| XRCC5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | XRCC5、KARP-1、KARP1、KU80、KUB2、Ku86、NFIV、Ku80、チャイニーズハムスター細胞における欠陥修復を補完するX線修復5、クロス補完するX線修復5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム: 194364; MGI : 104517;ホモロジーン: 40681;ジーンカード:XRCC5; OMA :XRCC5 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Ku80は、ヒトではXRCC5遺伝子によってコードされるタンパク質 である。[5] Ku70とKu80は 一緒になってKuヘテロ二量体を形成し、 DNA二本鎖切断末端に結合し、 DNA修復の非相同末端結合(NHEJ)経路に必要とされる。また、哺乳類の免疫系における抗原の多様性を促進するためにNHEJ経路を利用するV(D)J組換えにも必要とされる。
NHEJにおける役割に加えて、Kuはテロメア長の維持とテロメア下遺伝子サイレンシングにも必要である。[6]
Kuはもともと、全身性エリテマトーデスの患者にこのタンパク質に対する自己抗体が高レベルで存在することが判明したときに特定されました。[7]
命名法
Ku80 は、以下を含むいくつかの名前で呼ばれてきました。
- ループス Ku 自己抗原タンパク質 p80
- ATP依存性DNAヘリカーゼ2サブユニット2
- チャイニーズハムスター細胞における欠陥修復を補完するX線修復5
- X線修復クロス補完5(XRCC5)
エピジェネティック抑制
Ku80のタンパク質発現レベルは、Ku80をコードする遺伝子XRCC5のプロモーター領域のエピジェネティックな高メチル化によって抑制される可能性がある。 [8]非小細胞肺癌 の原発性腫瘍と近くの正常肺組織の87組のマッチした研究では、腫瘍の25%でXRCC5遺伝子座のヘテロ接合性の消失が見られ、同様の割合の腫瘍でXRCC5のプロモーター領域の高メチル化が見られた。Ku80のタンパク質発現の低さは、mRNA発現の低下およびXRCC5プロモーターの高メチル化と有意に関連していたが、遺伝子のLOHとは関連していなかった。[8]
老化
Ku80のホモ接合性欠陥を持つマウス変異体は、早期に老化が始まります。[9] [10] Ku80(-/-) マウスは、老化に関連した病理(骨減少症、萎縮性皮膚、肝細胞変性、肝細胞封入体、肝臓過形成巣、および年齢特異的死亡率)を示します。さらに、Ku80(-/-) マウスは、寿命とサイズが著しく減少します。Ku(-/+) ヘテロ接合性マウスでKu80対立遺伝子を1つだけ失うと、出生後の成長は正常ですが、骨格筋の老化が加速します。[11] ヒト、ウシ、およびマウスのKu80タンパク質レベルの分析により、Ku80レベルは種間で大幅に異なり、これらのレベルは種の寿命と強く相関していることが示されました。[12] これらの結果は、Ku80を介したDNA修復のNHEJ経路が、早期老化を引き起こす二重鎖切断の修復に重要な役割を果たしていることを示唆している(老化のDNA損傷理論を参照)。
臨床的意義
この遺伝子のまれなマイクロサテライト 多型は、さまざまな放射線感受性の患者の癌と関連している。[5]
癌における欠乏
DNA修復遺伝子の発現欠損は癌のリスクを高める(発癌におけるDNA修復欠損を参照)。Ku80タンパク質発現は黒色腫で欠損していることが判明した。[13] さらに、Ku80の発現低下は腺癌型の15%と扁平上皮型非小細胞肺癌の32%で確認され、これはXRCC5プロモーターの過剰メチル化と相関していた。[8]
Ku80 は、さまざまな癌においてエピジェネティックに抑制される 26 種類の DNA 修復タンパク質のうちの 1 つであると考えられます (癌のエピジェネティクスを参照)。
インタラクション
Ku80 は以下と相互作用することが示されています:
- DNA-PKcs、[14] [15] [16]
- GCN5L2、[17]
- Ku70、[14] [17] [18] [19] [20]
- NCOA6、[21] [22]
- PCNA、[16] [23] [24]
- POU2F1、[16] [25]
- TERF2IP、[26]
- テロメラーゼ逆転写酵素、[27]
- チロシンキナーゼ2、[28] および
- ウェルナー症候群ATP依存性ヘリカーゼ。[29] [30]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000079246 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000026187 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab "Entrez Gene: XRCC5 X線修復はチャイニーズハムスター細胞5の欠陥修復を補完する(二本鎖切断の再結合、Ku自己抗原、80kDa)"。
- ^ Boulton SJ、 Jackson SP (1998年3月)。「Ku依存性非相同末端結合経路の構成要素はテロメア長維持とテロメアサイレンシングに関与している」。EMBO J. 17 (6): 1819– 28. doi :10.1093/emboj/17.6.1819. PMC 1170529. PMID 9501103 。
- ^ 「Entrez Gene: XRCC6 X線修復はチャイニーズハムスター細胞6(Ku自己抗原、70kDa)の欠陥修復を補完する」。
- ^ abc Lee MN, Tseng RC, Hsu HS, Chen JY, Tzao C, Ho WL, Wang YC (2007). 「非小細胞肺がんにおける染色体安定性制御遺伝子 BRCA1、BRCA2、XRCC5 のエピジェネティック不活性化」Clin. Cancer Res . 13 (3): 832–8 . doi : 10.1158/1078-0432.CCR-05-2694 . PMID 17289874.
