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メソポタミアの地理は、その民族学と歴史を含めて、ティグリス川とユーフラテス川という二つの大河を中心に展開している。南部は平坦で湿地帯が多いが、北部の起伏の多い高原がバビロニア沖積層に急激に沈み込む地点で二つの川が接近するため、両者はより完全に隔てられている。記録に残る最も古い時代には、北部はメソポタミアに含まれていたが、アッシリア王国の興隆後にアッシリアとして区別された。アッシリアの首都アッシュールを除けば、ニネベ、カラフ、アルベラといった主要都市はすべてティグリス川の東岸に位置していた。その理由は、東岸には豊富な水源があったのに対し、西側の広大な平原はユーフラテス川に流れ込む小川に頼らざるを得なかったからである。
メソポタミアは古代ギリシャ語で「二つの川の間の土地」を意味し、ティグリス川とユーフラテス川の間の土地を指しますが、この地域は広く定義すると、現在のイラクの大部分、シリア東部、トルコ南東部を含む地域になります。[ 1 ]メソポタミアという名称の最も古い記録は紀元前4世紀に遡り、北シリアのユーフラテス川の東の土地を指すのに使われていました。[ 2 ]現代では、ユーフラテス川とティグリス川の間のすべての土地に広く適用され、シリアの一部だけでなく、イラクとトルコ南東部のほぼ全域、イラン南西部の一部も含まれるようになりました。[ 3 ]ユーフラテス川の西にある隣接するステップ地帯とザグロス山脈の西部も、より広いメソポタミアという用語に含まれることがよくあります。[ 4 ] [ 5 ] [ 6 ]さらに、通常は上メソポタミアまたは北部メソポタミアと下メソポタミアまたは南部メソポタミアに区別されます。[ 7 ]上メソポタミアは、ジャジーラとしても知られ、ユーフラテス川とティグリス川の源流からバグダッドまでの地域です。[ 4 ]下メソポタミアは、バグダッドからペルシャ湾までの地域です。[ 7 ]現代の科学的な用法では、メソポタミアという用語は、しばしば年代的な意味合いも持ちます。この地域の現代の西洋の歴史学では、「メソポタミア」という用語は通常、時間の始まりから630年代のイスラム教徒の征服までの地域を指すために使用され、アラビア語のイラクとジャジーラは、その出来事以降の地域を表すために使われます。[ 3 ] [ 8 ]
この広大な平原は長さ約250マイル（400km ）で、平原から急激にそびえ立つ石灰岩の山脈が1本あるだけで、サラズル山脈、ハムリン山脈、シンジャール山脈という名前でザグロス山脈から分岐している。数多くの古い居住地の遺跡は、この平坦な地域がかつてどれほど密集して人が住んでいたかを示しているが、現在ではほとんどが荒野となっている。高原の北には、水が豊富で起伏のある地域が広がり、その中に石灰岩の丘陵の低い山脈が連なっている。これらの山脈は、時には乾燥し、時には矮性オークに覆われ、北側と北東側の斜面と、そこから分離している主山脈の間には、豊かな平原と肥沃な谷が広がっている。これらの山脈の背後には、ティグリス川とユーフラテス川の源流であり、アッシリアとアルメニア、クルディスタンを隔てるユーフラテス山脈とザグロス山脈の巨大な尾根がそびえ立っている。アッシリアという名前自体は、ティグリス川右岸、大ザブ川と小ザブ川の中間に位置する都市アシュル（現在のカルアト・シェルカト、カレ・シェルガト）に由来する。アッシリア人が西アジアで支配的な勢力となった後も、アシュルは長らく首都であり続けたが、最終的には北へ約97キロメートル離れたカラフ（ニムルド）、ニネベ（ネビ・ヴヌス、クユンジク）、ドゥル・シャルキン（コルサバード）に取って代わられた。
