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| 染色体10 | |
|---|---|
 G バンド後のヒト染色体 10 対。1 つは母親から、もう 1 つは父親からのもの。 | |
 ヒト男性の核型図における第10染色体対。 | |
| 特徴 | |
| 長さ ( bp ) | 134,758,134 bp (CHM13) |
| 遺伝子の数 | 706（CCDS）[1] |
| タイプ | 常染色体 |
| セントロメアの位置 | 亜中動原体[2] (39.8 Mbp [3] ) |
| 完全な遺伝子リスト | |
| CCDS | 遺伝子リスト |
| HGNC | 遺伝子リスト |
| ユニプロット | 遺伝子リスト |
| 国立情報学研究所 | 遺伝子リスト |
| 外部マップビューア | |
| アンサンブル | 染色体10 |
| エントレズ | 染色体10 |
| 国立情報学研究所 | 染色体10 |
| カリフォルニア大学サンタフェ校 | 染色体10 |
| 完全なDNA配列 | |
| 参照シーケンス | NC_000010 (ファスタ) |
| ジェンバンク | CM000672 (ファスタ) |
染色体 10 は、ヒトの23 対の染色体のうちの 1 つです。通常、人間はこの染色体を 2 つ持っています。染色体 10 は約 1 億 3,400 万塩基対( DNAの構成要素) に及び、細胞内の総 DNA の 4 ～ 4.5 % を占めます。
遺伝子
遺伝子の数
以下は、ヒト染色体10の遺伝子数の推定値の一部です。研究者はゲノム注釈にさまざまなアプローチを使用しているため、各染色体の遺伝子数の予測は異なります（技術的な詳細については、遺伝子予測を参照してください）。さまざまなプロジェクトの中で、共同コンセンサスコーディングシーケンスプロジェクト（CCDS）は非常に保守的な戦略を採用しています。そのため、CCDSの遺伝子数予測は、ヒトのタンパク質コード遺伝子の総数の下限を表しています。[4]
遺伝子リスト
以下は、ヒトの 10 番染色体上の遺伝子の部分的なリストです。完全なリストについては、右側の情報ボックスのリンクを参照してください。
- AFAP1L2 : アクチンフィラメント関連タンパク質 1 いいね 2
- ALL1をコードするタンパク質、白血病、急性リンパ性白血病、感受性、1
- ALOX5：アラキドン酸5-リポキシゲナーゼ（必須脂肪酸を炎症反応の重要な因子であるロイコトリエンに加工します。また、白血病を含むさまざまな癌を引き起こすと考えられている、ゆっくりと分裂する細胞である癌幹細胞の発達と維持を促進します）
- ANKRD22 : アンキリン反復ドメイン 22 タンパク質をコードする
- ARHGAP21 : rho GTPase 活性化タンパク質 21
- ARID5B : AT に富む相互作用ドメインを含むタンパク質 5Bをコードする
- ARMH3 : 3つの
- AS3MT :ヒ酸メチルトランスフェラーゼをコードする酵素
- AVPI1 :アルギニンバソプレシン誘導タンパク質 1をコードするタンパク質
- C10orf67 : 染色体 10オープンリーディングフレーム67
- CAMK1D : カルシウム/カルモジュリン依存性タンパク質キナーゼID
- CCAR1 : 細胞分裂周期およびアポトーシス調節因子 1
- CCDC3 : コイルドコイルドメイン含有タンパク質3
- CCDC186 :タンパク質CCDC186をコードする
- CCNY : サイクリン-Y
- CDC123 : 細胞分裂周期タンパク質123ホモログ
- CDH23 : カドヘリン様23
- CDH23-AS1 : CDH23 アンチセンス RNA 1
- CDNF : 脳内ドーパミン神経栄養因子
- CEFIP : 心臓に富む FHL2 相互作用タンパク質をコードするタンパク質
- COMMD3-BMI1 : COMMD3-BMI1 リードスルー
- CPXM2 : カルボキシペプチダーゼ x をコードするタンパク質、m14 ファミリー メンバー 2
- CUTC : 銅恒常性タンパク質 cutC ホモログ
- CXCL12 : ケモカイン（CXC モチーフ）リガンド 12、SDF-1、scyb12
- DDX50 : DExDボックスヘリカーゼ50
- DEPP : プロゲステロンによって誘導される脱落膜タンパク質
- DHX32 : DEAH ボックスヘリカーゼ 32
- DIP2C : ディスコ相互作用タンパク質 2 ホモログ c をコードするタンパク質
- DKK1 : ディックコフ関連タンパク質1
- DNAJC12 : DnaJ (Hsp40) ホモログ、サブファミリー c、メンバー 12
- DNAJC9 : DnaJ (Hsp40) ホモログ、サブファミリー c、メンバー 9
- DPYSL4 : ジヒドロピリミジナーゼ関連タンパク質4
- EBLN1 :内因性ボルナウイルス様核タンパク質 1をコードするタンパク質
- ECD : エクジソン非依存型細胞周期調節因子
- EGR2 : 初期成長反応 2 (Krox-20 ホモログ、ショウジョウバエ)
- EIF5AP1 : 真核生物翻訳開始因子 5A 様 1
- EPC1 : ポリコームホモログ1のエンハンサー
