シグナル認識粒子RNA

RN7SL1
識別子
別名	RN7SL1、7L1a、7SL、RN7SL、RNSRP1、シグナル認識粒子RNA、RNA、7SL、細胞質1、シグナル認識粒子7SL1のRNA成分
外部ID	オミム: 612177 ;ジーンカード: RN7SL1 ; OMA : RN7SL1 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト） クリスチャン 染色体14（ヒト）[ 1 ] バンド 14q21.3 始める 49,586,580 bp [ 1 ] 終わり 49,586,878 bp [ 1 ]
RNA発現パターン Bgee 人間 マウス（相同体） トップは 骨髄細胞 結腸上皮 脳梁 アキレス腱 上前頭回 一次視覚野 腓腹神経 単球 太ももの筋肉 小脳の右半球 該当なし より多くの参照発現データ バイオGPS 該当なし
オルソログ 種 人間 ねずみ アントレ 6029 該当なし アンサンブル ENSG00000276168 該当なし UniProt ナ​ 該当なし RefSeq（mRNA） 該当なし 該当なし RefSeq（タンパク質） 該当なし 該当なし 所在地（UCSC） Chr 14: 49.59 – 49.59 MB 該当なし PubMed検索 [ 2 ] 該当なし
ウィキデータ
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シグナル認識粒子RNA（7SL、6S、ffs、または4.5S RNAとも呼ばれる）は、シグナル認識粒子（SRP）リボ核タンパク質複合体の一部です。SRPはシグナルペプチドを認識してリボソームに結合し、タンパク質合成を停止させます。SRP受容体は膜に埋め込まれたタンパク質で、膜貫通孔を持っています。SRP-リボソーム複合体がSRP受容体に結合すると、SRPはリボソームを解放して離れていきます。リボソームはタンパク質合成を再開しますが、今度はタンパク質はSRP受容体の膜貫通孔を通って移動します。

このようにして、SRPは細胞内のタンパク質の移動を制御し、膜貫通孔に結合することで、タンパク質が膜を通過して必要な場所へ移動できるようにする。この複合体のRNAとタンパク質の構成要素は高度に保存されているが、生物界によって多少の違いが見られる。

一般的なSINEファミリーAluは、おそらく中央配列の欠失後に7SL RNA遺伝子から生じたと考えられます。^{[ 3 ]}

真核生物のSRPは、300ヌクレオチドの7S RNAと6つのタンパク質（SRP72、68、54、19、14、9）から構成される。古細菌のSRPは、7S RNAと真核生物のSRP19およびSRP54タンパク質の相同体から構成される。真核生物と古細菌の7S RNAは、非常に類似した二次構造を持つ。^{[ 4 ]}

ほとんどの細菌では、SRPはRNA分子（4.5S）とFfhタンパク質（真核生物のSRP54タンパク質の相同体）から構成されています。一部のグラム陽性細菌（例えば枯草菌）は、 Aluドメインを含む、より長い真核生物のようなSRP RNAを持っています。^{[ 5 ]}

真核生物と古細菌では、8つのらせん要素が長いリンカー領域によって隔てられたAluドメインとSドメインに折り畳まれます。 ^{[ 6 ] [ 7 ]} Aluドメインは、SRPのペプチド鎖伸長遅延機能を媒介すると考えられています。^{[ 6 ]} SRP54 Mドメインと相互作用する普遍的に保存されたらせんは、シグナル配列認識を媒介します。^{[ 7 ] [ 8 ]} SRP19-らせん6複合体は、SRPアセンブリに関与し、SRP54結合のためにらせん8を安定化すると考えられています。^{[ 6 ]}ヒトは、便宜上RN7SL1、RN7SL2、RN7SL3と名付けられた3つの機能的なSRP RNA遺伝子を持っています。特にヒトゲノムには、 Aluリピートを含む大量のSRP RNA関連配列が含まれていることが知られています。^{[ 5 ]}

