ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
EGR2 識別子 エイリアス EGR2 、AT591、CMT1D、CMT4E、KROX20、初期成長反応2、CHN1 外部ID オミム :129010; MGI : 95296; ホモロジーン : 20123; ジーンカード :EGR2; OMA :EGR2 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) クロ。 染色体10(マウス) [2] バンド 10 B5.1|10 34.96 cM 始める 67,535,475 bp [2] 終わり 67,542,188 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) トップの表現 胆嚢 脛骨神経 顆粒球 睾丸 単球 胃粘膜 平滑筋組織 腓骨神経 腹部の皮膚 リンパ節
トップの表現 神経外胚葉 ニューロメア 菱形 リップ 皮膚の領域 脊髄神経 尿管 尿道 胸腺 男性の尿道
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
DNA結合
DNA結合転写因子活性
HMGボックスドメイン結合
DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
クロマチン結合
金属イオン結合
RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合
タンパク質結合
核酸結合
ユビキチンタンパク質リガーゼ結合
トランスフェラーゼ活性
DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
SUMOリガーゼ活性
細胞成分 生物学的プロセス
有機物質に対する細胞反応
律動的な行動
末梢神経系の発達
転写の調節、DNAテンプレート
ロンボメア3の開発
脳のセグメンテーション
RNAポリメラーゼIIによる転写
タンパク質SUMO化
菱形3の形成
転写、DNAテンプレート
インスリンに対する反応
転写の正の制御、DNAテンプレート
脳の発達
ロンボメア5形成
核からのタンパク質の輸出
学習または記憶
骨格筋細胞の分化
シュワン細胞の分化
神経シナプス可塑性の調節
髄鞘形成
顔面神経の構造組織
骨化の調節
運動ニューロン軸索誘導
脂肪細胞の分化
RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
RNAポリメラーゼIIによる転写の調節
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_000399 NM_001136177 NM_001136178 NM_001136179 NM_001321037
RefSeq (タンパク質) NP_000390 NP_001129649 NP_001129650 NP_001129651 NP_001307966
NP_001334387 NP_034248 NP_001360912 NP_001360914 NP_001360915 NP_001360916
場所 (UCSC) 10 章: 62.81 – 62.82 Mb 10 章: 67.54 – 67.54 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
早期成長反応タンパク質2は、ヒトでは EGR2 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である 。EGR2(Krox20とも呼ばれる)は転写調節因子であり、3つのジンクフィンガーDNA結合部位を含み、移動する神経堤細胞集団で高度に発現している。 [5] [6] [7] その後、頭蓋神経節の神経堤由来細胞で発現する。Krox20によってコードされるタンパク質には、2つのcys2his2型ジンクフィンガーが含まれる。Krox20遺伝子の発現は、初期の後脳発達に限定されている。 [6] [8] これは、脊椎動物、ヒト、マウス、ニワトリ、ゼブラフィッシュで進化的に保存されている。 [9] さらに、アミノ酸配列と胚遺伝子パターンのほとんどの側面が脊椎動物間で保存されており、後脳発達におけるその役割をさらに示唆している。 [7] [10] [11] [12] マウスでKrox20が欠失すると、Krox20遺伝子(ジンクフィンガーのDNA結合ドメインを含む)のタンパク質コード能力が低下する。これらのマウスは出生後に生存できず、後脳に重大な欠陥を示す。 [6] [8] これらの欠陥には、頭蓋感覚神経節の形成における欠陥、三叉神経(V)と顔面神経(VII)および聴覚神経(VII)の部分的な融合、これらの神経節から出る近位神経根が脳幹に入る際に混乱して互いに絡み合うこと、舌咽神経(IX)神経複合体の融合などが含まれるが、これらに限定されない。 [13] [14] [15]
関数
早期成長反応タンパク質2は、3つの直列C2H2型ジンクフィンガーを持つ転写因子です。この遺伝子の変異は、常染色体優性 シャルコー・マリー・トゥース病 1D型 [16] 、 デジェリン・ソッタス病 [17] 、先天性低髄鞘形成神経障害[ 18] に関連しています。2 つの研究では、 EGR2の 発現が骨芽細胞の増殖 [19] と、非常に悪性度の高い骨関連癌であるユーイング肉腫由来の細胞株と関連していることが示されています。 [20]
