分類学的階級

生物分類学において、分類ランクとは、進化上の関係に基づいた階層的な分類体系において、生物群（分類群または系統群）が占めるレベルを示すものです。一部の著者は命名ランクという用語の使用を好みます^{[ 1 ]。}これは、いくつかの定義によれば、生物のランク付けは分類学よりも命名法の下でより正確に記述されると主張しているためです。したがって、真核生物や動物界のような最も包括的な分類群（または系統群）には最高の分類ランクが割り当てられ、ヒト、ヒキガエル、ティラノサウルス、キツネザルのような最も包括的でない分類群には最低ランクが割り当てられます。

分類階級は、「絶対的」なものと「相対的」なものに分けられます。「絶対的」な分類階級では、種、属、族、科、目、綱、門、界、ドメインといった複数の記述用語自体が階級を表します。「相対的」な分類階級では、インデントされた分類体系によって階級が示され、インデントのレベルが階級を表します。このページでは、絶対的分類階級を重点的に説明します。

ランクに基づくコード（動物コード、植物コード、栽培植物コード、原核生物コード、ウイルスコードなど）はすべて絶対ランクを必要とするが、すべての命名システムで絶対ランクが必要なわけではない。例えば、系統命名法のPhyloCodeは絶対ランクを必要としない。^{[ 2 ]}

特定の種、アカギツネ（Vulpes vulpes）とその分類および動物規約における順位について考えてみましょう。種小名vulpes（小文字のv）は、特定の種vulpes（アカギツネ）が属Vulpes （大文字のV ）に属することを示しています。この属は、「真の」キツネのすべての種を、種 小名vulpesより 1 段階上の順位にまとめています。キツネの最も近縁な動物は、イヌ科の分類群に分類され、イヌ、オオカミ、ジャッカルなどが含まれます。階層の次の上位の分類群は食肉目であり、イヌ亜目（上記すべてに加えて、クマ、アザラシ、イタチ、スカンク、アライグマ）とネコ亜目（ネコ、ジャコウネコ、ハイエナ、マングース）が含まれます。食肉目は、毛深く温血で授乳する哺乳綱に属する動物群の一つに過ぎず、哺乳綱に属する動物群はすべて脊索動物門に属する脊索を持つ動物群に含まれます。そして、上記に挙げた動物群はすべて動物界に属します。最後に、最上位の分類群では、上記すべての動物群は、細胞核を持つ他のすべての生物とともに真核生物ドメインに分類されます。

より一般的に言えば、分類群は分類過程から生じる生物の階層的なグループ分けを記述し、表現するものであり、分類群に割り当てられたランクは、その階層内における各グループの相対的な位置を示します。上位の分類群（例えば、ドメインや界）は、下位の分類群（例えば、門や属）よりも多くの下位分類群を含みます。これは、分類ランクの逆ピラミッド図で示されています。そして、種、あるいは亜種は、下位分類群の数が最も少ないか、全く含みません。特定の分類群のランクは、他の分類群と共通する祖先から受け継いだ形質や分子特性の進化的な継承を反映しています。

二名法は基本的である。つまり、分類体系において、特定の生物を識別するために、通常は最初の 2 つのランク (属と種小名)以外のランクの名前を指定する必要はない。^{[ 3 ]}これは世界的に当てはまるわけではない。なぜなら、ほとんどのランクベースのコードは互いに独立しており、コード間に同名異義語 (複数のコード間で異なる生物に同じ名前が使われている)が多数存在するからである。これは通常、動物または特定のランクベースのコードでカバーされる分類群に見られる。このため、すべての分類群名を規制するBioCodeを作成する試みが行われた。 ^{[ 4 ]}しかし、この試みは、コミュニティ間で根強く定着した命名慣習のために、今のところ失敗している。^{[ 5 ] [ 6 ]}

