歴史 ゲノム科学の時代は、多くの生物のDNA配列が解読された1990年代に始まった。21世紀に入り、ヒトゲノム計画 の完了により、機能ゲノム研究や腫瘍ゲノムの解析が可能になった。がんは、ゲノム科学研究の主要な対象となっている。
エピゲノミクスの時代は、主に2000年頃に始まった。[ 2 ] [ 3 ] プロモーター 領域にあるCpGアイランドのメチル化の変化である（ がんにおけるDNAメチル化を 参照）。最近開発された多くの方法では、がん組織と正常組織におけるDNAメチル化の状態を評価できる。[ 4 ] [ 5 ]
がんゲノム 全体の配列決定へのアクセスは、がん（またはがんゲノム）研究にとって重要である。その理由は以下のとおりである。
突然変異は癌の直接的な原因であり、腫瘍の表現型 を決定づける。 同一患者から癌組織と正常組織のサンプルを入手できること、そしてほとんどの癌変異が体細胞 変異であるという事実により、癌特異的な変異を特定することが可能になる。 がんの変異は累積的であり、時には病期と関連している。転移 と薬剤耐性は区別できる。[ 6 ] メチル化プロファイリングへのアクセスは、がん研究にとって重要である。その理由は以下のとおりである。
エピドライバーは、ミュータントドライバーと同様に、がんの直接的な原因となる可能性がある。[ 7 ] がんのエピ変異は累積的であり、時には病気の段階と関連している。[ 8 ]
全ゲノムシーケンス 最初の癌ゲノムは2008年に配列決定されました。[ 6 ] 急性骨髄性白血病 （AML）ゲノムと、同じ患者から得られたその正常対応ゲノムの配列が決定されました。比較により、10個の変異遺伝子が明らかになりました。そのうち2つは、すでに腫瘍の進行に寄与すると考えられていました。1つは、キナーゼシグナル伝達を活性化し、予後不良と関連するFLT3 受容体チロシンキナーゼ遺伝子の内部タンデム重複、もう1つは、 NPM1 遺伝子（NPMc）のエクソン12への4塩基挿入です。これらの変異はAML腫瘍の25～30%に見られ、直接的に病気を引き起こすのではなく、病気の進行に寄与すると考えられています。
残りの8つは新規変異であり、すべて単一塩基置換であった。そのうち4つは、がんの発症と強く関連する遺伝子ファミリーに属していた（PTPRT 、CDH24、PCLKC 、SLC15A1 ）。残りの4つは、これまでがんの発症との関連は報告されていなかった。これらの変異は 、代謝経路 において潜在的な機能を有しており、がんを促進するメカニズムを示唆していた（KNDC1、GPR124 、EB12、GRINC1B）。
これらの遺伝子は、がんの病因に関与することが知られている経路に関わっていますが、この研究以前は、ほとんどが標的遺伝子治療の候補ではありませんでした。この分析により、体細胞変異の同定における全がんゲノムシーケンス のアプローチと、正常細胞ゲノムと腫瘍細胞ゲノムの並行シーケンスの重要性が検証されました。[ 9 ]
2011年、エベロリムス という薬剤によって腫瘍が消失した稀な膀胱がん患者のゲノムがシーケンスされ、TSC1 NF2 mTORの 調節を乱し、無制限に増殖することを可能にした。その結果、2015年に国立がん研究所で「卓越反応者イニシアチブ」が設立された。このイニシアチブでは、通常は効果がないがん治療薬に少なくとも6か月間良好な反応を示した稀な患者のゲノムをシーケンスして、関連する変異を特定することができる。変異が特定されると、他の患者もこれらの変異についてスクリーニングされ、その後、その薬剤が投与される。2016年、この目的のために、最大2400の施設が参加する全国的ながん治療薬の臨床試験が2015年に開始された。適切な変異を持つ患者は、40種類以上の薬剤のうちの1つとマッチングされる。[ 10 ]
2014年に分子腫瘍学センターは、341の癌関連遺伝子の変異を調べるスクリーニングツールであるMSK-IMPACT検査を開始しました。2015年までに5000人以上の患者がスクリーニングを受けました。適切な変異を持つ患者は、標的療法を提供する臨床試験に参加する資格があります。[ 10 ]
テクノロジー 腫瘍ゲノミクスで現在使用されている技術 ゲノム技術には以下が含まれます。
トランスクリプトーム マイクロアレイ ：転写産物の 量を評価する。分類、予後、異なる治療アプローチの可能性を高め、タンパク質のコード領域の変異の特定に役立つ。[ 19 ] [ 20 ] [ 21 ] RNAシーケンス
バイオインフォマティクス 技術は、ゲノムデータの統計解析を可能にする。がん遺伝子の機能的特性はまだ確立されていない。潜在的な機能としては、腫瘍形成に関連する形質転換能力や、がん発生の各段階における特定の役割などが挙げられる。
がんサンプル群全体で体細胞がん変異が 検出された後、バイオインフォマティクス計算解析を実行して、機能的変異およびドライバー変異の可能性を特定できます。この特定には、変異のマッピング、タンパク質または調節要素 の機能に対する変異の影響の評価、腫瘍群全体での正の選択の兆候の検出という、主に3つのアプローチが日常的に使用されています。ただし、これらのアプローチは必ずしも順次的ではなく、異なるアプローチの要素間には重要な優先順位の関係があります。各ステップで異なるツールが使用されます。[ 22 ]
オペロミクス オペロミクスは、ゲノミクス、トランスクリプトミクス、プロテオミクス を統合して、がん発生の根底にある分子メカニズムを理解することを目指しています。[ 23 ]
突然変異は進化における自然選択の原材料となり、DNA複製エラー、外因性変異原の作用、または内因性DNA損傷によって引き起こされる可能性がある。複製およびゲノム維持の機構は、突然変異によって損傷を受けたり、生理的条件や癌における発現レベルの差異によって変化したりする可能性がある（[ 25 ]
Gao ら[ 26 ] DNA 損傷応答 (DDR) システムによって維持されています。修復されない DNA 損傷は、発がんを促進する突然変異の主な原因です。[ 27 ] [ 28 ] 合成 により、 DNA 複製中の 突然変異 エラーを増加させる可能性があります。過剰な DNA 損傷は、DNA 修復中のエラーにより、エピジェネティックな 変化も増加させる可能性があります。 [ 29 ] [ 30 ] このような突然変異とエピジェネティックな変化は、がん を引き起こす可能性があります。DDR 遺伝子は、ヒトのがんではエピジェネティックなメカニズムによって抑制されることがよくあります。このような抑制には、プロモーター領域の DNA メチル化や、マイクロ RNA による DDR 遺伝子の抑制が含まれる場合があります。DDR 遺伝子のエピジェネティックな抑制は、多くの種類のがんで遺伝子突然変異よりも頻繁に発生します (がんのエピジェネティクスを 参照)。このように、DDR遺伝子の発現を抑制する上で、エピジェネティックな抑制は突然変異よりも重要な役割を果たすことが多い。このDDR遺伝子の発現低下は、発がんの重要な要因であると考えられる。
ヌクレオチド配列のコンテキストは突然変異の確率に影響を与え[ 31 ] [ 32 ] [ 33 ] [ 33 ] [ 34 ]などがある。
腫瘍における変異の観測された変異スペクトルとDNA配列コンテキストを分析するもう1つの（中立的な）方法は、癌サンプルからの異なるタイプとコンテキストのすべての変異を離散分布にプールすることです。複数の癌サンプルが利用可能な場合、それらのコンテキスト依存の変異は非負行列の形で表すことができます。この行列は、理想的には個々の変異原性因子を記述するコンポーネント（変異シグネチャ）にさらに分解できます。[ 35 ] [ 36 ] [ 37 ] [ 38 ]
合成致死性 合成致死とは、2つ以上の遺伝子の発現異常が組み合わさることで細胞死を引き起こすが、これらの遺伝子のうち1つだけの異常では細胞死を引き起こさない現象である。これらの異常は、突然変異、エピジェネティックな変化、または遺伝子の阻害物質によって引き起こされる可能性がある。