- ERCC6 : 除去修復相互補完齧歯類修復欠損、補完グループ 6
- FAM107B : 配列類似度107のファミリー、メンバーB
- FAM13C : 配列類似度13のファミリー、メンバーC
- FAM170B :配列類似性170のメンバーBを持つタンパク質ファミリーをエンコード
- FAM188A : 配列類似度188のファミリー、メンバーA
- FAM208b : タンパク質 FAM208b をコードする
- FAM213A : 配列類似性213のファミリー、メンバーA
- FAM25BPタンパク質をコードするタンパク質 FAM25
- FAS-AS1、長い非コードRNA
- FBXL15 : タンパク質 F ボックスとロイシンリッチリピートタンパク質 15 をエンコードします
- FGFR2 : 線維芽細胞増殖因子受容体 2 (細菌発現キナーゼ、ケラチノサイト増殖因子受容体、頭蓋顔面異骨症 1、クルーゾン症候群、ファイファー症候群、ジャクソン・ワイス症候群)
- FRA10AC1 : 脆弱部位、葉酸型
- FRAT1 : WNTシグナル伝達経路調節因子
- FRAT2 : WNTシグナル伝達経路調節因子
- FRMPD2をコードするタンパク質FERMとPDZドメインを含む2
- GATA3 : GATA3 転写因子をコード化します。GATA3 は、副甲状腺、聴覚の神経成分、腎臓の胚発生に重要です。遺伝子の半数不全は、まれな疾患である副甲状腺機能低下症、難聴、および腎異形成症候群の原因となります。
- GHITM : 成長ホルモン誘導性膜タンパク質
- GPR15LG : タンパク質 GPR15LG、GPR15リガンドをエンコード
- GPRIN2 : Gタンパク質制御神経突起伸展誘導因子2
- GTPBP4 : 核小体GTP結合タンパク質4
- HELLS : リンパ特異的ヘリカーゼ
- HKDC1 : ヘキソキナーゼドメインを含む1
- KIN : DNA/RNA結合タンパク質KIN17
- LHPP : ホスホリジンホスホヒスチジン無機ピロリン酸ホスファターゼをコードするタンパク質
- MTG1 : ミトコンドリア GTPase 1
- NPM3 : ヌクレオプラスミン-3
- NRBF2 : 核受容体結合因子2
- NSMCE4A : 非SMC要素4ホモログA
- OTUD1 : OTU 脱ユビキチン化酵素1をコードするタンパク質
- PAPSS2 : 二機能性 3'-ホスホアデノシン 5'-ホスホ硫酸合成酵素 2 をコードする
- PCBD1 : 6-ピルボイルテトラヒドロプテリン合成酵素/肝細胞核因子1アルファ（TCF1）の二量体化補因子
- PCDH15 :プロトカドヘリン15
- PI4K2A : ホスファチジルイノシトール4キナーゼ2アルファ
- PIP4K2A : ホスファチジルイノシトール5リン酸4キナーゼ2型アルファ
- PITRM1 : ピトリリシンメタロペプチダーゼ1
- S1を含むタンパク質プレクストリン相同ドメインをコードするPLEKHS1
- PLXDC2 : プレキシンドメイン含有タンパク質2
- PRAP1 : プロリンリッチ酸性タンパク質 1 をコードするタンパク質
- PROSER2 : プロリンおよびセリンリッチ 2 または c10orf47
- PTEN 遺伝子: ホスファターゼおよびテンシン相同遺伝子 (複数の進行癌で変異 1)
- RET : ret 原癌遺伝子 (多発性内分泌腫瘍症および甲状腺髄様癌 1、ヒルシュスプルング病)
- RPP30 : リボヌクレアーゼPタンパク質サブユニットp30
- RRP12 : リボソームRNAプロセシング12ホモログ
- RSU1 : ras抑制タンパク質1
- RTKN2 : タンパク質 Rhotekin 2 をコードする
- SCZD11 : タンパク質をコードする統合失調症感受性遺伝子座、染色体10q関連
- SGPL1 : スフィンゴシン-1-リン酸リアーゼ1
- SHTN1 : Shootin 1 をコードするタンパク質
- SLC16A12 : 溶質キャリアファミリー 16 メンバー 12 をコードするタンパク質
- SMNDC1 : 1を含む生存運動ニューロンドメイン
- SPG9をコードするタンパク質痙性対麻痺 9 (常染色体優性)
- SRGN : セルグリシン
- STAMBPL1 : STAM結合タンパク質様1
- STOX1 :タンパク質Storkhead box 1をコードする
- SUFU : 融合タンパク質の抑制因子
- SUPV3L1 : Suv3 様 RNA ヘリカーゼ
- SYCE1 : シナプトネマ複合体中心要素タンパク質 1 をコードするタンパク質
- TACC2をコードするタンパク質酸性コイルドコイル含有タンパク質2の変換
- TBC1D12 : TBC1 ドメイン ファミリー、メンバー 12
- TCTN3 : テクトニックファミリーメンバー3
- TMEM10 : オパリン
- TMEM254 : 膜貫通タンパク質 254 をコードするタンパク質
- TMEM26 :膜貫通タンパク質 26をコードするタンパク質
- TMEM72 :膜貫通タンパク質 72をコードするタンパク質
- TYSND1 : 1を含むトリプシンドメインをコードするタンパク質
- UCN3 : ウロコルチン-3
