ウェルカム・サンガー研究所

ウェルカム・サンガー研究所

設立	1992
監督	マシュー・ハーレス
学部	32
スタッフ	約900
住所	ウェルカムゲノムキャンパス
位置	ヒンクストン 、 ケンブリッジシャー、イギリス
座標	北緯52度04分39秒 東経00度11分15秒 / 北緯52.07750度 東経0.18750度 / 52.07750; 0.18750
Webサイト	サンガー

ウェルカム・サンガー研究所は、以前はサンガー・センター、ウェルカム・トラスト・サンガー研究所として知られ、主にウェルカム・トラストの資金提供を受けている非営利の英国のゲノム学および遺伝学研究機関です。^[1]

ケンブリッジ郊外のヒンクストン村にあるウェルカムゲノムキャンパスに位置し、欧州バイオインフォマティクス研究所と同じ場所にあります。1992年に設立され、ノーベル賞を2度受賞したフレデリック・サンガーにちなんで名付けられました。^{[2] [3]}ヒトゲノムプロジェクトに参加するための大規模なDNA配列解析センターとして構想され、ヒトゲノムのゴールドスタンダード配列に単独では最大の貢献を果たしました。研究所は設立当初からデータ共有の方針を確立し、維持しており、研究の多くを共同で行っています。

2000年以降、研究所は「健康と病気における遺伝学の役割」を理解するためにその使命を拡大しました。^[4]現在、研究所は約900人の従業員を雇用しており^[5]、がん、老化、体細胞変異、細胞遺伝学、ヒト遺伝学、寄生虫と微生物、生命の樹という5つの主要な研究分野に取り組んでいます。

1993年、当時17人だったサンガーセンターのスタッフは、ケンブリッジシャーのヒンクストンホールにある仮の実験室スペースに引っ越した。^[6] この55エーカー（220,000平方メートル^）の敷地は、ウェルカムゲノムキャンパスとなる予定だった。キャンパスには約1,300人のスタッフがおり、そのうち約900人がサンガー研究所で働いている。^[7]ゲノムキャンパスには、ウェルカムトラストカンファレンスセンター^[8]とヨーロッパバイオインフォマティクス研究所も含まれる。キャンパスの大規模な拡張は2005年に正式にオープンした。^[9]建物には新しい実験室、データセンター、スタッフ用アメニティが収容されている。^[10]センターの名前について議論しているとき、サンガー（センターがオープンしたときにはまだ存命だった）は、創設ディレクターのジョンサルストンに、センターは「良いものにしたほうがいい」と語った。サルストンは「むしろ、聞かなければよかった」とコメントした。^[11]

サンガー研究所のシーケンシングスタッフは毎週何百万ものDNAサンプルを扱っています。 ^[要出典]同研究所は「最先端の技術を活用して、数年前には答えられなかった疑問に答えています」。^[12]技術の進歩により、サンガー研究所は個々の人間、脊椎動物 、病原体のゲノムのシーケンシングを、これまで以上に速いペースで、低コストで実行できるようになりました。同研究所では、100 を超える病原体シーケンシングプロジェクトが進行中です。[ ^13]サンガー研究所の出力は、1 日あたり約 100 億塩基の生のシーケンシングデータです。 ^[14]

バイオインフォマティクスデータベース リソースは、サンガー研究所が関与している研究プログラムの成果の 1 つです。サンガー研究所がホストしているものには、次のものがあります。

いくつかのデータベースはサンガー研究所で開始されましたが、現在は他の場所でホストされています。

サンガー研究所の科学研究は 5 つの科学プログラムに分かれており、それぞれが特定の生物学、疾病、分析に焦点を当てた主要な研究分野を定義しています。サンガー研究所の現在のプログラムは、がん、老化と体細胞変異、細胞遺伝学、ヒト遺伝学、寄生虫と微生物、生命の樹です。すべてのプログラムの研究は、ヒト、病原体、細胞の進化、ゲノム変異の表現型と生物学的影響、および突然変異を引き起こすプロセスに関する洞察を提供します。

データ集約と情報科学の革新におけるリーダーシップを提供し、ゲノム全体の機能スクリーニングと薬物試験のための癌のハイスループット細胞モデルを開発し、クローン進化、老化、発達における体細胞変異の役割を調査します。このプログラムには、癌ゲノムプロジェクトが含まれます。