合成致死性の治療的可能性は、効果的な抗がん戦略として継続的に向上しています。最近では、Ronald A. DePinho 氏らを含む科学者による「副次的致死性」と呼ばれる研究により、標的がん治療への合成致死性の適用可能性が高まっています。Muller らは、腫瘍抑制遺伝子に染色体的に近接するパッセンジャー遺伝子が、一部のがんで副次的に欠失していることを発見しました。[ 39 ] 合成致死性 アプローチを追求するための未開拓の資源となる可能性があります。そのため、副次的致死性は、腫瘍学における新規かつ選択的な治療標的の特定に大きな可能性を秘めています。[ 40 ] 膠芽腫 （GBM）における冗長必須解糖系ENO1 遺伝子のホモ接合性欠失は、1p36腫瘍抑制遺伝子座の欠失との近接の結果であり、GBM阻害に対する合成致死アプローチの可能性を秘めていることが特定された。[ 39 ] ENO1は、哺乳類のα-エノラーゼ 酵素をコードする3つの相同遺伝子（ ENO2 、ENO3 ）の1つである。[ 41 ] エノラーゼ2 をコードするENO2は主に神経組織で発現しており、ENO1 欠失GBMでは、ENO2がENO1の冗長相同体として理想的な標的となる可能性があるという仮説につながっている。[ 42 ] [ 39 ] エノラーゼ阻害剤である抗生物質SF2312を発見した。 [ 43 ] [ 43 ] 同じチームによるその後の研究では、同じアプローチが膵臓癌 にも適用できることが示された。膵臓癌では、ホモ接合性に欠損した SMAD4が、酸化還元恒常性に不可欠な酸化脱炭酸酵素であるミトコンドリアリンゴ酸酵素2（ ME2 ）の副次的欠損を引き起こす。[ ] 膵癌 、本質的に冗長な NAD(P)+-依存性アイソフォーム ME3 の枯渇によって ME2 欠損細胞を合成致死性に準備することを示した。ME3 枯渇の影響は、AMPK 活性化とミトコンドリア ROS を介したアポトーシスによる新規ヌクレオチド合成の阻害によって媒介されることがわかった。 [ 45 ] [ 44 ] 一方、Oike らは、代謝以外のプロセスにおける冗長な必須遺伝子、すなわちクロマチンリモデリングSWI/SNF SMARCA4 およびSMARCA2 サブユニットを標的とすることで、この概念の一般化可能性を示した。 [ 46 ]
一部の癌遺伝子は、癌細胞だけでなく全ての細胞の生存に不可欠です。そのため、これらの癌遺伝子をノックアウトする（つまり癌細胞を死滅させる）薬剤は、正常細胞にも損傷を与え、深刻な疾患を引き起こす可能性があります。しかし、癌細胞には不可欠でも、健康な細胞にはそうでない遺伝子も存在します。
合成致死の原理に基づく治療法は、がん患者の生存期間を延長させ、発がんの逆転における将来の進歩に期待が寄せられている。合成致死の主要なタイプは、がんの発生にしばしば関与し、腫瘍細胞にも依然として存在するDNA修復欠陥に作用する。以下にいくつかの例を示す。
BRCA1 またはBRCA2 の 発現は、高悪性度の乳がんおよび卵巣がんの大部分で欠損しており、通常はプロモーターのエピジェネティックなメチル化または過剰発現したマイクロ RNA によるエピジェネティックな抑制が原因です ( BRCA1 およびBRCA2 の記事を参照)。BRCA1 および BRCA2 は、二本鎖切断の 相同組換え 修復の主要経路の重要な構成要素です。どちらか一方が欠損すると、がん、特に乳がんまたは卵巣がんのリスクが高まります。BRCA1 および BRCA2 によって通常修復される損傷の一部に対するバックアップ DNA 修復経路は、PARP1 に依存しています。したがって、多くの卵巣がんは、FDA 承認の PARP 阻害剤による治療に反応し、BRCA1 または BRCA2 が欠損しているがん細胞に対して合成致死を引き起こします。この治療法は、2016 年に第 III 相臨床試験で乳がんおよびその他多数のがんに対しても評価されています。[ 47 ]
二本鎖切断の相同組換え 修復には2つの経路がある。主要な経路はBRCA1、PALB2 、BRCA2に依存し、代替経路はRAD52に依存する。[ 48 ] [ 49 ]
DNAミスマッチ修復（MMR）に用いられる遺伝子の変異は、高い変異率を引き起こします。[ 50 ] [ 51 ] PD-1 遺伝子の産物は通常、細胞傷害性免疫応答を抑制します。この遺伝子の阻害により、より大きな免疫応答が可能になります。腫瘍にMMRの欠陥がある癌患者にPD-1阻害剤を投与すると、患者の67～78%が免疫関連の無増悪生存を経験しました。対照的に、MMRに欠陥のない患者では、PD-1阻害剤を追加しても、免疫関連の無増悪生存を経験した患者はわずか11%でした。したがって、PD-1の阻害は主にMMRの欠陥に対して合成致死的です。
クロマチン修飾因子であるARID1Aは 、DNAの二本鎖切断を修復する主要な経路である非相同末端結合に必要であり [ 52 ] [ 53 ] [ 54 ] [ 55 ] [ 56 ] [ 57 ] [ 58 ] [ 59 ]のいずれかによって起こることが示されている。
別のアプローチは、ゲノム内の各遺伝子を個別にノックアウトし、正常細胞と癌細胞への影響を観察することです。[ 60 ] [ 61 ] PARP-1阻害剤を特定するために使用されました。 [ 62 ] [ 63 ]
がん研究のためのデータベース がんゲノムプロジェクト （CGP）は、がんにおけるすべての体細胞変異を解明するための取り組みです。このプロジェクトでは、原発腫瘍およびがん細胞株のゲノムのエキソンと隣接するスプライス接合部を系統的にシーケンス解析します。COSMICソフトウェアは、これらの実験から得られたデータを表示します。2008年2月時点で、CGPは1,848個の腫瘍において4,746個の遺伝子と2,985個の変異を特定しました。
がんゲノム解剖プロジェクト には、がんゲノム、トランスクリプトーム、プロテオームに関する研究情報が含まれています。
Progenetixは、細胞遺伝学的および分子細胞遺伝学的腫瘍データを提供する、腫瘍ゲノム参照データベースです。
Oncomineは、がんのトランスクリプトームプロファイルに関するデータを収集した。
統合型腫瘍ゲノムデータベースIntOGenとGitoolsデータセットは、腫瘍タイプ別に分類された多次元ヒト腫瘍ゲノムデータを統合しています。IntOGenの最初のバージョンは、がんにおける遺伝子発現 の調節異常とCNVの役割に焦点を当てていました。 [ 64 ] [ 65 ] [ 66 ]
国際がんゲノムコンソーシアム（ICGC） は、ヒトがんゲノムデータを収集する最大のプロジェクトです。データはICGCのウェブサイトからアクセスできます。BioExpress® Oncology Suiteには、原発性、転移性、良性腫瘍サンプルおよび正常サンプル（対応する隣接対照を含む）の遺伝子発現データが含まれています。このスイートには、多くのよく知られたがんの血液悪性腫瘍サンプルも含まれています。
モデル動物向けの特定のデータベースとしては、レトロウイルス標識癌遺伝子データベース（RTCGD）があり、マウス腫瘍におけるレトロウイルスおよびトランスポゾン挿入変異誘発に関する研究をまとめている。
遺伝子ファミリー 遺伝子ファミリー全体の変異解析により、同じファミリーの遺伝子は、類似したコード配列とタンパク質ドメイン によって予測されるように、類似した機能を持つことが明らかになった。そのようなクラスの 2 つは、タンパク質にリン酸基を付加するキナーゼ ファミリーと、タンパク質からリン酸基を除去するホスファターゼファミリーである。 [ 67 ] ホスファチジルイノシトール 3-キナーゼ ( PIK3CA ) 遺伝子は、大腸がん、乳がん、胃がん、肺がん、およびその他のさまざまながんに一般的に変異を含む脂質キナーゼをコードしている。[ 68 ] [ 69 ] BRAF遺伝子である。 [ 70 ] MAPK 増殖シグナル伝達経路に関与するセリン /スレオニン キナーゼをコードしています。BRAFの変異は、メラノーマの59%で恒常的なリン酸化と活性を引き起こします。BRAFが発見される前は、メラノーマ発生の遺伝的メカニズムは不明であったため、患者の予後は不良でした。[ 71 ]
