クリステンセネラ・ホンコンゲンシス

Christensenella hongkongensisは、臨床的に関連するグラム陽性 球菌の一種で、2006年に香港とカナダの患者から初めて分離されました^{。 [2]}この種は比較的まれですが、死亡率は最大50％と高いです。 ^[3] Christensenella は、香港、韓国、ニュージーランド、カナダ、スウェーデン、フランス、イタリアなど世界中の患者の血液培養から分離されているため、世界中に広く分布していると考えられています。世界中でC. hongkongensisの症例が15件未満確認されています。 ^[4]

Christensenella hongkongensisは、バチルス門（またはフィルミクテス門）のChristensenellaceae科に属する細菌の一種です。バチルス門には、多様なグラム陽性細菌のグループが含まれます。クロストリジウム綱の中で、C. hongkongensisはさらにクロストリジウム目（Clostridiales）に分類され、好気呼吸を欠くことでバチルス属と区別されます。^[5]したがって、C. hongkongensisは、胞子を形成せず、嫌気性で、運動性のない細菌で、新しい科Christensenellaに属し、腸内で酪酸を生成することで知られています。^[5]

Christensenella属は、2012年に諸富らがヒトの糞便からChristensenella minuta種を分離した際に初めて発見されました。Christensenellaという名前は、細菌学への貢献を称えてヘンリック・クリステンセン教授に敬意を表して付けられたものです。^{[6]種小名のhongkongensisは、}香港の 地域に由来しており、この細菌種は当初、この地域の患者から得られた培養物で特定されました。^[7]

この種は2007年に香港とカナダに住む4人の患者の血液培養から初めて発見された。^[8]香港の患者2人は48歳と39歳の男性だった。48歳の男性は腸閉塞と敗血症と診断され、39歳の男性は虫垂炎を患っていた。カナダの患者のうち1人は肝胆道系敗血症を患っていた74歳の男性で、もう1人は転移性癌と敗血症と診断された女性だった。^[8]分離はBACTEC 9240血液培養システムを使用して行われ、細菌特性の同定には従来の微生物学的方法が使用された。^[8]この種は分離されて以来、文献ではあまり報告されていない。この種が特定されたのは合計11回で、そのうち7回は香港の患者、残りは韓国（1件）、ニュージーランド（1件）、カナダ（2件）であった。^[9]

当初、この菌種は、その表現型と、16S rRNA配列に基づく系統関係の解析に基づいて「Catabacter hongkongensis」として分類されました。 ^[8] 2012年、諸富らは健康な成人の便サンプルから培養物を分離し、Christensenella minutaの発見を通じてChristensenella属を特定しました。 ^[6]それ以来、Christensenella属は拡大し、さらに4つの種が発見されました。^[7] 2021年に、「Catabacter hongkongensis」の全ゲノムを再評価したところ、 135の共通タンパク質配列のアラインメントと、2つの属間のリボソームの96-97%のIDにより、 Christensenella属との類似性が高いことが明らかになりました。^[7]これらの発見により、細菌分類の一貫性を保つために、 「Catabacter hongkongensis 」はChristensenella hongkongensisに再分類されることになりました。

Christensenella hongkongensis 16S リボソーム RNA 遺伝子の配列決定により、 Christensenella minuta、Christensenella massiliensis、Christensenella intestinhominis、Christensenella timonesisと 96-97% ID を共有する系統学的近縁種であることが明らかになりました。^[5] 16S rRNA遺伝子配列はNCBIから取得され、MAFT を使用してアラインメントされました。最大尤度法を使用して系統樹が構築され、近い枝が以下にリストされています。^[5]

クリステンセネラ・ミヌータは、体内の他の微生物と共生関係を結ぶ性質を持つ常在細菌であり、腸の健康、代謝、体重/BMIに影響を与えます。^[10]

クリステンセネラ・マッシリエンシスは中温性常在細菌であり、人体の腸内に生息して繁殖する。^[11]

クリステンセネラ・インテスティノミニスは、ヒトの腸内に生息する共生細菌で、コレステロール値を下げる独自の能力を持つ。^[12]

クリステンセネラ・ティモネシスは、最近ヒトの腸から分離された細菌種である。^[13]

クリステンセネラ・ホンコンゲンシスはヒトの腸内微生物叢に生息し、糖などの有機化合物を発酵させて 酪酸などの副産物を生成します。^[14]さらに、この細菌は成長するために適切な基質または栄養源を必要とし、酸素が不足しているヒトの大腸の環境で最もよく発達し、そこで炭水化物を発酵させて細菌のエネルギー源と炭素源として機能します。^[15]

Christensenella hongkongensisは嫌気性菌で、有機化合物の発酵を伴います。Christensenella minutaとの共通点から、マンノース、アラビノース、グルコース、ラムノース、サリシン、キシロースを利用してエネルギーを生成できると考えられます。^{[14]これらの生成物の発酵には、}ピルビン酸の部分酸化が関与し、酪酸などの有機酸が生成されます。^[16]

