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| 7SKRNA | |
|---|---|
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| 識別子 | |
| シンボル | 7SK |
| Rfam | 品番 |
| その他のデータ | |
| RNAタイプ | 遺伝子 |
| ドメイン | 真核生物 |
| それで | 0000274 0000000 |
| PDB構造 | PDBe |
| RN7SK | |
|---|---|
| 識別子 | |
| シンボル | RN7SK |
| NCBI遺伝子 | 125050 |
| その他のデータ | |
| 軌跡 | 第6章 12.2 |
分子生物学 において、7SKは後生動物に豊富に存在する小さな核RNAです。[1] これは、正の転写伸長因子P-TEFbを制御することで転写を調節する役割を果たします。[2] 7SKは、複合体の安定性と機能を調節する他の多くのタンパク質とともに、小さな核リボ核タンパク質複合体（snRNP）に存在します。
構造
初期の研究では、細胞内の7SKは多くのタンパク質と関連していることが示されており、二次構造の調査からRNAの異なる領域間の塩基対形成のモデルが示唆されました。 [3] 7SK snRNPの機能における画期的な進歩は、正の転写伸長因子P-TEFbが複合体の構成要素であるという発見によってもたらされました。[4] [5] 7SKは、RNA結合タンパク質HEXIM1 [6] [7]またはHEXIM2の作用を介して、P-TEFbのサイクリン依存性キナーゼ活性と関連して阻害します。[8] [9] 7SKの5'末端のガンマリン酸は、7SK snRNPの構成成分であるメチルリン酸キャッピング酵素MEPCEによってメチル化されます。[10] La関連タンパク質LARP7も7SKと関連していることがわかっており、これはおそらくRNAの3'末端との相互作用を介していると考えられます。[11] [12] [13] siRNAを介したノックダウンによるMEPCEまたはLARP7のいずれかの減少は、生体内での7SKの不安定化につながる。7SK snRNPのサブセットにはP-TEFbとHEXIMが欠けているが、代わりにhnRNPが含まれている。[14]
関数
7SK snRNP の主な機能は、転写の伸長段階を制御する因子である P-TEFb の制御です。[2] P-TEFb のキナーゼ活性は、この因子が 7SK snRNP 内にあるときに阻害されます。P-TEFb は、HIV トランスアクチベーターTatまたはブロモドメイン含有タンパク質BRD4 のいずれかによって 7SK snRNP から放出されます。この放出により、7SK RNA の構造変化と HEXIM の排出が起こります。[15] hnRNP は、P-TEFb と HEXIM を欠く複合体を安定化します。P-TEFb は特定の遺伝子に作用した後、未知のメカニズムによって 7SK snRNP に再隔離されます。7SK snRNP は、ヒトとショウジョウバエの両方で特徴付けられています。[16] 詳細なレビュー。[14]
参考文献
- ^ Diribarne G 、Bensaude O (2009)。「7SK RNA、一般転写因子P-TEFb を制御する非コードRNA」。RNA生物学。6 (2): 122–8。doi : 10.4161/rna.6.2.8115。PMID 19246988。
- ^ ab Peterlin BM、 Brogie JE 、 Price DH (2012)。「7SK snRNA：真核生物の転写を制御する上 で重要な役割を果たす非コードRNA」。Wiley Interdisciplinary Reviews。RNA。3 (1): 92– 103。doi : 10.1002/wrna.106。PMC 3223291。PMID 21853533。
- ^ Wassarman DA 、Steitz JA (1991 年 7 月)。「機能不明の最も豊富なヒト小型 RNP である 7SK リボ核タンパク質 (RNP) の構造解析」。 分子細胞生物学。11 (7): 3432– 45。doi :10.1128/ MCB.11.7.3432。PMC 361072。PMID 1646389。
- ^ Nguyen VT、Kiss T、Michels AA、 Bensaude O (2001 年 11 月)。「7SK 小型核 RNA は CDK9/cyclin T 複合体に結合し、その活性を阻害する」。Nature . 414 ( 6861 ): 322– 5。Bibcode :2001Natur.414..322N。doi : 10.1038 /35104581。PMID 11713533。S2CID 4341651。
- ^ Yang Z、Zhu Q、Luo K、Zhou Q (2001 年 11 月)。「7SK 小型核 RNA は CDK9/cyclin T1 キナーゼを阻害して転写を制御する」。Nature . 414 ( 6861 ) : 317– 22。Bibcode :2001Natur.414..317Y。doi : 10.1038 /35104575。PMID 11713532。S2CID 4379065。
