起源 現代人のミトコンドリアDNA系統樹の外群は、古代人 、特に ネアンデルタール人 とデニソワ人 のミトコンドリアDNAである。全ゲノム解析に基づくと、現代人の系統がネアンデルタール人およびデニソワ人の系統から分岐したのは約76万~ 55万年前と推定されている。これは、分岐時期を約80万6千~ 44万7千年前とするY染色体DNA に基づく推定値と一致する。 [ 4 ] しかし、ミトコンドリアDNAに関しては、現代人とネアンデルタール人は姉妹クレードを形成し、デニソワ人が基底外群となっているように見える。ネアンデルタール人と現代人のミトコンドリアDNAの分岐は約49万8千~ 29万5千年前と推定されており、核DNAに基づく推定値よりもかなり若い。これは、約27万年前、つまり解剖学的現代人類が初めて出現した頃(ジェベル・イルホウド )に、アフリカからネアンデルタール人のゲノムへの初期の遺伝子流入があったことを反映していると説明されている。Posthら(2017)は、最小限の混交を仮定した場合でも、アフリカからの初期の ホモ・サピエンスの mtDNAが元のネアンデルタール人のmtDNAを完全に置き換えた可能性があると示唆している。ネアンデルタール人とデニソワ人の系統は約43万年前に分岐しており、デニソワ人のmtDNAは遺伝子浸透の影響を受けていない。 [ 4 ]
現代人のミトコンドリアDNAの最も近い共通祖先(「ミトコンドリア・イブ」と呼ばれる)は 、 約23万~ 15万年前と推定されている。ハプログループL1-6の出現は、定義上、それよりも後の時期、推定20万~ 13万年前[ 1 ] 、おそらく東アフリカ の集団で起こったと考えられる[ 3 ] 。ハプログループL0は、基底ハプログループL1-6*からやや遅れて、推定19万~ 11万年前に出現した。
これらの系統の時間の深さは、アフリカにおけるこのハプログループのサブ構造が複雑でよく理解されていないことを意味する。[ 5 ] 日付の推定は必然的に不正確である。上記の間隔は、Soares et al. (2009) に従った95% 信頼区間 の上限と下限の推定値を表し ており、最も可能性の高い年代はこれらの間隔の中心付近である。[ 1 ]
系統発生
L1-6 ハプログループL1-6(L1'2'3'4'5'6とも呼ばれる)は、ミトコンドリア・イブから約2万年後、つまり約17万年前に未分化ハプログループLから分岐した( ソアレスら(2009)の推定では167 ± 36 kya 。この系統は、約70 kya の最近のアフリカからの移住イベントの前に、 L1 (150 kya)、L5 (120 kya)、L2 (90 kya) に分岐した。L3は 約70 kyaに出現し、アフリカからの移住イベントと密接に関連している。東アフリカまたはアジアで発生した可能性がある。L6とL4 は L3の姉妹系統であるが、東アフリカに限定されており、アフリカからの移住には参加しなかった。
ハプログループL1 は、約14万年前にLから分岐しました。その出現は、エーミアン 期における解剖学的現代人によるアフリカへの初期の移住 と関連しており、現在では主にバントゥー語およびセミバントゥー語を話す 西アフリカの 集団に見られます。
ハプログループL5 は以前はL1eに分類されていましたが、現在では約12万年前にL1から分岐したことが認識されています。また、主にピグミー族と関連があり、東中央アフリカのムブティ・ピグミー族で最も高い頻度(15%)を示しています。 [ 8 ]
ハプログループL2は 、東西アフリカへの人類移住に関連して、約9万年前にL(1'4'6)'2から分岐しました。南東バントゥー族の移住 の結果、 以前はより広範囲に分布していたL0、L1、L5に代わって、現在では中央サハラ以南アフリカ全域に広がっています。[ 9 ]
ハプログループL6 は、約9万年前にL3'4'6から分岐した。現在ではマイナーなハプログループであり、分布は主にアフリカの角と東アフリカ南部に限られている。
ハプログループL3は 、約7万年前にL3'4から分岐しました。これはおそらく、南方拡散 イベント(アフリカからの移住)の直前、東アフリカで起こったと考えられます。アフリカ人以外のすべての人々のミトコンドリアDNAはL3に由来し、M と N の2つの主要な系統に分かれています。
ハプログループL4 は、約7万年前に東アフリカで発生したマイナーなハプログループですが、アフリカからの移住には参加しませんでした。以前はL7と呼ばれていたこのハプログループは、L4のサブクレードとして再分類され、L4a と名付けられました。
分布 ハプログループMとNのサブブランチを除くと、Lハプログループは サハラ以南のアフリカ 全域で優勢であり、その割合は96~100%に達します。北アフリカ 、アラビア半島 、中東 、南北アメリカ 、ヨーロッパ にも分布しており、国によって頻度は低頻度から高頻度まで様々です。
アフリカ ハプログループ L の基底系統を識別するために使用されている変異は古く、15 万年前のものかもしれません。これらの系統の時間の深さは、アフリカにおけるこのハプログループのサブ構造が複雑であり、現在、十分に理解されていないことを意味します。[ 5 ] ハプログループ L 内の最初の分岐は 14 万~ 20 万年前に発生し、マクロハプログループ L0 と L1-6 を定義する変異が生じました。これら 2 つのハプログループは、アフリカ全土でさまざまな頻度で見られ、したがって、mtDNA 変異の絡み合ったパターンを示します。しかし、ハプログループ L のいくつかのサブクレードの分布は、地理的または民族的単位を中心に構成されています。たとえば、ハプログループ L0、L0d、L0k の最も深いクレードは、ほぼ完全に南アフリカのコイサン族に限定されています。L0d はタンザニアのサンダウェ族の間でも検出されており、コイサン族と東アフリカの集団の間には古代のつながりがあったことを示唆しています。[ 11 ]
アフリカにおけるマクロハプログループL(ミトコンドリアDNA)の構成。おおよその頻度:
南アフリカ ハプログループLは、南アフリカ の多くの先住民族で100%に達します。南アフリカのさまざまな少数民族では、ハプログループL系統の頻度が異なります。ケープカラード では47% 、ケープマレー では44% 、インド系イスラム教徒では14%、南アフリカのその他のイスラム教徒では20%となっています。[ 19 ]
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外部リンク PhyloTree.org – mtDNA サブツリー L、マクロハプログループ L (van Oven & Kayser M 著)。