ヒトに見られる哺乳類タンパク質
TSC1 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス TSC1 、LAM、TSC、結節性硬化症1、TSC複合体サブユニット1 外部ID オミム ：605284; MGI : 1929183; ホモロジーン : 314; ジーンカード ：TSC1; OMA :TSC1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体2（マウス） [2] バンド 2|2 A3 始める 28,531,240 bp [2] 終わり 28,581,179 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 緻密部 臀筋 外淡蒼球 海馬のI領域 網状部 視床の外側核群 迷走神経背側運動核 下オリーブ核 上前庭核 中側頭回
トップの表現 腹内側核 外側視床下部 外側中隔核 前扁桃体領域 視索上核 吻側回遊流 視床下部室傍核 黒質 乳頭体 弓状核
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
シャペロンバインディング タンパク質結合 タンパク質N末端結合 Hsp70タンパク質結合 ATPase阻害活性 Hsp90タンパク質結合 GTPase活性化タンパク質結合 細胞成分
細胞質 細胞皮質 成長円錐 細胞内膜で囲まれた細胞小器官 ラメリポディウム 膜 アクチンフィラメント TSC1-TSC2複合体 細胞骨格 細胞質 核 細胞質の核周囲領域 脂肪滴 細胞膜 細胞投影 タンパク質含有複合体 シャペロン複合体 シナプス後密度 生物学的プロセス
核からのrRNAの輸出 細胞周期の調節 神経管閉鎖 大脳皮質の発達 メモリーT細胞の分化 タンパク質キナーゼ活性の調節 接着斑集合体の正の調節 髄鞘形成 インスリン受容体シグナル伝達経路の負の調節 シナプス組織 翻訳の規制 海馬の発達 リン酸化タンパク質ホスファターゼ活性の調節 細胞-マトリックス接着 カリウムイオン輸送 適応免疫反応 タンパク質ヘテロオリゴマー化 腎臓の発達 神経系の発達 細胞投影組織 GTPase活性の活性化 接着斑集合体の調節 グルコース輸入 細胞-マトリックス接着の調節 細胞サイズの負の調節 インスリンに対する反応 心筋細胞の分化 翻訳の否定的規制 細胞集団増殖の負の調節 酸素・グルコース欠乏に対する細胞反応 成人の運動行動 TORシグナル伝達の負の調節 ニューロン死の調節 マクロオートファジーの負の制御 ニューロン投射発達の負の調節 マクロオートファジーの正の制御 GTPase活性の負の調節 ストレスファイバー集合の調節 ストレスファイバー集合の正の調節 酸化ストレスによるニューロン死の抑制 ATP依存性活性の負の調節 タンパク質の安定化 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_000368 NM_001008567 NM_001162426 NM_001162427 NM_001362177
NM_022887 NM_001289575 NM_001289576
RefSeq (タンパク質) NP_000359 NP_001155898 NP_001155899 NP_001349106
NP_001276504 NP_001276505 NP_075025
場所 (UCSC) 9 章: 132.89 – 132.95 Mb 2 章: 28.53 – 28.58 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
結節性硬化症1（TSC1）は ハマルチン としても知られ、ヒトでは TSC1 遺伝子 によってコードされる タンパク質 です 。 [5]
関数 TSC1は、シャペロンHsp90（熱ショックタンパク質90） のATPase活性を阻害し 、そのシャペロンサイクルを減速させる コシャペロン として機能します。TSC1は、 TSC2 を含むキナーゼおよび非キナーゼクライアントをシャペロンするHsp90の促進因子として機能し、それによってプロテアソームでのユビキチン化と分解を防ぎます。 [6] TSC1、TSC2、およびTBC1D7は、TSC複合体としても知られる多タンパク質複合体です。この複合体は、 mTORC1の必須活性化因子である小さなGTPase Rheb のGTPase活性化タンパク質（GAP）として機能することにより、 mTORC1シグナル伝達を負に制御します。TSC複合体は、 腫瘍抑制因子 として関与していることが示唆されています 。
