TBXT 識別子 別名 TBXT 、T、ブラキュリーホモログ(マウス)、SAVA、TFT、Tブラキュリー転写因子、Tボックス転写因子T、T外部ID オミム : 601397 ; MGI : 98472 ;ホモロジーン : 2393 ;ジーンカード : TBXT ; OMA : TBXT - オルソログRNA発現 パターンBgee 人間 マウス (相同体)トップは 生殖腺 睾丸 卵母細胞 網状部 腎髄質 滑膜関節 二次卵母細胞 人間のペニス 外側淡蒼球 滑膜
トップは 胚の尾 傍軸中胚葉 原始的な筋 脊索 中胚葉 胚発生オーガナイザー 上胚葉 胚 女性の尿道 胚
より多くの参照発現データ
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能 細胞成分 生物学的プロセス 体節形成 レチノイン酸に対する細胞応答 心臓の左右非対称性の判定 転写の調節、DNAテンプレート SMADタンパク質のシグナル伝達 RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 神経板形態形成 骨形成 解剖学的構造の形態形成 心臓形態形成 脊索の発達 遺伝子発現の調節に関わるシグナル伝達 RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 BMPシグナル伝達経路 転写、DNA鋳型 胚の骨格系の発達 血管新生 多細胞生物の発生 生殖過程 神経管閉鎖 細胞集団増殖の正の制御 脊索 肛門後尾部形態形成 典型的なWntシグナル伝達経路 中胚葉の移動は原腸形成に関与する 中胚葉の発達 胚の前後軸の指定 透明帯の貫通 原始的な条線形成 シグナル伝達 前部/後部パターン指定 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 DNA結合転写因子活性の負の制御 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ アントレ アンサンブル UniProt RefSeq(mRNA) NM_001270484 NM_003181 NM_001366285 NM_001366286
RefSeq(タンパク質) NP_001257413 NP_003172 NP_001353214 NP_001353215
所在地(UCSC) Chr 6: 166.16 – 166.17 MB Chr 17: 8.65 – 8.66 MB PubMed 検索[ 3 ] [ 4 ]
ウィキデータ
T-box転写因子T (ブラキュリータンパク質 とも呼ばれる)は、ヒトや他の類人猿ではTBXT 遺伝子 によってコードされている。[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] ブラキュリーは、T-box 遺伝子ファミリー内の転写因子 として機能する。 [ 8 ] ブラキュリーの相同体は 、最も初期に分岐した非左右相称 動物(刺胞動物 、平板動物 、海綿動物 、有櫛動物 )の代表を含む、スクリーニングされたすべての動物で見つかっている。[ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ]
歴史 ブラキュリー 変異は、1927年にナデジダ・アレクサンドロヴナ・ドブロヴォルスカヤ=ザヴァツカヤ によってマウスで初めて記述され、ヘテロ接合体では尾の長さと仙椎に影響を与える変異として報告された。ホモ接合体では、ブラキュリー変異は中胚葉 形成、脊索 分化の欠陥、および前肢芽の後方の構造の欠如により、胚発生10日目頃に致死となる(ドブロヴォルスカヤ=ザヴァツカヤ、1927)。ブラキュリーという名前は、ギリシャ語で「短い」を意味するbrakhus と「尾」を意味するoura に由来する。
2018年、HGNCは ヒト遺伝子の名称をTから TBXT に更新した。これはおそらく、1文字の遺伝子記号を検索する際の困難を克服するためであろう。
Tbxtは ベルンハルト・ヘルマンら[ 12 ] によってクローニングされ、436アミノ酸からなる胚性核転写因子 をコードすることが証明された。Tbxtは、N末端にあるTボックスと呼ばれる領域を介して、ほぼ回文配列であるTCACACCTという特定のDNAエレメントに結合する。Tbxtは Tボックス ファミリーの創始メンバーであり、哺乳類では現在18個のTボックス遺伝子が存在する。
ヒトブラキュリータンパク質の結晶構造は、2017年にオックスフォードの構造ゲノミクスコンソーシアムのオファー・ギレアディとその同僚によって解明された。[ 13 ]
7.5日齢CD1マウス胚におけるBrachyuryの発現
