ゲノム内衝突

原則として、2 つの親アレルは成熟した配偶子に存在する確率が等しい。しかし、親から子への親アレルの不均等な伝達につながるメカニズムがいくつか存在する。その 1 つの例は、S分離歪み因子 (SD) ^{[ 9 ]}と呼ばれる遺伝子ドライブ複合体で、減数分裂または配偶子形成中に「不正」を行い、機能的な配偶子の半分以上に存在している。最もよく研​​究されている例は、ショウジョウバエ( Drosophila melanogaster)のSD、マウス( Mus musculus )のtハプロタイプ^{[ 10 ]}、およびNeurospora spp. (Neurospora spp.) (真菌)のsk ^{[ 11 ]}である。ヒトでも可能性のある例が報告されている。^{[ 12 ]}性染色体上に存在する分離歪み因子（ショウジョウバエのいくつかの種 ではX染色体の場合と同様^{[ 13 ] [ 14 ]}）は、キャリア個体の子孫に性比の偏りを引き起こすため、性比歪み因子と呼ばれています。

メデア遺伝子は、それを継承しないヘテロ接合体の母親から生まれた子孫の死を引き起こします。これはコクゾウムシ（Tribolium castaneum）で起こります。^{[ 20 ]}母性効果利己遺伝子は実験室で合成に成功しています。^{[ 21 ]}

トランスポゾンは、ゲノム内の新たな位置に移動する能力を持つ自律複製遺伝子であり、ゲノム内に蓄積していく。ゲノムの他の部分に悪影響を及ぼすにもかかわらず、自己複製を続ける。これらはしばしば「ジャンプ遺伝子」または寄生DNAと呼ばれ、 1944年にバーバラ・マクリントックによって発見された。

ホーミングエンドヌクレアーゼ遺伝子（HEG）は、競合する対立遺伝子を自身のコピーに変換し、ヘテロ接合体のほぼすべての減数分裂娘細胞に受け継がれます。HEGは、競合する対立遺伝子を切断するエンドヌクレアーゼをコードすることによってこれを実現します。この切断は、HEGの配列を鋳型として使用して修復されます。^{[ 22 ]}

HEGは配列特異的エンドヌクレアーゼをコードしています。認識配列（RS）は15～30  bpの長さで、通常ゲノム中に1回存在します。HEGは自身の認識配列の中央に位置しています。ほとんどのHEGは自己スプライシングイントロン（グループIおよびII）とインテインによってコードされています。インテインはタンパク質スプライシングによって生成される内部タンパク質断片であり、通常エンドヌクレアーゼ活性とスプライシング活性を含んでいます。HEGを持たない対立遺伝子はホーミングエンドヌクレアーゼによって切断され、二本鎖切断はHEGを含む対立遺伝子を鋳型として相同組換え（遺伝子変換）によって修復されます。修復後、両方の染色体にHEGが含まれるようになります。^{[ 23 ]}

B染色体は非必須染色体であり、通常の（A）染色体セットのどのメンバーとも相同性がなく、形態的にも構造的にもA染色体とは異なり、予想よりも高い頻度で伝達され、子孫に蓄積されます。場合によっては、B染色体は単に利己的であり、寄生染色体として存在するという主張を裏付ける強力な証拠があります。^{[ 24 ]} B染色体は、植物と動物の両方の主要な分類群すべてに見られます。

異形配偶子形成では、一般的に雌性配偶子からのみ細胞質要素を受け継ぐ接合子が生成される。したがって、雄はこれらの遺伝子の行き止まりとなる。この事実から、細胞質遺伝子は雌の子孫の生産を増やし、それらを持たない子孫を排除するための多くのメカニズムを進化させてきた。^{[ 27 ]}

雄の生物は、核内の性決定因子とは無関係に、細胞質内で遺伝する原生生物（微胞子虫）または細菌（ボルバキア）によって雌に性転換される。これは、端脚類、等脚類、甲殻類、鱗翅目などの生物で起こる。

雄の胚（細胞質遺伝性細菌の場合）または雄の幼虫（微胞子虫の場合）が死に至ります。胚が死に至った場合、投資は雄から雌へと移り、雌はこれらの細胞質要素を伝達することができます（例えば、テントウムシでは、感染した雌宿主は死んだ雄の兄弟を食べますが、これは細菌の観点からはプラスです）。微胞子虫による幼虫の死の場合、病原体は雄の系統（そこからは伝達されません）から環境へと伝達され、そこで他の個体によって再び感染する可能性があります。雄殺しは多くの昆虫で起こります。雄の胚が死に至った場合、ボルバキアを含むさまざまな細菌が関与していることが示唆されています。

雌雄同株の被子植物では、場合によってはミトコンドリアによって雄性配偶体（葯組織）が死滅し、雌性配偶体の発達にエネルギーと物質が消費される。これにより、雌雄同株から雌雄異株へと移行し、個体群の一部が雄性不稔となる。

特定の半倍数体膜翅目昆虫やダニ類では、雄は無性生殖によって生まれるが、ボルバキア菌やカルディニウム菌は染色体の複製を誘導し、雌へと変化させることができる。細胞質内の細菌は、半数体細胞に不完全な有糸分裂を起こさせ、雌となる二倍体細胞を生成させる。こうして、完全に雌だけの個体群が形成される。このようにして無性生殖となった個体群に抗生物質を投与すると、無性生殖を強制していた細胞質内の細菌が除去されるため、個体群は瞬時に有性生殖へと戻る。

多くの節足動物では、感染した雄の精子と非感染の雌の卵子によって作られた接合子は、ボルバキアまたはカルディニウムによって殺される可能性がある。^{[ 26 ]}