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インド・ヨーロッパ祖語（PIE）の音韻体系は、現存するインド・ヨーロッパ語族および消滅したインド・ヨーロッパ語族の類似点と相違点に基づいて、言語学者によって再構築されてきた。PIEは文字言語ではなかったため、言語学者はヒッタイト語、サンスクリット語、古代ギリシア語、ラテン語など、PIEの最も初期の子孫言語の証拠に頼って音韻体系を再構築する必要がある。
印欧祖語の音韻体系の抽象的な単位（すなわち、音素、あるいは伝統的な音韻論における音素）の再構築は、議論の余地はあるものの、概ね異論なく受け入れられている。しかし、それらの音声学的解釈を確立するのはより困難である。これは特に、母音、いわゆる喉頭音、口蓋音と軟口蓋音、有声破裂音と有声有気破裂音に当てはまる。
インド・ヨーロッパ祖語は、以下の音素を持つと再構されています。なお、音素にはアスタリスクが付いていますが、これは再構された言語からの音素であることを示しています。これらの音素が様々なインド・ヨーロッパ語族の言語にどのように反映されているかについては、インド・ヨーロッパ語族の音韻法則に関する記事を参照してください。
この表では、インド・ヨーロッパ祖語の転写にWiktionaryの表記法を使用しています。他の場所でよく見られる異表記は、以下の各節で個々の音素について示されています。上付き文字* ʰは有気音、上付き文字* ʷ は唇音化を表します。子音* yは口蓋半母音です（IPA表記は[ j ]であり、 [ y ]ではありません）。
インド・ヨーロッパ祖語はかつて、無声無気音、無声有気音、有声無気音、有声有気音（*t、*tʰ、*d、*dʰなど）の4つの破裂音系列で再構築されていました。より最近の再構築では、無声有気音を破裂音と喉頭音の連続として分析しているため、現在の標準的な再構築では、無声、有声、有声有気音という伝統的な音声学的記述を持つ3つの破裂音系列のみが含まれています。しかし、このような3部構成のシステムは、どの派生言語にも見られません（サンスクリット語には無声有気音系列を含む4つの区分があります）。また、確認されている言語全体で類型論的にもまれです。*b（下記参照）の欠如またはまれさも異例です。さらに、インド・ヨーロッパ祖語の語根には、無声有気音と有声有気音の破裂音を混ぜたり、2つの有声破裂音を含んだりすることを禁じる制約があります。こうした考察から、一部の学者は印欧祖語の破裂音体系について声門説を提唱し、有声破裂音を声門化音に、有声有気破裂音を無声音に置き換えている。声門化の直接的な証拠は限られているが、バルト・スラブ語におけるウィンターの法則など、間接的な証拠はいくつか存在する。
印欧祖語の* p、*b、*bʰ は、カバー記号Pでグループ化されています。 * bの音素的地位は議論の的となっています。 *b は語頭子音として現れないようです (下記で指摘する *bel- のような疑わしい語根を除いて)。一方、内部に *b を持つ再構築語根は通常、西欧語派に限定されており、印欧祖語におけるその妥当性に疑問を投げかけています。[ 1 ]
*b を含む少数の語根を、後の音韻発達の結果として説明しようとする試みもある。[ 2 ]提案されている発達には以下のようなものがある。
せいぜい、PIE * bは非常にマイナーな音素にとどまる。
標準的な再構成では、 * t、*d、*dʰ の3 つの歯冠破裂音が識別されます。これらは記号的にカバー記号Tでグループ化されます。
1 世紀以上前にBrugmann のGrundriß der vergleichenden Grammatik der indogermanischen Sprachenに記載されているような伝統的な再構成によれば、 PIE 用に3 つのシリーズの軟口蓋帆が再構成されています。