臨床的意義 この遺伝子の欠陥は 、TSC複合体の機能障害により 結節性硬化症を引き起こす可能性がある。 [ 要出典 ] TSC1の欠陥は局所性 皮質異形成 の原因となる可能性もある 。 [ 要出典 ] TSC1は、 海馬 CA3領域の脳 ニューロンを 脳卒中 の影響から 保護することに関与している可能性がある 。 [7]
インタラクション TSC1 は以下と相互作用する ことが示されています :
AKT1 , [8] HSP70 [6] HSP90 [6] NEFL , [9] PLK1 、 [10] および TSC2 . [10] [11] [12] [13] [14] [ 15] [16] [17] [18] [19] [20] [21] [22] [23] [24] [25] [26] [27] [ 過剰な引用 ]
参照
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000165699 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000026812 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「Entrez Gene: TSC1 結節性硬化症 1」。 ^ abc Woodford MR、Sager RA、Marris E、Dunn DM、Blanden AR、Murphy RL、Rensing N、Shapiro O、Panaretou B、Prodromou C、Loh SN、Gutmann DH、Bourboulia D、Bratslavsky G、Wong M、 Mollapour M (2017 年12 月)。「腫瘍抑制因子 Tsc1 は、キナーゼ および 非キナーゼクライアント のフォールディングを促進する 新しい Hsp90 コシャペロンです」。The EMBO Journal。36 ( 24): 3650–3665。doi :10.15252/embj.201796700。PMC 5730846。PMID 29127155 。 ^ Papadakis M、Hadley G、Xilouri M、Hoyte LC、Nagel S、McMenamin MM、Tsaknakis G、Watt SM、Drakesmith CW、Chen R、Wood MJ、Zhao Z、Kessler B、Vekrellis K、Buchan AM (2013 年 3 月)。「Tsc1 (ハマルティン) はオートファジーを誘導することで虚血に対する神経保護作用を発揮する」。Nature Medicine。19 ( 3 ) : 351–7。doi : 10.1038/nm.3097。PMC 3744134。PMID 23435171 。 ^ Roux PP、Ballif BA、Anjum R、Gygi SP、Blenis J (2004 年 9 月)。「腫瘍促進ホルボールエステルと活性化 Ras は p90 リボソーム S6 キナーゼを介して結節性硬化症腫瘍抑制因子複合体を不活性化する」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。101 ( 37): 13489–94。Bibcode :2004PNAS..10113489R。doi : 10.1073 / pnas.0405659101。PMC 518784。PMID 15342917 。 ^ Haddad LA、Smith N、Bowser M、Niida Y、Murthy V、Gonzalez-Agosti C、Ramesh V (2002 年 11 月)。「TSC1 腫瘍抑制因子ハマルチンはニューロフィラメント L と相互作用し、ニューロン細胞骨格の新規インテグレーターとして機能する可能性がある」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 46): 44180–6。doi : 10.1074/ jbc.M207211200。PMID 12226091 。 ^ ab Astrinidis A、Senapedis W、Henske EP (2006 年 1 月 )。「結節性硬化症複合体 1 遺伝子産物であるハマルチンは、リン酸化依存的にポロ様キナーゼ 1 と相互作用する」。 ヒト 分子遺伝学 。15 (2): 287–97。doi : 10.1093/hmg/ ddi444。PMID 16339216 。 ^ Hodges AK 、Li S、Maynard J、Parry L、Braverman R、Cheadle JP、DeClue JE、Sampson JR (2001 年 12 月)。「TSC1 および TSC2 の病理学的変異はハマルチンとチュベリンの相互作用を阻害する」。 ヒト 分子 遺伝学 。