バシロタ

バチルス門（同義語「Firmicutes」）は細菌の門であり、そのほとんどはグラム陽性の細胞壁構造を持つ。^{[ 3 ]}バチルス門の細菌は球菌（単数形は球菌）と呼ばれる丸い細胞、または桿菌（バチルス）と呼ばれる棒状の細胞を持つ。ネガティビクテス綱に属するメガスフェラ、ペクティナトゥス、セレノモナス、ザイモフィルスなどのバチルス門の細菌は、多孔質の偽外膜を持つため、グラム陰性に染色される。^{[ 4 ]}バチルス門の細菌の多くは内生胞子を生成し、内生胞子は乾燥に強く、極限状態でも生存できる。^{[ 5 ]}バチルス門の細菌はさまざまな環境に生息しており、このグループには注目すべき病原菌も含まれている。^{[ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ]}ヘリオバクテリアという一つの科に属する細菌は、無酸素光合成によってエネルギーを生成する。^{[ 11 ]}バシロタ菌はビール、ワイン、シードルの腐敗において重要な役割を果たしている。

2021年にFirmicutesなどの門の名称が変更されたことは、微生物学者の間で依然として議論の的となっており、多くの微生物学者は文献で長年使われてきた以前の名称を使い続けている。^{[ 12 ]}「Firmicutes」という名称は、この門の細菌に典型的な厚い細胞壁を指すラテン語の「丈夫な皮膚」に由来している。科学者たちはかつてFirmicutesをすべてのグラム陽性細菌を含むものとして分類していたが、最近では放線菌門とは対照的に、低G+C群と呼ばれる関連形態の中核グループであると定義している。

このグループは通常、嫌気性であるクロストリジウムと、偏性または任意好気性であるバチルスに分けられます。系統樹では、最初の 2 つのグループは、その主要な属であるクロストリジウムとバチルスと同様に、側系統群または多系統群として現れます。^{[ 13 ]}しかし、バチルス全体としては、一般的に単系統群、またはモリクテスを除いた側系統群であると考えられています。^{[ 14 ]}

バチルス門は、一部の人々^{[ 15 ]}によって古細菌の起源であると考えられており、古細菌は細胞生命の最後の普遍的共通祖先（LUCA）から独立して起源した初期の系統（生命のドメイン）を形成するのではなく、細菌から比較的遅れて分岐したというモデルに基づいています。

現在受け入れられている分類法は、命名法上の地位を有する原核生物名のリスト（LPSN）^{[ 16 ]}および国立生物工学情報センター（NCBI） ^{[ 17 ]}に基づいています。

2016年時点で274属以上が対象とされた。バチルス門に属する代表的な属には、以下のようなものがある。

バチルス目、バチルス属

• バチルス
• リステリア
• ブドウ球菌

桿菌目、乳酸桿菌目

• 腸球菌
• 乳酸菌
• ロイコノストック
• 連鎖球菌

クロストリジウム

• クロストリジオイデス
• クロストリジウム
• セレノモナス

エリシペロトリチア

• 丹毒

バシロタは、ヒトの腸内細菌叢の 11% ～ 95% を占めることがあります。^{[ 24 ]}腸内細菌叢の一部であるバシロタ門は、エネルギーの再吸収に関与し、糖尿病や肥満の発症に関連している可能性があることが示されています。^{[ 25 ] [ 26 ] [ 27 ] [ 28 ]}複数の研究で、痩せた対照群よりも肥満者の方がバシロタの存在量が多いことがわかっています。^{[ 29 ] [ 30 ]}西洋食（高脂肪/高糖質）を与えられたマウスでは、標準的な低脂肪/高多糖質食を与えられたマウスよりもバシロタの相対存在量が多いことがわかりました。 ^{[ 30 ]}バシロタの量が多いことは、マウスの脂肪量と体重の増加とも相関していました。^{[ 31 ]}特に、肥満マウスでは、モリキュート綱（バシロタ門内）が最も一般的でした。このバチルス菌の存在量が多い肥満マウスの腸内細菌叢を無菌マウスの腸に移植すると、無菌マウスはバチルス菌の存在量が少ない痩せたマウスの腸内細菌叢を移植されたマウスよりも脂肪が増えた。^{[ 32 ]}

ヒトの糞便から分離されたChristensenella（バチルス門、クロストリジウム綱）の存在は、体格指数の低下と相関することがわかっている。^{[ 33 ]}

Faecalibacterium prausnitzii (F. prausnitzii)は、ヒトにおいて抗炎症作用を持つ可能性のあるバチルス門に属する細菌です。 ^{[ 34 ]}この種は、肥満における軽度の炎症の軽減と関連しています。 ^{[ 35 ]}さらに、炎症性腸疾患の患者は、F. prausnitzii のレベルが低い傾向があります。^{[ 36 ] [ 37 ]}

最近、BilR（ビリルビン還元酵素）はビリルビンをウロビリノーゲンに還元する腸内微生物酵素であり、ヘムのリサイクルにおける腸内微生物叢の役割が強調されていることが言及された^{[ 38 ]。}

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• 門「フィルミクテス」 - JP Euzéby: 命名法上の地位を有する原核生物名のリスト