ゲノム変異が細胞生物学に与える影響を研究することで、ヒト遺伝子の機能を探ります。大規模で体系的なスクリーニングを使用して、ヒト人工多能性細胞 (hIPSC)、その分化誘導体、およびその他の細胞タイプにおける自然発生的および人工的なゲノム変異の影響を発見します。これは、国際的なヒト細胞アトラスイニシアチブの創設と組織化を推進する創設プログラムの 1 つです。

研究所のヒト遺伝学の研究は、健康と病気におけるヒトの遺伝的変異の特徴付けに焦点を当てている。ヒトゲノム計画への研究所の貢献とは別に、サンガー研究所の研究者は、病気、集団比較、進化遺伝学に関連するさまざまな研究分野で貢献してきた。2008年1月、世界中の科学者との共同作業である1000ゲノムプロジェクトが開始され、「病気の研究を支援するためのヒトの遺伝的変異の最も詳細なマップ」を作成するために1000人のゲノムを配列決定する取り組みが示された。 ^[25]パイロットプロジェクトのデータは、2010年6月に公共データベースで無料で利用できるようになった。^[26] 2010年、サンガー研究所はUK10Kプロジェクトへの参加を発表した。^{[27] [28] [29]}このプロジェクトでは、 1万人のゲノムを配列決定し、まれな遺伝子変異とそれが人間の健康に及ぼす影響を特定する。サンガー研究所は、さまざまな種類の癌腫瘍を記述するための国際的な取り組みである国際癌ゲノムコンソーシアムにも参加しています。 ^[30]また、 DNA要素の百科事典を作成するためのGENCODEおよびENCODE研究プログラム^[31]にも参加しています。 ^[要出典]

このプログラムは、集団規模の研究にゲノミクスを適用し、ヒトの疾患に関係する原因となる変異と経路、およびそれらが細胞生物学に及ぼす影響を特定します。また、発達障害をモデル化して、どの身体的側面が可逆的であるかを調査します。

進化、感染、治療への耐性の共通基盤メカニズムを調査し、特にマラリアに着目して細菌、ウイルス、寄生虫の理解を深めます。また、宿主と病原体の相互作用の生物学に対するゲノム変異の影響、特に感染に対する宿主の反応と健康および疾患におけるミクロイオチアの役割についても調査します。配列決定後のすべてのゲノムは、Web ベースのオンサイト管理データベース GeneDB で公開されます。^[要出典]

生命の樹プログラムは、英国で発見された複雑な生物の多様性を、シーケンシングと細胞技術を通じて調査するために 2019 年に創設されました。また、種のゲノム配列を比較対照して、進化と保全に関する洞察を明らかにします。このプログラムは、英国諸島の 66,000 種の複雑な種 (真核生物) のゲノム配列をすべて英国全体で決定する取り組みであるダーウィン生命の樹プロジェクトで主導的な役割を果たします。

サンガー研究所の研究の多くは、より広範な科学コミュニティとの協力のもとで行われており、研究所の研究論文の90％以上は他の組織との共同研究によるものです。^[32]重要な共同研究には以下のものがあります。

サンガー研究所には、一般参加活動プログラムがあります。このプログラムは、複雑な生物医学研究を、学校の生徒や教師、地域社会のメンバーなど、さまざまな対象者に公開することを目的としています。

コミュニケーションと公共の関与プログラムは、「サンガー研究所の研究に関連する問題についての情報に基づいた議論を促進する」こと^[36]と「さまざまな聴衆と効果的に関与できる研究者のコミュニティを育てる」ことを目指しています。^[36]研究所は、年間1,500人以上の学生、教師、コミュニティグループの訪問を受け入れています。訪問者は科学スタッフと会い、研究所とその施設を見学し、倫理的な議論や活動に参加することができます。このプログラムでは、科学学習センターの全国ネットワークを通じて、 GCSEと16歳以降の科学の教師向けの専門能力開発セッションも提供しており、現代の遺伝学に関する知識を更新することに関心のあるグループの訪問を受け入れています。サンガー研究所へのビデオ会議は、科学学習センター、科学センター、学校向けにも提供されています。

科学および公共の関与を担当するスタッフは、英国のInsideDNA ^[37]巡回展やサイエンスミュージアムのWho am I?ギャラリー^[38]などの国家プロジェクトにも協力し、貢献しています。また、ケンブリッジサイエンスフェスティバルなどの公共イベントにも参加しています。

この研究所は、基礎科学の卒業生のための4年間のコースと臨床医のための3年間のコースの2つの博士課程を運営しています。4年間のコースでは、学生は博士課程のプロジェクトを選択する前に科学的視野を広げるために3つの異なる研究室をローテーションする必要があります。各学生は、少なくとも1つの実験プロジェクトと1つの情報科学ベースのローテーションプロジェクトを選択する必要があります。^[39]この研究所には約50人の博士課程前の学生が在籍しており、全員がケンブリッジ大学に登録されています。^[40]

