ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
DNMT1 利用可能な構造 電子データ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 4YOC、3EPZ、3PTA、3SWR、4WXX
識別子 エイリアス DNMT1 、ADCADN、AIM、CXXC9、DNMT、HSN1E、MCMT、m.HsaI、DNA(シトシン-5-)メチルトランスフェラーゼ1、DNAメチルトランスフェラーゼ1 外部ID OMIM : 126375; MGI : 94912; HomoloGene : 124071; GeneCards : DNMT1; OMA :DNMT1 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) クロ。 9番染色体(マウス) [2] バンド 9 A3|9 7.66 cM 始める 20,818,505 bp [2] 終わり 20,871,184 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) トップの表現 卵母細胞 二次卵母細胞 腓骨神経 心室帯 神経節隆起 骨髄細胞 付録 小脳半球 小脳の右半球 アキレス腱
トップの表現 一次卵母細胞 胎児の尾 性器結節 二次卵母細胞 受精卵 尿道 副腎管 パネートセル 体節 脛骨大腿関節
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
メチルトランスフェラーゼ活性
DNA結合
トランスフェラーゼ活性
プロモーター特異的クロマチン結合
メチルCpG結合
亜鉛イオン結合
DNAメチルトランスフェラーゼ活性
クロマチン結合
金属イオン結合
タンパク質結合
RNA結合
DNA(シトシン-5-)メチルトランスフェラーゼ活性
DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
細胞成分
ペリセントリックヘテロクロマチン
レプリケーションフォーク
核質
ヘテロクロマチン
核
生物学的プロセス
シトシンのC-5メチル化
転写の調節、DNAテンプレート
DNAメチル化の維持
DNAメチル化依存性ヘテロクロマチンアセンブリの正の制御
RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御
転写、DNAテンプレート
メチル化
DNAメチル化
遺伝子発現の正の調節
遺伝子発現の負の調節、エピジェネティック
ヒストンH3-K4メチル化の正の制御
細胞集団増殖の調節
ヒストンH3-K9メチル化の負の制御
アミノ酸刺激に対する細胞反応
遺伝子発現の調節
Rasタンパク質シグナル伝達
転写の負の調節、DNAテンプレート
シトシンのDNAメチル化
胚の発達に関わるDNAメチル化
クロマチン組織
CG配列内のシトシンのDNAメチル化
遺伝子発現の負の調節
血管関連平滑筋細胞増殖の正の調節
血管関連平滑筋細胞のアポトーシス過程の負の調節
表現型の切り替えに関与する血管関連平滑筋細胞分化の負の調節
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001130823 NM_001379 NM_001318730 NM_001318731
NM_001199431 NM_001199432 NM_001199433 NM_010066 NM_001314011
RefSeq (タンパク質) NP_001124295 NP_001305659 NP_001305660 NP_001370
NP_001186360 NP_001186361 NP_001186362 NP_001300940 NP_034196 NP_001391614
場所 (UCSC) 19章: 10.13 – 10.23 Mb 9 章: 20.82 – 20.87 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
DNA(シトシン-5)メチルトランスフェラーゼ1 (Dnmt1) は、 DNA の特定の CpG部位 へのメチル基の転移( DNAメチル化と 呼ばれるプロセス)を触媒する 酵素です。ヒトでは、 DNMT1 遺伝子 によってコードされています 。 [5] Dnmt1は、主にDNMT1、 DNMT3A 、および DNMT3Bで構成される DNAメチルトランスフェラーゼ 酵素ファミリーの一部を形成します 。
関数
この酵素はDNAメチル化を維持する役割を担っており、細胞分裂をまたいでこの エピジェネティック パターンの忠実性を確保しています。この役割に沿って、DNMT1はヘミメチル化DNA上のCpGをメチル化することに強い好みを持っています。 [6] しかし、DNMT1は転移因子や父性インプリント制御領域を含む特定のゲノムコンテキストで新規DNAメチル化を触媒することができます。 [7] [8] 異常なメチル化パターンは、特定のヒト腫瘍や発達異常と関連しています。 [9] [10]
参照
インタラクション
DNMT1 はUHRF1 と
相互作用する ことが示されています。
DNMT1は細胞周期のS期に高度に転写され、娘DNA鎖上に新たに生成されたヘミメチル化部位のメチル化に必要となる。 [18] PCNAおよびUHRF1との相互作用は、複製フォークへの局在に関与していると考えられている。 [19] DNMT1とG9aの直接的な協力は、細胞分裂中のDNAおよびH3K9のメチル化を調整する。 [17] このクロマチンメチル化は、哺乳類の発生中の遺伝子発現の安定した抑制に必要である。
モデル生物
ノックアウト実験では、この酵素がマウス細胞におけるメチル化の大部分を担っており、胚の発達に不可欠であることが示されています。 [20]また、母体と接合子の両方の Dnmt1 が欠損すると、胚盤胞における刷り込み遺伝子の完全な脱メチル化が起こることも 示されています。 [21]
臨床的意義
DNMT1は造血幹細胞(HSC)の維持に重要な役割を果たしている。DNMT1が減少したHSCは、移植後に効率的に自己複製することができない。 [22] また、腸幹細胞(ISC)や乳腺幹細胞(MaSC)などの他の幹細胞タイプにとっても重要であることがわかっている。DNMT1の条件付き欠失は、腸全体の低メチル化、陰窩の拡大、ISCの分化タイミングの変化、MaSCの増殖と維持をもたらす。 [23]
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外部リンク
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