ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| パップSS2 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | PAPSS2、ATPSK2、BCYM4、SK2、3'-ホスホアデノシン5'-ホスホ硫酸合成酵素2 |
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| 外部ID | オミム:603005; MGI : 1330223;ホモロジーン: 55840;ジーンカード:PAPSS2; OMA :PAPSS2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 19番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 19 C1|19 27.46 cM | 始める | 32,573,190 bp [2] |
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| 終わり | 32,644,587 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 脛骨
- S状結腸粘膜
- 肺の下葉
- 軟骨組織
- ベータ細胞
- 臓側胸膜
- 副腎皮質
- 右副腎
- 右副腎皮質
- 小腸粘膜
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| | トップの表現 | - 十二指腸
- 涙腺
- 幽門洞
- 後頭部
- 後頭骨
- 胃の上皮
- ランゲルハンス島
- 胃の粘液細胞
- 指
- 後頭骨の外側部分
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ATP結合
- ヌクレオチジルトランスフェラーゼ活性
- キナーゼ活性
- 触媒活性
- ヌクレオチド結合
- トランスフェラーゼ活性
- 硫酸アデニルトランスフェラーゼ(ATP)活性
- アデニル硫酸キナーゼ活性
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 血液凝固
- 骨格系の発達
- 骨の発達
- リン酸化
- 代謝
- 硫酸塩の同化
- 3'-ホスホアデノシン 5'-ホスホ硫酸生合成プロセス
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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NM_001201470 NM_011864 NM_001360403 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001015880 NP_004661 NP_004661.2 |
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NP_001188399 NP_035994 NP_001347332 |
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| 場所 (UCSC) | 10 章: 87.66 – 87.75 Mb | 19章: 32.57 – 32.64 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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二機能性3'-ホスホアデノシン5'-ホスホ硫酸合成酵素2は、ヒトではPAPSS2 遺伝子によってコードされる酵素である。[5] [6]
硫酸化は、内因性化合物(脂質、タンパク質、炭水化物)および外因性化合物(生体異物および薬物)の一般的な修飾である。哺乳類では、硫酸源はATPと無機硫酸から生成される3'-ホスホアデノシン5'-ホスホ硫酸( PAPS )である。異なる遺伝子によってコードされる2つの異なる組織アイソフォームがPAPSを合成する。この遺伝子は、2つのPAPS合成酵素のうちの1つをコードしている。この遺伝子の欠陥は、パキスタン型脊椎骨端骨幹端異形成症を引き起こす。この遺伝子については、異なるアイソフォームをコードする2つの選択的スプライシング転写バリアントが報告されている。[6]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000198682 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000024899 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ul Haque MF、King LM、Krakow D、Cantor RM、Rusiniak ME、Swank RT、Superti-Furga A、Haque S、Abbas H、Ahmad W、Ahmad M、Cohn DH (1998 年 10 月)。「ヒト脊椎骨端骨端異形成症および短形マウスにおける相同遺伝子の変異」Nat Genet . 20 (2): 157–62. doi :10.1038/2458. PMID 9771708. S2CID 13108930.
- ^ ab 「Entrez遺伝子:PAPSS2 3'-ホスホアデノシン5'-ホスホ硫酸合成酵素2」。
さらに読む
- Ewing RM、Chu P、Elisma F、他 (2007)。「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」。Mol . Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Shimizu C, Fuda H, Lee YC, Strott CA (2002). 「ヒト 3'-ホスホアデノシン 5'-ホスホ硫酸合成酵素 2 の転写制御」。Biochem . J. 363 ( Pt 2): 263–71. doi :10.1042/0264-6021:3630263. PMC 1222474. PMID 11931653 .
- Fuda H, Shimizu C, Lee YC, et al. (2002). 「ヒト二機能性 3'-ホスホアデノシン 5'-ホスホ硫酸合成酵素アイソフォームの特性と発現」Biochem. J. 365 ( Pt 2): 497–504. doi :10.1042/BJ20020044. PMC 1222679. PMID 11931637 .
- Xu ZH、Freimuth RR、Eckloff B、et al. (2002)。「ヒト 3'-ホスホアデノシン 5'-ホスホ硫酸合成酵素 2 (PAPSS2) 薬理遺伝学: 遺伝子再配列、遺伝的多型および変異アロザイムの機能的特徴」。薬理遺伝学。12 (1): 11–21。doi :10.1097/00008571-200201000-00003。PMID 11773860 。
- Xu Z、Wood TC、Adjei AA、Weinshilboum RM (2001)。「ヒト 3'-ホスホアデノシン 5'-ホスホ硫酸合成酵素: 放射化学酵素アッセイ、生化学的特性、および肝臓の変異」。Drug Metab. Dispos . 29 (2): 172–8. PMID 11159808。
- Xu ZH、Otterness DM、Freimuth RR、他 (2000)。「ヒト 3'-ホスホアデノシン 5'-ホスホ硫酸合成酵素 1 (PAPSS1) および PAPSS2: 遺伝子クローニング、特性評価および染色体局在」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 268 (2): 437–44. doi :10.1006/bbrc.2000.2123. PMID 10679223。
- Besset S、Vincourt JB 、Amalric F、Girard JP (2000)。「PAPS合成酵素1の核局在:真核細胞の核における硫酸活性化経路」。FASEB J. 14 (2): 345–54. doi : 10.1096/fasebj.14.2.345 . PMID 10657990. S2CID 9024784.
- Kurima K、Singh B、Schwartz NB (1999)。「ATP スルフリラーゼ/アデノシン 5'-ホスホ硫酸キナーゼアイソフォーム SK2 をコードするマウスおよびヒト遺伝子のゲノム構成」。J . Biol. Chem . 274 (47): 33306–12. doi : 10.1074/jbc.274.47.33306 . PMID 10559207。
- Ahmad M、Haque MF、Ahmad W、他 (1998)。「近親交配したパキスタン人の家系に分離した、特徴的な常染色体劣性型の脊椎骨端骨端異形成症」。Am . J. Med. Genet . 78 (5): 468–73. doi :10.1002/(SICI)1096-8628(19980806)78:5<468::AID-AJMG13>3.0.CO;2-D. PMID 9714015。
- Kurima K、Warman ML、Krishnan S、他 (1998)。「硫酸塩活性化酵素ファミリーのメンバーがマウスの短形性を引き起こす」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 95 ( 15 ): 8681–5。Bibcode : 1998PNAS ...95.8681K。doi : 10.1073 / pnas.95.15.8681。PMC 21136。PMID 9671738。