メソポタミアの乾燥した高原とは対照的に、カルデアには、周囲を流れる二つの大河の堆積物によって形成された肥沃な沖積平野が広がっていた。土壌は極めて肥沃で、勤勉な人々が暮らしていた。東にはエラムの山々がそびえ立ち、南には湿地帯とカルデア人やその他のアラム人が居住し、西にはバビロニア文明がユーフラテス川の岸辺を越えて、遊牧民の古代セム語を話す人々（またはスティー族）の領土にまで広がっていた。ここには、この国の最初の首都ウル（ムゲイル、より正確にはムカイヤル）があり、バビロンとその郊外ボルシッパ（ビルス・ニムルド）、そして二つのシッパル（聖書のセファルヴァイム、現在のアブ・ハッバ）が、川のアラビア側とカルデア側の両方を占めていた。 「バビロンの川」を意味するアラクトゥ川は、市の南側を流れ、市の南西のアラビア側の岸辺には、長さ40マイル（64km ） 、最も広い部分で幅35マイルの、かなりの高さの赤い砂岩の崖に囲まれた広大な淡水湖、ナジャフ湖が広がっていた。この湖の上下、ボルシッパからクーファにかけては、アレクサンドロス大王が危うく命を落としかけたことで有名なカルデア湿原が広がっていた（アリアノス『アルテミス伝』第7巻22節、ストラボン『歴史』第16巻1章12節）。しかし、この湿原はヒンディヤ運河の状態に依存しており、運河が閉鎖されると完全に姿を消してしまう。
ユーフラテス川の東、シッパラ、クタ、バビロンの南には、キシュ（ヒッラの東14kmのウルタイミル）、エル・ル神殿があったニップル（ニッフェル）、さらに古いベル・ウルクまたはウルク（アラビア語でワルカ）、太陽神殿のあるラルサ（アラビア語でセンケラ）があり、おそらくティグリス川の古代の流路であったシャット・エル・ハイの東には、初期バビロニア史において重要な役割を果たしたラガシュ（テロ）があった。
この国の原始的な港町エリドゥは、文化の神エアの崇拝の中心地であり、ユーフラテス川の西側、ウルの少し南に位置していた。現在では海から約130マイル（210km ）離れている。アレクサンドロス大王の時代にカラクス・スパシヌが建設されて以来、海岸の堆積によって約46インチ（年間約115フィート（35m ））の土地が形成されてきたため、この都市はおそらく6000年前に存在していたと考えられる。南部の湿地帯は、隣接する砂漠と同様に、アラム族が頻繁に訪れていた。その中でも最も有名なのは古代カルデア人で、マルドゥク・アプラ・イディナ2世の下でバビロンを支配し、後にこの国の住民全体にその名を冠するようになった。湿地帯を流れるユーフラテス川とティグリス川の合流した流れは、バビロニア人には「塩の川」を意味するndr marratiとして知られていた（エレミヤ書1:21参照）。この名前は元々ペルシャ湾に用いられていたものである。
バビロニアの沖積平野はエディンと呼ばれていたが、その名称は本来、ベドウィンがバビロニア人の主人の羊の群れを放牧していた川の西岸の「平野」に限定されていた。この「岸」またはキサドは、ティグリス川の対応する西岸（フリッツ・ホンメルによれば、現代のシャット・エル・ウアイ川）とともに、ヘブライ語聖書のカスディムまたはカスディンの由来となったヘセドの地の名となった。ラガシュの初期の碑文では、この地域全体がグ・エディンナとして知られており、これはセム語のキサド・エディニに相当するシュメール語である。海岸地帯も同様にグ・グッバ（アッカド語のキサド・タムティム）「海の岸」として知られていた。