- UROS : ウロポルフィリノーゲン III 合成酵素 (先天性赤血球系ポルフィリン症)
- USMG5 : 骨格筋成長タンパク質5中にアップレギュレーションされる
- USP54 : ユビキチン特異的ペプチダーゼ 54 をコードするタンパク質
- USP6NL : USP6 N末端類似タンパク質
- UTF1 : 未分化胚細胞転写因子1
- VIM-AS1 : VIMアンチセンスRNA1
- WASHC2C : WASH複合体サブユニット2C
- WBP1L : WWドメイン結合タンパク質1様
- ZNF37A : ジンクフィンガータンパク質37A
- ZNF438 : ジンクフィンガータンパク質438
- ZRANB1 : 1を含むジンクフィンガーranbp2型
病気と障害
以下の疾患は、10番染色体上の遺伝子に関連しています。
細胞遺伝学的バンド
ヒト染色体10のGバンド表意文字
参考文献
- ^ ab 「検索結果 - 10[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("has ccds"[Properties] AND alive[prop]) - 遺伝子」。NCBI。Homo sapiensのCCDSリリース20。2016年9月8日。 2017年5月28日閲覧。
- ^トム・ストラチャン、アンドリュー・リード（2010年4月2日）。ヒト分子遺伝学。ガーランド サイエンス。p.45。ISBN 978-1-136-84407-2。
- ^ ab ゲノム装飾ページ、NCBI。ホモ・サピエンスのイデオグラムデータ（850 bphs、アセンブリ GRCh38.p3）。最終更新 2014-06-03。2017-04-26 に取得。
- ^ Pertea M、Salzberg SL (2010)。「ニワトリとブドウの間：ヒト遺伝子の数の推定」。Genome Biol . 11 (5): 206. doi : 10.1186/gb-2010-11-5-206 . PMC 2898077. PMID 20441615 .
- ^ 「10番染色体の統計とダウンロード数」HUGO遺伝子命名委員会2017年5月12日。2017年6月29日時点のオリジナルよりアーカイブ。 2017年5月19日閲覧。
- ^ 「第10染色体：染色体概要 - ホモサピエンス」Ensembl Release 88。 2017年3月29日。 2017年5月19日閲覧。
- ^ 「ヒト染色体10：エントリー、遺伝子名、MIMへの相互参照」UniProt 2018年2月28日2018年3月16日閲覧。
- ^ 「検索結果 - 10[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("genetype protein coding"[Properties] AND alive[prop]) - 遺伝子」。NCBI。2017年5月19日。 2017年5月20日閲覧。
- ^ 「検索結果 - 10[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ( ("genetype miscrna"[Properties] OR "genetype ncrna"[Properties] OR "genetype rrna"[Properties] OR "genetype trna"[Properties] OR "genetype scrna"[Properties] OR "genetype snrna"[Properties] OR "genetype snorna"[Properties]) NOT "genetype protein coding"[Properties] AND alive[prop]) - 遺伝子」。NCBI 。 2017年5月19日。 2017年5月20日閲覧。
- ^ 「検索結果 - 10[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("genetype pseudo"[Properties] AND alive[prop]) - 遺伝子」。NCBI。2017年5月19日。 2017年5月20日閲覧。
- ^ ゲノムデコレーションページ、NCBI。ホモサピエンスのイデオグラムデータ（400 bphs、アセンブリ GRCh38.p3）。最終更新 2014-03-04。2017-04-26 に取得。
- ^ ゲノムデコレーションページ、NCBI。ホモサピエンスのイデオグラムデータ（550 bphs、アセンブリ GRCh38.p3）。最終更新 2015-08-11。2017-04-26 に取得。
- ^国際ヒト細胞遺伝学命名法常設委員会（2013年）。ISCN 2013：ヒト細胞遺伝学 命名法の国際システム（2013年）。Karger Medical and Scientific Publishers。ISBN 978-3-318-02253-7。
- ^ Sethakulvichai, W.; Manitpornsut, S.; Wiboonrat, M.; Lilakiatsakun, W.; Assawamakin, A.; Tongsima, S. (2012). 「ヒト染色体画像のバンドレベル解像度の推定」2012 第 9 回国際コンピュータサイエンスおよびソフトウェアエンジニアリング会議 (JCSSE)。 pp. 276–282。doi :10.1109/JCSSE.2012.6261965。ISBN 978-1-4673-1921-8.S2CID 16666470 。
