国際マウス表現型解析コンソーシアム

国際マウス表現型解析コンソーシアム

コンテンツ
説明	ノックアウトマウスの表現型の百科事典。
生物	ねずみ
接触
主な引用	ブラウンとムーア、2012年[1]
発売日	2011
アクセス
Webサイト	http://www.mousephenotype.org

国際マウス表現型解析コンソーシアム（IMPC）は、20,000種のノックアウトマウス系統の表現型を作成し、特徴付ける国際的な科学的取り組みです。 ^{[1] [2] [3]} 2011年9月に発足した^{[1]このコンソーシアムは、} NIH 、欧州各国政府、パートナー機関からの資金提供を受けて、4大陸の15を超える研究機関で構成されています。^[4]

この取り組みは10年（2021年まで）かかると予想されており、国際ノックアウトマウスコンソーシアムによって同質遺伝子C57BL/6 N背景で生成されたホモ 接合変異マウスの分析に焦点を当てます。マウス系統は、胚、神経筋、感覚、心血管、代謝、呼吸、血液、神経学的パラメータを測定することでヒトの疾患への洞察を明らかにすることに重点を置いた広範な表現型解析パイプラインで特徴付けられます。^{[1] [5]} これらの表現型を評価するために使用されるプロトコルは、IMPCパートナー全体で標準化されており、IMPReSSで利用できます。^[5]

IMPCパートナーによって生成されたマウス系統は、KOMPリポジトリ^[6]と欧州ミュータントマウスアーカイブ^{[7]に保管されています。多くの場合、2種類の対立遺伝子のいずれかを持つ系統がアーカイブされます。1つは主要なIMPC表現型解析パイプラインで使用されるヌル対立遺伝子、もう1つは}Cre-Lox組換えおよびFLP-FRT組換えシステムを介して組織限定ノックアウトを可能にする条件付きレディ対立遺伝子です。

表現型データは、自由にアクセス可能で完全に検索可能なオンラインデータベースに記録され、^[8]「哺乳類の遺伝子機能の包括的な百科事典」と呼ばれるものが生成されます。^[1]

国際マウス表現型標準スクリーンリソース (IMPReSS) は、マウス研究クリニックが突然変異マウス系統の生物学的特性を評価するために使用する標準化されたプロトコルを調整および提示します。IMPReSS は、IMPC がすべての遺伝子のノックアウトマウス系統を特徴付けるという目標を達成するのを支援するために 2011 年に開始され、プロジェクトの 10 年間の存続期間中、積極的に開発され続けます。^[1] EMPReSS の後継である IMPReSS は、「表現型パイプライン」の概念に基づいて構築されています。これは、指定された年齢のマウスに対して実行される一連の個別の手順であり、1 つの手順から次の手順への干渉を最小限に抑えるように構成されています。^{[9] [10] [ 11]}各手順は、データとメタデータの両方を取得する複数のパラメーターのセットに分割されます。データ パラメーターは、データ共有を容易にし、人間の病気の表現型マウス モデルの識別を支援するために、生物医学オントロジー用語に関連付けられています。 ^[12]

IMPReSSの前身である欧州マウス表現型解析リソース標準化スクリーン（EMPReSS）^[9]は、EUMODIC ^[13]およびEUMORPHIA ^{[14]プロジェクトの一環として、欧州の研究機関の変異マウス系統の特性評価のための150以上の標準化されたプロトコルを開発しました。EMPReSSは2002年から積極的に開発され、2011年にIMPReSSに置き換えられました。EMPReSSプロトコルから収集された表現型データは、} Europhenomeで入手できます。

マウスにおける標的遺伝子ノックアウトの約30％は、胎児死亡または周産期死亡につながります。^{[15]したがって、これらの突然変異の影響は、}ヘテロ接合性突然変異体を除いて、生きた成体マウスで研究することはできません。しかし、胎児致死ノックアウトの体系的な研究は、これらの遺伝子が胎児の発達と生存にどのように影響するかを理解するために重要です。

2013年にIMPCはマウス胚の表現型解析に関するブルームズベリー報告書を発表し^[15] 、ホモ接合変異体における胚致死ノックアウトのスクリーニングのための標準的なパイプラインを概説した。英国では、彼らの勧告がDMDD（発達障害のメカニズムの解明）プロジェクトの基礎となっている。^[16]

• サンガーマウス遺伝学プロジェクト