- ^ Vogel H, Lim DS, Karsenty G, Finegold M, Hasty P (1999). 「Ku86 の欠失はマウスの老化の早期開始を引き起こす」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (19): 10770– 5. Bibcode :1999PNAS...9610770V. doi : 10.1073/pnas.96.19.10770 . PMC 17958 . PMID 10485901.
- ^ Reiling E、Dollé ME、Youssef SA、Lee M、Nagarajah B、Roodbergen M、de With P、de Bruin A、Hoeijmakers JH、Vijg J、van Steeg H、Hasty P (2014)。 「Ku80欠損の早老性表現型は、DNA-PKCS欠損よりも優勢である。」プロスワン。9 (4): e93568。Bibcode :2014PLoSO...993568R。土井:10.1371/journal.pone.0093568。PMC 3989187。PMID 24740260。
- ^ Didier N, Hourdé C, Amthor H, Marazzi G, Sassoon D (2012). 「Ku80の単一対立遺伝子の喪失は骨格筋の祖先機能不全と老化の加速につながる」EMBO Mol Med . 4 (9): 910– 23. doi :10.1002/emmm.201101075. PMC 3491824 . PMID 22915554.
- ^ Lorenzini A、Johnson FB、Oliver A、Tresini M、Smith JS、Hdeib M、Sell C、Cristofalo VJ、Stamato TD (2009)。「種の寿命とDNA二本鎖切断の認識には有意な相関関係があるが、テロメアの長さとは相関関係がない」。Mech . Ageing Dev . 130 ( 11– 12): 784– 92. doi :10.1016/j.mad.2009.10.004. PMC 2799038. PMID 19896964 。
- ^ Korabiowska M, Tscherny M, Stachura J, Berger H, Cordon-Cardo C, Brinck U (2002). 「黒色腫の進行における DNA 非相同末端結合タンパク質 Ku70 および Ku80 の差次的発現」. Mod. Pathol . 15 (4): 426– 33. doi : 10.1038/modpathol.3880542 . PMID 11950917.
- ^ ab Gell D, Jackson SP (1999年9月). 「DNA依存性タンパク質キナーゼ複合体内のタンパク質間相互作用のマッピング」. Nucleic Acids Res . 27 (17): 3494– 502. doi :10.1093/nar/27.17.3494. PMC 148593. PMID 10446239 .