国際動物命名規約では、ランクを次のように定義しています。「命名目的のための分類群の分類階層のレベル（例：すべての科は命名目的には同じランクであり、上科と亜科の間に位置します）。」^{[ 7 ]}このページの議論では、分類群はクレード（単系統群の生物）であると一般的に想定していますが、これは動物命名規約または植物命名規約（藻類、菌類、植物の国際命名規約）のいずれでも要求されていません。また、生物命名法の専門家の中には、要求されるべきではないと考える人もいます。^{[ 8 ]}その場合、分類群の階層、つまりそのランクは、必ずしもクレードの階層を反映するとは限りません。

分類学の古いアプローチは、外見、有機構造、行動の類似性に基づいてグループを形成する現象論的なものであったが、20 世紀後半に開発された 2 つの重要な新しい方法が分類学の実践を劇的に変化させた。1 つは、ドイツの昆虫学者ウィリ・ヘニッヒの研究から生まれた分岐分類学の出現である。^{[ 9 ]}分岐分類学は、生物が共有する特徴の割合 (共有派生形質と呼ばれる) に基づいて生物を分類する方法である。2 つの生物が共有する特徴の割合が高いほど、両者が共通の祖先からより最近に派生したと想定される。 2つ目は、遺伝子解析に基づく分子系統学で、表現型の特徴が少ない場合に特に役立つ多くの追加データを提供できます。例えば、多くのウイルス、細菌^{[ 10 ]}、古細菌の場合や、胎盤哺乳類の主要な分類群のように、はるか昔に急速な進化放散で生じた分類群間の関係を解明する場合などです。^{[ 11 ]}

カール・リンネは、Systema Naturaeなどの画期的な出版物で、界、綱、目、属、種、および種の 1 つ下のランクに限定されたランク付けスケールを使用しました。今日では、命名法は命名規約によって規制されています。主な分類ランクは、界、門または区分、綱、目、科、属、種の 7 つです。さらに、ドメイン(カール・ウーズによって提案) が基本的なランクとして広く使用されています。regioとdominium の両方がラテン語の形で提案され、2023 年にラテン語の dominium の形で原核生物の国際命名規約に採用されました。^{[ 12 ]}

分類群に正式名称が与えられる際、通常は階級が割り当てられます。基本的な階級は種と属です。生物に種名が与えられると、その生物は属に分類され、属名は種名の一部となります。

種の名称は二名法とも呼ばれ、つまり2つの語からなる名称です。例えば、ヒトの種の動物学名はHomo sapiensです。これは通常、印刷物ではイタリック体で表記され、イタリック体が使用できない場合は下線が引かれます。この場合、Homoは属名で大文字で始まり、sapiensは種名で小文字で始まります。常に使用されるわけではありませんが、一部の種には亜種小名が含まれます。例えば、現代人はHomo sapiens sapiensまたはH. sapiens sapiensです。

動物学の命名法では、上位分類群の名前は通常イタリック体にはならないが、植物学規約、原核生物規約、ウイルス規約、バイオ規約草案^{[ 4 ]}、系統規約^{[ 2 ]}はすべて、すべての分類群の名前（すべての階級）をイタリック体にするよう推奨している。

国際動物命名規約には、上科、科、亜科、族、亜族、属、亜属、種、亜種といった分類階級に適用される規則があります。 ^{[ 13 ]}

国際動物命名規約は、名称を「科群名」、「属群名」、「種群名」に分類している。同規約は、これらの分類について以下のランクを明示的に規定している。^{[ 13 ]： §29～31}

• 家族グループ
  • 上科（-oidea）
  • 科（-idae）
  • 亜科（-inae）
  • 部族（-ini）
  • 亜部族（-ina）
• 属グループ
  • 属
  • 亜属
• 種群
  • 種
  • 亜種

