ミトコンドリアタンパク質をコードする遺伝子。その産物はATP合成に関与する。
ATP8 識別子 エイリアス ATP8 、ATPase8、MTMT-ATP合成酵素F0サブユニット8 外部ID OMIM : 516070; MGI : 99926; HomoloGene : 124425; GeneCards : ATP8; OMA :ATP8 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) クロ。 ミトコンドリアDNA(マウス) [2] バンド 該当なし 始める 7,766 bp [2] 終わり 7,969 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) トップの表現 小脳の右半球 右肺 胸部大動脈下行 腓腹筋 右卵巣 鼻粘膜の嗅覚領域 右副腎皮質 上前頭回 皮下脂肪組織 左副腎
トップの表現 神経軸の線条体 心室帯 神経節隆起 視床下部 神経管 膀胱 海馬歯状回顆粒細胞 白色脂肪組織 副腎 皮膚の領域
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
ATPase活性
膜貫通輸送活性
プロトン膜輸送活性
細胞成分
膜の不可欠な構成要素
ミトコンドリア内膜
ミトコンドリアプロトン輸送ATP合成酵素複合体、結合因子F(o)
ミトコンドリア
膜
ミトコンドリア膜
プロトン輸送ATP合成酵素複合体、結合因子F(o)
ミトコンドリアプロトン輸送ATP合成酵素複合体
生物学的プロセス
ミトコンドリアATP合成とプロトン輸送の結合
ATP合成とプロトン輸送の連動
イオン輸送
ATP生合成プロセス
クリステ形成
出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
ヒトミトコンドリアゲノムにおける MT-ATP8 遺伝子の位置。MT -ATP8 は、2 つの ATP 合成酵素ミトコンドリア遺伝子 (赤いボックス) のうちの 1 つです。
ヒトミトコンドリア遺伝子MT-ATP8 および MT-ATP6 の読み取りフレームにおける 46 ヌクレオチドの重複 。各ヌクレオチド トリプレット (角括弧) に対して、対応するアミノ酸が、 MT-ATP8の場合は +1 フレーム (赤)、 MT-ATP6 の場合は +3 フレーム (青) のいずれかに (1 文字コードで) 示されています 。
ATP合成酵素タンパク質8(後生動物) シンボル ATP-シント_8 パム PF00895 ファム 一族 CL0255 インタープロ 著作権
真菌ATP合成酵素タンパク質8(A6L) シンボル Fun_ATP-シント_8 パム PF05933 ファム 一族 CL0255 インタープロ 著作権
MT-ATP8 (または ATP8 )は、 ミトコンドリア遺伝子 であり、フルネームは「ミトコンドリアでコード化されたATP合成酵素膜サブユニット8」であり、ミトコンドリアATP合成酵素のサブユニットであるATP合成酵素F o サブユニット8(またはサブユニットA6L)をコード化しています 。 この サブ ユニット は 、 大きな 膜貫通型F型 ATP合成 酵素のF o 複合体に属します。 [5]複合体Vとしても知られるこの酵素は、 電子伝達系 における 酸化的リン酸化 の最終段階を担っています 。具体的には、ATP合成酵素の1つのセグメントは、陽子 と呼ばれる 正に帯電した イオンがミトコンドリア内の特殊な膜を通過できるようにします。酵素の別のセグメントは、この陽子の流れによって生成されたエネルギーを使用して、 アデノシン二リン酸 (ADP)と呼ばれる分子を ATP に 。 [6]サブユニット8は 後生動物 、 植物 、 真菌 の間で 配列 が異なる 。
構造
ヒトや他の哺乳類のATP合成酵素タンパク質8は、 ミトコンドリアゲノム内の MT-ATP8 遺伝子によってコード化されている。完全なヒトミトコンドリアゲノムが初めて公開されたとき、MT-ATP8 遺伝子 は 未確認 の 読み枠 URF A6L として記述された。 [5] MT-ATP8 遺伝子の珍しい特徴は、 MT-ATP6 遺伝子と46ヌクレオチドの重複があることである。MT -ATP8 の読み枠(+1)に対して 、 MT-ATP6 遺伝子は+3の読み枠から始まる。