- ^ Jin S、Kharbanda S、Mayer B、Kufe D、Weaver DT(1997年10月)。「DNA依存性タンパク質キナーゼ触媒サブユニットのキナーゼ相同領域におけるKuとc-Ablの結合」。J . Biol. Chem . 272(40):24763 ~6。doi :10.1074/ jbc.272.40.24763。PMID 9312071。
- ^ abc Matheos D、Ruiz MT、Price GB、Zannis-Hadjopoulos M (2002 年 10 月)。「Ku 抗原は、複製タンパク質と関連するオリジン特異的結合タンパク質であり、哺乳類の DNA 複製に必要である」。Biochim . Biophys. Acta . 1578 ( 1– 3): 59– 72. doi :10.1016/s0167-4781(02)00497-9. PMID 12393188。
- ^ ab Barlev NA、Poltoratsky V、Owen-Hughes T、Ying C、Liu L、Workman JL、Berger SL(1998年3月)。「Ku-DNA依存性タンパク質キナーゼ複合体によるブロモドメイン介在結合およびリン酸化を介したGCN5ヒストンアセチルトランスフェラーゼ活性の抑制」。Mol . Cell . Biol . 18(3): 1349–58。doi : 10.1128/ mcb.18.3.1349。PMC 108848。PMID 9488450。
- ^ Yang CR、Yeh S、Leskov K、Odegaard E、Hsu HL、Chang C、Kinsella TJ、Chen DJ、Boothman DA (1999 年 5 月)。 「Ku70結合タンパク質(KUB)の単離」。核酸研究27 (10): 2165–74 .土井:10.1093/nar/27.10.2165。PMC 148436。PMID 10219089。
- ^ Singleton BK、Torres-Arzayus MI、Rottinghaus ST、Taccioli GE、Jeggo PA (1999 年 5 月)。「Ku80 の C 末端は DNA 依存性タンパク質キナーゼ触媒サブユニットを活性化する」。Mol . Cell. Biol . 19 (5): 3267– 77. doi :10.1128/mcb.19.5.3267. PMC 84121. PMID 10207052 。
- ^ Song K, Jung D, Jung Y, Lee SG, Lee I (2000年9月). 「ヒトKu70とTRF2の相互作用」. FEBS Lett . 481 (1): 81–5 . doi : 10.1016/s0014-5793(00)01958-x . PMID 10984620. S2CID 22753893.
- ^ Ko L, Cardona GR, Chin WW (2000 年 5 月). 「LXXLL モチーフ含有タンパク質である甲状腺ホルモン受容体結合タンパク質は、一般的なコアクチベーターとして機能する」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (11): 6212– 7. Bibcode :2000PNAS...97.6212K. doi : 10.1073/pnas.97.11.6212 . PMC 18584 . PMID 10823961.
- ^ Ko L, Chin WW (2003 年 3 月). 「核受容体共活性化因子甲状腺ホルモン受容体結合タンパク質 (TRBP) は関連する DNA 依存性タンパク質キナーゼと相互作用し、これを刺激する」. J. Biol. Chem . 278 (13): 11471–9 . doi : 10.1074/jbc.M209723200 . PMID 12519782.
- ^ Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (2002年10月). 「プロテオミクスによるヒト細胞溶解物中の増殖細胞核抗原(PCNA)結合タンパク質の同定。ヒトCHL12/RFCs2-5複合体の新規PCNA結合タンパク質としての同定」J. Biol. Chem . 277 (43): 40362– 7. doi : 10.1074/jbc.M206194200 . PMID 12171929.
- ^ Balajee AS、 Geard CR(2001年3月)。「DNA損傷によって引き起こされるクロマチン結合PCNA複合体の形成は、ヒト細胞におけるATM遺伝子産物とは無関係に起こる」。Nucleic Acids Res . 29 ( 6):1341–51。doi :10.1093 / nar/29.6.1341。PMC 29758。PMID 11239001。
- ^ Schild-Poulter C、Pope L、Giffin W、Kochan JC、Ngsee JK、Traykova-Andonova M、Haché RJ (2001 年 5 月)。「Ku 抗原のホメオドメインタンパク質への結合は、DNA 依存性タンパク質キナーゼによるリン酸化を促進する」。J . Biol. Chem . 276 (20): 16848– 56. doi : 10.1074/jbc.M100768200 . PMID 11279128。
- ^ O'Connor MS、Safari A、Liu D、Qin J、 Songyang Z (2004 年 7 月)。「ヒト Rap1 タンパク質複合体とテロメア長の調節」。J . Biol. Chem . 279 ( 27): 28585–91。doi : 10.1074/ jbc.M312913200。PMID 15100233。
- ^ Chai W、Ford LP、Lenertz L、Wright WE、Shay JW (2002 年 12 月)。「ヒト Ku70/80 は hTERT との相互作用を通じてテロメラーゼと物理的に結合します」。J . Biol. Chem . 277 (49): 47242–7 . doi : 10.1074/jbc.M208542200 . PMID 12377759。
- ^ Adam L、Bandyopadhyay D、Kumar R (2000 年 1 月)。「インターフェロン α シグナル伝達は、p95Vav の核から細胞質への再分布を促進し、Vav、Ku80、および Tyk2 を含むマルチサブユニット複合体の形成を促進する」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 267 (3): 692– 6. doi :10.1006/bbrc.1999.1978. PMID 10673353。
- ^ Karmakar P、Snowden CM、Ramsden DA、Bohr VA (2002 年 8 月)。「Ku ヘテロダイマーは Werner タンパク質の両端に結合し、機能的相互作用は Werner N 末端で発生します」。Nucleic Acids Res . 30 (16): 3583–91 . doi :10.1093/nar/gkf482. PMC 134248 . PMID 12177300。
- ^ Li B, Comai L (2000年9月). 「DNA末端処理におけるKuとウェルナー症候群タンパク質の機能的相互作用」J. Biol. Chem . 275 (37): 28349–52 . doi : 10.1074/jbc.C000289200 . PMID 10880505.