規約の規則は、上科から亜種までの階級に適用され、上科より上の階級にはある程度しか適用されません。「属群名」と「種群名」の間には、それ以上の階級は公式には認められておらず、Ranaのような種数の多いクレードでこれらのグループの分類群に名前を付ける際に問題が生じます。^{[ 14 ]}動物学者は、Drosophila 属のように多くの種を含む分類群で、亜属と種レベルの間の追加の非公式な階級として、便宜上、「種群」、「種亜群」、「種複合体」、「超種」などの追加用語を使用することがあります。 （「種群」という言葉は、階級のカテゴリーと非公式の階級そのものの両方として使われるため、混乱を招く可能性があることに注意してください。このため、アラン・デュボワは少なくとも2000年以降、「名目系列」、「科系列」、「属系列」、「種系列」（その他にも）といった代替表現を使用しています。^{[ 15 ] [ 14 ]}）

上位の階級（科以上）では、下位の階級を表すために、階級名に「infra」（下位）という接頭辞を付けることがあります。例えば、infraorder（亜目より下位）やinfrafamily（亜科より下位）などです。

植物学の階級は、生物を（多くの場合）その関係に基づいて分類します（単系統性は、このクレードでは必須ではなく、この言葉も「クレード」という言葉も言及されていません）。階級は、界から始まり、門（または綱） ^{[ 16 ]} 、綱、目、科、属、種へと続きます。各階級の分類群は、一般的に共通の特徴と進化の歴史を持っています。これらの階級を理解することは、分類学と生物多様性の研究に役立ちます。

栽培植物の国際命名規約には、次の分類カテゴリーの定義があります:栽培品種群、栽培品種、品種群。

ICNの規則は主に家族以下の階級に適用され、家族以上の階級にはある程度しか適用されない。

以下に、5種の生物の分類を示します。遺伝学研究室でおなじみのショウジョウバエ（ Drosophila melanogaster）、ヒト（Homo sapiens）、グレゴール・メンデルが遺伝学の発見に用いたエンドウ豆（Pisum sativum）、ベニテングタケ（Amanita muscaria）、そして大腸菌（Escherichia coli）です。8つの主要な階級は太字で示し、いくつかのマイナーな階級も併せて示しています。

表の注釈

• 表を簡潔に保ち、技術的な論争を避けるため、一般的および非一般的な中間階級の一部は省略されています。たとえば、ヨーロッパ、アフリカ、北アメリカ北部の哺乳類（バージニアオポッサムを除く）は、哺乳綱、クラドテリア群、ザテリア亜群、トリボスフェニダ下群、獣亜綱、真獣類クレード、胎盤類クレードに属しますが、表には哺乳綱と真獣類のみが記載されています。一般的に使用されている真獣類クレードと胎盤類クレードの両方を含めると、どちらが「下綱」の階級で、もう一方の階級はどのようなものであるべきか、あるいはこの2つの名称が同義語であるかどうかについて、正当な議論が生じる可能性があります。
• 上位分類群、特に中間のランクは、関係性に関する新しい情報が発見されるにつれて改訂される傾向がある。たとえば、顕花植物は門（Magnoliophyta）から亜綱（Magnoliidae）に格下げされ、顕花植物の主要なグループを区別するランクは上目になった。^{[ 22 ]}霊長類の伝統的な分類（哺乳綱、獣亜綱、真獣下綱、霊長目）は、マッケナとベルなどの新しい分類（哺乳綱、獣亜綱、全獣下綱）によって修正され、獣下綱と真獣下綱は霊長目の間のより低いランクに割り当てられた。これらの違いは、化石記録に利用可能なランクが少なく、分岐点が多いために生じる。
• 種内では、さらに細分化された単位が認識されることがある。動物は亜種（例えば、Homo sapiens sapiens、現代人）または形態（例えば、Corvus corax varius morpha leucophaeus、シロクロガラス）に分類される。植物は亜種（例えば、Pisum sativum subsp. sativum、エンドウ）または変種（例えば、Pisum sativum var. macrocarpon、スノーピー）に分類され、栽培植物には栽培品種名が付けられる（例えば、Pisum sativum var. macrocarpon 'Snowbird'）。細菌は株（例えば、Escherichia coli O157:H7 、食中毒を引き起こす可能性のある株）によって分類されることがある。