- ^ Michels AA、Nguyen VT、Fraldi A、Labas V、Edwards M、Bonnet F、他 (2003 年 7 月)。「MAQ1 および 7SK RNA は転写依存的に CDK9/cyclin T 複合体と相互作用する」。 分子細胞生物学。23 ( 14): 4859– 69。doi :10.1128/MCB.23.14.4859-4869.2003。PMC 162212。PMID 12832472。
- ^ Yik JH、Chen R、Nishimura R、Jennings JL、Link AJ、Zhou Q (2003年10月)。「HEXIM1と7SK snRNAの協調作用によるP-TEFb (CDK9/Cyclin T)キナーゼとRNAポリメラーゼII転写の阻害」。分子細胞。12 ( 4 ) : 971– 82。doi : 10.1016/S1097-2765(03)00388-5。PMID 14580347。
- ^ Byers SA、Price JP、Cooper JJ、Li Q、Price DH (2005 年 4 月)。「HEXIM1 関連タンパク質である HEXIM2 は、7SK との関連を通じて正の転写伸長因子 b を制御する」。The Journal of Biological Chemistry。280 ( 16 ): 16360–7。doi : 10.1074/jbc.M500424200。PMID 15713662。
- ^ Yik JH、Chen R、Pezda AC、Zhou Q (2005 年 4 月)。「転写制御のための活性および不活性の正の転写伸長因子 b 複合体のバランス維持における HEXIM1 および HEXIM2 の補償的寄与」。The Journal of Biological Chemistry。280 ( 16): 16368– 76。doi : 10.1074/ jbc.M500912200。PMID 15713661。
- ^ Jeronimo C、Forget D、Bouchard A、Li Q、Chua G、Poitras C、他 (2007 年 7 月)。「ヒト転写機構のタンパク質相互作用ネットワークの体系的解析により、7SK キャッピング酵素の正体が明らかになる」。Molecular Cell。27 ( 2 ) : 262– 74。doi : 10.1016 /j.molcel.2007.06.027。PMC 4498903。PMID 17643375。
- ^ Krueger BJ、Jeronimo C、Roy BB、Bouchard A、Barrandon C、Byers SA、他 (2008 年 4 月)。「LARP7 は 7SK snRNP の安定した構成要素であるが、P-TEFb、HEXIM1、hnRNP A1 は可逆的に関連付けられている」。核酸研究。36 ( 7 ): 2219– 29。doi : 10.1093/nar/gkn061。PMC 2367717。PMID 18281698。
- ^ Markert A、Grimm M、Martinez J、Wiesner J、Meyerhans A、Meyuhas O、et al. (2008 年 6 月)。「La 関連タンパク質 LARP7 は 7SK リボ核タンパク質の構成要素であり、細胞およびウイルスのポリメラーゼ II 遺伝子の転写に影響します」。EMBO Reports。9 ( 6 ) : 569– 75。doi : 10.1038 /embor.2008.72。PMC 2427381。PMID 18483487。
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- ^ ab C Quaresma AJ、Bugai A、Barboric M (2016年9月)。「7SK snRNPとP -TEFbによるRNAポリメラーゼII 伸長制御の解明」。核酸研究。44 (16): 7527– 39。doi :10.1093/nar/gkw585。PMC 5027500。PMID 27369380。
- ^ Krueger BJ、Varzavand K、Cooper JJ、Price DH（2010年8月）。Blagosklonny MV（編）。「ウイルスおよび細胞活性化因子による7SK snRNPからのP-TEFbおよびHEXIM1の放出メカニズムには、7SKの構造変化が含まれる」。PLOS ONE。5 （8 ）：e12335。Bibcode ： 2010PLoSO ... 512335K。doi ：10.1371/ journal.pone.0012335。PMC 2925947。PMID 20808803。
- ^ Nguyen D, Krueger BJ, Sedore SC, Brogie JE, Rogers JT, Rajendra TK, et al. (2012年7月). 「ショウジョウバエ7SK snRNPと発生におけるdHEXIMの重要な役割」. Nucleic Acids Research . 40 (12): 5283–97 . doi :10.1093/nar/gks191. PMC 3384314. PMID 22379134 .
外部リンク
- UCSC ゲノム ブラウザのヒト 7SK ゲノムの位置と 7SK 遺伝子の詳細ページ。
- UCSC ゲノム ブラウザのヒト RN7SK ゲノムの位置と RN7SK 遺伝子の詳細ページ。