分類上の順位

生物学において、分類上の順位（一部の用語の定義によれば、順位付けは分類学そのものというより命名法の一部であるため、一部の著者は命名上の順位^{[1]と呼ぶことを好む）は、進化上の関係を反映する}階層構造における生物群（分類群）の相対的または絶対的なレベルである。したがって、最も包括的なクレード（真核生物や後核類など）は最高位となり、最も包括的でないクレード（ホモ・サピエンスやヒキガエルなど）は最低位となる。順位は、相対的であり、インデントされた分類法で表され、インデントのレベルが順位を反映するか、または絶対的であり、種、属、科、目、綱、門、界、ドメインなどのさまざまな用語が順位を示す。このページでは絶対的なランクを強調しており、ランクに基づくコード（動物コード、植物コード、栽培植物コード、原核生物コード、ウイルスコード）では絶対的なランクが必要です。ただし、分類学者のすべての命名システムで絶対的なランクが必要なわけではありません。たとえば、系統命名法のコードであるPhyloCode [ ^2]では絶対的なランクは必要ありません。

分類群は生物の階層的なグループであり、そのランクはこの階層における位置を表します。高位の分類群（例えば、ドメインまたは界と見なされるもの）には、低位の分類群（例えば、属、種、または亜種と見なされるもの）よりも多くのサブ分類群が含まれます。これらの分類群のランクは、共通の祖先からの形質または分子的特徴の継承を反映しています。種と属の名前は基本的な名前です。つまり、特定の生物を識別するために、特定のランクに基づくコードでカバーされる分類群のセット内では、通常、最初の 2 つのランク以外の名前を指定する必要はありません。^[3]ただし、ほとんどのランクに基づくコードは互いに独立しているため、これは世界的に当てはまりません。そのため、コード間の同名語（異なる生物、多くの場合、動物と植物コードでカバーされる分類群に使用される同じ名前）が多数存在します。このため、すべての分類名を規制するバイオコードを作成する試みがなされたが^[4]、この試みはこれまでのところ失敗している^[5] 。これは 、各コミュニティにしっかりと根付いた伝統によるものである^{[6] 。}

特定の種、アカギツネ（Vulpes vulpes）について考えてみましょう。動物学規約の文脈では、種小名 vulpes（小文字のv ）は、すべての「真の」キツネを含むVulpes属（大文字のV ）の特定の種を特定します。それらの近縁種はすべてイヌ科に属し、イヌ、オオカミ、ジャッカル、およびすべてのキツネが含まれます。次に上位の主要な分類群である食肉目（目と見なされます）には、イヌ目（クマ、アザラシ、イタチ、スカンク、アライグマ、および上記のすべて）とネコ目（ネコ、ジャコウネコ、ハイエナ、マングース）が含まれます。食肉目は、毛深く、温血で、授乳期の動物である哺乳綱の 1 つのグループです。哺乳綱は脊索動物門の脊索を持つ動物として分類され、脊索を持つすべての動物とともに動物界に分類されます。最後に、最高位では、これらすべてが真核生物ドメインの細胞核を持つ他のすべての生物とともにグループ化されます。

国際動物命名規約では、ランクを次のように定義しています。「命名上の目的で、分類階層における分類群のレベル（例えば、命名上の目的では、すべての科は上科と亜科の間にある同じランクになります）」。^[7]このページの議論では、一般的に分類群がクレード（生物の単系統群）であると想定していますが、これは国際動物命名規約でも植物規約でも必須ではなく、生物学的命名法の専門家の中には、必須であるべきではないと考える人もいます。^{[8]その場合、分類群の階層（したがって、そのランク）は、必ずしも}クレードの階層を反映しません。