ミトコンドリアDNA ミトコンドリアDNA （mtDNA）の変異は腫瘍の形成と関連している。4種類のmtDNA変異が特定されている：[ 72 ]
点突然変異 がん細胞に含まれるmtDNAのコード 領域と非コード 領域で点突然変異が観察されている。膀胱がん、頭頸部がん、肺がんの患者では、コード領域内の点突然変異が互いに類似している兆候が見られる。これは、健康な細胞が腫瘍細胞に変化する（新生物的変化）と、ミトコンドリア が均質になるように見えることを示唆している。がん性ミトコンドリアの非コード領域であるDループ 内に多数の点突然変異が存在することは、この領域内の突然変異が一部のがんの重要な特徴である可能性を示唆している。[ 72 ]
削除 この種の変異は、サイズが小さい（1 kb未満）ため、散発的にしか検出されません 。複数の種類の癌で特定のmtDNA変異（複合体1サブユニット遺伝子ND1の264 bp欠失と66 bp欠失）が出現することは、小さなmtDNA欠失が腫瘍形成 の初期に現れる可能性があることを示唆する証拠となります。また、腫瘍の進行に伴って、これらの欠失を含むミトコンドリアの量が増加することも示唆されます。例外として、多くの癌で出現する比較的大きな欠失（「共通欠失」として知られる）がありますが、腫瘍細胞と比較して正常細胞ではより多くのmtDNA大規模欠失が見つかっています。これは、腫瘍細胞がこれらの大規模欠失（「共通欠失」は4 kb以上）を含むミトコンドリアを排除する適応プロセスによるものと考えられます。[ 72 ]
挿入 約260 bpと約520 bpの2つの小さなmtDNA挿入は、乳がん、胃がん、肝細胞がん（HCC）、結腸がん、および正常細胞に存在する可能性がある。これらの挿入とがんとの相関関係は確立されていない。[ 73 ]
コピー数変異 リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応 アッセイによるmtDNAの特性解析により、多くの癌においてmtDNAコピー数の定量的変化が存在することが明らかになった。コピー数の増加は酸化ストレスによって起こると予想される。一方、減少はH鎖 の複製起点部位および/またはDループ領域のD310ホモポリマーcストレッチにおける体細胞点突然変異、p53 （腫瘍抑制遺伝子）を介した経路の変異、および/またはPOLG 変異による酵素活性の低下によって引き起こされると考えられている。コピー数の増加/減少は、腫瘍細胞内で一定に保たれる。腫瘍細胞内のmtDNA量が一定であるという事実は、mtDNA量が異常な細胞増殖の結果として単純に変化するのではなく、腫瘍細胞内のより複雑なシステムによって制御されていることを示唆している。ヒト癌におけるmtDNA含有量の役割は、特定の腫瘍タイプまたは部位によって明らかに異なる。[ 72 ]
57.7% (500/867) は体細胞点変異を含み、調査した 1172 個の変異のうち、37.8% (443/1127) は D ループ制御領域に位置し、13.1% (154/1172) は tRNA または rRNA 遺伝子に位置し、49.1% (575/1127) はミトコンドリア呼吸に必要な複合体を生成するために必要な mRNA 遺伝子に見つかりました。
診断アプリケーション 一部の抗がん剤はmtDNAを標的とし、腫瘍細胞を殺すのに効果的であることが示されています。研究では、ミトコンドリア変異をがん細胞治療のバイオマーカーとして使用しています。ミトコンドリアゲノムは核DNAよりもはるかに小さく、特定の変異をスクリーニングしやすいため、核DNAよりもミトコンドリアDNA内の変異を標的にすることが容易です。血液サンプルで発見されたmtDNA含有量の変化は、将来のがん感受性を予測するためのスクリーニングマーカーとして、また悪性腫瘍の進行を追跡するために役立つ可能性があります。mtDNAのこれらの潜在的に有用な特性に加えて、細胞周期の制御下にはなく、ATP 生成とミトコンドリアの恒常性を維持するために重要です。これらの特性により、mtDNAを標的とすることは実用的な治療戦略となります。[ 72 ]
がんバイオマーカー がんの病期分類、予後、治療には、いくつかのバイオマーカーが 有用である。これらは、一塩基多型 （SNP）、染色体異常 、DNAコピー数の変化、マイクロサテライト不安定性、プロモーター領域のメチル化 、あるいは高タンパク質レベルや低タンパク質レベルなど多岐にわたる。[ 90 ] [ 91 ]
参考文献 1 2 Strausberg RL 、 Simpson AJ、Old LJ、Riggins GJ (2004 年5 月 )。 「腫瘍ゲノミクスと新しい癌治療 法 の 開発」。Nature。429 ( 6990 ) : 469–74。Bibcode : 2004Natur.429..469S。doi : 10.1038 / nature02627。PMID 15164073。S2CID 37628107。 ↑ Ting AH、 McGarvey KM、 Baylin SB (2006)。 「がんのエピゲノム—構成要素と機能的相関」 。Genes Dev。20 ( 23 ) : 3215–31。doi : 10.1101 / gad.1464906。PMID 17158741 。 ↑ Jones PA、Baylin SB (2007)。 「 がん のエピゲノミクス 」 。Cell。128 ( 4 ) : 683–92。doi : 10.1016 / j.cell.2007.01.029。PMC 3894624。PMID 17320506 。 ↑ Li D, Zhang B, Xing X, Wang T (2015). "ゲノムワイドCpGメチル化を調査するためのMeDIP-seqとMRE-seqの組み合わせ" . Methods . 72 : 29– 40. doi : 10.1016/j.ymeth.2014.10.032 . PMC 4300244 . PMID 25448294 . ↑ Wei J, Li G, Dang S, Zhou Y, Zeng K, Liu M (2016). "大腸癌の過メチル化マーカーの発見と検証" . Dis. Markers . 2016 2192853. doi : 10.1155/2016/2192853 . PMC 4963574 . PMID 27493446 . 1 2 Strausberg RL、Simpson AJ (2010 年 1 月)。 「腫瘍生物学のより深い理解へ の アプローチとしての全ゲノムがん解析」 。Br . J. Cancer。102 ( 2 ): 243–8。doi : 10.1038 / sj.bjc.6605497。PMC 2816661。PMID 20029419 。 ↑ Vogelstein B、Papadopoulos N 、 Velculescu VE、Zhou S、Diaz LA、 Kinzler KW (2013)。 「 がん ゲノム ランドスケープ」 。Science。339 (6127 ) : 1546–58。Bibcode : 2013Sci ... 339.1546V。doi : 10.1126 / science.1235122。PMC 3749880。PMID 23539594 。 ↑ Luo Y, Wong CJ, Kaz AM, Dzieciatkowski S, Carter KT, Morris SM, Wang J, Willis JE, Makar KW, Ulrich CM, Lutterbaugh JD, Shrubsole MJ, Zheng W, Markowitz SD, Grady WM (2014). "DNAメチル化シグネチャの違いにより、腺腫から大腸癌への進行の複数の経路が明らかになる" . Gastroenterology . 