブユニットと強く相互作用し、TFIID複合体におけるヌクレオソーム様コアの形成に関与している可能性があります。[ 7 ]
参考文献 1 2 3 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000148835 – Ensembl 、2017年5月 1 2 3 GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000025049 – Ensembl 、2017年5月 ↑ 「ヒトPubMed参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ↑ 「マウス PubMed 参照:」 。 米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ↑ Dubrovskaya V、Mattei MG、Tora L (1997年2月)。 「 ヒトTFIID複合体の100kDaサブユニット(hTAFII100)をコードする遺伝子(TAF2D)の染色体10バンドq24-q25.2への局在」 。Genomics。36 ( 3 ) : 556–7。doi : 10.1006 / geno.1996.0509。PMID 8884287 。 ↑ Tanese N、Saluja D、Vassallo MF、Chen JL、Admon A (1997 年 1 月)。 「ヒト TFIID 複合体の 2 つのサブユニット、hTAFII130 および hTAFII100 の分子クローニングと解析」 。Proc Natl Acad Sci USA。93 ( 24 ) : 13611–6。Bibcode : 1996PNAS ... 9313611T。doi : 10.1073 / pnas.93.24.13611。PMC 19367。PMID 8942982 。 1 2 "Entrez Gene: TAF5 TAF5 RNAポリメラーゼII、TATAボックス結合タンパク質(TBP)関連因子、100kDa" 。 1 2 3 Tao Y、Guermah M、Martinez E、Oelgeschläger T、長谷川 S、高田 R、山本 T、堀越 M、ローダー RG (1997 年 3 月)。 「ヒトTAFII100の特異的相互作用と潜在的機能」 。 J.Biol.化学 。 272 (10): 6714–21 . 土井 : 10.1074/jbc.272.10.6714 。 PMID 9045704 。 ↑ Hsieh YJ、Kundu TK、Wang Z、Kovelman R、Roeder RG (1999年11月)。 「TFIIICのTFIIIC90サブユニットはRNAポリメラーゼIII機構の複数の構成要素と相互作用し、ヒストン特異的アセチルトランスフェラーゼ活性を有する」 。Mol . Cell. Biol . 19 (11): 7697–704 . doi : 10.1128/mcb.19.11.7697 . PMC 84812 . PMID 10523658 . ↑ Martinez E、Palhan VB、Tjernberg A、Lymar ES、Gamper AM、Kundu TK、Chait BT、Roeder RG (2001 年 10 月)。 「ヒト STAGA 複合体は、生体内で pre-mRNA スプライシング因子および DNA 損傷結合因子と相互作用するクロマチンアセチル化転写共活性化因子である」 。Mol . Cell. Biol . 21 (20): 6782–95 . doi : 10.1128/MCB.21.20.6782-6795.2001 . PMC 99856. PMID 11564863 . ↑ Bertolotti A、Melot T、Acker J、Vigneron M、Delattre O、Tora L (1998 年 3 月)。 「EWS は、EWS-FLI-1 とは異なり、TFIID と RNA ポリメラーゼ II の両方と関連している: TET ファミリーの 2 つのメンバー、EWS と hTAFII68、および TFIID と RNA ポリメラーゼ II 複合体のサブユニット間の相互作用」 。Mol . Cell. Biol . 18 (3): 1489–97 . doi : 10.1128/mcb.18.3.1489 . PMC 108863. PMID 9488465 . ↑ Bellorini M、Lee DK、Dantonel JC、Zemzoumi K、Roeder RG、Tora L、Mantovani R (1997年6月)。 「CCAAT結合NF-Y-TBP相互作用:NF-YB およびNF-YCは 、 TBP塩基性残基との結合のために、ヒストンフォールドモチーフに隣接する短いドメインを必要とする」 。Nucleic Acids Res。25 ( 11 ) : 2174–81。doi : 10.1093 / nar /25.11.2174。PMC 146709。PMID 9153318 。 ↑ Ruppert S、Wang EH、 Tjian R (1993 年 3月 )。 「ヒト TAFII250 のクローニングと発現: 細胞周期 制御 に 関与する TBP 関連因子」 。Nature。362 ( 6416 ) : 175–9。Bibcode : 1993Natur.362..175R。doi : 10.1038 / 362175a0。PMID 7680771。S2CID 4364676 。
さらに読む Zhou Q、Sharp PA (1995) 「HIV-1 Tatによる制御の新規メカニズムと因子」 EMBO J. 14 ( 2): 321–8 . doi : 10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07006.x . PMC 398086. PMID 7835343 . Parada CA、Yoon JB、Roeder RG (1995) 「in vitroでの伸長段階におけるHIV-1転写の新規LBP-1媒介制限」 J. Biol. Chem . 270 (5): 2274–83 . doi : 10.1074/jbc.270.5.2274 . PMID 7836461 . Ou SH、Garcia-Martínez LF、Paulssen EJ、Gaynor RB (1994)。「ヒト免疫不全ウイルス1型TATAエレメント機能における隣接Eボックスモチーフの役割」。J . Virol . 68 (11): 7188–99 . doi : 10.1128/JVI.68.11.7188-7199.1994 . PMC 237158. PMID 7933101 . Kashanchi F、Piras G 、 Radonovich MF、Duvall JF、Fattaey A、Chiang CM、Roeder RG、Brady JN (1994)。「ヒトTFIIDとHIV-1トランスアクチベーターtatの直接 相互作用」。Nature。