分類学上の分類に対する古いアプローチは現象論的であり、外見、有機的構造、行動の類似性に基づいてグループを形成していましたが、20世紀後半に開発された2つの重要な新しい方法が分類学の実践を劇的に変えました。1つは、ドイツの昆虫学者ヴィリー・ヘニングの研究に端を発した分岐論の出現です。^[9]分岐論は、共通する特徴の割合（シナポモルフィと呼ばれる）に従って生命体を分類する方法です。2つの生物が共有する特徴の割合が高いほど、両方が共通の祖先からより最近に進化したと想定されています。 2つ目は、遺伝子解析に基づく分子系統学です。これは、多くのウイルス、細菌^[10]、古細菌など、表現型の特徴がほとんどない場合に関係を解明するのに特に役立つ多くの追加データを提供することができます。また、胎盤哺乳類の主な分類群^[11]など、はるか昔に起こった急速な進化的放散で生じた分類群間の関係を解明するのにも役立ちます。

カール・リンネは、Systema Naturaeなどの画期的な出版物で、界、綱、目、属、種、および種の1つ下の階級に限定したランク付けの尺度を使用していました。今日、命名法は命名法コードによって規制されています。界、門または門、綱、目、科、属、種の7つの主要な分類上の階級があります。さらに、カール・ウーゼによって提案されたドメインは、命名法コードのいずれにも記載されていないものの、現在では基本的な階級として広く使用されています。これは、1974年にムーアによって導入されたドミニオン（ラテン語：dominium）の同義語です。 ^{[12] [13]}

分類群に正式な名前が与えられると、通常はランクが割り当てられます。基本的なランクは種と属です。生物に種名が与えられると、属に割り当てられ、属名は種名の一部になります。

種名は二名法とも呼ばれ、2つの用語からなる名前です。たとえば、ヒトの動物学上の名称はHomo sapiensです。これは通常、印刷時にはイタリック体で表記され、イタリック体が使用できない場合は下線が引かれます。この場合、Homo は属名で大文字で表記されます。sapiensは種を示し、大文字では表記されません。常に使用されるわけではありませんが、一部の種には亜種小名が含まれます。たとえば、現代人はHomo sapiens sapiensまたはH. sapiens sapiensです。

動物学の命名法では、高等分類群名は通常斜体にしませんが、植物綱領、原核生物綱領、ウイルス綱領、生物綱領草案^[4]、および系統綱領^[2]では、すべての分類群名（すべてのランク）を斜体にすることを推奨しています。

国際動物命名規約には、上科、科、亜科、族、亜族、属、亜属、種、亜種の分類上の階級に適用される規則がある。 ^[14]

国際動物命名規約では、名前を「科群名」、「属群名」、「種群名」に分類しています。規約では、これらのカテゴリについて、以下のランクが明示的に示されています。^{[14] ：§29–31}

• 家族グループ
  • 上科（-oidea）
  • 科(-idae)
  • 亜科(-inae)
  • 部族（-ini）
  • 亜部族（-ina）
• 属グループ
  • 属
  • 亜属
• 種族グループ
  • 種
  • 亜種

この規約の規則は、上科から亜種の階級に適用され、上科より上の階級にはある程度までしか適用されない。「属グループ名」と「種グループ名」では、それ以上の階級は正式には認められておらず、そのため、Ranaなどの種の分岐群内のこれらのグループの分類群に名前を付けるときに問題が生じる。^[15]動物学者は、多くの種を含む分類群（例： Drosophila属）の亜属レベルと種レベルの間の追加的だが非公式な階級として、便宜上、種グループ、種亜グループ、種複合体、上種などの追加の用語を使用することがある。 （「種群」を階級のカテゴリーとしても非公式の階級としても使用すると混乱を招く可能性があるので注意。このため、アラン・デュボアは少なくとも2000年以降、「名目シリーズ」、「科シリーズ」、「属シリーズ」、「種シリーズ」（その他）などの代替表現を使用している。^{[16] [15]}）

上位ランク（科以上）では、下位を意味する接頭辞「infra」をランクに追加して、下位レベルを表す場合があります。たとえば、infra order（亜目より下）またはinfra family（亜科より下）などです。