147 (2): 418–29.e8. doi : 10.1053/j.gastro.2014.04.039 . PMC 4107146 . PMID 24793120 . ↑ Ley TJ、Mardis ER、Ding L、Fulton B、McLellan MD、Chen K、et al . ( 2008 年 11 月)。 「 細胞 遺伝 学 的に正常な急性骨髄性白血病ゲノムの DNA シーケンス」 。Nature。456 ( 7218 ): 66–72。Bibcode : 2008Natur.456...66L。doi : 10.1038 / nature07485。PMC 2603574。PMID 18987736 。 1 2 ペイコフ、キラ (2015-10-16). 「奇跡的な回復が癌克服について教えてくれること」 . ポピュラーメカニクス . 2016-04-28 に取得。 ↑ Bardelli A. ; Velculescu VE (2005). "ヒト癌における遺伝子ファミリーの変異解析". Current Opinion in Genetics & Development . 15 (1): 5– 12. doi : 10.1016/j.gde.2004.12.009 . PMID 15661527 . ↑ Benvenuti S.; Arena S.; Bardelli A. (2005). "腫瘍ゲノムの変異プロファイリングによる癌遺伝子の同定". FEBS Letters . 579 (8): 1884–1890 . doi : 10.1016/j.febslet.2005.02.015 . PMID 15763568. S2CID 31708201 . ↑ Shih IM; Wang TL (2005). "革新的な技術を応用して癌ゲノムを探索する". Current Opinion in Oncology . 17 (1): 33– 38. doi : 10.1097/01.cco.0000147382.97085.e4 . PMID 15608510 . S2CID 39104975 . ↑ Greshock J、Naylor TL、Margolin A、Diskin S、Cleaver SH、Futreal PA、et al. (2004 年 1 月)。 「癌遺伝子解析用に最適化さ れ た BAC クローンセット を使用した 1 Mb 解像度アレイベース比較ゲノムハイブリダイゼーション」 。Genome Res。14 ( 1 ) : 179–87。doi : 10.1101/gr.1847304。PMC 314295。PMID 14672980 。 ↑ Lucito R、Healy J、Alexander J、Reiner A、Esposito D、Chi M、et al. (2003 年 10 月)。 「代表的オリゴヌクレオチドマイクロアレイ解析：ゲノムコピー数変異を検出するための高解像度法」 。Genome Res . 13 (10): 2291–305 . doi : 10.1101 / gr.1349003 . PMC 403708. PMID 12975311 . ↑ Hu M, Yao J, Polyak K (2006). "メチル化特異的デジタル核型分析". Nat Protoc . 1 (3): 1621– 36. doi : 10.1038/nprot.2006.278 . PMID 17406428 . S2CID 10554933 . ↑ Körner H、Epanchintsev A、Berking C、Schuler-Thurner B、Speicher MR、Menssen A、Hermeking H (2007 年 1 月)。 「デジタル核型分析 により 、 悪性黒色腫におけるジストロフィン/DMD 遺伝子の頻繁な不活性化 が 明らかになった」 。Cell Cycle。6 (2): 189–98。doi : 10.4161 / cc.6.2.3733。PMID 17314512 。 ↑ Volik S、Zhao S、Chin K、Brebner JH、Herndon DR、Tao Q、et al. (2003 年 6 月)。 「 末端 配列 プロファイリング :異常ゲノム の 配列ベース解析」 。Proc . Natl. Acad. Sci. USA。100 ( 13) : 7696–701。Bibcode : 2003PNAS..100.7696V。doi : 10.1073 / pnas.1232418100。PMC 164650。PMID 12788976 。 ↑ Van, de Vijver MJ; et al. (2002). "乳がんにおける生存予測因子としての遺伝子発現シグネチャー". New England Journal of Medicine . 347 (25): 1999–2009 . doi : 10.1056/NEJMoa021967 . hdl : 1874/15577 . PMID 12490681 . ↑ van 't Veer LJ、Dai H、van de Vijver MJ、He YD、Hart AA、Bernards R、Friend SH (2003)。 「 発現 プロファイリングは乳がんの予後を予測する」 。Breast Cancer Res。5 ( 1 ) : 57–8。doi : 10.1186 / bcr562。PMC 154139。PMID 12559048 。 ↑ Xu Q.; Lee C. (2003). "ヒト発現配列における新規スプライス形態の発見と癌特異的代替スプライシングの機能解析" . Nucleic Acids Research . 31 (19): 5635– 5643. doi : 10.1093/nar/gkg786 . PMC 206480 . PMID 14500827 . ↑ Gonzalez-Perez A、Mustonen V、Reva B、Ritchie GR、Creixell P、Karchin R、et al. (2013 年 8 月)。 「がんゲノムにおける機能的遺伝子変異を同定するための計算 アプローチ 」 。Nat . Methods。10 ( 8 ) : 723–9。doi : 10.1038 / nmeth.2562。PMC 3919555。PMID 23900255 。 ↑ Hanash SM (2000年9月)「オペロミクス：DNAからRNA、タンパク質までの組織の分子解析」 Clin. Chem. Lab. Med . 38 (9): 805–13 . doi : 10.1515/CCLM.2000.116 . PMID 11097332 . S2CID 34163524 . ↑ Peeper D 、Berns A (2006 年6 月 ) 。 「 がん遺伝子同定における異種間オンコゲノミクス」 。Cell。125 (7): 1230–3。doi : 10.1016 /j.cell.2006.06.018。PMID 16814709 。 ↑ Rogozin IB、Pavlov YI、Goncearenco A、De S、Lada AG、Poliakov E、Panchenko AR、Cooper DN (2018年11月)。 「がんゲノムにおける変異シグネチャと変異可能なモチーフ」 。Brief . Bioinformatics . 19 (6): 1085– 1101. doi : 10.1093/bib/bbx049 . PMC 6454500 . PMID 28498882 . ↑ Gao D、 Herman JG 、Guo M (2016)。 