印欧祖語におけるこれらの音の実際の発音は定かではありません。現在の考えの一つは、「口蓋軟口蓋音」は実際には単純な軟口蓋音、つまり*[k]、*[ɡ]、*[ɡʱ]であり、「平軟口蓋音」はより後方で、おそらく口蓋垂子音として、つまり*[q]、*[ɢ]、*[ɢʱ]として発音されていたというものです。[ 3 ]唇軟口蓋音が単に「通常の軟口蓋音」の唇音化形態であった場合、それらは* [qʷ]、*[ɢʷ]、*[ɢʷʱ]と発音されたはずですが、サテム語が最初に「口蓋軟口蓋音」を移動させ、その後「通常の軟口蓋音」と「唇軟口蓋音」を融合させた場合、口蓋垂理論では唇軟口蓋音を* [kʷ]、*[ɡʷ]、*[ɡʷʱ] と発音することも可能です。この理論をさらに裏付けるには、Centum および satem 言語 § 異なる実現を参照してください。
別の説としては、印欧祖語には2つの系列（単純軟口蓋音と唇軟口蓋音）しか存在せず、口蓋化された軟口蓋音は元々サテム語における条件付き音変化として生じたというものがある。ケントゥム語とサテム語 § 軟口蓋音系列は2つのみ を参照。
サテム諸語では、唇軟口蓋音* kʷ, *gʷ, *gʷʰが通常の軟口蓋音系列* k, *g, *gʰと融合し、口蓋軟口蓋音* ḱ, *ǵ, *ǵʰは、個々の言語に応じて、歯擦摩擦音またはさまざまなタイプの破擦音になった。音韻条件によっては、脱口蓋化が起こり、サテム諸語でセントム反射のように見えるものが生じた。たとえば、バルト・スラブ語とアルバニア語では、共鳴音の前に口蓋軟口蓋音が脱口蓋化されたが、共鳴音の後に前舌母音が続く場合は例外であった。唇軟口蓋音の反射は、サテム諸語では通常の軟口蓋音の反射と一般的に区別がつかないが、唇音化の消失が痕跡を残している単語もあり、たとえば、後続の母音を u 色付けするなどしている。
一方、ケントゥム語群では、口蓋軟口蓋音* ḱ、*ǵ、*ǵʰが通常の軟口蓋音系列* k、*g、*gʰと融合し、唇軟口蓋音* kʷ、*gʷ、*gʷʰは一般的に区別されたままであった。ケントゥム語では、 boukólos 規則として知られる規則に従って、*w (またはその異音 *u) に隣接する唇軟口蓋音が脱唇化される。
唯一確実な印欧祖語の摩擦音素* sは、鋭い音だった。単独の歯擦音によくあるように、それは後退歯擦音として実現された可能性が高い。[ 4 ] *s には、 *nisdós (「巣」)などの単語で同化によって出現した有声異音* zがあり、後にいくつかの派生言語で音素化された。印欧祖語の語根の中には、語頭に* sが現れる変種を持つものもある。そのような* sはs-移動性と呼ばれる。
「喉頭音」は摩擦音であった可能性もあるが、その音声的実現については意見が一致していない。一般的には声門摩擦音、軟口蓋摩擦音、口蓋垂摩擦音、あるいは咽頭摩擦音（その名称の由来となったセム語族の喉頭音と同様）であったと考えられているが、これらの再構築された音素の少なくとも一部は、元々は声門破裂音または口蓋垂破裂音であった可能性も示唆されている。
カバー記号* H (「不明な喉頭音」も示す) でマークされた音素* h₁、*h₂、*h₃ (または* ə₁、*ə₂、*ə₃および* /ə/ )は、3 つの「喉頭音」音素を表します。
喉頭音素の音声値は議論の余地があり、その正確な音声値についてはさまざまな提案がなされてきました。 * h₂ は口の奥で発音される摩擦音を表し、 * h₃ は唇の丸めを示すということだけは確実に言えるという慎重な主張から、より明確な提案まで様々です。例えば、Meier-Brüggerは、 * h₁ = [h]、* h₂ = [χ]、* h₃ = [ɣ]または[ɣʷ]の実現は「ほぼ間違いなく正確である」と書いています。[ 5 ] * h₁ * h₂ * h₃についてよく引用されるもう 1 つの推測は[ʔ ʕ ʕʷ]です(例えば Beekes)。 