属レベルより上位の分類群には、多くの場合、模式属に基づいて、標準的な語尾を用いて名前が付けられます。これらの名前を形成する際に使用される語尾は、以下の表に示すように、界（場合によっては門と綱）によって異なります。

示されている発音は最も英語化されたものです。よりラテン語由来の発音もよく見られます。特に、強勢のあるaの発音は/ eɪ /ではなく/ ɑː /です。

表の注釈

• 植物学や菌類学では、科以下の分類群の名称は、属名（その分類群のタイプ属と呼ばれることもある）に標準的な語尾を付けて命名されます。例えば、バラ科（Rosaceae）は、バラ属（Rosa）に科を表す標準的な語尾「-aceae」を付けて命名されています。科より上位の分類群の名称も、属名から派生したものか、あるいは記述的な名称（例えば、GymnospermaeやFungiなど）です。
• 動物の場合、分類群には上科までの標準的な接尾辞しかありません。^{[ 29 ]} AAAS ^{[ 30 ]}では、例えば目に-ida / ɪdə /という統一接尾辞が提案されています（ただし推奨されていません）。原生動物学者はこのシステムを採用しているようです。多くの後生動物（高等動物）の目にも、例えばHyolithidaやNectaspida (Naraoiida)のように、このような接尾辞があります。
• 属名を基にした名前を作るのは必ずしも簡単ではない。例えば、homoには属格hominisがあるため、 Homo（ヒト）属はHominidaeに属し、「Homidae」には属さない。
• 動物におけるエピファミリー、インフラファミリー、インフラトライブの階級は、系統分岐の複雑さから通常よりも細かい区別が必要な場合に使用されます。これらはスーパーファミリーの階級より下位ですが、国際動物命名規約では規制されておらず、したがって正式な標準語尾はありません。ここに挙げられている接尾辞は規則的ですが、非公式です。^{[ 31 ]}
• ウイルス学では、ウイロイド、サテライト核酸、およびウイルス様分類群の正式な語尾はウイルスと同様で、-vir- が-viroid-、-satellit-、および-viriform-に置き換えられるだけです。^{[ 23 ]}領域と亜領域の追加レベルは、それぞれ-viriaと-viraで終わります。^{[ 23 ]}

進化上の関係は経験的なものであるため、分類学者は時として新たな階級を導入する必要が生じる。これに関して、異なる命名規約にはそれぞれ異なる規則が定められている。

以下は、さまざまな中間ランクのさまざまな研究分野で使用される用語のリストです。^{[ 32 ]}ドクロと骨のシンボル (☠) が付いている用語は特にウイルス学で使用され、バイオハザード シンボル (☣︎) が付いている用語は細菌学で使用され、小花 (✿) が付いている用語は植物学で使用され、傘 (☂) が付いている用語は菌類学で使用され、アスタリスク (*) が付いている用語は動物学で使用され、魚眼 (◉) が付いている用語は魚類学で使用され、花 (⚘) が付いている用語は鱗翅目学で使用されます。