Companies Houseによると、親会社であるGenome Research Limitedの5人の役員は、ヘンリー・パーキンソン、ケイ・エリザベス・デイヴィス、ロルフ・ディーター・ホイヤー、ジェームズ・カスバート・スミス、デビッド・リンゼイ・ウィレットです。^[41]サンガーのウェブサイトによると、ヘンリー・パーキンソンは法務責任者です。^[42]

2023 年現在、^{[アップデート]}サンガー研究所は 1,000 人以上の従業員を雇用しており、Matthew_Hurlesが率いています。著名な科学スタッフ、教員、卒業生は以下のとおりです。

2019年現在、^{[アップデート]}32人の科学者が仮説主導の研究を主導し、生物医学的疑問の答えを求めています。^[43]その他、ドミニク・クウィアトコウスキー、ニコール・ソランゾ、マイケル・ストラットン、サラ・タイヒマン、マシュー・ハーレスなどが含まれます。研究所には、准教授、国際フェロー、名誉教授も多数います。これらには、エイドリアン・バード、ユアン・バーニー、クリス・ポンティング、フィオナ・パウリー、スティーブン・オラハリー、アントニオ・ビダル・プイグ、ウルフ・ライクなどが含まれます。

サンガー理事会は科学諮問委員会^[44]によって運営されており、委員会のメンバーにはデイビッド・アルトシュラー教授、アントン・バーンズ教授、デイビッド・J・リップマン教授、ケビン・マーシュ教授、サー・ポール・ナース教授が含まれています。

サンガー研究所の過去の教員には以下の人物が含まれる: ^[45]

ジョン・E・サルストンはサンガー研究所の初代所長であった。サルストンは研究所の所在地としてヒンクストンを選ぶ際に重要な役割を果たし、2000年にヒトゲノム草案の完成が発表されるまで所長を務めた。^[48]サルストンは1963年にケンブリッジ大学を卒業し、1966年にDNAの化学合成に関する博士号を取得した。 ^[49]彼は研究所所長を退任してから2年後の 2002年に、ロバート・ホルヴィッツとシドニー・ブレナーと共にノーベル生理学・医学賞を受賞した。 ^[50]

2000年、アラン・ブラッドリーは、米国のベイラー医科大学の教授職を辞し、サンガー研究所の所長に就任した。ブラッドリーは、サンガー研究所がヒトゲノム計画で達成した成果を基盤として、「遺伝子機能、癌ゲノム、マウスやゼブラフィッシュなどのモデル生物のゲノムに集中する」ことを望んでいた。^[51]ブラッドリーは、ケンブリッジ大学で遺伝学の学士号、修士号、博士号を取得した。^{[52] [53] [54] [55]}

2010年、ブラッドリーは新興企業を設立するために指導者としての役職を退いたが、名誉所長として研究所の教員として残っている。がんゲノムプロジェクトと国際がんゲノムコンソーシアムのリーダーであるマイク・ストラットンが、その年の5月にサンガー研究所の所長に任命された。^[56]

サンガー研究所はヒトゲノム計画開始の3年後の1993年に開設され、 2004年に発表されたヒトゲノムのゴールドスタンダード配列に対して単一の研究としては最大の貢献を果たしました。[ 57 ^]研究所は、ヒトの23対の染色体のうち8対（1、6、9、10、13、20、22、X）の配列決定に協力しました。^[58]ヒトゲノムの公開以来、研究所で行われている研究は生物の配列決定を超えて、がん、マラリア、糖尿病などの疾患の研究を含むさまざまな生物医学研究分野へと発展してきました。

2018年8月、ウェルカム・トラスト・サンガー研究所の所長を含む上級管理職に対する職員いじめと性差別の申し立てについて調査が進行中であると報じられた。 ^[59]マトリックス・チェンバーズの弁護士トーマス・キブリングが行った調査は2018年10月に終了し、ストラットンの不正行為を疑いなくしたが、サンガー研究所の運営における改善の余地を列挙した。^{[60] [61]}調査結果と調査の独立性は争点となった。^[62]

2019年10月、同研究所は倫理的、法的に許可されていないにもかかわらず、ステレンボッシュ大学と内部告発者から報告を受け、収益化の目的で医療機器を製造していたと報じられた。^[63]

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