メソポタミア南部のより包括的な名前は、「土地」を意味するケンギ、または「シュメールの地」を意味するケンギ シュメールでした。シュメールは、聖書のシナー文字とアマルナ文字のサンカールの原本であると考えられています。ケンギとシュメールに対抗したのは、ウラ（ウン）とアッカド、つまりバビロニア北部でした。ウラの本来の意味はおそらく「粘土質の土壌」だったと思われますが、「上国」または「高地」を意味するようになり、ケンギは「低地」を意味します。セム語の時代には、ウラはウンと発音され、地理用語としての「都市」を意味するウルと混同されましたが、アガドのセム語形であるアッカドゥ（エラムの碑文にはアッカティムと書かれています）に置き換えられました。アッカドの首都サルゴンの名前です。サルゴン帝国の台頭が、アッカドの名前がこのように拡張された原因と考えられます。それ以降、皇帝の称号では「シュメールとアッカド」はバビロニア全土を指すようになった。カッシートによるバビロニア征服後、北バビロニアはカル・ドゥニヤシュ、すなわち「ドゥニヤスク神の壁」として知られるようになった。これは、ネブカドネザル2世が北からの攻撃から王国を守るためにシッパルとオピスの間に築いた砦に似た砦の列に由来する。後者はストラボンが言及した「セミラミスの壁」 （xi. 14. 8）であったため、カル・ドゥニヤシュはクセノフォンのメディアの壁（Anab. ii. 4. 12）を表していた可能性があり、その痕跡はFRチェズニーによってファルージャからジバルまで広がっていることが発見されている。
人口密度の高さは、もともとは疫病が蔓延し居住不可能な沼地であったバビロニア平原を開墾し、世界で最も肥沃な土地へと変貌させた、精巧な灌漑事業によってもたらされた。灌漑と工学の科学は、巧みに計画され管理された運河網で覆われたバビロニアで最初に発展したようだ。その中でも主要な3つの運河は、ユーフラテス川の水をバビロン上流のティグリス川へと運んでいた。ファルージャからクテシフォンまで続くザブザラト運河（またはナフル・サルサル） 、テル・イブラヒムまたはクータを経由してシッパラからマダムまで続くクータ運河、そしてその2つの間にある王の運河（またはアル・マルカ）である。おそらくハンムラビにちなんで名付けられたこの最後の水路は、ユーフラテス川からウピまたはオピスに向かっており、H. ウィンクラー（『古代東洋研究』第 2 巻、 509 頁以降）によれば、ティグリス川西岸のセレウキアの近くにあったとされている。新バビロニア時代の文献ではパルッカトゥと呼ばれているパラコパスは、パルッカトゥまたはファルジャから始まり、ユーフラテス川西岸に平行してイッダラトゥまたはテレドンまで伸びており、広大な土地を潤し、ボルシッパ近くの大きな湖に水を供給していた。B. マイスナーがこれを初期の文献の「太陽神の運河」と同一視しているのは正しいかもしれない。
この灌漑システムのおかげで、バビロニアでは土壌の耕作が非常に進歩しました。ヘロドトス（1.193）によれば、小麦は通常、種まき人の200倍、時には300倍の収穫をもたらしました。大プリニウス（博物誌xviii. 11）は、小麦は2回刈り取られ、その後は羊の飼料として適していたと述べており、ベロッソスは、小麦、ゴマ、大麦、オフィリス、ヤシ、リンゴ、そして多くの種類の殻付き果実が野生で生育しており、小麦は今でもアナの近辺で野生で生育していると指摘しています。ペルシアの詩では、ヤシの360の用途が称賛されており（ストラボン xvi. I. 14）、アンミアヌス・マルケリヌス（xxiv. 3）は、ユリアヌスの軍隊が到達した地点からペルシア湾の海岸まで、緑豊かな森が途切れることなく広がっていたと述べています。
キシュ、ウルク、ラガシュなどの主要都市のほとんどの位置は確実に分かっているが、運河網に沿って点在する小規模な集落の位置を復元するのはより困難である。メソポタミアの地名に関する重要な資料は、バビロニアの大百科事典『ウラ＝フブル』とその注釈である。これらの文書には地名のリストが含まれているが、それらを地理的な位置と関連付けるには状況証拠が必要である。この目的に最も役立つ文書は、旅行者が通過する順に集落を列挙した旅行記である。
シュメールの重要な運河には