• 種の階級より上の分類群には、学名が一部だけ含まれています（一名法）。
• 種の名前は通常、属名+種小名の2つの部分（二名法）で構成されます。例：Canis lupus。亜属名（括弧内）が属名と種小名の間に挿入される場合があり、亜種の三名法と混同しないようにする必要があります。例として、Lithobates (Aquarana) catesbeianusがあり、これはLithobates属とAquarana亜属に属する種を示しています。^[15]
• 亜種の名前は、属名 + 種小名 +亜種名の 3 つの部分 (三名法) で構成されます (例: Canis lupus italicus )。種の下位には 1 つのランクしかないため、ランクを示す接続語は不要または使用されません。

植物学上の階級は、（多くの場合）関係性に基づいて生物を分類します（このクレードでは単系統性は必須ではなく、この単語や「クレード」についても言及されていません）。階級は界から始まり、門（または門）、 ^[17]綱、目、科、属、種の順に進みます。各階級の分類群は、一般的に共通の特徴と進化の歴史を持っています。これらの階級を理解することは、分類学と生物多様性の研究に役立ちます。

国際栽培植物命名規約には、栽培品種グループ、栽培品種、グレックスなどの分類カテゴリーの定義があります。

ICN の規則は、主に科以下のランクに適用されますが、科以上のランクにもある程度適用されます。(記述的な植物名も参照してください。)

属以上の階級の分類群は、植物名が1つの部分（単一名）で表されます。種以上の階級（ただし属より下）の分類群は、植物名が2つの部分（二部名）で表されます。種以下の分類群はすべて、植物名が3つの部分（種内名）で表されます。種内名の階級を示すには、「接続語」が必要です。したがって、Poa secunda subsp. juncifolia （「subsp.」は「subspecies」の略）は、 Poa secundaの亜種の名前です。^[19]

雑種は、親を特定する「雑種式」によって指定することも、名前を付けることもできます。雑種名を付けられた雑種には、同じランクが適用され、接頭辞としてnotho（ギリシャ語で「ろくでなし」）が付けられ、nothogenusが最高ランクとして許可されます。^[20]

古い出版物で階級を表す別の用語が使用されていたが、意図が明らかである場合、植物学の命名法では特定の代替を指定しています。^{[引用が必要]}

• 名前が「目の名前として意図されていたが、その順位を「order」の代わりに「cohors」（ラテン語で「cohort」の意味。^{[21]生態学におけるこの用語の使用については、} cohort studyも参照）、「nixus」、「alliance」、または「Reihe」などの用語で示して公表された場合（第17.2条）、目の名前として扱われます。
• 「家族」は、「秩序」の現代的な意味が意図されていない特定の状況下では、「秩序」（ordo）または「自然秩序」（ordo naturalis）の代わりに使用されます。（第18条2項）
• 「「亜目」の現代的な意味が意図されていなかった特定の状況では、「亜科」は「亜目」（subordo）に置き換えられます。（第19条2）
• 1890 年 1 月 1 日より前の出版物では、種内ランクが 1 つしか使用されていない場合、それは変種のランクであるとみなされます。(第 37.4 条) これは通常、種内分類群をギリシャ文字の α、β、γ などでラベル付けした出版物に適用されます。

以下に 5 つの種の分類を示します。遺伝学研究室でおなじみのショウジョウバエ( Drosophila melanogaster )、ヒト( Homo sapiens )、メンデルが遺伝学の発見に使用したエンドウ豆( Pisum sativum )、ベニテングタケのAmanita muscaria、および細菌Escherichia coli。8つの主要なランクは太字で示され、いくつかのマイナーなランクも示されています。