Simon (2013) [ 6 ]は、ヒエログリフのルウィ語の記号 *19 は/ʔa/ ( /a/とは異なる)を表し、 * h₁の反射を表していると主張した。しかし、3 つの喉頭音すべてが最終的にいくつかの言語で声門閉鎖音として一緒になった可能性もある。バルト・スラブ語におけるこの発展の証拠は、母音後の喉頭音が最終的に「鋭音」(元々喉頭音で閉じられていない長い母音の「曲折音」レジスターとは対照的) として一般的に説明されるレジスターの区別に発展し、強勢の有無にかかわらずすべての長い音節で何らかの形でマークされていることから得られる。さらに、場合によっては、元の鋭音レジスターは、現代ラトビア語の「破裂音調」(つまり声門化した母音) によって反映される。
音韻論的な意味では、インド・ヨーロッパ祖語の共鳴音は、音節核（つまり音節的）にも音節外（つまり非音節的）にも現れる可能性のある音素でした。インド・ヨーロッパ祖語の共鳴音は、流音、鼻音、半母音から成ります。より具体的には、* r、*l、*n、*y（または* i̯）は非唇音共鳴音で、カバー記号Rでグループ化され、唇音共鳴音* m、*w（または* u̯）はカバー記号Mでマークされます。これらはすべて音節異音を持ち、* r̥、*l̥、*m̥、*n̥、*i、*uと転写され、一般的に子音間、語頭の子音の前、または語末の子音の後に使用されました。* iと* u は確かに音声上の母音でしたが、音韻論的には音節共鳴音として振る舞いました。[ ŋ ]は軟口蓋子音の前では* nの異音でした。
子孫言語において印欧祖語の子音が受けた変化には、以下のようなものがある。
サンスクリット語、ギリシャ語、ゲルマン語は、ラテン語も多少は含めて、印欧祖語の子音を再構する上で最も重要である。これらの言語はすべて、破裂音の3つの系列（無声、有声、有声有気音）を区別しているからである。ゲルマン語では、ヴェルナーの法則と唇口蓋音の変化（特にゴート語以外）によって、元の区別の一部が不明瞭になっている。しかし一方で、ゲルマン語はギリシャ語とサンスクリット語の両方に影響を与えるグラスマンの法則の異化の影響を受けない。ラテン語も3つの系列を区別しているが、主に語頭の有声有気音の区別を不明瞭にし（* gʰを除くすべてが/f/になる）、語中の多くの区別を縮約している。ギリシャ語は、他の言語では多くの位置で唇口蓋音を脱唇化する傾向があるため、唇口蓋音の再構において特に重要である。
アナトリア語とギリシャ語は、喉頭音の再構築において最も重要な言語である。アナトリア語は多くの喉頭音を直接保存している一方、ギリシャ語は他の多くの言語では喉頭音が消えてしまう位置（例えば単語の先頭）に喉頭音の痕跡を保存し、ほとんどの文脈で各喉頭音が他の喉頭音と異なる（いわゆる三重反射）ことを反映している。 バルト・スラブ語は、「鋭母音」と「曲折母音」の区別において比較的直接的に喉頭音が表現されているため、喉頭音の再構築において有用な場合がある 。古アヴェスター語は、喉頭語幹名詞における母音交替によって引き起こされる多くの遺物（例えば喉頭裂、喉頭吸引、喉頭伸長）を忠実に保存しているが、古アヴェスター語のコーパスの少なさが、その有用性をさらに高めることを妨げている。ヴェーダ・サンスクリット語は、同じ遺物を忠実に再現しているとは言えないものの、より多く保存しているため、時として有用となる。
インド・ヨーロッパ祖語にいくつの母音があったのか、あるいはそもそもこの言語で「母音」とみなされるものが何なのかについては議論がある。一般的には、少なくとも4つの母音セグメントが存在し、それらは通常* e、* o、* ē、* ō と表記されるという点で合意されている。これらはすべて、程度は異なるものの形態論的に制約を受けている。長母音は短母音よりも少なく、その形態論的制約は特に強いため、初期の段階では長さの対立がなく、わずか2つの母音（あるいは研究者によっては1つの母音のみ）の体系が存在した可能性が示唆される。