さらに読む
- 小池 正之 (2003). 「Ku70 および Ku80 タンパク質の二量体化、転座および局在」J. Radiat. Res . 43 (3): 223– 36. Bibcode :2002JRadR..43..223K. doi : 10.1269/jrr.43.223 . PMID 12518983.
- Chen DJ、Park MS、Campbell E、Oshimura M、Liu P、Zhao Y、White BF、Siciliano MJ (1992)。「ヒトDNA二本鎖切断修復遺伝子(XRCC5)の染色体2への割り当て」。ゲノミクス。13(4):1088– 94。doi :10.1016/0888-7543(92)90023- L。PMID 1505945 。
- Wedrychowski A, Henzel W, Huston L, Paslidis N, Ellerson D, McRae M, Seong D, Howard OM, Deisseroth A (1992). 「造血細胞におけるインターフェロン誘導性転写エンハンサーに結合するタンパク質の同定」J. Biol. Chem . 267 (7): 4533– 40. doi : 10.1016/S0021-9258(18)42866-9 . PMID 1537839.
- Jeggo PA, Hafezparast M, Thompson AF, Broughton BC, Kaur GP, Zdzienicka MZ, Athwal RS (1992). 「ヒト染色体2への二本鎖切断再結合に関与するDNA修復遺伝子(XRCC5)の局在」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 89 (14): 6423– 7. Bibcode :1992PNAS...89.6423J. doi : 10.1073/pnas.89.14.6423 . PMC 49513 . PMID 1631138.
- Knuth MW、Gunderson SI、Thompson NE、Strashheim LA、Burgess RR (1990)。「ヒトU1プロモーターの近位配列要素に結合する、KuおよびTREFに関連する転写活性化タンパク質である近位配列要素結合タンパク質1の精製および特性評価」。J . Biol. Chem . 265 (29): 17911– 20. doi : 10.1016/S0021-9258(18)38250-4 . PMID 2211668。
- Stuiver MH、Coenjaerts FE、van der Vliet PC (1990)。「自己抗原 Ku は、多量体タンパク質-DNA 複合体を形成するタンパク質である NF IV と区別がつかない」。J . Exp. Med . 172 (4): 1049– 54. doi :10.1084/jem.172.4.1049. PMC 2188621. PMID 2212941 。
- Mimori T, Ohosone Y, Hama N, Suwa A, Akizuki M, Homma M, Griffith AJ, Hardin JA (1990). 「強皮症多発性筋炎重複症候群患者の自己抗体が認識するヒト自己抗原 Ku (p70/p80) の 80 kDa サブユニットタンパク質をコードする cDNA の単離および特性評価」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 87 (5): 1777– 81. Bibcode :1990PNAS...87.1777M. doi : 10.1073/pnas.87.5.1777 . PMC 53566 . PMID 2308937.
- Yaneva M, Wen J, Ayala A, Cook R (1989). 「Ku抗原の86kDaサブユニットのcDNA由来アミノ酸配列」J. Biol. Chem . 264 (23): 13407–11 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)80011-4 . PMID 2760028.
- Genersch E, Eckerskorn C, Lottspeich F, Herzog C, Kühn K, Pöschl E (1995). 「ヒトコラーゲンIV遺伝子の制御に関与する配列特異的転写因子CTCBFの精製:Ku抗原と相同性のあるサブユニット」。EMBO J. 14 ( 4): 791– 800. doi :10.1002/j.1460-2075.1995.tb07057.x. PMC 398145. PMID 7882982 .