10 (25): 2899–905。doi : 10.1093/hmg/10.25.2899。PMID 11741833 。 ^ Aicher LD、Campbell JS 、 Yeung RS (2001 年 6 月)。「チューベリンのリン酸化はハマルチンとの相互作用を制御する。結節 性 硬化症に関与する 2 つのタンパク質」。The Journal of Biological Chemistry。276 ( 24): 21017–21。doi : 10.1074/ jbc.C100136200。PMID 11290735 。 ^ ファン・スレグテンホルストM、ネリストM、ナーゲルケルケンB、チードルJ、スネルR、ファン・デン・オーウェランドA、ロイザーA、サンプソンJ、ハレーD、ファン・デル・スルイスP (1998年6月)。 「ハマルチンとツベリン、TSC1 および TSC2 遺伝子産物の間の相互作用」。 ヒト分子遺伝学 。 7 (6): 1053–7。 土井 ： 10.1093/hmg/7.6.1053 。 hdl : 1765/8818 。 PMID 9580671。 ^ ネリスト M、ゴードブラッド MA、デ ウィンター C、ヴァーハーフ B、ジャンキー A、ロイザー AJ、ファン デン オーウェラント AM、ファン デル スルイス P、ハレー DJ (2002 年 10 月)。 「ツベリンと14-3-3ゼータの間の相互作用の同定と特性評価」。 生物化学ジャーナル 。 277 (42): 39417–24。 土井 ： 10.1074/jbc.M204802200 。 PMID 12176984。 ^ Li Y、Inoki K、 Guan KL (2004 年 9 月)。「低分子 GTPase Rheb および TSC2 GAP 活性の生化学的および機能的特性」。 分子細胞生物学 。24 (18): 7965–75。doi : 10.1128/ MCB.24.18.7965-7975.2004。PMC 515062。PMID 15340059 。 ^ Mak BC、Takemaru K、Kenerson HL、 Moon RT、Yeung RS（2003年2月）。「チューベリン-ハマルチン複合体はβ-カテニンシグナル伝達活性を負に制御する」。The Journal of Biological Chemistry。278 （ 8）：5947–51。doi ： 10.1074/ jbc.C200473200。PMID 12511557 。 ^ Ma L、Chen Z、Erdjument-Bromage H、Tempst P、Pandolfi PP (2005 年 4 月)。「Erk による TSC2 のリン酸化と機能的不活性化が結節性硬化症と癌の発症に及ぼす影響」。Cell . 121 ( 2): 179–93. doi : 10.1016/j.cell.2005.02.031 . PMID 15851026. S2CID 18663447. ^ Cai SL、Tee AR、Short JD、Bergeron JM、Kim J、Shen J、Guo R、Johnson CL、Kiguchi K、Walker CL (2006 年 4 月)。「TSC2 の活性は AKT を介したリン酸化と膜分割によって阻害される」。The Journal of Cell Biology。173 ( 2): 279–89。doi : 10.1083 /jcb.200507119。PMC 2063818。PMID 16636147 。 ^ Cao Y, Kamioka Y, Yokoi N, Kobayashi T, Hino O, Onodera M, Mochizuki N, Nakae J (2006年12月). 「FoxO1とTSC2の相互作用は、哺乳類ラパマイシン標的タンパク質/p70 S6K経路の活性化を介してインスリン抵抗性を誘導する」 The Journal of Biological Chemistry . 281 (52): 40242–51. doi : 10.1074/jbc.M608116200 . PMID 17077083. ^ Inoki K, Zhu T, Guan KL (2003年11月). 「TSC2は細胞エネルギー応答を仲介し、細胞の成長と生存を制御する」. Cell . 115 (5): 577–90. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00929-2 . PMID 14651849. S2CID 18173817. ^ Nellist M、Burgers PC、van den Ouweland AM 、 Halley DJ、Luider TM (2005 年 8 月)。