ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
RFC5 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス RFC5 、RFC36、複製因子Cサブユニット5 外部ID オミム ：600407; MGI : 1919401; ホモロジーン ：6730; ジーンカード ：RFC5; OMA :RFC5 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 5番染色体（マウス） [2] バンド 5|5 女性 始める 117,516,168 bp [2] 終わり 117,527,112 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 ポンス 上前庭核 舌の体 内淡蒼球 上腕二頭筋の骨格筋組織 内皮細胞 迷走神経下神経節 ブロードマン領域23 視床下核 右心室
トップの表現 胚葉上層 胚 骨髄 胚 卵黄嚢 胸腺 心室帯 胎児の尾 神経管 中脳
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
ヌクレオチド結合 DNA結合 一本鎖DNAヘリカーゼ活性 タンパク質結合 ATP結合 酵素結合 DNAクランプローダー活性 細胞成分
DNA複製因子C複合体 Ctf18 RFC類似複合体 核質 核 生物学的プロセス
ヌクレオチド除去修復、DNAギャップ充填 エラーのないトランスレジョン合成 エラーを起こしやすいトランスレジョン合成 DNA指向性DNAポリメラーゼ活性の正の調節 トランスレジョン合成 転写連動ヌクレオチド除去修復 ヌクレオチド除去修復、DNA切断 ヌクレオチド除去修復、DNA切断、5'-to損傷 DNA複製 DNA修復 半保存的複製によるテロメア維持 DNA依存性DNA複製 p53クラスメディエーターによるシグナル伝達の調節 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001130112 NM_001130113 NM_001206801 NM_007370 NM_181578 NM_001346815
RefSeq (タンパク質) NP_001123584 NP_001123585 NP_001193730 NP_001333744 NP_031396 NP_853556
場所 (UCSC) 12章: 118.01 – 118.03 Mb 5 章: 117.52 – 117.53 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
複製因子Cサブユニット5 は、ヒトでは RFC5 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
関数 DNAポリメラーゼデルタ と DNAポリメラーゼイプシロンによる プライミングされた DNAテンプレート の伸長には 、補助タンパク質である 増殖細胞核抗原 （PCNA）と 複製因子C （RFC）が必要です。RFCはアクチベーター1とも呼ばれ、140、40、38、37、36kDの5つの異なるサブユニットからなるタンパク質複合体です。この遺伝子は36kDサブユニットをコードします。このサブユニットはPCNAの C末端 領域と相互作用することができます。38kDaおよび40kDaサブユニットとコア複合体を形成します。コア複合体は DNA依存性ATPase 活性を有し、in vitroシステムでPCNAによって刺激されることがわかっています。異なるアイソフォームをコードする 代替スプライス 転写バリアントが報告されています。 [6]
インタラクション RFC5 は以下と相互作用する ことが示されています :
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000111445 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000029363 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Okumura K, Nogami M, Taguchi H, Dean FB, Chen M, Pan ZQ, Hurwitz J, Shiratori A, Murakami Y, Ozawa K (1995年1月). 「ヒト複製因子Cの36.5kDa (RFC5), 37kDa (RFC4), 38kDa (RFC3), 40kDa (RFC2)サブユニット遺伝子の染色体バンド12q24.2-q24.3, 3q27, 13q12.3-q13, 7q11.23への割り当て」. Genomics . 25 (1): 274–8. doi :10.1016/0888-7543(95)80135-9. PMID 7774928. ^ ab "Entrez Gene: RFC5 複製因子 C (活性化因子 1) 5、36.5kDa"。 ^ Maruyama T, Farina A, Dey A, Cheong J, Bermudez VP, Tamura T, Sciortino S, Shuman J, Hurwitz J, Ozato K (2002 年 9 月). 「哺乳類のブロモドメインタンパク質 brd4 は、複製因子 C と相互作用し、S 期への進行を阻害する」. 分子 細胞生物学 . 22 (18): 6509–20. doi :10.1128/mcb.22.18.6509-6520.2002. PMC 135621. PMID 12192049. ^ Bermudez VP、Maniwa Y、Tappin I、Ozato K、Yokomori K、Hurwitz J (2003 年 9 月)。「姉妹染色分体凝集に必要な代替 Ctf18-Dcc1-Ctf8-複製因子 C 複合体は、増殖細胞核抗原を DNA 上にロードします」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。100 (18): 10237–42。Bibcode : 2003PNAS..10010237B。doi : 10.1073 / pnas.1434308100。