- ^ ゲノムデコレーションページ、NCBI。ホモサピエンスのイデオグラムデータ（850 bphs、アセンブリ GRCh38.p3）。最終更新 2014-06-03。2017-04-26 に取得。
- ^ 「p」: 短い腕、「q」: 長い腕。
- ^ 細胞遺伝学的バンド命名法については、記事locusを参照してください。
- ^ ab これらの値（ISCN 開始/終了）は、ISCN 書籍「国際ヒト細胞遺伝学命名法システム（2013）」のバンド/表意文字の長さに基づいています。任意の単位。
- ^ gpos : G バンドで陽性染色される領域で、一般的にAT が豊富で遺伝子が乏しい。gneg : G バンドで陰性染色される領域で、一般的にCG が豊富で遺伝子が豊富。acenセントロメア。var :可変領域。stalk :茎。
- Deloukas P、Earthrowl ME、Grafham DV、Rubenfield M、French L、Steward CA、Sims SK、Jones MC、Searle S、Scott C、Howe K、Hunt SE、Andrews TD、Gilbert JG、Swarbreck D、Ashurst JL、Taylor A、Battles J、Bird CP、Ainscough R、Almeida JP、Ashwell RI、Ambrose KD、Babbage AK、Bagguley CL、Bailey J、Banerjee R、Bates K、Beasley H、Bray-Allen S、Brown AJ、Brown JY、Burford DC、Burrill W、Burton J、Cahill P、Camire D、Carter NP、Chapman JC、Clark SY、Clarke G、Clee CM、Clegg S、Corby N、Coulson A、Dhami P、Dutta I、Dunn M、Faulkner L、Frankish A、Frankland JA、ガーナー P、ガーネット J、グリブル S、グリフィス C、グロコック R、ガスタフソン E、ハモンド S、ハーレー JL、ハート E、ヒース PD、ホー TP、ホプキンス B、ホーン J、ハウデン PJ、ハックル E、ハインズ C、ジョンソン C、ジョンソン D、カナ A、ケイ M、キンバリー AM、カーショウ JK、コキナキ M、レアード GK、ローラー S、リー HM、レオンガモーンレルト DA、レアード G、ロイド C、ロイド DM、ラブランド J、ラヴェル J、マクラーレン S、マクレイ KE、マクマレー A、マシュレギ モハマディ M、マシューズ L、ミルン S、ニッカーソン T、グエン M、オーバートン ラーティ E、パーマー SA、ピアス AV、ペック AI、ペラン S、フィリモア B、ポーター K、ライス CM、 Rogosin A、Ross MT、Sarafidou T、Sehra HK、Shownkeen R、Skuce CD、Smith M、Standring L、Sycamore N、Tester J、Thorpe A、Torcasso W、Tracey A、Tromans A、Tsolas J、Wall M、Walsh J、Wang H、Weinstock K、West AP、Willey DL、Whitehead SL、Wilming L、Wray PW、Young L、Chen Y、Lovering RC、Moschonas NK、Siebert R、Fechtel K、Bentley D、Durbin R、Hubbard T、Doucette-Stamm L、Beck S、Smith DR、Rogers J (2004)。「ヒト染色体 10 の DNA 配列と比較分析」。Nature。429 ( 6990 ) : 375–81。Bibcode :2004Natur.429..375D。doi : 10.1038/nature02462 . PMID 15164054.
- Deloukas P、French L、 Meitinger T、Moschonas NK (2000)。「1999 年ヒト染色体 10 のマッピングと配列に関する第 3 回国際ワークショップの報告」。Cytogenet Cell Genet。90 ( 1–2 ): 1–12。doi :10.1159/000015653。PMID 11060438。S2CID 28931509 。
- ギルバート F (2001). 「染色体10」. Genet Test . 5 (1): 69–82. doi :10.1089/109065701750168824. PMID 11336406.
外部リンク
ウィキメディア・コモンズには、ヒト染色体10に関連するメディアがあります。
- 国立衛生研究所。「第10染色体」。遺伝学ホームリファレンス。2010年4月8日にオリジナルからアーカイブ。 2017年5月6日に取得。
- 「染色体10」。ヒトゲノムプロジェクト情報アーカイブ1990-2003 。 2017年5月6日閲覧。