新たな研究では、Krox20、あるいはその欠如が男性の脱毛症の原因であることが示唆されている。 [21]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000122877 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000037868 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ Chavrier P、Janssen-Timmen U、Mattéi MG、Zerial M、Bravo R、Charnay P (1989 年 2 月)。「マウスのジンクフィンガー遺伝子 Krox-20 の構造、染色体位置、発現: 複数の遺伝子産物とプロトオンコジーン c-fos との共調節」。 分子 細胞 生物 学 。9 (2): 787–97。doi : 10.1128 /mcb.9.2.787。PMC 362656。PMID 2496302 。
^ abc Swiatek PJ、Gridley T (1993 年 11 月)。「ジンクフィンガー遺伝子 Krox20 の標的変異をホモ接合したマウスの周産期致死率と後脳発達の欠陥」。 遺伝子 と 発達 。7 (11): 2071–84。doi : 10.1101/ gad.7.11.2071。PMID 8224839 。
^ ab Wilkinson DG、Bhatt S、Chavrier P、Bravo R、Charnay P (1989 年 2 月)。「マウスの発達中の神経系におけるジンクフィンガー遺伝子のセグメント特異的発現」。Nature。337 ( 6206 ) : 461–4。Bibcode : 1989Natur.337..461W。doi : 10.1038 / 337461a0。PMID 2915691。S2CID 4336310。
^ ab Bradley LC、Snape A、Bhatt S 、Wilkinson DG (1993 年 1 月)。「アフリカツメガエル Krox-20 遺伝子の構造と発現: 菱形節と神経堤における保存された発現パターンと異なる発現パターン」。 発達 のメカニズム 。40 (1–2): 73–84。doi :10.1016/ 0925-4773 (93)90089-g。PMID 8443108。S2CID 20347966 。
^ Bhat RV、Worley PF、Cole AJ、Baraban JM (1992 年 4 月)。「成体ラットの脳におけるジンクフィンガーエンコーディング遺伝子 krox-20 の活性化: zif268 との比較」。脳研究 。 分子脳研究 。13 (3): 263–6。doi : 10.1016 /0169-328x(92)90034-9。PMID 1317498 。
^ Wilkinson DG、Bhatt S、Cook M、Boncinelli E、Krumlauf R (1989 年 10 月)。「マウス後脳の発達における Hox-2 ホメオボックス含有遺伝子の部分的発現」。Nature。341 ( 6241 ) : 405–9。Bibcode : 1989Natur.341..405W。doi : 10.1038/341405a0。PMID 2571936。S2CID 4324322 。
^ Hunt P, Gulisano M, Cook M, Sham MH, Faiella A, Wilkinson D, Boncinelli E, Krumlauf R (1991 年 10 月). 「脊椎動物の頭部の鰓領域に対する明確な Hox コード」. Nature . 353 (6347): 861–4. Bibcode :1991Natur.353..861H. doi :10.1038/353861a0. PMID 1682814. S2CID 4312466.
^ Oxtoby E, Jowett T (1993 年 3 月). 「ゼブラフィッシュ krox-20 遺伝子 (krx-20) のクローニングと後脳発達中のその発現」. Nucleic Acids Research . 21 (5): 1087–95. doi :10.1093/nar/21.5.1087. PMC 309267. PMID 8464695 .
^ Frohman MA、Boyle M 、Martin GR(1990年10月)。「マウスHox-2.9遺伝子の単離、胚発現の分析により前後軸に沿った位置情報は中胚葉によって指定されることが示唆される」。 発達 。110 (2 ) :589–607。doi :10.1242/dev.110.2.589。PMID 1983472 。
^ Murphy P 、Davidson DR、Hill RE (1989 年 9 月)。「マウス後脳におけるホメオボックス含有遺伝子のセグメント特異的発現」 。Nature。341 (6238): 156–9。Bibcode :1989Natur.341..156M。doi : 10.1038/ 341156a0。PMID 2571087。S2CID 4371764 。
^ Nieto MA、Bradley LC、Wilkinson DG (1991)。「脊椎動物後脳におけるKrox-20の保存され た 分節的発現と系統制限との関係」。 発達 。補足2: 59–62。doi : 10.1242 /dev.113.Supplement_2.59。hdl : 10261 /32226。PMID 1688180 。
^ 「Entrez Gene: EGR2 初期成長応答 2 (Krox-20 ホモログ、ショウジョウバエ)」。
^ Boerkoel CF、Takashima H、Bacino CA 、Daentl D、Lupski JR (2001 年 7 月)。「EGR2 変異 R359W は Dejerine - Sottas 神経障害のスペクトルを引き起こす」。 神経 遺伝学 。3 (3): 153–7。doi : 10.1007 /s100480100107。PMID 11523566。S2CID 32746701。
^ Warner LE、Mancias P、Butler IJ、McDonald CM、Keppen L、Koob KG、Lupski JR (1998 年 4 月)。「早期成長反応 2 (EGR2) 遺伝子の変異は遺伝性ミエリン症と関連している」。Nature Genetics。18 ( 4 ) : 382–4。doi : 10.1038/ng0498-382。PMID 9537424。S2CID 25550479。