- トゥテジャ N、トゥテジャ R、オーケム A、タネジャ P、ファン NW、シモンシッツ A、スーシッチ S、ラーマン K、マルシッチ L、チェン J (1994)。 「ヒト DNA ヘリカーゼ II: Ku 自己抗原として同定された新規 DNA 巻き戻し酵素」。エンボ J . 13 (20): 4991–5001。土井:10.1002/j.1460-2075.1994.tb06826.x。PMC 395441。PMID 7957065。
- Le Romancer M, Reyl-Desmars F, Cherifi Y, Pigeon C, Bottari S, Meyer O, Lewin MJ (1994). 「自己抗原 Ku の 86 kDa サブユニットは、タンパク質ホスファターゼ 2A の活性を制御するソマトスタチン受容体である」J. Biol. Chem . 269 (26): 17464–8 . doi : 10.1016/S0021-9258(17)32463-8 . PMID 8021251.
- Cao QP、Pitt S、 Leszyk J 、 Baril EF (1994)。「HeLa 細胞の DNA 依存性 ATPase はヒト Ku 自己抗原と関連している」。生化学。33 (28): 8548– 57。doi :10.1021/bi00194a021。PMID 8031790 。
- Taccioli GE、Gottlieb TM、Blunt T、Priestley A、Demengeot J、Mizuta R、Lehmann AR、Alt FW、Jackson SP、Jeggo PA (1994)。「Ku80: XRCC5 遺伝子の産物と DNA 修復および V(D)J 組み換えにおけるその役割」。Science。265 ( 5177 ) : 1442– 5。Bibcode : 1994Sci ...265.1442T。doi :10.1126/science.8073286。PMID 8073286 。
- Chen DJ、Marrone BL、Nguyen T、Stackhouse M、Zhao Y、Siciliano MJ (1994)。「X線ハイブリッドマッピングによるヒトDNA修復遺伝子(XRCC5)の2q35への領域割り当て」。ゲノミクス。21 ( 2 ):423–7。doi : 10.1006 /geno.1994.1287。PMID 8088837 。
- Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」.遺伝子. 138 ( 1– 2): 171– 4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Kaczmarski W、カーン SA (1993)。 「狼瘡自己抗原 Ku タンパク質は in vitro で HIV-1 TAR RNA に結合します。」生化学。生物物理学。解像度共通。196 (2): 935–42 .土井:10.1006/bbrc.1993.2339。PMID 8240370。
- Blunt T、Taccioli GE、Priestley A、Hafezparast M、McMillan T、Liu J、Cole CC、White J、Alt FW、Jackson SP (1996)。「XRCC5 (Ku80) DNA 修復遺伝子を含む YAC コンティグと YAC プロトプラスト融合による欠陥細胞の補完」。Genomics。30 ( 2 ) : 320– 8。doi : 10.1006/geno.1995.9871。PMID 8586433 。
- Warriar N、Pagé N、Govindan MV (1996)。「ヒトグルココルチコイド受容体遺伝子の発現および核タンパク質と転写制御要素との相互作用」。J . Biol. Chem . 271 (31): 18662– 71. doi : 10.1074/jbc.271.31.18662 . PMID 8702520。
- Myung K, He DM, Lee SE, Hendrickson EA (1997). 「KARP-1: Ku86 自己抗原遺伝子座から発現する新規ロイシンジッパータンパク質は DNA 依存性タンパク質キナーゼ活性の制御に関与している」. EMBO J. 16 ( 11): 3172–84 . doi :10.1093/emboj/16.11.3172. PMC 1169935. PMID 9214634 .
- Jin S、Kharbanda S、Mayer B、Kufe D、Weaver DT (1997)。「DNA依存性タンパク質キナーゼ触媒サブユニットのキナーゼ相同領域におけるKuとc-Ablの結合」。J . Biol. Chem . 272 (40): 24763–6 . doi : 10.1074/jbc.272.40.24763 . PMID 9312071。
外部リンク
- PDBe-KBは、ヒトX線修復相互補完タンパク質5のPDBで利用可能なすべての構造情報の概要を提供します。