「TSC1-TSC2 複合体のリン酸化と結合パートナー分析」。 生化学および生物物理学的研究通信 。333 (3): 818–26。doi :10.1016/ j.bbrc.2005.05.175。PMID 15963462 。 ^ Goncharova EA、Goncharov DA、Spaits M、Noonan DJ、Talovskaya E、Eszterhas A、Krymskaya VP (2006 年 5 月)。「リンパ脈管筋腫症における平滑筋様細胞の異常増殖: 腫瘍抑制因子 TSC2 の役割」。American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology。34 ( 5): 561–72。doi : 10.1165 /rcmb.2005-0300OC。PMC 2644221。PMID 16424383 。 ^ Astrinidis A、Senapedis W、Coleman TR、Henske EP (2003 年 12 月)。「結節性硬化症複合体 1 遺伝子の産物であるハマルチンの、サイクリン依存性キナーゼ 1/サイクリン B による細胞周期制御リン酸化」。The Journal of Biological Chemistry。278 ( 51): 51372–9。doi : 10.1074/ jbc.M303956200。PMID 14551205 。 ^ Nellist M、Verhaaf B、 Goedbloed MA、Reuser AJ、van den Ouweland AM、Halley DJ (2001 年 12 月)。「TSC2 ミスセンス変異はチュベリンのリン酸化を阻害し、チュベリン-ハマルチン複合体の形成を防ぐ」。 ヒト 分子遺伝学 。10 (25): 2889–98。doi : 10.1093/hmg/ 10.25.2889。hdl : 1765 / 9803。PMID 11741832 。 ^ Benvenuto G、Li S、Brown SJ、Braverman R、Vass WC、Cheadle JP、Halley DJ、Sampson JR、Wienecke R、DeClue JE (2000 年 12 月)。「結節性硬化症 1 (TSC1) 遺伝子産物ハマルチンは、ユビキチン化を阻害することで細胞増殖を抑制し、TSC2 産物チュベリンの発現を増強する」。Oncogene . 19 (54): 6306–16. doi : 10.1038/sj.onc.1204009 . PMID 11175345 。 ^ Murthy V、Haddad LA、Smith N、Pinney D、Tyszkowski R、Brown D、Ramesh V (2000 年 5 月)。「腎臓におけるハマルチンとチュベリンの細胞内局在の類似点と相違点」。American Journal of Physiology 。 腎臓生理学 。278 (5): F737–46。doi :10.1152/ ajprenal.2000.278.5.F737。PMID 10807585。S2CID 13321027 。 ^ Miloloza A、Rosner M、Nellist M、Halley D、Bernaschek G、Hengstschläger M (2000 年 7 月)。「TSC1 遺伝子産物であるハマルチンは細胞増殖を負に制御する」。 ヒト 分子 遺伝 学 。9 (12): 1721–7。doi : 10.1093/hmg/9.12.1721。PMID 10915759 。
さらに読む
Hengstschläger M (2001年8 月)。 「 結節性硬化症複合体遺伝子: ハエからヒトの遺伝学まで」。Archives of Dermatological Research。293 ( 8 ): 383–6。doi :10.1007/s004030100250。PMID 11686512。S2CID 35702323。 Ramesh V (2003 年6 月)。「脳における結節性硬化症複合体 (TSC) タンパク質機能の側面」。 生化学 協会論文集 。31 (パート 3): 579–83。doi :10.1042/BST0310579。PMID 12773159 。 Knowles MA、 Hornigold N、Pitt E (2003 年 6 月)。「散発性腫瘍における結節性硬化症複合体 (TSC) 遺伝子の関与」。 生化学 協会論文集 。31 (パート 3): 597–602。doi :10.1042/BST0310597。PMID 12773163 。 Ellisen LW (2005 年 11 月)。「ストレス下での成長 制御: REDD1- TSC 経路による mTOR 制御」。 