「ヒト癌 におけるDNA 損傷 修復遺伝子の異常なエピジェネティック変化の臨床 的 価値」 。Oncotarget。7 ( 24 ): 37331–37346。doi : 10.18632/ oncotarget.7949。PMC 5095080。PMID 26967246 。 ↑ Kastan MB (2008). "DNA損傷応答：ヒト疾患におけるメカニズムと役割：2007 GHA Clowes Memorial Award Lecture" (PDF) . Mol. Cancer Res . 6 (4): 517– 24. doi : 10.1158/1541-7786.MCR-08-0020 . PMID 18403632 . ↑ Bernstein, C; Prasad, AR; Nfonsam, V; Bernstein, H. (2013). 「第16章：DNA損傷、DNA修復、および癌」。Chen, Clark (編)『 DNA 修復における新たな研究方向 』BoD – Books on Demand。p. 413。ISBN 978-953-51-1114-6 。↑ O'Hagan HM、Mohammad HP、Baylin SB (2008)。 「二本鎖切断は 、 外来プロモーターCpGアイランドにおける遺伝子サイレンシングとSIRT1依存性DNAメチル化の開始を引き起こす可能性がある 」 。PLOS Genetics。4 ( 8 ) e1000155。doi : 10.1371 / journal.pgen.1000155。PMC 2491723。PMID 18704159 。 ↑ Cuozzo C、Porcellini A、Angrisano T、et al. (2007年7月) 「DNA損傷、相同組換え修復、およびDNAメチル化」 . PLOS Genetics . 3 (7) e110. doi : 10.1371/journal.pgen.0030110 . PMC 1913100. PMID 17616978 . （撤回済み。doi : 10.1371 /journal.pgen.1011921 、PMID 41144352、Retraction Watchを 参照） ↑ Coulondre C、Miller JH、Farabaugh PJ 、 Gilbert W (1978 年8 月 )。 「 大腸菌における塩基置換ホットスポットの分子基盤 」 。Nature。274 ( 5673 ) : 775–80。Bibcode : 1978Natur.274..775C。doi : 10.1038 / 274775a0。PMID 355893。S2CID 4165194 。 ↑ Cooper DN、Youssoufian H (1988年 2月)。「CpGジヌクレオチドとヒト遺伝性疾患」。Hum . Genet . 78 (2): 151–5 . doi : 10.1007/bf00278187 . PMID 3338800. S2CID 41948691 . 1 2 ロゴジン IB、コルチャノフ NA (1992 年 11 月)。 「免疫グロブリン遺伝子における体細胞超突然変異誘発 II. 突然変異誘発に対する隣接する塩基配列の影響」。 ビオチム。生物物理学。アクタ 。 1171 (1): 11–8 . 土井 : 10.1016/0167-4781(92)90134-l 。 ISSN 0006-3002 。 PMID 1420357 。 ↑ Rogozin IB、Pavlov YI、Bebenek K、Matsuda T、Kunkel TA (2001 年 6 月)。「体細胞突然変異ホットスポットは DNA ポリメラーゼ イータ エラー スペクトルと相関する」。Nat . Immunol . 2 (6): 530–6 . doi : 10.1038/88732 . ISSN 1529-2908 . PMID 11376340. S2CID 12807889 . ↑ Nik-Zainal S、Alexandrov LB、Wedge DC、Van Loo P、Greenman CD、Raine K、et al . ( 2012 年 5 月)。 「21 種類 の乳がんのゲノムを形成する突然変異プロセス」 。Cell。149 ( 5 ): 979–93。doi : 10.1016/ j.cell.2012.04.024。PMC 3414841。PMID 22608084 。 ↑ Alexandrov LB、Nik-Zainal S、Wedge DC、Campbell PJ、Stratton MR (2013 年 1 月)。 「 ヒト 癌 で作用する変異プロセスのシグネチャ の 解読」 。Cell Rep。3 ( 1 ): 246–59。doi : 10.1016 / j.celrep.2012.12.008。PMC 3588146。PMID 23318258 。 ↑ Rosenthal R、 McGranahan N、Herrero J、Taylor BS、Swanton C (2016 年 2 月)。 「DeconstructSigs: 単一腫瘍における変異プロセスの解明により、DNA 修復欠損と癌の進化パターンが区別 さ れる 」 。Genome Biol。17 : 31。doi : 10.1186 / s13059-016-0893-4。PMC 4762164。PMID 26899170 。 ↑ Goncearenco A、Rager SL、Li M、Sang QX、Rogozin IB、Panchenko AR (2017年7月)。 「がんの遺伝的多様 性 を 解明するための背景変異プロセスの探索」 。Nucleic Acids Res。45 ( W1 ): W514– W522。doi : 10.1093/nar/ gkx367。PMC 5793731。PMID 28472504 。 1 2 3 Muller FL 、 Colla S 、 Aquilanti E、Manzo VE、Genovese G、Lee J、et al . (2012 年 8 月)。 「 パッセンジャー 欠失 は 癌における治療上の脆弱性を生み出す」 。Nature。488 ( 7411 ): 337–42。Bibcode : 2012Natur.488..337M。doi : 10.1038 / nature11331。PMC 3712624。PMID 22895339 。 ↑ Muller FL、Aquilanti EA 、DePinho RA（2015 年 11月）。 「副次的致死性：腫瘍学における新たな治療戦略 」 。Trends Cancer。1 （ 3 ） ： 161–173。doi ： 10.1016 / j.trecan.2015.10.002。PMC 4746004。PMID 26870836 。 ↑ Poyner RR、Reed GH（1992 年8 月）。 「 エノラーゼの活性部位におけるホスホノアセトヒドロキサメートと の 二価陽イオン複合体の構造」。Biochemistry。31 （ 31 ）： 7166–73。doi ： 10.1021/bi00146a020。PMID 1322695 。 ↑ Joseph J、Cruz-Sánchez FF、Carreras J (1996 年 6 月)。「ヒト脳領域および腫瘍におけるエノラーゼ活性とアイソザイム分布」。J . Neurochem . 66 (6): 2484–90 . doi : 10.1046/j.1471-4159.1996.66062484.x . PMID 8632173. S2CID 24655147 . 1 2 Leonard PG、Satani N、Maxwell D、Lin YH、Hammoudi N、Peng Z、et al. (2016 年 12 月)。 「SF2312 はエノラーゼの天然ホスホネート阻害剤である」 。Nat . Chem. Biol . 