表面母音* iと* u は非常に一般的で、音節共鳴音* r̥、*l̥、*m̥、*n̥が存在したが、これらの音は通常、共鳴子音* y、*w、*r、*l、*m、*n の音節異音として分析される。[ 7 ]これらの音の音節バージョンと非音節バージョンは、*dóru (「木、木材」) (属格単数* dréwsおよび与格複数* drúmosで再構築) などの単語の屈折パラダイムや、動詞* yewg- (「くびきをつける、ハーネスをつける、結合する」 ) と同じ語根から* uで派生した名詞*yugóm (「くびきをつける」) などの単語の派生で交互に現れる。一部の著者（例えばRinge (2006) ）は、交替音素* yに加えて非交替音素* iを再構する十分な証拠があり、非交替音素* uについてはより弱い証拠があると主張している。[ 8 ]
さらに、すべての派生言語にはセグメント* aがあり、長母音を持つ言語には一般的に長母音/aː/、/iː/、/uː/があります。20 世紀半ばまで、PIE はこれらの母音すべてで再構築されていました。しかし、喉頭理論を取り入れた現代のバージョンでは、これらの母音は PIE 喉頭子音* h₁、*h₂、*h₃を含むシーケンスの後期の発展とみなされる傾向があります。たとえば、かつて PIE *āとして再構築されていたものは、現在では* eh₂として再構築されることが多く、*ī、*ūは現在*iH *uH (*H は任意の喉頭音を表す) として再構築され、*aにはさまざまな起源があり、その中には「音節的」[H̥] (母音に隣接していない任意の喉頭音) や「a 色付け」喉頭音* h₂eの隣にある* eなどがあります。 （発音上は印欧祖語の母音[a]を含んでいたかもしれないが、それは* eの異音であり、独立した音素ではない。）しかし、一部の研究者は、独立した音素*aを再構する必要があり、それは喉頭音に遡ることはできないと主張している。[ 9 ]
共鳴子音はどれも複合音節核の2番目の部分を構成でき、 * e、*o、*ē、*ōのいずれかの母音と二重母音を形成できます（ * owなど）。
一般的に、印欧祖語では語頭に母音を用いることは認められていなかった。以前の再構築で母音で始まる語は、現在では通常、3つの喉頭音のいずれかで始まると再構築されている。これらの喉頭音は、ヒッタイト語を除くすべての派生言語において、母音の前に（可能であれば母音に色を付けた後）消滅した。
特定の形態論的条件（例えば、印欧祖語の母音交替の結果）や音韻論的条件（例えば、共鳴音で終わる名詞の主格単数形の最後の音節、シグマ的アオリストの語根音節など。セメレーニの法則、スタングの法則を参照）により、母音* eと* oは長くなり、それぞれ長母音化段階の異形が生じる。したがって、単語の基本的な語彙形式には短母音しか含まれておらず、長母音* ēと* ō を含む形式は、確立された形態音韻論的規則から生じた。
母音の長母音化は初期インド・ヨーロッパ祖語では音韻的に条件付けられた変化であったかもしれないが、通常再構築されるインド・ヨーロッパ祖語の終焉直前の時期には、音韻的に正当化された結果として生じた長母音が音韻的に正当化されることなく類推的に他の形態に広がり始めたため、すべての長母音の出現を音韻的に予測することはもはや不可能である。*ph₂tḗr 「父」の韻律的に長い* eは、インド・ヨーロッパ祖語内で機能していた共時的な音韻規則であるセメレーニの法則の適用によって生じるが、 *pṓds 「足」の韻律的に長い* oは類推的に均一化された。
インド・ヨーロッパ祖語には、母音* aを持つ形態的に孤立した単語がいくつかあった可能性がある。例えば、*dap-「犠牲」（ラテン語daps、古代ギリシャ語dapánē、古アイルランド語dúas ）や、二重母音* ayの最初の部分として現れる*laywos「左」（ラテン語laevus、古代ギリシャ語laiós、OCS lěvъ）などである。 *a の音素的地位については激しく議論されてきた。Beekes [ 10 ]は「したがって、インド・ヨーロッパ祖語の音素* aの根拠はない」と結論付けている。彼の元教え子である Alexander Lubotsky も同じ結論に達している。[ 11 ]