MT-ATP8タンパク質は8 kDaで、68個の アミノ酸 で構成されています。 [7] [8]このタンパク質は、14個の核コードサブユニットと2個のミトコンドリアコードサブユニットからなる 複合体V としても知られる F 1 F o ATPaseのサブユニットです。F型ATPaseは、膜外触媒コアを含むF 1 と膜プロトンチャネルを含むF o の 2つの構造ドメインで構成され、中心茎と周辺茎で結合しています。Aサブユニットとして、MT-ATP8は複合体の非触媒膜 貫通 F o 部分に含まれ、 プロトンチャネル を構成しています。ミトコンドリアATP合成酵素の触媒部分は、3つのアルファ、3つのベータ、および他の3つの代表1つの化学量論で組み立てられた5つの異なるサブユニット(アルファ、ベータ、ガンマ、デルタ、イプシロン)で構成されています。プロトンチャネルは3つの主要なサブユニット(a、b、c)で構成されています。この遺伝子は、触媒コアのデルタサブユニットをコードしています。同じアイソフォームをコードする代替スプライス転写バリアントが特定されています。 [9] [6]
関数
MT-ATP8 遺伝子は、 チラコイド膜 と ミトコンドリア内膜 内に位置するミトコンドリア ATP合成酵素 のサブユニットをコードしています 。ミトコンドリアATP合成酵素は 、 酸化的リン酸化 中に内膜を横切る電気化学 的 プロトン 勾配を利用してATP合成を 触媒します 。 [9] F o 領域は、ATPを加水分解する水溶性成分を持つF 1 の回転を引き起こし、F 1 F oが 一緒になって膜を横切るプロトンの移動経路を作り出します。 [10]
この タンパク質サブユニットは、 酵母 ミトコンドリア F-ATPase の固定子柄の不可欠な構成要素であると思われます 。 [11] 固定子柄は 膜に固定されており、結合したATP合成/加水分解中に回転子に対するATPaseサブユニットの無駄な回転を防ぐ働きをします。このサブユニットは 後生動物 で類似の機能を持っている可能性があります 。
命名法
この酵素の命名 法 には長い歴史があります。F 1 画分は「画分 1」という用語に由来し、F o (下付き文字「o」で書かれ、「ゼロ」ではありません) は、 ATP 合成酵素の F o ユニットを阻害できる天然由来の抗生物質の一種である オリゴマイシン の結合画分であることに由来しています。 [12] [13] ATP 合成酵素のF o 領域は、ミトコンドリア膜に埋め込まれたプロトン孔です。これは、3 つの主要なサブユニット A、B、C と、(ヒトでは) 6 つの追加サブユニット d 、 e 、 f 、 g 、 MT-ATP6 (または F6)、MT-ATP8 (または A6L) で構成されています。このサブユニットの 大腸菌 ホモログ の 3D 構造は、 電子顕微鏡データ ( PDB の M 鎖 : 1c17 ) に基づいてモデル化されました。膜貫通4-α束を形成します。
臨床的意義
MT-ATP8 や、ミトコンドリアの 酸化リン酸化 に影響を与える他の遺伝子の変異は 、ミトコンドリア複合体 V 欠損症、 レーバー遺伝性視神経症 (LHON)、脳卒中様発作を伴うミトコンドリア脳筋症 ( MELAS )、 リー症候群 、 NARP 症候群など、さまざまな 神経変性 疾患や 心血管 疾患に関連しています。体の細胞のほとんどには何千ものミトコンドリアが含まれており、それぞれが 1 つ以上の ミトコンドリア DNAのコピーを持っています。一部の ミトコンドリア疾患 の重症度は、各細胞内の特定の遺伝子変化を持つミトコンドリアの割合に関連しています。MT-ATP6 遺伝子の変異による リー症候群 の人は、 変異を持つミトコンドリアの割合が非常に高い傾向があります (90% 以上から 95%)。 NARP の症状がそれほど重くないのは、 ミトコンドリアの変異の割合が低いためで、通常は70%から90%です。この2つの症状は同じ遺伝子変異から生じ、同じ家族の異なるメンバーに発生する可能性があるため、研究者はこれらが2つの異なる症候群ではなく、重複する症状のスペクトルを表している可能性があると考えています。 [6]
ミトコンドリア複合体V欠損症は 、 神経障害、 運動失調 、 肥大型心筋症 など、多様な臨床症状を呈する。肥大型心筋症は、軽度から重度の 肥大 、軽度から広範囲の 線維化 および 心筋細胞の 乱れ、左室流出路閉塞の欠如から重度の閉塞、および極めて多様な臨床経過を伴う明確な心室中隔輪郭/形態を呈することがある。 [14] [15]