^ Chandra A、Lan S、Zhu J、Siclari VA、Qin L(2013年7月)。「上皮成長因子受容体(EGFR)シグナル伝達は、早期成長反応2(EGR2)発現を増加させることで骨芽細胞の増殖と生存を促進する」。The Journal of Biological Chemistry。288 ( 28 ):20488–98。doi : 10.1074/ jbc.M112.447250。PMC 3711314。PMID 23720781 。
^ Grünewald TG、Bernard V、Gilardi-Hebenstreit P、Raynal V、Surdez D、Aynaud MM、他。 (2015年9月)。 「キメラ EWSR1-FLI1 は、GGAA マイクロサテライトを介してユーイング肉腫感受性遺伝子 EGR2 を制御します。」 自然遺伝学 。 47 (9): 1073–8。 土井 :10.1038/ng.3363。 PMC 4591073 。 PMID 26214589。
^ Le, Lu. 「科学者ら、はげや白髪の原因となる皮膚細胞を発見」 UTサウスウェスタン医療センター 。 2017年 5月9日 閲覧。
さらに読む
Rangnekar VM、Aplin AC 、 Sukhatme VP (1990 年 5 月)。「亜鉛フィンガータンパク質をコードするヒト初期成長応答遺伝子 EGR2 の血清および TPA 応答性プロモーターとイントロン-エクソン構造」。 核酸 研究 。18 ( 9): 2749–57。doi :10.1093/ nar /18.9.2749。PMC 330760。PMID 2111009 。
Chavrier P、Janssen-Timmen U、Mattéi MG、Zerial M、Bravo R、Charnay P (1989 年 2 月)。「マウスのジンクフィンガー遺伝子 Krox-20 の構造、染色体位置、および発現: 複数の遺伝子産物とプロトオンコジーン c-fos との共制御」。 分子 細胞 生物学 。9 (2): 787–97。doi : 10.1128 /mcb.9.2.787。PMC 362656。PMID 2496302 。
Joseph LJ、Le Beau MM、Jamieson GA、Acharya S、Shows TB、Rowley JD、Sukhatme VP (1988 年 10 月)。「亜鉛結合フィンガー構造を持つタンパク質をコードするヒト初期成長反応遺伝子 EGR2 の分子クローニング、配列決定、マッピング」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。85 ( 19): 7164–8。Bibcode :1988PNAS...85.7164J。doi : 10.1073 / pnas.85.19.7164。PMC 282144。PMID 3140236 。
トピルコ P、シュナイダー=モーノリー S、リーヴァイ G、バロン=ヴァン エヴァークーレン A、シェヌフィ AB、セイタニドゥ T、バビネ C、シャルネイ P (1994 年 10 月)。 「Krox-20は末梢神経系の髄鞘形成を制御します。」 自然 。 371 (6500): 796–9。 Bibcode :1994Natur.371..796T。 土井 :10.1038/371796a0. PMID 7935840。S2CID 4333028 。
Sham MH、Vesque C、Nonchev S、Marshall H、Frain M、Gupta RD、Whiting J、Wilkinson D、Charnay P、Krumlauf R (1993 年 1 月)。「ジンク フィンガー遺伝子 Krox20 は後脳の分節化中に HoxB2 (Hox2.8) を制御する」 。Cell。72 ( 2 ) : 183–96。doi : 10.1016 /0092-8674(93)90659-E。PMID 8093858。S2CID 3205209 。
Levi G、Topilko P、Schneider-Maunoury S、Lasagna M、Mantero S、Pesce B、Ghersi G、Cancedda R、Charnay P (1996 年 6 月)。「軟骨内骨形成における Krox-20 の役割」。Annals of the New York Academy of Sciences。785 ( 1): 288–91。Bibcode :1996NYASA.785..288L。doi : 10.1111 / j.1749-6632.1996.tb56286.x。PMID 8702157。S2CID 27761983。
Warner LE、Mancias P、Butler IJ、McDonald CM、Keppen L、Koob KG、Lupski JR (1998 年 4 月)。「早期成長反応 2 (EGR2) 遺伝子の変異は遺伝性ミエリン症と関連している」。Nature Genetics。18 ( 4 ) : 382–4。doi : 10.1038/ng0498-382。PMID 9537424。S2CID 25550479。
Warner LE、Svaren J、Milbrandt J、Lupski JR (1999 年 7 月)。「早期成長反応 2 遺伝子 (EGR2) の変異の機能的影響は、ヒトのミエリン症の重症度と相関している」。 ヒト 分子 遺伝 学 。8 (7): 1245–51。doi : 10.1093/hmg/8.7.1245。PMID 10369870 。