ヒッタイト語の発見と喉頭音理論の発展後、以前の* aのほとんどすべての例は、喉頭音* h₂の前後に母音* eが続く形に還元できるようになった（これにより、以前に再構築された* aはそれぞれ短母音と長母音となる）。 * a を印欧祖語の音素として認識することに反対する以下の議論が挙げられる。
しかし、マンフレッド・マイヤーホーファー[ 12 ]のような他の研究者は、 * aと* āの音素は* h₂とは独立して存在していたと主張している。この音素は、 *albʰós（「白い」）、*átta（「父」）、*apó （「遠くへ」）などの再構築語に存在し、それぞれのヒッタイトの子孫によって喉頭音の欠如が示唆されている。𒀠𒉺𒀸 （al-pa-aš、「雲」）、𒀜𒋫𒀸 （at-ta-aš、「父」）、𒀀𒀊𒉺（a-ap-pa、「後ろ」）。
古代ギリシア語は、喉頭音による母音の色付けと長音化効果の後、元の後期印欧祖語の母音体系を最も忠実に反映しており、どの音節の母音にもほとんど変化がありませんが、特定の子音、特に* s、*w、* yの消失は、しばしば母音の連続した長音化または短縮を代償的に引き起こし、再構築を複雑にする可能性があります。
サンスクリット語とアヴェスター語では、 * e、* a、* oが単一の母音* aに統合されています(長母音にも同様の統合があります)。しかし、ギリシャ語よりもさらに忠実に PIE の長さの違い (特に母音交替による) を反映しており、ギリシャ語のような子音消失の問題はありません。さらに、* o はブルグマンの法則によって、* e は先行する軟口蓋音の口蓋化によって再構築されることがよくあります(インド・イラン祖語を参照)。
ゲルマン語派では、短母音* aと* o (ゲルマン祖語の*a へ) と長母音* āと* ō (ゲルマン祖語の *ō へ) の融合、および語頭以外の音節における* eと* iの融合が見られるが、(特にゴート語の場合) は依然として PIE 母音の再構に重要である。
アナトリア語とトカラ語の証拠は、その保守性ゆえに重要な意味を持つ場合があるが、解釈が難しい場合も多い。特にトカラ語は、複雑で広範囲にわたる母音の変化が見られる。
イタリック語派とケルト語派は、母音を一方的に融合させることはないが、母音変化が非常に広範囲に及ぶ（特にケルト語と初期ラテン語の極端な母音弱化）ため、やや有用性に欠ける。アルバニア語とアルメニア語は、比較的後世に記録された言語であり、他のインド・ヨーロッパ語族から多くの語彙を借用し、複雑で理解しにくい母音変化を持つため、最も有用性が低い。
原バルト・スラブ語では、短い* oと* aが融合した。しかし、元の* oまたは* aの別の反映が、ウィンターの法則により、一部の環境で長母音として保持されたと主張されている。その後、初期原スラブ語では* ōと* āが融合し、バルト諸語で保持された。さらに、一部のバルト・スラブ語におけるアクセントの違いは、印欧祖語後の長母音が真の印欧祖語の長母音段階に由来するのか、喉頭音の前での代償的長母音化の結果なのかを示している。
印欧祖語には自由ピッチアクセントがあり、どの音節にも現れる可能性があり、その位置はパラダイム内の異なる要素間でしばしば変化した（例えば、動詞パラダイムの単数形と複数形の間、あるいは名詞パラダイムの主格／対格と斜格の間など）。ピッチアクセントの位置は、特に通常の母音（/e/と/o/）とゼロ級母音（つまり母音の欠如）の間の母音交替の変動と密接に関連している。