ミトコンドリア複合体V欠損症は、電子伝達系 の 複合体V の不足(欠損)または機能喪失であり、 多くの臓器や系、特に 神経系 と 心臓 に影響を及ぼすさまざまな 徴候や症状を 引き起こす可能性があります。この疾患は、乳児期または幼児期に生命を脅かす可能性があります。罹患した個人は、摂食障害、成長の遅れ、筋緊張の低下( 低緊張 )、極度の疲労( 無気力 )、および 発達遅延を示す可能性があります。彼らは血中の 乳酸 値の上昇( 乳酸アシドーシス )を発症する傾向があり、これは吐き気、嘔吐、脱力感、および急速な呼吸を引き起こす可能性があります。罹患した個人では 血中の アンモニア 値の上昇(高 アンモニア血症 )も発生する可能性があり、場合によっては脳機能の異常( 脳症 )や他の臓器の損傷につながります。 [16] MT-ATP6のフレームシフト変異を持つ患者では、 運動失調、 小頭症 、発達遅延、および知的障害が観察されています。これにより、位置8612にC挿入が生じ、わずか36アミノ酸長の切断タンパク質が生成され、 位置8610と8614に2つのT>C 一塩基多型が生じ、ホモポリマー シトシン ストレッチが生成されます。 [17]
肥大型心筋症は 、ミトコンドリア複合体V欠損症の一般的な症状であり、 心不全 につながる可能性がある 心筋の肥厚( 肥大 )を特徴とする 。 [16] m.8528T>C変異は、MT-ATP6およびMT-ATP8遺伝子の重複領域で発生し、乳児心筋症の複数の患者で報告されている。この変異は、MT-ATP6の開始コドンを スレオニン に変化させ、 MT-ATP8の位置55で トリプトファンから アルギニン に変化させる 。 [18] [15] ミトコンドリア複合体V欠損症の患者は、高い額、湾曲した眉毛、下を向いた目尻(下 眼瞼裂)、突出した鼻梁、低い耳、薄い唇、小さな顎( 小顎症 ) など、特徴的な顔貌のパターンを示すこともあります。 [16]
乳児型肥大型心筋症(CMHI)も、 MT-ATP6 およびMT-ATP8を含む異なる 遺伝子座に影響を及ぼす変異によって引き起こされます。 肥大型心筋症 の乳児型は、 心室肥大 を特徴とする心臓疾患で 、通常は非対称で、 心室中隔が 関与することがよくあります。症状には、 呼吸困難 、 失神 、虚脱、 動悸 、 胸痛 などがあります。運動によって容易に誘発される可能性があります。この疾患は、良性から悪性まで、家族内および家族間で変動があり、 心不全 や 突然心臓死 のリスクが高くなります。 [14] [15]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000228253 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000064356 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ ab Anderson S、Bankier AT、Barrell BG、de Bruijn MH、Coulson AR、Drouin J、Eperon IC、Nierlich DP、Roe BA、Sanger F、Schreier PH、Smith AJ、Staden R、Young IG (1981 年 4 月)。「ヒトミトコンドリアゲノムの配列と構成」。Nature . 290 ( 5806 ) : 457–65。Bibcode : 1981Natur.290..457A。doi : 10.1038/290457a0。PMID 7219534。S2CID 4355527。
^ abc 「MT-ATP8」。 遺伝学ホームリファレンス 。NCBI。
^ Zong NC、Li H、Li H、Lam MP、Jimenez RC、Kim CS、Deng N、Kim AK、Choi JH、Zelaya I、Liem D、Meyer D、Odeberg J、Fang C、Lu HJ、Xu T、Weiss J、Duan H、Uhlen M、Yates JR、Apweiler R、Ge J、Hermjakob H、Ping P (2013 年 10 月)。「専門的な知識ベースによる心臓プロテオーム生物学と医学の統合」。Circulation Research。113 ( 9 ) : 1043–53。doi : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151。PMC 4076475。PMID 23965338 。
^ 「ATP合成酵素タンパク質8」。 心臓オルガネラタンパク質アトラスナレッジベース(COPaKB) 。 [ 永久リンク切れ ]
^ ab 「MT-ATP8 ミトコンドリアでコード化された ATP 合成酵素 8 [Homo sapiens (ヒト)]」。 Gene。NCBI 。