細胞周期 。4 ( 11): 1500–02。doi : 10.4161/cc.4.11.2139。PMID 16258273 。 Jozwiak J、Jozwiak S (2007 年 3 月)。「巨大細胞: 塊茎形成の 2 ヒット モデルとの矛盾?」 細胞および分子神経生物学 。27 (2) : 251–61。doi : 10.1007 /s10571-006-9106-0。PMID 16897363。S2CID 31624726 。 永瀬哲也、関直人、石川和人、大平正人、瓦林裕子、大原央、田中亜人、小谷弘、宮島直人、野村直人（1996年10月）。 「未確認のヒト遺伝子のコード配列の予測。VI. 細胞株 KG-1 および脳からの cDNA クローンの分析によって推定された 80 個の新しい遺伝子 (KIAA0201 ～ KIAA0280) のコード配列」。 DNA 研究 。 3 (5): 321–9、341–54。 土井 ： 10.1093/dnares/3.5.321 。 PMID 9039502。 van Slegtenhorst M、de Hoogt R、Hermans C、Nellist M、Janssen B、Verhoef S、Lindhout D、van den Ouweland A、Halley D、Young J、Burley M、Jeremiah S、Woodward K、Nahmias J、Fox M、Ekong R、Osborne J、Wolfe J、Povey S、Snell RG、Cheadle JP、Jones AC、Tachataki M、Ravine D、Sampson JR、Reeve MP、Richardson P、Wilmer F、Munro C、Hawkins TL、Sepp T、Ali JB、Ward S、Green AJ、Yates JR、Kwiatkowska J、Henske EP、Short MP、Haines JH、Jozwiak S、Kwiatkowski DJ (1997 年 8 月)。 「 染色体9q34上の結節性硬化症遺伝子TSC1の同定」。 サイエンス。277 （ 5327 ）：805–8。doi ： 10.1126 /science.277.5327.805。PMID 9242607。 Jones AC、Daniells CE、Snell RG、Tachataki M、Idziaszczyk SA、Krawczak M、Sampson JR、Cheadle JP (1997 年 11 月)。「分子遺伝学および表現型分析により、家族性および散発性結節性硬化症に関連する TSC1 と TSC2 の違いが明らかになりました」。ヒト分子 遺伝 学 。6 ( 12 ): 2155–61。doi : 10.1093/hmg/6.12.2155。PMID 9328481 。 ファン・スレグテンホルストM、ネリストM、ナーゲルケルケンB、チードルJ、スネルR、ファン・デン・オーウェラントA、ロイザーA、サンプソンJ、ハレーD、ファン・デル・スルイスP（1998年6月）。 「ハマルチンとツベリン、TSC1 および TSC2 遺伝子産物の間の相互作用」。 ヒト分子遺伝学 。 7 (6): 1053–7。 土井 ： 10.1093/hmg/7.6.1053 。 hdl : 1765/8818 。 PMID 9580671。 Plank TL、Yeung RS 、 Henske EP (1998 年 11 月)。「結節性硬化症 1 (TSC1) 遺伝子の産物であるハマルチンは、チューベリンと相互作用し、細胞質小胞に局在するようです」。Cancer Research。58 ( 21 ): 4766–70。PMID 9809973。 Kwiatkowska J、Jozwiak S、Hall F、Henske EP、Haines JL、McNamara P、Braiser J、Wigowska-Sowinska J、Kasprzyk-Obara J、Short MP、Kwiatkowski DJ (1998 年 7 月)。「TSC1 遺伝子の包括的な変異分析: 変異の頻度、関連する特徴、および非浸透率に関する観察」。Annals of Human Genetics。62 ( Pt 4 ): 277–85。doi : 10.1046/j.1469-1809.1998.6240277.x。PMID 9924605。S2CID 12987381 。 ファン・スレグテンホルストM、ヴァーホーフS、テンペラーズA、バッカーL、ワンQ、ウェッセルスM、バッカーR、ネリストM、リンドハウトD、ハレーD、ファン・デン・オーウェラントA（1999年4月）。 「結節性硬化症複合体患者225人のコホートにおけるTSC1遺伝子の変異スペクトル：遺伝子型と表現型の相関関係の証拠なし」。 