国際がんゲノムコンソーシアム

国際がんゲノムコンソーシアム( ICGC ) は、世界を代表するがんおよびゲノム研究者間の協力の場を提供する自主的な科学組織です。ICGC は、世界中で重要な 50 種類のがんの種類およびサブタイプの腫瘍における 大規模ながんゲノム研究を調整するために 2008 年に設立されました。

25,000以上のがんゲノムをゲノム、エピゲノム、トランスクリプトームレベルで体系的に研究することで、がん遺伝子変異のレパートリーが明らかになり、変異原性の影響の痕跡が明らかになり、予後と治療管理のための臨床的に関連するサブタイプが定義され、新しいがん治療法の開発が可能になります。^[1]

ICGC には、癌ゲノムアトラス(TCGA) とサンガー癌ゲノムプロジェクトのデータが組み込まれています。

グラスゴー大学ウルフソン・ウォールがん研究センターの教授兼所長であるアンドリュー・ビアンキンAO教授は、2018年から事務局長兼会長を務めている^。[2]

ICGC は、ヒトゲノム計画以来、最も野心的な生物医学研究活動の 1 つです。このコンソーシアムは、世界的に懸念される癌に関係するゲノム変化を理解するための現在および将来の大規模プロジェクトの調整に役立ちます。ICGC メンバーによって作成されたカタログは、資格のある研究者に迅速かつ無料で提供されるため、世界中の科学者が新しい情報を使用して、さまざまな種類の癌の診断、治療、予防のより優れた方法を開発できるようになります。^{[引用が必要]}

ICGC の目的は、広範囲のヒト腫瘍に存在する体細胞 (非遺伝性) ゲノム異常の包括的な説明を提供することです。腫瘍の種類とサブタイプの多様性に関する現在の知識を考慮して、ICGC は、各クラスで約 500 個の癌サンプルのゲノム解析を行う約 50 個のプロジェクトを調整するという目標を設定しました。ただし、癌は非常に多様性があり、数百の種類/サブタイプが定義できることはよく知られています。したがって、50 個の ICGC プロジェクトという目標は、癌の種類全体を網羅することを意図しておらず、また網羅することもできません。^{[引用が必要]}

プロジェクトを提案する ICGC 資金および研究メンバーは、迅速なデータ公開、厳格な品質基準、研究参加者の保護などの要件を含む ICGC のポリシーに同意する必要があります。^{[引用が必要]}

ICGCは参加国から資金提供を受けており、各参加国は1つ以上のがんに焦点を当て、少なくとも50種類のがんのゲノムをマッピングすることを目標としている。 ^[3]コンソーシアムの事務局はカナダのトロントにあるオンタリオがん研究所にあり、^[4]データ調整センターも運営する。オンタリオ州政府は4000万ドルの資金を提供し、参加資金提供メンバーは各プロジェクトに2000万ドルを寄付することが期待されている。2009年、ドイツがん援助は790万ユーロで1つのICGCプロジェクトを支援した。これは民間組織が寄付した最高額だった。資金はドイツ国民からの寄付である。^[要出典]

ICGC の会員資格は、その原則とガイドラインに従うことに同意するすべての組織に開かれています。ICGC は、アジア、オーストラリア、ヨーロッパ、北米の資金提供組織から、15 の管轄区域で 47 のプロジェクト チームを結成し、21,000 を超える腫瘍ゲノムを研究するコミットメントを受けています。現在資金提供を受けているプロジェクトでは、膀胱、血液、骨、脳、乳房、子宮頸部、結腸、頭頸部、腎臓、肝臓、肺、口腔、卵巣、膵臓、前立腺、直腸、皮膚、軟部組織、胃、甲状腺、子宮に影響を及ぼす腫瘍を検査しています。今後、さらに多くの国や組織が ICGC に加わることが予想されます。オーストラリアとカナダ（膵臓がん）、中国（胃がん）、フランス（肝臓がん）、ドイツ（脳がん）、日本（肝臓がん）、スペイン（血液がん）、英国（血液がん、乳がん、肺がん、皮膚がん）、米国（血液がん、脳がん、乳がん、結腸がん、腎臓がん、肺がん、卵巣がん、直腸がん、胃がん、子宮がん）の ICGC メンバーによって実施された腫瘍のゲノム解析は、現在、ICGC ウェブサイトのデータ調整センターを通じて公開されています。^{[引用が必要]}