^ Velours J、Paumard P、Soubannier V、Spannagel C、Vaillier J、Arselin G、Graves PV (2000 年 5 月)。「酵母 ATP 合成酵素 F(0) の構成:システイン変異体、チオール修飾、架橋試薬に基づく研究」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics。1458 ( 2–3): 443–56。doi :10.1016/S0005-2728(00)00093-1。PMID 10838057 。
^ Stephens AN、Khan MA、Roucou X、Nagley P、Devenish RJ (2003 年 5 月)。「システインスキャン変異誘発および化学修飾により調べた酵母ミトコンドリア F1F0-ATP 合成酵素サブユニット 8 の分子近傍」。The Journal of Biological Chemistry。278 ( 20): 17867–75。doi : 10.1074/ jbc.M300967200。PMID 12626501 。
^ Kagawa Y, Racker E (1966年5月). 「酸化的リン酸化を触媒する酵素の部分分解。8. ミトコンドリアアデノシン三リン酸酵素に対するオリゴマイシン感受性を付与する因子の特性」. The Journal of Biological Chemistry . 241 (10): 2461–6. doi : 10.1016/S0021-9258(18)96640-8 . PMID 4223640.
^ Mccarty RE (1992 年 11 月). 「植物生化学者による H+-ATPase と ATP 合成酵素の観点」. The Journal of Experimental Biology . 172 (Pt 1): 431–441. doi :10.1242/jeb.172.1.431. PMID 9874753.
^ ab 「MT-ATP8 - ATP合成酵素タンパク質8 - Homo sapiens(ヒト)」 www.uniprot.org . UniProt . 2018年 8月3日 閲覧 。 この記事には、CC BY 4.0 ライセンスに基づいて利用可能なテキストが組み込まれています。
^ abc Ware SM、El-Hassan N、Kahler SG、Zhang Q、Ma YW、Miller E、Wong B、Spicer RL、Craigen WJ、Kozel BA、Grange DK、Wong LJ (2009 年 5 月)。「ミトコンドリア ATPase 6 および 8 遺伝子の重複領域の変異によって引き起こされる乳児心筋症」。Journal of Medical Genetics。46 ( 5) : 308–14。doi :10.1136/jmg.2008.063149。PMID 19188198。S2CID 25354118 。
^ abc 「ミトコンドリア複合体V欠損症」。 遺伝学ホームリファレンス 。NCBI 。 2018年 8月3日 閲覧 。 この記事には、パブリック ドメイン であるこのソースからのテキストが組み込まれています 。
^ Jackson CB、Hahn D、Schröter B、Richter U、Battersby BJ、Schmitt-Mechelke T、Marttinen P、Nuoffer JM、Schaller A(2017年6月)。「孤立性複合体V欠損、運動失調および脳筋症を引き起こす新規ミトコンドリアATP6フレームシフト変異」。European Journal of Medical Genetics。60 ( 6):345–351。doi :10.1016/j.ejmg.2017.04.006。hdl : 10138/ 237062。PMID 28412374 。
^ Imai A, Fujita S, Kishita Y, Kohda M, Tokuzawa Y, Hirata T, Mizuno Y, Harashima H, Nakaya A, Sakata Y, Takeda A, Mori M, Murayama K, Ohtake A, Okazaki Y (2016年3月). 「ATPase 6および8タンパク質の喪失によるミトコンドリア呼吸鎖複合体V欠損を伴う急速進行性乳児心筋症」. International Journal of Cardiology . 207 : 203–5. doi :10.1016/j.ijcard.2016.01.026. PMID 26803244.