PMC 193545。PMID 12930902 。 ^ abc Cai J、Gibbs E、Uhlmann F、Phillips B、Yao N、O'Donnell M、Hurwitz J (1997 年 7 月)。「ヒト複製因子 C p40、p37、および p36 サブユニットからなる複合体は、DNA 依存性 ATPase であり、ホロ酵素の組み立ての中間体である」。The Journal of Biological Chemistry 。272 ( 30): 18974–81。doi : 10.1074 /jbc.272.30.18974。PMID 9228079 。 ^ Mossi R, Jónsson ZO, Allen BL, Hardin SH, Hübscher U (1997年1月). 「複製因子Cは増殖細胞核抗原のC末端側と相互作用する」. The Journal of Biological Chemistry . 272 (3): 1769–76. doi : 10.1074/jbc.272.3.1769 . PMID 8999859. ^ Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (2002年10月). 「プロテオミクスによるヒト細胞溶解物中の増殖細胞核抗原（PCNA）結合タンパク質の同定。ヒトCHL12/RFCs2-5複合体の新規PCNA結合タンパク質としての同定」。The Journal of Biological Chemistry . 277 (43): 40362–7. doi : 10.1074/jbc.M206194200 . PMID 12171929. ^ ab Cai J, Yao N, Gibbs E, Finkelstein J, Phillips B, O'Donnell M, Hurwitz J (1998年9月). 「ヒト複製因子Cによって触媒されるATP加水分解には複数のサブユニットの関与が必要」. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 95 (20): 11607–12. Bibcode :1998PNAS...9511607C. doi : 10.1073/pnas.95.20.11607 . PMC 21688. PMID 9751713. ^ ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實・岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ・グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルシュタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005 年 10 月）。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。 自然 。 437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026. ^ Ellison V、Stillman B (1998 年 3 月)。「組み換えヒト複製因子 C (RFC) の再構成および DNA 依存性 ATPase 活性を有する RFC サブ複合体の同定」。The Journal of Biological Chemistry。273 ( 10): 5979–87。doi : 10.1074/ jbc.273.10.5979。PMID 9488738 。
さらに読む
O'Donnell M、Onrust R、Dean FB、Chen M 、 Hurwitz J (1993 年 1 月)。「複製ポリメラーゼの補助タンパク質の相 同性 - 大腸菌からヒトまで」。 核酸 研究 。21 (1): 1–3。doi :10.1093/nar/21.1.1。PMC 309057。PMID 8441605 。 Uhlmann F, Cai J, Flores-Rozas H, Dean FB, Finkelstein J, O'Donnell M, Hurwitz J (1996 年 6 月)。「ヒト複製因子 C の 5 つのサブユニットからの in vitro 再構成」。 米国 科学 アカデミー紀要 。93 (13): 6521–6。Bibcode : 1996PNAS ... 93.6521U。doi : 10.1073 / pnas.93.13.6521。PMC 39056。PMID 8692848 。 Mossi R、Jónsson ZO、Allen BL、Hardin SH 、 Hübscher U (1997 年 1 月)。「複製因子 C は増殖細胞核抗原の C 末端側と相互作用する」。The Journal of Biological Chemistry。272 ( 3): 1769–76。doi : 10.1074/ jbc.272.3.1769。PMID 8999859 。 Cujec TP、Cho H、Maldonado E 、 Meyer J、Reinberg D、Peterlin BM (1997 年 4 月)。「ヒト免疫不全ウイルストランスアクチベーター Tat は RNA ポリメラーゼ II ホロ酵素と相互作用する」。 分子 細胞 生物学 。17 (4): 1817–23。doi :10.1128/ mcb.17.4.1817。PMC 232028。PMID 9121429 。 Cai J、Gibbs E、Uhlmann F、Phillips B、Yao N、O'Donnell M、Hurwitz J (1997 年 7 月)。「ヒト複製因子 C p40、p37、p36 サブユニットからなる複合体は DNA 依存性 ATPase であり、ホロ酵素の組み立ての中間体である」。The Journal of Biological Chemistry。272 ( 30 ): 18974–81。doi : 10.1074/jbc.272.30.18974。PMID 9228079 。 Loor G、 Zhang SJ、Zhang P、Toomey NL、Lee MY (1997 年 12 月)。「PCNA と相互作用する DNA 複製および細胞周期タンパク質の同定」。 