12 (12): 1053– 1058. doi : 10.1038/nchembio.2195 . PMC 5110371 . PMID 27723749 . 1 2 Dey P、Baddour J、Muller F 、 Wu CC、Wang H、Liao WT、et al . (2017 年 2 月)。 「 リンゴ 酸酵素 2 の ゲノム欠失は膵臓癌における副次的致死性をもたらす」 。Nature。542 ( 7639 ) : 119–123。Bibcode : 2017Natur.542..119D。doi : 10.1038 / nature21052。PMC 5398413。PMID 28099419 。 ↑ Liou GY、Döppler H、DelGiorno KE、Zhang L、Leitges M、Crawford HC、Murphy MP、Storz P (2016 年 3 月)。 「腺房細胞 における 変異型 KRas 誘導ミトコンドリア酸化ストレスは EGFR シグナル伝達を上方制御し 、 膵臓前癌病変の形成を促進する」 。Cell Rep。14 ( 10 ) : 2325–36。doi : 10.1016/ j.celrep.2016.02.029。PMC 4794374。PMID 26947075 。 ↑ Oike T, Ogiwara H, Tominaga Y, Ito K, Ando O, Tsuta K, et al. (2013年9月). "クロマチンリモデリング因子BRG1の遺伝子欠損を有する癌を治療するための合成致死性に基づく戦略" . Cancer Res . 73 (17): 5508–18 . doi : 10.1158/0008-5472.CAN-12-4593 . PMID 23872584 . ↑ Murata S, Zhang C, Finch N, Zhang K, Campo L, Breuer EK (2016). "合成致死性の予測因子と調節因子：PARP阻害剤と個別化医療の最新情報" . Biomed Res Int . 2016 2346585. doi : 10.1155/2016/2346585 . PMC 5013223 . PMID 27642590 . ↑ Lok BH、Carley AC、Tchang B、Powell SN (2013)。 「RAD52の不活性化は 、 RAD51 を介した相同組換えにより 、 BRCA2に加えてBRCA1およびPALB2の欠損と合成致死性を示す」 。Oncogene。32 ( 30 ) : 3552–8。doi : 10.1038 / onc.2012.391。PMC 5730454。PMID 22964643 。 ↑ Cramer-Morales K、Nieborowska-Skorska M、Scheibner K、Padget M、Irvine DA、Sliwinski T、Haas K、Lee J、Geng H、Roy D、Slupianek A、Rassool FV、Wasik MA、Childers W、Copland M、Müschen M、Civin CI、Skorski T (2013)。 「 遺伝子変異と発現プロファイルによって特定された 白血病 におけるRAD52 を 標的とした個別化合成致死」 。Blood。122 ( 7 ): 1293–304。doi : 10.1182 / blood-2013-05-501072。PMC 3744994。PMID 23836560 。 ↑ Eshleman JR、Lang EZ、Bowerfind GK、Parsons R、Vogelstein B、Willson JK、Veigl ML、Sedwick WD、Markowitz SD (1995)。「結腸癌におけるマイクロサテライト不安定性に伴うhprt遺伝子座での突然変異率の増加 」 。Oncogene。10 ( 1 ) : 33–7。PMID 7824277 。 ↑ Le DT、Uram JN、Wang H、Bartlett BR、Kemberling H、Eyring AD、et al. (2015)。 「 ミスマッチ修復欠損腫瘍におけるPD-1阻害」 。N . Engl. J. Med . 372 (26): 2509–20 . doi : 10.1056/NEJMoa1500596 . PMC 4481136. PMID 26028255 . ↑ Watanabe R, Ui A, Kanno S, Ogiwara H, Nagase T, Kohno T, Yasui A (2014). "SWI/SNF 因子は、DNA 損傷に対する細胞抵抗性に必要であり、ARID1A および ARID1B を含み、相互依存的なタンパク質安定性を示す" . Cancer Res . 74 (9): 2465–75 . doi : 10.1158/0008-5472.CAN-13-3608 . PMID 24788099 . ↑ Raab JR、Resnick S、Magnuson T (2015)。 「 生化学 的 に 異なるSWI/SNF複合体によって媒介されるゲノムワイド転写調節」 。PLOS Genet。11 ( 12) e1005748。doi : 10.1371 / journal.pgen.1005748。PMC 4699898。PMID 26716708 。 ↑ Lawrence MS、Stojanov P 、 Mermel CH、Robinson JT、Garraway LA、Golub TR、Meyerson M、Gabriel SB、Lander ES、Getz G (2014)。 「 21 種類 の 腫瘍タイプにわたる癌遺伝子の発見と飽和分析 」 。Nature。505 ( 7484 ) : 495–501。Bibcode : 2014Natur.505..495L。doi : 10.1038 / nature12912。PMC 4048962。PMID 24390350 。 ↑ Zhang X, Sun Q, Shan M, Niu M, Liu T, Xia B, Liang X, Wei W, Sun S, Zhang Y, Liu XS, Song Q, Yang Y, Ma Y, Liu Y, Yang L, Ren Y, Zhang G, Pang D (2013). "ARID1A遺伝子のプロモーター過剰メチル化は、多くの浸潤性乳癌におけるmRNA発現低下の原因である" . PLOS ONE . 8 (1) e53931. Bibcode : 2013PLoSO...853931Z . doi : 10.1371/journal.pone.0053931 . PMC 3549982 . PMID 23349767 . ↑ Wu JN、Roberts CW (2013)。 「 がんにおけるARID1A変異：もう一つのエピジェネティック腫瘍抑制因子か？」 。 Cancer Discov。3 ( 1 ) : 35– 43。doi : 10.1158 /2159-8290.CD- 12-0361。PMC 3546152。PMID 23208470 。 ↑ Bitler BG、Aird KM、Garipov A、Li H、Amatangelo M、Kossenkov AV、Schultz DC、Liu Q、Shih IeM、Conejo-Garcia JR、Speicher DW、Zhang R (2015)。 「ARID1A変異癌におけるEZH2メチルトランスフェラーゼ活性を標的とした合成致死性」 。Nat . Med . 21 (3): 231–8 . doi : 10.1038/nm.3799 . PMC 4352133. PMID 25686104 . ↑ Kim KH, Kim W, Howard TP, Vazquez F, Tsherniak A, Wu JN, Wang W, Haswell JR, Walensky LD, Hahn WC, Orkin SH, Roberts CW (2015). "SWI/SNF変異癌はEZH2の触媒活性と非触媒活性に依存する" . Nat. Med . 