ティマーマン V、デ・ジョンヘ P、クートリック C、デ・フライント E、ロフグレン A、ネリス E、ワーナー LE、ルプスキー JR、マーティン JJ、ファン ブルックホーフェン C (1999 年 6 月)。 「デジェリン・ソッタス症候群表現型に関連する初期成長反応 2 遺伝子における新規ミスセンス変異」。 神経内科 。 52 (9): 1827 ~ 1832 年。 土井 :10.1212/wnl.52.9.1827。 PMID 10371530。S2CID 11569651 。
Bellone E、Di Maria E、Soriani S、Varese A、Doria LL、Ajmar F、Mandich P (1999 年 10 月)。「早期成長反応 2 遺伝子の新規変異 (D305V) は、重篤なシャルコー・マリー・トゥース病 1 型と関連している」。Human Mutation。14 ( 4): 353–4。doi : 10.1002 /( SICI )1098-1004(199910)14:4<353::AID-HUMU17>3.0.CO ; 2-4。PMID 10502832。S2CID 85039222 。
Pareyson D、Taroni F、Botti S、Morbin M、Baratta S、Lauria G、Ciano C、Sghirlanzoni A (2000 年 4 月)。「早期成長反応 2 遺伝子変異による CMT 疾患タイプ 1 の脳神経障害」。 神経 学 。54 ( 8): 1696–8。doi : 10.1212 /wnl.54.8.1696。hdl : 2434 /531868。PMID 10762521。S2CID 28404231 。
Gambardella L、Schneider-Maunoury S、Voiculescu O、Charnay P、Barrandon Y (2000 年 9 月)。「マウス毛包における転写因子 Krox-20 の発現パターン」。 発達 のメカニズム 。96 (2 ) : 215–8。doi : 10.1016 /S0925-4773(00) 00398-1。PMID 10960786。S2CID 18000564 。
吉原 孝文、神田 文雄、山本 正之、石原 秀、三須 健、服部 直樹、千原 功、祖父江 剛 (2001 年 3 月)。「後期発症型シャルコー・マリー・トゥース病 1 型に関連する早期成長反応 2 遺伝子の新規ミスセンス変異」。 神経 科学ジャーナル 。184 (2): 149–53。doi : 10.1016 / S0022-510X (00)00504-9。PMID 11239949。S2CID 19693658 。
Boerkoel CF、Takashima H、Bacino CA、Daentl D 、 Lupski JR (2001 年 7 月)。「EGR2 変異 R359W はDejerine - Sottas 神経障害のスペクトルを引き起こす」。 神経遺伝学 。3 (3): 153–7。doi : 10.1007 /s100480100107。PMID 11523566。S2CID 32746701。
Yang Y、Dong B、Mittelstadt PR、Xiao H 、 Ashwell JD (2002 年 5 月)。「HIV Tat は Egr タンパク質に結合し、Fas リガンドプロモーターの Egr 依存性トランス活性化を促進する」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 22): 19482–7。doi : 10.1074/ jbc.M201687200。PMID 11909874 。
Vandenberghe N、Upadhyaya M、Gatignol A、Boutrand L、Boucherat M、Chazot G、Vandenberghe A、Latour P (2002 年 12 月)。「末梢性脱髄性ニューロパチーに関連する早期成長反応 2 遺伝子の変異頻度」。Journal of Medical Genetics。39 ( 12 ): 81e–81。doi :10.1136/ jmg.39.12.e81。PMC 1757229。PMID 12471219 。
Musso M、Balestra P、Taroni F、Bellone E、Mandich P (2003 年 2 月)。「EGR2 変異体がヒト Cx32 プロモーターのトランス活性化に及ぼすさまざまな影響」。 神経 生物 学疾患 。12 (1 ) : 89–95。doi : 10.1016 /S0969-9961(02)00018-9。PMID 12609493。S2CID 29600641。
宇野木 正之、中村 勇治 (2003 年 4 月)。「EGR2 は BNIP3L と BAK の直接的なトランス活性化により、さまざまな癌細胞株でアポトーシスを誘導する」。Oncogene . 22 ( 14): 2172–85. doi : 10.1038/sj.onc.1206222 . PMID 12687019。
沼倉 千恵子、白幡 栄、山下 聡、金井 正之、木島 健、松木 剛、早坂 功 (2003 年 6 月)。「シャルコー・マリー・トゥース病 1 型日本人患者における早期成長反応 2 遺伝子のスクリーニング」。 神経 科学 ジャーナル 。210 (1–2): 61–4。doi : 10.1016 /S0022-510X(03)00028-5。PMID 12736090。S2CID 36723641 。
外部リンク
GeneReviews/NCBI/NIH/UW のシャルコー・マリー・トゥース神経障害 1 型に関するエントリ
GeneReviews/NCBI/NIH/UW のシャルコー・マリー・トゥース神経障害 4 型に関するエントリ
米国国立医学図書館の 医学主題標目表 (MeSH)における EGR2+タンパク質、+ヒト
この記事には、 パブリックドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。