核酸 研究 。25 ( 24 ): 5041–6。doi :10.1093/nar/25.24.5041。PMC 147130。PMID 9396813 。 Ellison V、 Stillman B (1998 年 3 月)。「組み換えヒト複製因子 C (RFC) の再構成と DNA 依存性 ATPase 活性を有する RFC サブ複合体の同定」 (PDF) 。The Journal of Biological Chemistry。273 ( 10): 5979–87。doi : 10.1074 / jbc.273.10.5979。PMID 9488738。S2CID 17647091 。 Cai J、Yao N、Gibbs E、Finkelstein J、Phillips B、O'Donnell M、Hurwitz J (1998 年 9 月)。「ヒト複製因子 C によって触媒される ATP 加水分解には複数のサブユニットの関与が必要」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。95 (20): 11607–12。Bibcode : 1998PNAS ...9511607C。doi : 10.1073 / pnas.95.20.11607。PMC 21688。PMID 9751713 。 Zhang G、Gibbs E、Kelman Z、O'Donnell M、Hurwitz J (1999 年 3 月)。「ヒト複製因子 C とヒト増殖細胞核抗原との相互作用に関する研究」。 米国科学アカデミー紀要。96 ( 5 ) : 1869–74。Bibcode : 1999PNAS ... 96.1869Z。doi : 10.1073 / pnas.96.5.1869。PMC 26703。PMID 10051561 。 Lindsey-Boltz LA、 Bermudez VP、Hurwitz J、Sancar A (2001 年 9 月)。「ヒト DNA 損傷チェックポイント Rad 複合体の精製と特性評価」。 米国 科学 アカデミー紀要 。98 (20): 11236–41。Bibcode :2001PNAS ... 9811236L。doi : 10.1073 / pnas.201373498。PMC 58713。PMID 11572977 。 Griffith JD、Lindsey - Boltz LA、Sancar A (2002 年 5 月)。「グリセロールスプレー/低電圧顕微鏡で可視化したヒト Rad17-複製因子 C およびチェックポイント Rad 9-1-1 複合体の構造」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 18): 15233–6。doi : 10.1074/ jbc.C200129200。PMID 11907025 。 Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (2002 年 10 月)。「プロテオミクスによるヒト細胞溶解物中の増殖細胞核抗原 (PCNA) 結合タンパク質の同定。ヒト CHL12/RFCs2-5 複合体の新規 PCNA 結合タンパク質としての同定」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 43 ): 40362–7。doi : 10.1074/ jbc.M206194200。PMID 12171929 。 Maruyama T, Farina A, Dey A, Cheong J, Bermudez VP, Tamura T, Sciortino S, Shuman J, Hurwitz J, Ozato K (2002 年 9 月)。「哺乳類のブロモドメインタンパク質 brd4 は、複製因子 C と相互作用し、S 期への進行を阻害する」。 分子 細胞 生物 学 。22 (18): 6509–20。doi :10.1128/ MCB.22.18.6509-6520.2002。PMC 135621。PMID 12192049 。 Venclovas C、 Colvin ME、Thelen MP (2002 年 10 月)。「RFC 依存性クランプローディングプロセスにおける相互作用の分子モデリングに基づく分析」。 タンパク質 科学 。11 (10): 2403–16。doi :10.1110/ ps.0214302。PMC 2373712。PMID 12237462 。 Merkle CJ、Karnitz LM、Henry-Sánchez JT、Chen J (2003 年 8 月)。「hCTF18、hCTF8、hDCC1 のクローニングと特性解析。姉妹染色分体凝集の確立に関与する Saccharomyces cerevisiae 複合体のヒト相同体」。The Journal of Biological Chemistry。278 ( 32 ) : 30051–6。doi : 10.1074/ jbc.M211591200。PMID 12766176 。 Bermudez VP、Maniwa Y、Tappin I、Ozato K、Yokomori K、Hurwitz J (2003 年 9 月)。「姉妹染色分体接着に必要な代替 Ctf18-Dcc1-Ctf8-複製因子 C 複合体は、増殖細胞核抗原を DNA にロードします」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。100 ( 18): 10237–42。Bibcode :2003PNAS..10010237B。doi : 10.1073 / pnas.1434308100。PMC 193545。PMID 12930902 。 Zou L、Liu D、Elledge SJ (2003 年 11 月)。「複製タンパク質 A を介した Rad17 複合体のリクルートメントと活性化」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。100 ( 24 ): 13827–32。Bibcode :2003PNAS..10013827Z。doi : 10.1073/ pnas.2336100100。PMC 283506。PMID 14605214 。