さらに読む
Torroni A、Achilli A、Macaulay V、Richards M、Bandelt HJ (2006 年 6 月)。「ヒト mtDNA ツリーの果実の収穫」。 遺伝 学の動向 。22 (6): 339–45。doi : 10.1016 /j.tig.2006.04.001。PMID 16678300 。
Bodenteich A、Mitchell LG、Polymeropoulos MH 、 Merril CR (1992 年 5 月)。「ヒトミトコンドリア D ループのジヌクレオチド反復」。 ヒト分子遺伝学 。1 (2): 140。doi :10.1093/hmg/1.2.140-a。PMID 1301157 。
Lu X、Walker T 、MacManus JP、Seligy VL (1992 年 7 月)。「HT-29 ヒト結腸腺癌細胞の分化はミトコンドリア RNA の発現増加と相関している: トレハロースの細胞増殖および成熟への影響」。Cancer Research。52 ( 13 ): 3718–25。PMID 1377597。
Marzuki S、Noer AS、Lertrit P、Thyagarajan D、Kapsa R、Utthanaphol P、Byrne E (1991 年 12 月)。「ヒトミトコンドリア DNA の正常変異体と翻訳産物: 参照データベースの構築」。Human Genetics。88 ( 2 ) : 139–45。doi :10.1007/bf00206061。PMID 1757091。S2CID 28048453 。
Moraes CT、Andreetta F、Bonilla E、Shanske S、DiMauro S、Schon EA (1991 年 3 月)。「重鎖プロモーター領域を欠く複製可能なヒトミトコンドリア DNA」。 分子 細胞 生物 学 。11 (3): 1631–7。doi :10.1128/ MCB.11.3.1631。PMC 369459。PMID 1996112 。
Attardi G、Chomyn A、Doolittle RF、Mariottini P、Ragan CI (1987)。「ヒトミトコンドリア DNA の 7 つの未確認の読み取りフレームは、呼吸鎖 NADH 脱水素酵素のサブユニットをエンコードします」。Cold Spring Harbor 定量生物学シンポジウム 。51 Pt 1 (1): 103–14。doi :10.1101/sqb.1986.051.01.013。PMID 3472707 。
Chomyn A、Cleeter MW、Ragan CI、Riley M、Doolittle RF、Attardi G (1986 年 10 月)。「URF6、ヒト mtDNA の最後の未確認リーディング フレーム、NADH 脱水素酵素サブユニットをコード」。Science。234 ( 4776 ) : 614–8。Bibcode : 1986Sci ...234..614C。doi : 10.1126/science.3764430。PMID 3764430 。
Chomyn A、Mariottini P、Cleeter MW、Ragan CI、Matsuno-Yagi A、Hatefi Y、Doolittle RF、Attardi G (1985)。「ヒトミトコンドリア DNA の 6 つの未確認の読み取りフレームは、呼吸鎖 NADH 脱水素酵素の成分をエンコードします」。Nature。314 ( 6012 ) : 592–7。Bibcode : 1985Natur.314..592C。doi : 10.1038/314592a0。PMID 3921850。S2CID 32964006 。
Anderson S、Bankier AT、Barrell BG、de Bruijn MH、Coulson AR、Drouin J、Eperon IC、Nierlich DP、Roe BA、Sanger F、Schreier PH、Smith AJ、Staden R、Young IG (1981 年 4 月)。「ヒトミトコンドリアゲノムの配列と構成」。Nature . 290 ( 5806 ) : 457–65。Bibcode : 1981Natur.290..457A。doi : 10.1038 /290457a0。PMID 7219534。S2CID 4355527。
Montoya J 、Ojala D、Attardi G (1981 年 4 月)。「ヒトミトコンドリア mRNA の 5' 末端配列の特徴」。Nature . 290 ( 5806): 465–70。Bibcode : 1981Natur.290..465M。doi : 10.1038/290465a0。PMID 7219535。S2CID 4358928。
Horai S, Hayasaka K, Kondo R, Tsugane K, Takahata N (1995年1月). 「ヒト科ミトコンドリアDNAの完全配列から明らかになった現代人の最近のアフリカ起源」. 米国科学アカデミー紀要 . 92 (2): 532–6. Bibcode :1995PNAS...92..532H. doi : 10.1073 /pnas.92.2.532 . PMC 42775. PMID 7530363.