Catabacter hongkongensisがChristensenella hongkongensisに再分類された後、FastANI を使用して、両属の 6 つのゲノム間で平均ヌクレオチド同一性 (ANI) のペア比較を実施しました。その後、ゲノム間の遺伝的類似性は、 Rの視覚化ライブラリggplot 2パッケージを使用してプロットされ、視覚化されました。^{[7]その後、ゲノムは遺伝子構成に基づいてさらに分析され、}代謝経路とゲノムの特徴についてさらに学習しようとしました。微生物の抗菌薬耐性をスクリーニングするために開発されたソフトウェアである ABRicateも、そのような耐性につながる特定の遺伝子を特定するために使用されました。 ^[7]

最終的に、研究者らは、6種の細菌のゲノムサイズが2.5～3.3メガベースペアで 、グアニン+シトシン（GC）含有量が48.52～52.07％であることを知りました。^[7] Catabacteraceae株とChristensenellaceae株（HKU16TおよびABBA15k）のANI値も、ゲノム間の類似性が98.97％であることを明らかにし、最終的に2つの株が同じ種に属することを示しました。^{[7]同様に、6つのゲノムのANI値は77.56％～83.48％の範囲で、}ヌクレオチド配列の類似性を表しています。^[7]具体的には、Christensenella intestinihominis（AF73-05CM02PP）とC. minuta（DSM 22607T）は、異なる種の中で83.48％という最も高いANI類似度を示しており、異なる種として分類されているにもかかわらず、最も密接な遺伝的関係があることを示唆しています。^[7]

参照されたChristensenella hongkongensisの2つの株（HKU16T、ABBA 15k）だけでもゲノムが解析され公開されています。^[17]したがって、C. hongkongensisの平均GC含量は48.66％、平均ゲノムサイズとタンパク質数は3000377塩基対と2848タンパク質、コンティグ数は123.5であることがわかりました。 ^[7]

C. hongkongensis は、胞子を形成しない厳密な嫌気性細菌であり、形状は短い桿菌に似ている。グラム染色では、培養年齢に依存したさまざまな染色が示されたが、一般的にはグラム陽性であった。 ^[7]この種は運動性があることも確認されており、鞭毛染色で明らかにされたように鞭毛を発現している。^{[8] C. hongkongensis は}カタラーゼ陽性であることも確認されており、アラビノース、グルコース、マンノース、キシロースなどの炭水化物を利用できる多様な代謝プロファイルを持っている。^[18]この種は羊血液寒天培地上で増殖し、37℃で48時間培養した後、コロニー形成が観察された。^{[8]この細菌は}溶血活性を示さず、インドールを生成したり硝酸塩を還元したりする能力もなかった。^{[8]この種の研究や文献では、最適な}成長条件や世代時間に関する具体的な詳細は明らかにされていない。

C. hongkongensis感染の症状には、発熱、嘔吐、腹部膨張、便秘などがある。この細菌は菌血症の症例で存在することが報告されている。^{[2] [19]} C. hongkongensis を正確に同定するには、16S rRNA配列決定が推奨される。^[2] MALDI-TOFなどの他の同定方法では、細菌を正しく同定できていない。^[20]

C. hongkongensis感染時には、通常、抗生物質治療が行われる。C . hongkongensisは、カナマイシン、バンコマイシン、セフロキシム、シプロフロキサシン、メトロニダゾールなどの抗生物質に感受性があることが示されている。^{[2] [3]}ある症例では、患者は抗生物質治療を受けることなく回復した。^[20]

文献におけるC. hongkongensisの蔓延は、重篤な感染症、特に胃腸疾患との関連性から生じています。腸閉塞、急性腸感染症、敗血症などの症状を患っている患者にこの細菌が存在する症例がいくつかあります。また、これらの基礎疾患の影響を例示することも多々あると予測されています。^{[9]この種はヨーロッパの水サンプルでも特定されました。これは、この生物が外部環境に存在することを明らかにし、}消化管の感染源として汚染された水や食品の摂取が考えられます。^[21]このことから、この細菌が存在する可能性のある地域では、衛生と水質管理を改善する必要があることがわかります。C . hongkongensisの臨床転帰は、疫学に関する情報が限られているにもかかわらず、潜在的な死亡率の懸念も引き起こしています。文献で進行悪性腫瘍と特定された患者は全員死亡しており、その原因はおそらく消化管転座（細菌が消化管から体の他の部位へ移動すること）である。^[9] C. hongkongensisによって引き起こされる可能性のある病状は、菌血症と潜在的な敗血症性ショックである。^{[8] [22]}菌血症とは、患者の血流中に細菌が存在することを指し、無症状であることが多いが、適切に対処しないと感染症や敗血症につながる可能性がある。^[8]