表の注釈

• 表を簡潔にし、技術的な議論を避けるため、一般的な中間階級と一般的でない中間階級がいくつか省略されています。たとえば、ヨーロッパ、アフリカ、北アメリカ北部の哺乳類^[a]は、 Mammalia綱、 Cladotheria群、Zatheria亜群、Tribosphenida下群、Theria亜綱、Eutheria 分岐群、 Placentalia 分岐群に属していますが、表には Mammalia と Theria しか含まれていません。一般的に使用されている Eutheria 分岐群と Placentalia 分岐群の両方が含まれていると、どちらが「下階級」なのか、もう一方の階級はどうあるべきか、または 2 つの名前が同義語であるかどうかについて正当な議論が生じる可能性があります。
• より高次の分類群の階級、特に中間階級は、関係性に関する新たな情報が発見されるにつれて改訂される傾向がある。例えば、顕花植物は、門（Magnoliophyta）から亜綱（Magnoliidae）に格下げされ、上目は顕花植物の主要なグループを区別する階級となった。^[23]霊長類の従来の分類（哺乳綱、獣亜綱、真獣亜綱下綱、霊長類目）は、マッケナとベル（哺乳綱、獣亜綱、ホロテリア下綱）などの新しい分類によって修正され、獣亜綱と霊長類目の間には、より低い階級が割り当てられている。（詳細は哺乳類の分類を参照。）これらの違いは、化石記録には利用可能な階級が少なく、分岐点が多いために生じる。
• 種の中にさらに単位が認められる場合がある。動物は亜種（例えば、Homo sapiens sapiens、現代人）または形態（例えば、Corvus corax varius morpha leucophaeus、カラス）に分類される場合がある。植物は亜種（例えば、Pisum sativum subsp. sativum、エンドウ豆）または変種（例えば、Pisum sativum var. macrocarpon、スノーピー）に分類され、栽培植物には栽培品種名が付けられる（例えば、Pisum sativum var. macrocarpon 'Snowbird'）。細菌は株によって分類される場合がある（例えば、Escherichia coli O157:H7 、食中毒を引き起こす可能性のある株）。

属レベルより上の分類群は、多くの場合、標準的な語尾を持つタイプ属に基づいて名前が付けられます。これらの名前を形成するために使用される語尾は、以下の表に示すように、界（および場合によっては門と綱）によって異なります。

示されている発音は最も英語化されたものです。よりラテン語的な発音も一般的で、特に強勢のあるaには/ eɪ /ではなく/ ɑː /が使われます。

表の注釈

• 植物学と菌類学では、科以下の階級の名称は、その分類群のタイプ属と呼ばれることもある属名に基づいており、標準的な語尾が付いています。たとえば、バラ科Rosaceaeは、属Rosaにちなんで命名されており、科を表す標準的な語尾は「-aceae」です。科より上の階級の名称も、属名から作られるか、説明的な名前です ( GymnospermaeやFungiなど)。
• 動物の場合、上科までの分類群にのみ標準的な接尾辞がある。^[30] AAAS ^{[31]では、例えば目に対して}-ida / ɪ d ə /という統一接尾辞が提案されている（ただし推奨されていない）。原生動物学者はこのシステムを採用しているようだ。多くの後生動物（高等動物）目にもこのような接尾辞があり、例えばHyolithidaや Nectaspida（Naraoiida）などである。
• 属名に基づいて名前を形成することは簡単ではない場合があります。たとえば、homoには属格hominis があるため、 Homo属(ヒト) はHomidae ではなくHominidaeに属します。
• 動物における上科、下科、下族の階級は、系統分岐の複雑さにより通常よりも細かい区別が必要な場合に用いられる。これらは上科より下位に位置するが、国際動物命名規約では規制されていないため、正式な標準的な語尾はない。ここに挙げた接尾辞は規則的だが非公式である。^[32]
• ウイルス学では、ウイロイド、サテライト核酸、ビリフォームの分類群の正式な語尾はウイルスと似ていますが、-vir-が-viroid-、-satellit-、-viriform-に置き換えられています。^[24]レルムとサブレルムの追加レベルは、それぞれ-viriaと-viraで終わります。 ^[24]