開発における役割 ブラキュリー 遺伝子は、左右相称動物の正中線を規定し、前後軸を確立する上で保存された役割を果たしているようである[ 14 ] 。この機能は脊索動物と軟体動物で明らかである [ 15 ] 。 その祖先的な役割、あるいは少なくとも刺胞動物で果たす役割は、原口を規定することにあるようである [ 8 ] 。 また、原腸形成期には中胚葉を規定する[ 16 ] 。組織培養に基づく技術により、その役割の1つは、原始線条から離れる細胞の速度を制御することである可能性が示されている[ 17 ] [ 18 ] 。中胚葉 形成と細胞分化 に必要な遺伝子の転写に影響を与える。
Brachyuryは 胎児の発育中に頸椎の設計図を確立するのに役立つことも示されています。頸椎の数はすべての哺乳類で高度に保存されていますが、この遺伝子の自然発生的な脊椎および脊髄形成異常 (VSD)変異は、通常の7個ではなく6個以下の頸椎の発達と関連付けられています。[ 19 ]
表現 マウスでは、Tは 胚盤 胞期の胚の内部細胞塊 で発現し(ただし、マウス胚性幹細胞 の大部分では発現しない)、続いて原始線条 で発現する(図参照)。発生が進むにつれて、発現は結節と脊索に局在するようになる。
アフリカツメガエル では、Xbra (アフリカツメガエルの T ホモログであり、最近t と改名された)は、原腸形成前の胚の中胚葉辺縁帯で発現し、その後、原腸形成中期に原口と脊索に局在する。
オルソログ ゼブラフィッシュの 相同遺伝子はntl (尾がない)として知られている。
ヒト科動物の進化における役割
尾部発達 TBXT は脊椎動物 に見られる転写因子 です。そのため、腰部 と仙骨 部における軸の発達と後部中胚葉の構築における役割が観察されていることから、尾の形成をコードする遺伝子型の主な原因となっています。 [ 20 ] [ 16 ] TBXT は、尾椎 を含む脊椎の柔軟性、長さ、バランスに関与する脊索 細胞を形成する遺伝子を転写します。[ 21 ] 転写因子が脊椎の発達において果たす役割から、哺乳類の尾の発達に主に関与するタンパク質として挙げられています。[ 5 ] [ 22 ] しかし、遺伝的に誘発される表現型 であるため、尾をコードする物質が突然変異 によって効果的にサイレンシングされる可能性があります。これは、ヒト科の 分類群で ntl オルソログが発達したメカニズムです。
アルミニウム製部品 特に、 TBXTのAlu エレメントは、 尾部欠損(ntl )オルソログの原因となっている。Aluエレメントは、霊長類にのみ存在する、進化した可動性RNAである。これらのエレメントはゲノム内を移動することができ、Aluエレメントはトランスポゾンとなる。[23] TBXTにおいて尾部欠損を触媒することが観察されているAlu エレメント はAluY で ある 。[ 24 ] [ 25 ] 通常 、 Alu エレメントは 個々には影響を与えないが、TBXTで活性を示す別のAluエレメントである AluSx1は、その ヌクレオチド配列が AluY の逆配列となるようにコード化されている。 このため、複製プロセスで 2 つの要素がペアになり、ステムループ 構造の形成と転写 に根本的に影響を与える代替スプライシングイベント につながります。[ 26 ] この構造は、2 つのAlu 要素の間に保持されているコドンをヘアピンのようなループに隔離して配置するため、結果としてペアになったり転写されたりすることはありません。トラップされた物質には、特にTBXT をコードする6 番目のエクソンが含まれます。 [ 24 ] [ 27 ] ステムループ構造では、ループ内にトラップされた遺伝物質は、転写共役ヌクレオチド除去修復 (TC NER) タンパク質によって、 RNA ポリメラーゼが ループのネックで停止していることによる損傷として認識されます。また、このようにして損傷が発生することもあります。停止した転写プロセスは、TC NER タンパク質がステムループの位置を確認するための目印として機能します。[ 28 ] TBXTが切断されると、エクソン6を含む捕捉されたヌクレオチドは、TC NER機構によって完了した転写プロセスから切除される。エクソン6が切除される結果、エクソン内に含まれる情報も転写から除去される。したがって、エクソン6に蓄積された物質が、ヒト科動物の完全な尾の成長に部分的に関与していると考えられている。[ 24 ] [ 27 ]