SRP RNAは、鳥類およびマウスの癌原性RNA（オコルナ）ウイルス粒子で最初に検出されました。^{[ 9 ]}その後、SRP RNAは、膜およびポリソーム画分と関連している非感染HeLa細胞の安定した成分であることがわかりました。^{[ 10 ] [ 11 ]} 1980年、細胞生物学者は、小胞体膜を横切る分泌タンパク質の転座を促進する11S「シグナル認識タンパク質」（偶然にも「SRP」と略される）をイヌの 膵臓から精製しました。^{[ 12 ]}その後、SRPにはRNA成分が含まれていることが発見されました。^{[ 13 ]}異なる種のSRP RNA遺伝子を比較すると、SRP RNAのヘリックス8は生命のすべてのドメインで高度に保存されていることが明らかになりました。^{[ 14 ]}哺乳類のSRP RNAの 5' 末端と 3' 末端付近の領域は、ヒトゲノムの中間反復配列の主要な Alu ファミリーに類似している。^{[ 15 ]} Alu DNA は、SRP RNA の中央の SRP RNA 特異的 (S) 断片の切除、それに続く逆転写、およびヒト染色体の複数の部位への組み込みによってSRP RNA から生じたことが現在では理解されている。^{[ 3 ]} SRP RNA は、いくつかの細胞小器官でも同定されており、たとえば、多くの光合成生物のプラスチドSRP や、 ^{[ 16 ]}いくつかの外生菌根菌の核リボソーム内部転写スペーサー領域などである。 ^{[ 17 ]}

真核生物のSRP RNAは、 RNAポリメラーゼIII （Pol III）によってDNAから転写される。^{[ 18 ]} RNAポリメラーゼIIIは、5SリボソームRNA、tRNA、7SK RNA、およびU6スプライソソームRNAの遺伝子も転写する。ヒトSRP RNA遺伝子のプロモーターには、転写開始部位の下流に位置する要素が含まれる。植物SRP RNAプロモーターには、上流刺激要素（USE）とTATAボックスが含まれる。酵母SRP RNA遺伝子には、TATAボックスと、 Pol IIIによるSRP遺伝子の転写の調節に役割を果たす追加の遺伝子内プロモーター配列（AブロックおよびBブロックと呼ばれる）がある。 ^{[ 19 ]}細菌では、遺伝子はオペロンに組織化され、 RNAポリメラーゼによって転写される。多くの細菌の小型（4.5S）SRP RNAの5'末端はRNase Pによって切断される。^{[ 20 ]} Bacillus subtilis SRP RNAの末端はRNase IIIによって処理される。これまでのところ、SRP RNAのイントロンは観察されていない。

2005年に、すべてのSRP RNAの命名法として、12本のらせんからなる番号付けシステムが提案された。らせんの各セクションは小文字の接尾辞で命名される（例：5a）。挿入部分、つまりらせんの「分岐」には点線で区切られた番号が付けられる（例：9.1、12.1）。

SRP RNAは、サイズと構造的特徴の数に関して、幅広い系統発生スペクトルに及ぶ（下記のSRP RNA二次構造の例を参照）。最小の機能的SRP RNAは、マイコプラズマおよび関連種で発見されている。大腸菌SRP RNA（4.5S RNAとも呼ばれる）は114ヌクレオチド残基から構成され、RNAステムループを形成する。グラム陽性細菌である枯草菌は、アーキア相同体と似ているがSRP RNAヘリックス6を欠く、より大きな6S SRP RNAをコードしている。アーキアSRP RNAはヘリックス1～8を持ち、ヘリックス7を欠き、ヘリックス3とヘリックス4の頂端ループを含む三次構造を特徴とする。真核生物SRP RNAはヘリックス1を欠き、可変サイズのヘリックス7を含む。原生動物のSRP RNAの中には、ヘリックス3と4が縮小しているものがある。子嚢菌類のSRP RNAは、小ドメインが完全に縮小しており、ヘリックス3と4を欠いている。現在までに知られている最大のSRP RNAは酵母（サッカロミセス）に見られ、ヘリックス5への挿入としてヘリックス9～12を獲得し、さらにヘリックス7が拡張されている。種子植物は、非常に多様なSRP RNAを多数発現している。^{[ 4 ]}

1 つ以上の SRPタンパク質がSRP RNAに結合して機能的な SRP を組み立てます。SRP タンパク質は、キロダルトンで測定されたおおよその分子量に基づいて命名されています。^{[ 32 ]}ほとんどの細菌のSRP は、SRP RNA と SRP54 (「54 番目のホモログ」を意味する Ffh とも呼ばれる) で構成されています。古細菌のSRPは、 SRP54 と SRP19 というタンパク質を含んでいます。真核生物では、SRP RNA は、核小体の領域で輸入された SRP タンパク質 SRP9/14、SRP19、および SRP68/72 と結合します。この pre-SRP は細胞質に輸送され、そこでタンパク質 SRP54 に結合します。^{[ 33 ]}遊離または SRP RNA に結合したタンパク質SRP9/14、SRP19、または SRP54 の分子構造は高解像度で知られています。