分類学者は必要だと感じればいつでも自由に新しい階級を創設することができるため、階級の数は不確定です。その際には、適用される命名法コードによって異なるいくつかの制限があります。^[要出典]

以下は、最も一般的なものから最も具体的なものまで、絶対的な順位を示すためだけの人工的な統合である（ただし、注記を参照）。^[33]

• スーパードメイン
  • ドメインまたは帝国
    • サブドメイン（生物学）
• 領域（ウイルス学）^[24]
  • サブレルム（ウイルス学）^[24]
• ハイパーキングダム
  • スーパーキングダム
    • 王国
      • サブ王国
        • インフラキングダム
          • パルヴ王国
• 上門、または上区分（植物学）
  • 門、または（植物学における） 区分
    • 亜門、または（植物学における）下位区分
      • Infraphylum、または infradivision (植物学)
        • 小門
• スーパークラス
  • クラス
    • サブクラス
      • インフラクラス
        • 下位階級
          • パルブクラス
• 動物学におけるスーパーディビジョン^[34]
  • 分類（動物学）^[34]
    • 動物学における分類^[34]
      • 動物学におけるインフラディビジョン^[34]
• スーパーレギオン（動物学）
  • レギオン（動物学）
    • 亜群（動物学）
      • インフラレギオン（動物学）
• スーパーコホート（動物学）^[35]
  • コホート（動物学）^[35]
    • サブコホート（動物学）^[35]
      • インフラコホート（動物学）^[35]
• ギガオーダー（動物学）^[36]
  • マグノオーダー（動物学）^[36]
    • Grandorderまたはcapaxorder（動物学）^[36]
      • ミラーオーダーまたはハイパーオーダー（動物学）^[36]
        • スーパーオーダー
          • シリーズ（魚類学）
            • 注文
              • パルバーダー目（いくつかの動物学分類における位置）
                • ナノオーダー（動物学）
                  • 亜目（動物学）
                    • マイナー目（動物学）
                      • 亜目
                        • インフラオーダー
                          • パルヴォーダー（通常の位置）、またはミクロオーダー（動物学）^[36]
• セクション（動物学）
  • サブセクション（動物学）
• ギガ科（動物学）
  • 大科（動物学）
    • グランドファミリー（動物学）
      • 動物学における上科
        • スーパーファミリー
          • 亜科（動物学）
            • シリーズ（チョウ目）
              • グループ（チョウ目）
                • 家族
                  • 亜科
                    • インフラファミリー
• スーパートライブ
  • 部族
    • サブ部族
      • インフラトライブ
• 超属
  • 属
    • 亜属
      • セクション（植物学）
        • サブセクション（植物学）
          • シリーズ（植物学）
            • サブシリーズ（植物学）
• 種の複合体
  • 種
    • 亜種、またはforma specialis（真菌の場合）、またはpathovar（細菌の場合）^[37]）
      • 変種または変種（植物学）; または形態または形態（動物学）または異常（鱗翅目学）
        • 亜変種（植物学）
          • 形態またはforma (植物学)
            • サブフォームまたはサブフォルマ（植物学）