AluYが AluSx1 とともにTBXTのテールコード物質に及ぼす影響の結果、アイソフォーム TBXT-Δexon6が生成される。[ 24 ] [ 29 ] アイソフォームは、多くの場合、突然変異、多型、および組換えの結果であり、多くの場合、由来するタンパク質と非常に類似した機能を共有している。しかし、多くの場合、元のタンパク質が持つことが知られている指示の追加または欠落により、重要な違いがある可能性がある。[ 30 ] TBXT-Δexon6はこのカテゴリーに属し、TBXTを含む生物で適切なテール形成を可能にするコードを処理する能力を欠くアイソフォームである。これは、テール形成のコードを助けるエクソン6の物質が転写されたRNAの内容から切り取られるためである。その結果、アイソフォームでは事実上欠落しており、したがって、アイソフォームの名前を決定する重要な要素となっている。影響力のあるアイソフォームのその他の一般的な例としては、サブユニットに応じて細胞の特定の部位にリン酸基を挿入するAMP誘導性プロテインキナーゼに関与するものが挙げられる。 [ 31 ]
種分化 AluY エレメントの最初の挿入は約2000万~2500万年前に起こり、この変異を示すことが知られている最古のヒト科の祖先は類人猿のヒト上科である。 [ 24 ]尾 がないことは圧倒的に優勢な表現型となり、種分化 に寄与している。時間の経過とともに、この変異は自然選択の影響と固定によりより定期的に発生し、最終的にホモ・サピエンス の種分化の前に類人猿の遺伝子プールにおけるその存在を安定させ拡大した。[ 32 ] 尾がないことがヒト科の 分類群で標準的な表現型となり、尾の緩和の遺伝的に不利な側面を相殺する可能性のある理由はいくつかあるが、確かなことはほとんどわかっていない。[ 25 ] 一部の専門家は、尾がないことがより強く、より直立した姿勢に寄与すると仮説を立てている。腰椎が小さい霊長類に見られる姿勢は効果的であると考えられている。ヒト科動物に見られる均等に分散された体重を考慮すると、地上での移動と登攀時のバランス維持はより実現可能である。[ 33 ] 追加の付属肢の存在は、捕食者が掴むことができる別の付属肢の存在を意味し、また、移動するためにエネルギーを消費し、より多くのスペースを占めることになる。
疾患における役割
その他の疾患 ブラキュリー の過剰発現は、腎線維症 などの良性疾患に関連するEMTに関与している可能性がある。[ 22 ]
治療標的としての役割 ブラキュリーは腫瘍組織では発現するが正常な成人組織では発現しないため、様々な腫瘍タイプに適用可能な潜在的な薬剤標的として提案されている。
実質的な非構造ドメインを持つ転写因子であるブラキュリーは、低分子医薬品の標的としては困難であると考えられてきた。しかし、ブラキュリータンパク質に結合する複数の化学系列が特定されており、標的タンパク質分解剤やその他のモダリティの足場を提供する可能性がある。[ 56 ] [ 57 ] 2025年、脊索腫財団は、より強力なリガンドの発見を促進するために、 TBXTチャレンジと呼ばれる賞金付きコンテストを開始した。
さらに、ブラキュリー特異的ペプチドは、ブラキュリーが発現する細胞のHLA受容体上に提示され、腫瘍特異的抗原として機能します。ブラキュリー発現細胞に対する免疫応答を刺激することを目的とした様々な治療用ワクチンが開発されています。[ 34 ]
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さらに読む Yoshikawa T, Piao Y, Zhong J, Matoba R, Carter MG, Wang Y, et al. (2006 年 1 月). "マウス胚盤胞の ICM で主に発現する遺伝子のハイスループットスクリーニング(全胚 in situ ハイブリダイゼーション法による)" . Gene Expression Patterns . 6 (2): 213– 224. doi : 10.1016/j.modgep.2005.06.003 . PMC 1850761 . PMID 16325481 . Meisler MH (1997). "突然変異ウォッチ:マウスのブラキュリー(T)、Tボックス遺伝子ファミリー、およびヒトの疾患". Mammalian Genome . 8 (11): 799–800 . doi : 10.1007/s003359900581 . hdl : 2027.42/42140 . PMID 9337389 . S2CID 12617264 .
外部リンク Brachyury の Protein Atlas エントリは、Wayback Machine に 2019 年 3 月 27 日に アーカイブされています。 ブラキウリのマウスゲノム情報エントリ 欧州バイオインフォマティクス研究所のブラキウリーのInterProエントリ Brachyury のタンパク質エントリへのハイパーリンク情報 Xenbase のBrachyury遺伝子エントリUCSCゲノムブラウザにある ヒト T ゲノムの位置と T 遺伝子の詳細ページ 。