重複遺伝子 （またはOLG ）[ 1 ] [ 2 ] ヌクレオチド配列 が別の遺伝子の発現可能なヌクレオチド配列と部分的に重複する遺伝子です。 [ 3 ] このように、ヌクレオチド配列は1つ以上の遺伝子産物 の機能に寄与する可能性があります。重複遺伝子は、細胞ゲノム とウイルス ゲノム の両方に存在し、基本的な特徴です。[ 2 ] [ 2 ] 原核生物 とウイルス では、重複はコーディング配列 間でなければなりませんが、 mRNA 転写産物間ではあってはならず、これらのコーディング配列が同じ鎖または反対鎖のいずれかでヌクレオチドを共有している場合に定義されます。真核生物 では、遺伝子の重複はほぼ常にmRNA転写産物の重複として定義されます。具体的には、真核生物における遺伝子重複とは、2つ以上の遺伝子の一次mRNA転写産物の境界間で少なくとも1つのヌクレオチドが共有されている場合に定義され、重複領域の任意の箇所でDNA塩基変異が 生じると、関連するすべての遺伝子の転写産物に影響を与える。この定義には、5'および3'非翻訳領域 （UTR）とイントロン が含まれる。
オーバープリンティング とは、ある遺伝子の配列の全部または一部が、同じ遺伝子座にある別の遺伝子から別の 読み取り枠 で読み取られるタイプの重複を指します。[ 4 ] ヌクレオチド置換 によって生成されると考えられており、元の遺伝子の機能を維持しながら新しいタンパク質を発現するように 誘導することができます。 [ 5 ] 非コード 領域であったゲノムの既存の配列から新しい遺伝子が 新たに [ 6 ] [ 7 ] 相同遺伝子がありません。 [ 8 ] ゲノム 構造の特に一般的な特徴であり、少数のウイルス遺伝情報から発現可能な遺伝子の数を大幅に増加させる可能性が高い。[ 9 ] オーバープリントは、ウイルスの進化の歴史 の中で多数の新規タンパク質の生成に関与している可能性が高い。
分類学的分布 バクテリオファージΦX174ゲノムにおける重複遺伝子。このゲノムには11個の遺伝子（A、A*、BH、J、K）がある。遺伝子B、K、Eは遺伝子A、C、Dと重複している。[ 29 ] 重複遺伝子は、頻度は様々だが、あらゆる生物領域で見られる。特に ウイルス ゲノムではよく見られる。
原核生物 細菌 ゲノムにおける遺伝子重複の推定では、通常、細菌遺伝子の約3分の1が重複しているが、通常は数塩基対のみであることがわかる。[ 12 ] [ 44 ] [ 45 ] 遺伝子調節 において機能し、重複する遺伝子が転写 および翻訳的に 共調節されることを可能にするという証拠が見つかっている。[ 12 ] [ 23 ] [ 12 ] [ 14 ] [ 11 ] [ 45 ] [ 46 ] 60塩基対 を超える長い重複は、収束遺伝子でより一般的である。しかし、推定される長い重複領域は誤注釈 率が非常に高い。[ 47 ] モデル生物である 大腸菌 [ 48 ]
真核生物 原核生物のゲノムと比較すると、真核生物のゲノムは注釈が不十分な場合が多く、そのため真の重複を特定することは比較的困難である。[ 28 ] [ 49 ] [ 50 ] [ 51 ] [ 52 ] [ 50 ] [ 51 ] [ 53 ] 新たに 発生したと考えられる遺伝子の一般的な特徴である。 [ 51 ] [ 54 ] [ 55 ]
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