21 (12): 1491– 6. doi : 10.1038/nm.3968 . PMC 4886303 . PMID 26552009 . ↑ Miller RE、Brough R、Bajrami I、Williamson CT、McDade S、Campbell J、et al. (2016)。 「ダサチニブによるARID1A変異卵巣明細胞腫瘍の合成致死標的化」 （PDF） 。Mol . Cancer Ther . 15 (7): 1472–84 . doi : 10.1158/1535-7163.MCT-15-0554 . PMID 27364904 . ↑ Kaelin WG (2005). 「抗がん療法における合成致死性の概念」 Nature Reviews Cancer . 5 (9): 689– 698. doi : 10.1038/nrc1691 . PMID 16110319 . S2CID 3218512 . ↑ O'Connor MJ; Martin NMB; Smith GCM (2007). "DNA鎖 切断修復阻害に基づく標的がん治療". Oncogene . 26 (56): 7816–7824 . doi : 10.1038/sj.onc.1210879 . PMID 18066095. S2CID 33955861 . ↑ Farmer H、McCabe N、Lord CJ、Tutt AN、Johnson DA、Richardson TB、Santarosa M、Dillon KJ、Hickson I、Knights C、Martin NM、Jackson SP、Smith GC、Ashworth A (2005年4月)「BRCA変異細胞におけるDNA修復欠陥を標的と し た 治療 戦略 」 Nature.434 ( 7035 ) : 917–21.Bibcode : 2005Natur.434..917F.doi : 10.1038 / nature03445.PMID 15829967.S2CID 4364706 . ↑ Bryant HE; Schultz, Niklas; Thomas, Huw D.; Parker, Kayan M.; Flower, Dan; Lopez, Elena; Kyle, Suzanne; Meuth, Mark; Curtin, Nicola J.; Helleday, Thomas; et al. (2005). "ポリ(ADP-リボース)ポリメラーゼ阻害剤によるBRCA2欠損腫瘍の特異的殺傷". Nature . 434 (7035): 913– 917. Bibcode : 2005Natur.434..913B . doi : 10.1038/nature03443 . PMID 15829966 . S2CID 4391043 . ↑ グンデム G、ペレス=ラマス C、ジェネ=サンツ A、ケジエルスカ A、イスラム A、デューポンズ J、ファーニー SJ、ロペス=ビガス N (2010 年 2 月)。 「IntOGen: 多次元腫瘍ゲノムデータの統合とデータマイニング」。 ナット。メソッド 。 7 (2): 92–3 . 土井 : 10.1038/nmeth0210-92 。 hdl : 10230/28107 。 PMID 20111033 。 S2CID 205417208 。 ↑ Gonzalez-Perez A、Perez-Llamas C、Deu-Pons J、Tamborero D、Schroeder MP、Jene-Sanz A、Santos A、Lopez-Bigas N (2013年11月)。 「 IntOGen 変異は 、 腫瘍の種類を超えて癌ドライバーを特定する」 。Nat . Methods。10 ( 11): 1081–2。doi : 10.1038 / nmeth.2642。PMC 5758042。PMID 24037244 。 ↑ ルビオ＝ペレス C、タンボレロ D、シュローダー MP、アントリン AA、デュポンズ J、ペレス＝ラマス C、メストレ J、ゴンサレス＝ペレス A、ロペス＝ビガス N (2015 年 3 月)。 「28種類の腫瘍のコホートに対する抗がん剤のインシリコ処方により、標的化の機会が明らかになりました 。 」 がん細胞 。 27 (3): 382–96 。 土井 : 10.1016/j.ccell.2015.02.007 。 hdl : 10230/33093 。 PMID 25759023 。 ↑ Blume - Jensen P 、 Hunter T (2001 年 5月)。 「発がん 性 キナーゼシグナル伝達」。Nature。411 ( 6835) : 355–65。Bibcode : 2001Natur.411..355B。doi : 10.1038 / 35077225。PMID 11357143。S2CID 4428819 。 ↑ Bardelli A, et al. (2003). "結腸直腸癌におけるチロシンキノームの変異解析". Science . 300 (5621): 949. doi : 10.1126/science.1082596 . PMID 12738854 . S2CID 85934154 . ↑ サミュエルズ Y 、ワン Z、バルデリ A、シリマン N、プタク J、サボ S、ヤン H、ガズダル A、パウエル SM、リギンズ GJ、ウィルソン JK、マルコウィッツ S、キンズラー KW、フォーゲルシュタイン B、ベルクレスク VE (2004 年 4 月)。 「ヒトの癌におけるPIK3CA遺伝子の突然変異の高頻度」。 科学 。 304 (5670): 554. 土井 : 10.1126/science.1096502 。 PMID 15016963 。 S2CID 10147415 。 ↑ Davies H、Bignell GR、Cox C、Stephens P、Edkins S、Clegg S、et al . (2002 年 6 月)。 「 ヒト 癌 における BRAF 遺伝子の変異」 (PDF) 。Nature 。417 (6892) : 949–54。Bibcode : 2002Natur.417..949D 。doi : 10.1038 / nature00766 。PMID 12068308 。S2CID 3071547 。 ↑ Danson S.; Lorigan P. (2005). "進行性悪性黒色腫の治療成績の改善 – 全身療法に関する最新情報". Drugs . 65 (6): 733– 743. doi : 10.2165/00003495-200565060-00002 . PMID 15819587 . S2CID 46969987 . 1 2 3 4 5 Yu, Man (2012). ヒト癌における体細胞ミトコンドリアDNA変異 . Advances in Clinical Chemistry. Vol. 57. pp. 99–138 . doi : 10.1016/B978-0-12-394384-2.00004-8 . ISBN 978-0-12-394384-2 PMID 22870588 ↑ Hung, WY; JC Lin; LM Lee; et al. (2008). "ヒトミトコンドリアDNA Dループ領域のポリシトシン伸長変動と相関するタンデム重複/三重重複" . Mutagenesis . 23 (2): 137– 142. doi : 10.1093/mutage/gen002 . PMID 18252697 . ↑ Fliss, MS; Usadel, H.; Caballero, OL; et al. (2000). "腫瘍および体液中のミトコンドリアDNA変異の容易な検出". Science . 