Rieder MJ、Taylor SL、Tobe VO 、 Nickerson DA (1998 年 2 月)。「品質ベースの蛍光再配列を用いた DNA 変異の識別の自動化: ヒトミトコンドリアゲノムの分析」。 核酸 研究 。26 ( 4 ): 967–73。doi :10.1093/nar/26.4.967。PMC 147367。PMID 9461455 。
Andrews RM、Kubacka I、Chinnery PF、Lightowlers RN 、 Turnbull DM、 Howell N (1999 年 10 月)。「ヒトミトコンドリア DNA のケンブリッジ参照配列の再分析と改訂」。Nature Genetics。23 ( 2): 147。doi : 10.1038 / 13779。PMID 10508508。S2CID 32212178 。
Ingman M 、Kaessmann H、Pääbo S、 Gyllensten U (2000 年 12 月)。「ミトコンドリアゲノムの変異と現代人の起源」。Nature . 408 ( 6813): 708–13。Bibcode :2000Natur.408..708I。doi : 10.1038 /35047064。PMID 11130070。S2CID 52850476。
Finnilä S、Lehtonen MS、Majamaa K (2001 年 6 月)。 「ヨーロッパの mtDNA の系統発生ネットワーク」。 アメリカ人類遺伝学ジャーナル 。 68 (6): 1475–84。 土井 :10.1086/320591。 PMC 1226134 。 PMID 11349229。
Maca-Meyer N、González AM、Larruga JM、Flores C 、Cabrera VM (2003)。「主要なゲノムミトコンドリア系統が初期の人類の拡大を描写する 」 。BMC Genetics。2 : 13。doi : 10.1186 / 1471-2156-2-13。PMC 55343。PMID 11553319 。
Herrnstadt C、Elson JL、Fahy E、Preston G、Turnbull DM、Anderson C、Ghosh SS、Olefsky JM、Beal MF、Davis RE、Howell N (2002 年 5 月)。「アフリカ、アジア、ヨーロッパの主要ハプログループの完全なミトコンドリア DNA コーディング領域配列の縮小中央値ネットワーク分析」。American Journal of Human Genetics。70 ( 5 ): 1152–71。doi :10.1086/339933。PMC 447592。PMID 11938495 。
シウバ WA、ボナット SL、ホランダ AJ、リベイロ=ドス=サントス AK、パイシャン BM、ゴールドマン GH、アベ=サンデス K、ロドリゲス=デルフィン L、バルボサ M、パソ=ラーソン ML、ペツル=アーレル ML、バレンテ V、サントス SE 、ザーゴ MA (2002 年 7 月)。 「アメリカ先住民のミトコンドリアゲノムの多様性は、創始者集団のアメリカへの単一の早期侵入を裏付けています。」 アメリカ人類遺伝学ジャーナル 。 71 (1): 187–92。 土井 :10.1086/341358。 PMC 384978 。 PMID 12022039。
Mishmar D, Ruiz-Pesini E, Golik P, Macaulay V, Clark AG, Hosseini S, Brandon M, Easley K, Chen E, Brown MD, Sukernik RI, Olckers A, Wallace DC (2003 年 1 月)。「自然選択がヒトの地域的な mtDNA 変異を形作った」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。100 ( 1): 171–6。Bibcode :2003PNAS..100..171M。doi : 10.1073 / pnas.0136972100。PMC 140917。PMID 12509511 。
Ingman M、Gyllensten U (2003年7 月)。 「 オーストラリア およびニューギニア原住民のミトコンドリアゲノム変異と進化史」。 ゲノム 研究 。13 (7): 1600–6。doi :10.1101/gr.686603。PMC 403733。PMID 12840039 。
この記事には、 パブリックドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。
この記事にはパブリックドメインの Pfam および InterPro : IPR001421からのテキストが組み込まれています。