367 ( 6460 ) : 295–9。Bibcode : 1994Natur.367..295K。doi : 10.1038 / 367295a0。PMID 8121496。S2CID 4362048。 丸山K、菅野S(1994)。「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡便な方法」Gene.138 (1–2 ) :171–4.doi :10.1016 / 0378-1119 ( 94) 90802-8.PMID 8125298 . Wang Z、Morris GF、Rice AP、Xiong W、Morris CB (1996) 「ヒト免疫不全ウイルス1型Tatタンパク質の野生型および転写活性化欠損変異体は、試験管内でヒトTATA結合タンパク質に結合する」。J . Acquir. Immune Defic. Syndr. Hum. Retrovirol . 12 (2): 128– 38. doi : 10.1097/00042560-199606010-00005 . PMID 8680883 . Dubrovskaya V、Lavigne AC、Davidson I、Acker J、Staub A、Tora L (1996)。 「hTAFII100の異なるドメイン は 、転写因子TFIIFβ(RAP30)との機能的相互作用およびTFIID複合体への組み込み に必要である」。EMBO J。15 (14 ):3702–12。doi :10.1002 /j.1460-2075.1996.tb00740.x。PMC 452026。PMID 8758937 。 Pendergrast PS、Morrison D、Tansey WP、Hernandez N (1996) 「TBPのカルボキシ末端ドメインの変異は、ヒト免疫不全ウイルス1型の全長および短鎖転写産物の合成に同様の影響を与える」 J. Virol . 70 ( 8): 5025–34 . doi : 10.1128/JVI.70.8.5025-5034.1996 . PMC 190456. PMID 8764009 . カシャンチ F、クライフ SN、デュバル JF、サダイエ MR、ラドノビッチ MF、チョー M、マーティン MA、チェン SY、ワインマン R、ブレイディ JN (1996)。「ヒト免疫不全ウイルス 1 型 Tat と TFIID の固有部位との相互作用は、ネガティブ補因子 Dr1 を阻害し、TFIID-TFIIA 複合体を安定化します。 」 J. ヴィロル70 (8): 5503–10 .土井 : 10.1128/JVI.70.8.5503-5510.1996。PMC 190508 。PMID 8764062。 Zhou Q、Sharp PA (1996)「Tat-SF1:HIV-1 Tatによる転写伸長促進の補因子」Science . 274 ( 5287): 605–10 . Bibcode : 1996Sci...274..605Z . doi : 10.1126/science.274.5287.605 . PMID 8849451. S2CID 13266489 . Tao Y、Guermah M、Martinez E、Oelgeschläger T、長谷川 S、高田 R、山本 T、堀越 M、ローダー RG (1997)。「ヒトTAFII100の特異的相互作用と潜在的機能」。J.Biol.化学 。272 (10): 6714–21 .土井 : 10.1074/jbc.272.10.6714 。PMID 9045704。 García-Martínez LF、Ivanov D、Gaynor RB (1997) 「精製されたHIV-1およびHIV-2転写開始前複合体へのTatの結合」 J. Biol. Chem . 272 (11): 6951–8 . doi : 10.1074/jbc.272.11.6951 . PMID 9054383 . Dantonel JC 、Murthy KG、Manley JL 、Tora L ( 1997)。「転写因子TFIIDは因子CPSFをリクルートしてmRNAの3'末端を形成する」 。Nature。389 ( 6649 ) : 399–402。Bibcode : 1997Natur.389..399D。doi : 10.1038 / 38763。PMID 9311784。S2CID 4413324。 鈴木 裕、中川 義友 健、丸山 健、須山 昭、菅野 誠 (1997)「全長濃縮および5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」Gene.200 ( 1–2 ) : 149–56.doi : 10.1016 / S0378-1119 ( 97) 00411-3.PMID 9373149 . Bertolotti A、Melot T、Acker J、Vigneron M、Delattre O、Tora L (1998)。「EWSはTFIIDとRNAポリメラーゼIIの両方と関連しているが、EWS-FLI-1は関連していない:TETファミリーの2つのメンバー、EWSとhTAFII68、およびTFIIDとRNAポリメラーゼII複合体のサブユニット間の相互作用」。Mol . Cell. Biol . 18 (3): 1489–97 . doi : 10.1128/mcb.18.3.1489 . PMC 108863 . PMID 9488465 . Brand M, Yamamoto K, Staub A, Tora L (1999). "TATA結合タンパク質を含まないTAFII含有複合体サブユニットの同定は、ヌクレオソームアセチル化およびシグナル伝達における役割を示唆する" . J. Biol. Chem . 274 (26): 18285–9 . doi : 10.1074/jbc.274.26.18285 . PMID 10373431 . Brand M、Moggs JG、Oulad-Abdelghani M、Lejeune F、Dilworth FJ、Stevenin J、Almouzni G、Tora L (2001)。「 TFTC複合体中のUV損傷DNA結合タンパク質は、DNA損傷認識とヌクレオソームアセチル化を結びつける」。EMBO J。20 ( 12 ) : 3187–96。doi : 10.1093 / emboj / 20.12.3187。PMC 150203。PMID 11406595 。 Martinez E、Palhan VB、Tjernberg A、Lymar ES、Gamper AM、Kundu TK、Chait BT、Roeder RG (2001) 「ヒトSTAGA複合体は、生体内でpre-mRNAスプライシング因子およびDNA損傷結合因子と相互作用するクロマチンアセチル化転写共活性化因子である」。Mol . Cell. Biol . 21 (20): 6782–95 . doi : 10.1128/MCB.21.20.6782-6795.2001 . PMC 99856. PMID 11564863 .