287 (5460): 2017–2019 . Bibcode : 2000Sci...287.2017F . doi : 10.1126/science.287.5460.2017 . PMID 10720328 . S2CID 24438279 . 1 2 Dani, MA; SU Dani; SP Lima; et al. (2004). "様々な種類の腫瘍でΔmtDNA4977が正常より少ないことから、癌細胞は基本的にこの変異がないことが示唆される". Genet. Mol. Res . 3 (3): 395– 409. PMID 15614730 . ↑ Ye, C.; XO Shu; W. Wen; et al. (2008). "散発性乳がんおよび良性乳腺疾患におけるミトコンドリアDNA 4977 bp欠失の定量的解析" . Breast Cancer Res. Treat . 108 (3): 427– 434. doi : 10.1007/s10549-007-9613-9 . PMC 3836503 . PMID 17541740 . ↑ Tseng, LM; PH Yin; CW Chi; et al. (2006). "乳がんにおけるミトコンドリアDNA変異とミトコンドリアDNA欠乏". Genes Chromosomes Cancer . 45 (7): 629– 638. doi : 10.1002/gcc.20326 . PMID 16568452 . S2CID 21181048 . ↑ Zhu, W.; W. Qin; P. Bradley; A. Wessel; CL Puckett; ER Sauter (2005). "乳癌組織および対応する乳頭吸引液中のミトコンドリアDNA変異" . Carcinogenesis . 26 (1): 145– 152. doi : 10.1093/carcin/bgh282 . PMID 15375011 . ↑ Zhou S、Kachhap S、Sun W、Wu G、Chuang A、Poeta L、Grumbine L、Mithani SK、Chatterjee A、Koch W、Westra WH、Maitra A、Glazer C、Carducci M、Sidransky D、McFate T、Verma A、Califano JA (2007 年 5 月)。 「ヒト頭頸部扁平上皮がんにおけるミトコンドリア DNA 変異の頻度と表現型への影響」 。 手順国立アカド。科学。アメリカ 。 104 (18): 7540– 5. Bibcode : 2007PNAS..104.7540Z 。 土井 ： 10.1073/pnas.0610818104 。 PMC 1863503 。 PMID 17456604 。 ↑ Poetsch M、Petersmann A、Lignitz E、Kleist B (2004 年 3 月)。「頭頸部扁平上皮癌におけるミトコンドリア DNA 不安定性、ミトコンドリア DNA 大規模欠失、および核マイクロサテライト不安定性の関係」。Diagn . Mol. Pathol . 13 ( 1): 26–32 . doi : 10.1097/00019606-200403000-00005 . PMID 15163006. S2CID 21271445 . ↑ Tan, DJ; J. Chang; WL Chen; et al. (2004). "ビンロウ咀嚼者の口腔癌における体細胞ミトコンドリアDNA変異". Ann . NY Acad. Sci . 1011 (1): 310–316 . Bibcode : 2004NYASA1011..310T . doi : 10.1196/annals.1293.030 . PMID 15126307. S2CID 19794015 . ↑ Lee, HC; SH Li; JC Lin; CC Wu; DC Yeh; YH Wei (2004). "ヒト肝細胞癌におけるDループの体細胞変異とミトコンドリアDNAコピー数の減少". Mutation Research . 547 ( 1–2 ): 71–78 . doi : 10.1016/j.mrfmmm.2003.12.011 . PMID 15013701 . ↑ Yin, PH; CC Wu; JC Lin; CW Chi; YH Wei; HC Lee (2010). "肝細胞癌におけるミトコンドリアゲノムの体細胞変異". Mitochondrion . 10 (2): 174– 182. doi : 10.1016/j.mito.2009.12.147 . PMID 20006738 . ↑ Tan, DJ; J. Chang; LL Liu; et al. (2006). "食道癌における体細胞変異とミトコンドリアDNA含有量変化の意義" . BMC Cancer . 6:93 . doi : 10.1186/1471-2407-6-93 . PMC 1459869. PMID 16620376 . ↑ Kassauei K 、 Habbe N、Mullendore ME、Karikari CA、Maitra A、Feldmann G (2006)。「膵臓癌におけるミトコンドリアDNA変異 」 。Int J Gastrointest Cancer。37 ( 2–3 ) : 57–64。doi : 10.1007 / s12029-007-0008-2。PMID 17827523。S2CID 9716204 。 ↑ Hung WY、Wu CW、Yin PH、Chang CJ、Li AF、Chi CW、Wei YH、Lee HC (2010年3月)「ミトコンドリアゲノムの体細胞変異とヒト胃癌の進行におけるそれらの潜在的な役割」 Biochim. Biophys. Acta . 1800 (3): 264–70 . doi : 10.1016/j.bbagen.2009.06.006 . PMID 19527772 . ↑ Wu CW、Yin PH、Hung WY、Li AF、Li SH、Chi CW、Wei YH、Lee HC（2005年9月）。「胃癌におけるミトコンドリアDNA変異とミトコンドリアDNA欠乏 」 。Genes Chromosomes Cancer。44 （ 1 ） ： 19–28。doi ： 10.1002 / gcc.20213。PMID 15892105。S2CID 11009518 。 ↑ Yu, JJ; T. Yan (2010). "前立腺癌患者におけるミトコンドリアDNA変異が腫瘍悪性度に及ぼす影響". Aging Male . 13 (3): 159– 165. doi : 10.3109/13685530903536668 . PMID 20136572. S2CID 22017823 . ↑ Gomez-Zaera, M.; J. Abril; L. Gonzalez; et al. (2006). "前立腺癌患者における体細胞および生殖細胞系ミトコンドリアDNA配列変異の同定". Mutation Research . 595 ( 1– 2): 42– 51. doi : 10.1016/j.mrfmmm.2005.10.012 . PMID 16472830 . ↑ Ludwig JA 、Weinstein JN (2005 年 11月 )。 「がん の病 期 分類、予後、治療選択におけるバイオマーカー」 。Nat . Rev. Cancer。5 ( 11 ): 845–56。doi : 10.1038/ nrc1739。PMID 16239904。S2CID 25540232 。 ↑ Kurian (2023年7月3日) 「がん診断後の生殖 細胞 系遺伝子検査」 JAMA 330 ( 1): 43– 51. doi : 10.1001/jama.2023.9526 . PMC 10242510 . PMID 37276540 . 2023年 7月4日 取得 。 
