DNAに結合したPolD–PCNAプロセス複合体のクライオ電子顕微鏡構造 増殖細胞核抗原 (PCNA )は、真核 細胞 においてDNAポリメラーゼδの プロセス 因子として機能し、複製に不可欠なDNAクランプである。PCNAは ホモ三量体 であり、DNAを囲むことでプロセス性を発揮し、DNA複製、DNA修復、クロマチンリモデリング、エピジェネティクス に関与するタンパク質をリクルートするための足場として機能する。[ 5 ]
多くのタンパク質は、既知の2つのPCNA相互作用モチーフであるPCNA相互作用ペプチド(PIP)ボックス[ 6 ] とAlkBホモログ2 PCNA相互作用モチーフ(APIM)[ 7 ] を介してPCNAと相互作用する。PIPボックスを介してPCNAに結合するタンパク質は主にDNA複製に関与する一方、APIMを介してPCNAに結合するタンパク質は主に遺伝毒性ストレスの文脈で重要である[ 8 ] 。
関数 この遺伝子によってコードされるタンパク質は核内に存在し、DNAポリメラーゼデルタの補因子である。コードされたタンパク質はホモ三量体として働き、DNA複製中のリーディング鎖合成のプロセス性を高めるのに役立つ。DNA損傷に応答して、このタンパク質はユビキチン化さ れ、RAD6依存性DNA修復経路に関与する。この遺伝子には、同じタンパク質をコードする2つの転写バリアントが見つかっている。この遺伝子の偽遺伝子は 、4番染色体とX染色体上に存在することが報告されている。[ 9 ]
PCNAは古細菌にも広く存在し、通常は複製ポリメラーゼ、特にpolD のプロセス因子として機能している。[ 10 ] しかし、Sulfolobus属では、複製polBポリメラーゼのプロセス因子としても機能する。[ 11 ]
DNA修復における役割 DNAポリメラーゼεは DNA修復 中に切除された損傷DNA鎖の再合成に関与しているため、PCNAはDNA合成とDNA修復の両方にとって重要である。[ 18 ] [ 19 ]
PCNA は、複製後修復 (PRR) として知られる DNA 損傷耐性経路にも関与しています。[ 20 ] PRR には 2 つのサブ経路があります。(1)損傷乗り越え合成 経路。これは、損傷した DNA 塩基を活性部位に組み込むことができる特殊な DNA ポリメラーゼによって実行され (通常の複製ポリメラーゼは停止します)、損傷を回避します。(2) 相同組換え機構の動員による損傷回避に関与すると考えられている「テンプレート スイッチ」経路。PCNA は、これらの経路の活性化と、細胞がどの経路を利用するかの選択に極めて重要です。PCNA は、ユビキチン によって翻訳後修飾されます。[ 21 ] PCNA のリジン番号 164 のモノユビキチン化は、損傷乗り越え合成経路を活性化します。 PCNA 上の非標準的なリジン-63結合ポリユビキチン鎖によるこのモノユビキチンの伸長[ 21 ] は、テンプレートスイッチ経路を活性化すると考えられている。さらに、PCNA リジン-164 (および程度は低いがリジン-127) のSUMO化 (小型ユビキチン様修飾因子 、SUMOによる) は、テンプレートスイッチ経路を阻害する。 [ 21 ] この拮抗作用は、SUMO化されたPCNAがSrs2と呼ばれるDNAヘリカーゼをリクルートするためである。 [ 22 ] このDNAヘリカーゼは、相同組換えの開始に不可欠なRad51 ヌクレオプロテインフィラメントを破壊する役割を担っている。
PCNA結合タンパク質 PCNAは多くのタンパク質と相互作用する。[ 5 ]
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外部リンク 米国国立医学図書館の 医学主題見出し (MeSH)における PCNAANA:細胞周期関連(有糸分裂):PCNAタイプ1およびタイプ2抗体パターン— Antibody Patterns.com UniProt : P12004 (増殖細胞核抗原) の PDB で利用可能なすべての構造情報の概要( PDBe-KB) 。