ランクは主観的な相違に基づいて割り当てられており、自然界における変異の段階的性質を完全に反映するものではありません。これらの問題は、 1969年にランク付けの廃止を提唱したウィリー・ヘニングによってすでに認識されており、 ^[38]この立場は、わずか数年後にグラハム・C・D・グリフィスの支持を集めました。^[39]実際、これらのランク付けは固定主義的な文脈で提案され、進化の到来によりこのシステムの基盤が弱体化したことはかなり以前から認識されていました。1886年に出版されたアメリカ鳥類学会が採択した『北米の鳥類の命名法とチェックリストの規約』の序文には、「1842年[ストリックランド規約が起草された年]には、リンネの体系が科学の永続的な遺産ではないことや、数年後には進化論が、名前が付けられるべきものに対する人々の考えを根本的に変え、その基礎そのものを弱体化させることになるとは、誰も疑わなかったようだ」と書かれている。^[40]このようなランクは、ランクに基づく規約で要求されているという理由だけで使用されている。このため、一部の体系学者は、これを命名上のランクと呼ぶことを好む。^{[1] [6]}ほとんどの場合、より高次の分類群は、単に最も包括的な分類群が必然的に最初に出現したという理由だけで、さらに過去に遡って出現する。^{[41]さらに、いくつかの主要な分類群（}脊椎動物や被子植物など）の多様性は、他の分類群（菌類、節足動物、線虫など）の多様性よりもよく知られていますが、これは他の分類群よりも多様性が高いからではなく、他の分類群よりも簡単にサンプルを採取して研究できるため、または研究に対する関心と資金をより多く集めるためです。^{[42] [43]}

これらの多くの階級のうち、最も基本的な（または重要な）のは種であると多くの分類学者は考えているが、この意見は普遍的に共有されているわけではない。^{[44] [45] [46]}したがって、種は必ずしも他の階級の分類群よりも明確に定義されているわけではなく、実際、絶滅によって生じた表現型のギャップを考えると、実際にはその逆の場合が多い。^[6]理想的には、分類群はクレード、つまり議論されている生物の系統発生を表すことを意図しているが、これは動物学および植物学の規約の要件ではない。^[6]

すべての分類群に正式な階級がある分類は、系統発生に関する知識を適切に反映することはできない。階級に基づく（リンネの）命名法では、分類群の名前は階級に依存するため、階級のない分類群には名前を付けることができない。PhyloCodeの下で実施され、国際系統命名学会によってサポートされている系統命名法[47] [48] や限定名の使用などの代替アプローチは、この問題を回避し^ている。[ 50 ] ^{[ 51]}分類上の階級を進化樹に重ね合わせることの理論的な困難さは、ダーウィンの進化モデルによって例証される 境界パラドックスとして現れる。

属、科、またはその他の高等分類群（種より上のカテゴリーの分類群）を構成する種の数についての規則はない。^{[52] [53]}それは、生物学者が入手可能なすべての情報を用いて判断した自然なグループ（つまり、人為的ではなく、多系統的ではないグループ）でなければならない。異なる門で同等にランク付けされた高等分類群は、起源の時期、表現型の特殊性、または含まれる低ランクの分類群の数の点で必ずしも同等ではない（例えば、昆虫の科が何らかの形で軟体動物の科と進化的に比較可能であると想定するのは誤りである）。^{[53] [54] [6]}分類群をランク付けするために提唱されてきたすべての基準のうち、起源の年齢が最も頻繁に提唱されてきた。ウィリ・ヘニングは1966年にこれを提案したが^[9] 、 1969年に^[38]このシステムは実行不可能であると結論付け、絶対的なランクを廃止することを提案した。しかし、分類群の起源年齢（唯一の基準として、または主要な基準の1つとして）を使用して分類群をランク付けするという考えは、タイムバンドリングという名前で存続しており、今でも多くの著者によって提唱されています。^{[55] [56] [57] [58]}動物の場合、少なくとも門のランクは通常、特定の体制に関連付けられていますが、これもまた恣意的な基準です。^[要出典]

謎の分類群とは、より広い関係が不明または定義されていない分類群のことである。^[59] （Incertae sedisを参照。）

分類階層を記憶するのに役立つ頭字語がいくつかあります。例えば、「フィリップ王が素晴らしいスパゲッティを食べにやって来ました」などです。^[60] （分類記憶術を参照）。

• 繁殖
• 生命のカタログ（データベース）
• 系統分類学
• ランドレース
• 生命の樹（生物学）
• 同盟（分類）
• 株（生物学）