• オーストラリア：ワーウィック・アンダーソン、国立保健医療研究評議会
• カナダ：トーマス・ハドソン（オンタリオがん研究所）、スーザン・ラングロワ（前立腺がんカナダ）、シンディ・ベル（ゲノムカナダ）
• 中国：ヘンリー・ヤン、ユーヨン・ルー、中国癌ゲノムコンソーシアム
• 欧州委員会: ジャック・レマクル、パトリック・コラール、イロ・エーロラ
• フランス: ファビアン・カルボ、国立がん研究所 (INCa)
• ドイツ：アクセル・アレッツとフランク・ラプラス、連邦教育研究省。ゲルト・ネッテコーフェン、ドイツ癌協会（ミルドレッド・シェールにより設立、ボンおよびベルリン） 。
• インド：MK BhanおよびTS Rao、科学技術省、バイオテクノロジー局
• イタリア: マリア クリスティーナ ファルヴェッラ イタリア教育大学研究省 (MIUR) およびジャンパオロ トルトラヴェローナ大学
• 日本: 渡邉園子、理化学研究所、柴田龍宏、国立がん研究センター末松幸子、土田理恵、江野英夫 医薬基盤研究所
• メキシコ: ミゲル・ベタンクール・インスティトゥート・カルロス・スリム・デ・ラ・サルー
• サウジアラビア： スルタン・ビン・トルキ・アル・セダイリー ・キング・ファイサル専門病院・研究センター
• 韓国：キム・ヒョンレ国立がんゲノムセンター、個別化ゲノム医療国家プロジェクト、韓国保健福祉省
• スペイン: スペイン科学イノベーション省、エリアス・カンポ氏とロサ・ロドリゲス・ベルナベ氏
• 英国：マイケル・ダン、マイケル・ストラットン、ウェルカム・トラスト・サンガー研究所
• 英国：デビッド・スコットとニック・ジョーンズ、Cancer Research UK
• 米国：ジャン・クロード・ゼンクルーゼン、ルイス・スタウト（国立がん研究所）、エリック・グリーン、キャロリン・ハッター（国立ヒトゲノム研究所）

• 英国：ロザリンド・イーレス、がん研究研究所
• 米国：オリバー・エレメント、ウェイル・コーネル・メディシンのイングランダー精密医療研究所
• 韓国：イ・キュソン、サムスンメディカルセンター研究員、成均館大学医学部
• 韓国：国立がんセンター、イ・ウンスク
• 中国: Huanming Yang、BGI Genomics
• 韓国：ソウル国立大学医学部、ユン・ソンス・ソウル国立大学病院
• 日本：吉野隆之 国立がん研究センター東病院
• 中国：北京大学 奇民戦健康科学センター

オブザーバー資格を持つ代表者:

• 香港：ジョセフ・リー、香港科技大学

各参加国は特定の腫瘍の種類を主な研究対象としている。^[5]

• オーストラリア：膵臓がん- 乳管腺癌および卵巣がん- 漿液性嚢胞腺癌^[6]
• カナダ：膵臓がん - 乳管腺がんおよび前立腺がん-腺がん
• 中国：胃がん– 腸管型およびびまん型
• 欧州連合/ フランス:腎臓がん-腎細胞がん(明細胞サブタイプに重点を置くが、これに限定しない)
• 欧州連合/英国:乳がん– ER+ve、HER2-ve
• フランス: 乳がん – HER2遺伝子の増幅によって定義されるサブタイプ
• フランス:肝臓がん-肝細胞がん（アルコールと肥満に起因する）
• ドイツ：小児脳腫瘍 -髄芽腫、小児毛様細胞性星細胞腫、悪性リンパ腫、前立腺癌^[7]
• インド：口腔がん– 歯肉頬部
• イタリア：稀な膵臓腫瘍 – 腸膵臓内分泌腫瘍および稀な膵臓外分泌腫瘍
• 日本：肝臓がん - 肝細胞がん（ウイルス関連）
• スペイン：慢性リンパ性白血病（CLL、変異型および非変異型IgVH）
• 英国：乳がん – トリプルネガティブ/小葉性/その他
• 米国：肺扁平上皮癌、腎乳頭癌、腎明細胞癌、乳管癌、腎細胞癌、子宮頸癌（扁平上皮癌）、結腸腺癌、胃腺癌、直腸癌、肝細胞癌、頭頸部（口腔）扁平上皮癌、甲状腺癌、膀胱尿路上皮癌（非乳頭状）、子宮体部（子宮内膜癌）、膵管腺癌、急性骨髄性白血病、前立腺腺癌、肺腺癌、皮膚悪性黒色腫、乳房小葉癌および低悪性度神経膠腫、食道癌、卵巣漿液性嚢胞腺癌、肺扁平上皮癌副腎皮質癌、びまん性大細胞型 B 細胞リンパ腫、傍神経節腫および褐色細胞腫、胆管癌、子宮癌肉腫、ブドウ膜黒色腫、胸腺腫、肉腫、中皮腫、および精巣胚細胞癌。

大規模な国際的シーケンシングの取り組みの一環として、また精密医療の新時代を見据えて、国際がんゲノム医療コンソーシアム（ICGCmed）は、すでに蓄積された豊富なゲノムデータと新たに生成されるゲノムデータを、がん領域全体にわたるライフスタイル、患者の病歴、がん診断データ、治療に対する反応および治療後の生存率などの臨床情報および健康情報にリンクします。この大規模統合データを使用することで、研究者、科学者、政策立案者、臨床医は、患者、医療提供者などと協力して、予防戦略、病気の早期発見のマーカー、診断と予後のより具体的な基準と方法、および患者の病気の分子サブタイプと最も効果的な治療法の組み合わせを一致させることに基づく介入を開発できるようになります。

これにより、新たな治療ターゲットの発見、より正確な疾患の定義、薬剤耐性を防ぐための戦略の改善につながります。

• がんゲノムアトラス-国立がん研究所
• がんゲノムプロジェクト-ウェルカムトラストサンガー研究所

• ICGC データポータル