医学遺伝学ジャーナル 。 36 (4): 285–9。 土井 ：10.1136/jmg.36.4.285。 PMC 1734341 。 PMID 10227394。 Niida Y、Lawrence-Smith N、Banwell A、Hammer E、Lewis J、Beauchamp RL、Sims K、Ramesh V、Ozelius L (2000)。「結節性硬化症の無関係な患者 126 名における TSC1 および TSC2 の生殖細胞系列変異の分析」。Human Mutation。14 ( 5 ): 412–22。doi : 10.1002 /( SICI )1098-1004(199911)14:5<412::AID-HUMU7>3.0.CO;2- K。PMID 10533067。S2CID 38335573 。 Zhang H, Nanba E, Yamamoto T, Ninomiya H, Ohno K, Mizuguchi M, Takeshita K (2000). 「結節性硬化症複合体の日本人患者におけるTSC1およびTSC2遺伝子の変異解析」。Journal of Human Genetics . 44 (6): 391–6. doi : 10.1007/s100380050185 . PMID 10570911. ネリスト M、ファン スレッテンホースト MA、ゴードブラッド M、ファン デン オーウェラント AM、ハレー DJ、ファン デル スルイス P (1999 年 12 月)。 「細胞質のツベリン-ハマルチン複合体の特徴。ツベリンはハマルチンの細胞質のシャペロンです。」 生物化学ジャーナル 。 274 (50): 35647–52。 土井 ： 10.1074/jbc.274.50.35647 。 PMID 10585443。 Yamashita Y, Ono J, Okada S, Wataya-Kaneda M, Yoshikawa K, Nishizawa M, Hirayama Y, Kobayashi E, Seyama K, Hino O (2000 年 1 月)。「結節性硬化症の日本人患者における生殖細胞系列変異に対する TSC1 および TSC2 遺伝子の全エクソンの解析: 10 の変異の報告」。American Journal of Medical Genetics。90 ( 2): 123–6。doi : 10.1002 /(SICI)1096-8628(20000117)90:2<123::AID-AJMG7>3.0.CO;2- L。PMID 10607950 。 Lamb RF、Roy C、Diefenbach TJ、Vinters HV、Johnson MW、Jay DG、Hall A (2000 年 5 月)。「TSC1 腫瘍抑制因子ハマルチンは ERM タンパク質と GTPase Rho を介して細胞接着を制御する」。Nature Cell Biology。2 ( 5 ) : 281–7。doi :10.1038/35010550。PMID 10806479。S2CID 25353057。 Miloloza A、Rosner M、Nellist M、Halley D、Bernaschek G、Hengstschläger M (2000 年 7 月)。「TSC1 遺伝子産物であるハマルチンは細胞増殖を負に制御する」。 ヒト 分子 遺伝 学 。9 (12): 1721–7。doi : 10.1093/hmg/9.12.1721。PMID 10915759 。 マーシー V、ステマー＝ラチャミモフ AO、ハダッド LA、ロイ JE、カットーン AN、ビーチャム RL、スミス N、ルイ DN、ラメシュ V (2001 年 3 月)。 「結節性硬化症タンパク質のツベリンとハマルチンの発生的発現」。 アクタ・ニューロパソロジカ 。 101 (3): 202-10。 土井 ：10.1007/s004010000269。 PMID 11307618。S2CID 8067136 。 Catania MG、 Mischel PS 、Vinters HV（2001年7月）。「ハマルチンとチュベリン の G2/Mサイクリン依存性キナーゼCDK1およびその調節サイクリンAおよびBとの相互作用」。 神経 病理学および実験神経学ジャーナル 。60 （7）：711–23。doi ： 10.1093/ jnen /60.7.711。PMID 11444800 。
外部リンク GeneReviews/NIH/NCBI/UW の結節性硬化症複合体またはブルヌビル病に関するエントリ PDBe-KBの UniProt : Q92574 (Hamartin) の PDB で利用可能なすべての構造情報の概要 。