ランクは主観的な相違に基づいて割り当てられ、自然界における変異の段階的な性質を完全に反映していません。これらの問題はすでにウィリ・ヘニッヒによって指摘されており、彼は1969年にランクの廃止を提唱しました^{[ 38 ]}。この立場はわずか数年後にグラハム・CD・グリフィスからも支持を得ました^{[ 39 ]} 。実際、これらのランクは固定主義的な文脈で提案されたものであり、進化の出現によってこのシステムの基盤が崩壊したことは、ずっと以前から認識されていました。 1886 年に発行されたアメリカ鳥類学会が採択した北米鳥類命名規約とチェックリストの序文には、「1842 年 [ストリックランド規約が起草されたとき] には、リンネ体系が科学の永続的な遺産ではないこと、あるいは数年後には進化論が、名前が付けられるべきものに対する人々の概念を根本的に変えることによって、その基礎そのものを蝕むことになることを疑っていた者は誰もいなかったようだ」と記されている。^{[ 40 ]}このような階級は、階級に基づく規約で要求されているという理由だけで使用されている。そのため、一部の分類学者は、それらを命名階級と呼ぶことを好む。^{[ 1 ] [ 6 ]}ほとんどの場合、より上位の分類群は、より過去に遡って発生する。それは、最も包括的な分類群が必然的に最初に現れたからである。^{[ 41 ]}さらに、脊椎動物や被子植物などの一部の主要な分類群の多様性は、菌類、節足動物、線虫などの他の分類群の多様性よりもよく知られていますが、それは他の分類群よりも多様性が高いからではなく、他の分類群よりも容易にサンプリングおよび研究できるから、または研究に対する関心と資金がより多く集まるからです。^{[ 42 ] [ 43 ]}

これらの多くの階級のうち、多くの分類学者は最も基本的（または重要）な階級は種であると考えているが、この意見は普遍的に共有されているわけではない。^{[ 44 ] [ 45 ] [ 46 ]}したがって、種は必ずしも他の階級の分類群よりも明確に定義されているわけではなく、実際には、絶滅によって生じた表現型のギャップを考慮すると、実際にはその逆であることが多い。理想的には、分類群はクレード、つまり議論されている生物の系統発生を表すことを意図しているが、これは動物学および植物学の規約の要件ではない。^{[ 6 ]}

すべての分類群に正式な階級がある分類体系では、系統発生に関する知識を適切に反映することはできません。分類群名は階級に基づく（リンネ式）命名法では階級に依存しているため、階級のない分類群には名前を付けることができません。^系統命名法[ ^{47 ] [ 48 ]} （ PhyloCodeで実装され、国際系統命名学会^{[ 49 ]}によって支持されている）や限定名の使用などの代替アプローチは、この問題を回避します^{[ 50 ] [ 51 ]} 。進化系統樹に分類階級を重ね合わせる際の理論的な困難は、ダーウィン進化モデルで説明できる境界パラドックスとして現れます。

属、科、またはその他の上位分類群 (つまり、種レベルより上のカテゴリーの分類群) を構成する種の数に関する規則はありません。^{[ 52 ] [ 53 ]}生物学者が利用可能なすべての情報を使用して判断した自然なグループ (つまり、人為的ではなく、多系統群ではない) である必要があります。異なる門で同等にランク付けされた上位分類群は、起源の時期、表現型の特異性、または含まれる下位分類群の数に関して必ずしも同等ではありません (たとえば、昆虫の科が何らかの形で軟体動物の科と進化的に比較可能であると仮定するのは誤りです)。^{[ 53 ] [ 54 ] [ 6 ]}分類群をランク付けするために提唱されたすべての基準の中で、起源の年代が最も頻繁に提唱されています。ウィリ・ヘニッヒは1966年にこれを提案したが^{[ 9 ]} 、 1969年にはこのシステムは実用的ではないと結論付け^{[ 38 ]}、絶対的なランクを廃止することを提案した。しかし、起源の年代（唯一の基準として、または主要な基準の1つとして）を使用して分類群をランク付けするという考えは、タイムバンディングという名前で存続しており、今でも複数の著者によって支持されている。^{[ 55 ] [ 56 ] [ 57 ] [ 58 ]}動物の場合、少なくとも門のランクは通常、特定の体型と関連付けられているが、これもまた恣意的な基準である。

謎めいた分類群とは、より広範な関係が不明または未定義の分類群のことである。^{[ 59 ]}

分類階層を覚えるのに役立つ記憶術はいくつかあり、例えば「キング・フィリップ・ケイム・オーバー・フォー・グレート・スパゲッティ」などがある。^{[ 60 ]}（界、門、綱、目、科、属、種）

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