一般的に、主題名詞と動詞（語根と語尾の間に「主題母音」、通常は /e/ または /o/ を持つもの）は固定アクセントを持ち、そのアクセントは（特定の名詞または動詞に応じて）語根または語尾のいずれかにありました。これらの単語は、活用形内で母音交替のバリエーションもありませんでした。（ただし、アクセントと母音交替は依然として関連していました。たとえば、語根アクセントを持つ主題動詞は語根に e 級母音交替を持つ傾向があり、語尾アクセントを持つ主題動詞は語根に 0 級母音交替を持つ傾向がありました。）一方、非主題名詞と動詞は通常、移動アクセントを持ち、語根にアクセントと完全な級を持つ強形（例：動詞の単数能動態、名詞の主格と対格）と、語尾アクセントと語根に 0 級を持つ弱形（例：動詞の複数能動態とすべての中動態、名詞の斜格）の間で変化しました。一方、一部の名詞や動詞は、母音交替が長音化と完全音化の間で変化し、アクセントが語根にほぼ固定されているという異なるパターンを示しました。これらはナルテン語幹と呼ばれます。名詞と動詞の両方に、追加のパターンが存在します。たとえば、一部の名詞（いわゆるアクロスタティック名詞、最も古い名詞の分類の1つ）は語根に固定アクセントがあり、母音交替がo音化とe音化の間で変化しますが、ヒステロダイナミック名詞は、語根がゼロ音化で、アクセントが接尾辞と語尾の間で変化し、接尾辞にそれに対応する母音交替の変化があります。
アクセントはヴェーダ語サンスクリット語と（名詞の場合）古代ギリシア語で最もよく保存されている。また、バルト・スラブ語（ラトビア語、リトアニア語、セルビア・クロアチア語など）のアクセントパターンにもある程度反映されている。他の印欧祖語、特にゲルマン語のヴェルナーの法則の変異など、いくつかの現象にも間接的に確認できる。他の言語（イタリック語やケルト語など）では、痕跡もなく失われてしまった。現代ギリシア語、バルト・スラブ語、そして（ある程度）アイスランド語を除けば、現代語には印欧祖語のアクセントの痕跡はほとんど残っていない。
インド・ヨーロッパ祖語には、多くの音韻規則が再構築されている。しかしながら、これらの規則の一部は、インド・ヨーロッパ祖語自体ではなく、派生言語において生じたものであるという主張もある。
ゼメレーニの法則は、共鳴音と母音に先行される語末のsまたはh₂を削除し、母音の代償的伸長を引き起こします。-VRs、-VRh₂ > VːR。例：
この規則は印欧祖語後期にはもはや有効ではなくなり、多くの潜在的な例が類推によって復元された。例えば、-men-で終わる中性名詞の属格単数は-mḗnではなく-mén-sと再構築された。これは共鳴音で終わる名詞の主格単数形、および中性集合名詞の主格対格にも文法化された。類推により、他の子音で終わるいくつかの名詞も主格単数形に長母音を獲得したが、可能な限り-s語尾を保持した。例: *pṓd-s、*dyḗw-s。
スタングの法則は、セメレーニの法則と同様に、語末子音の連続に影響を与えますが、結果として最後の子音ではなく、最後から2番目の子音が削除されます。具体的には、母音と語末のmの間にあるwは削除され、代償的な長音化が起こります：Vwm > *Vːm。
一部の言語学者は、末尾のmの前にh₂を削除する追加ルールを含めています: *Vh₂m > *Vːm。
印欧祖語では、一般的に同じ子音が2つ連続して現れることは許されなかった。そのような連続を避けるために、様々な規則が用いられた。
同じ共鳴音または*が連続して現れ、その前に母音が続く場合、どちらか一方が削除された。さらに、その連続が語末である場合は、直前の母音が代償的に長くなった。
歯音の連続では、それらの間に 挿入音*sが挿入された。 * h₁ed-ti '食べる' > * h₁etsti > ヒッタイト語ezzi。この規則はヒッタイト語で保存されており、クラスター *tst はz ([ts] と発音) と綴られる。このクラスターは、後の子孫 (ラテン語やゲルマン語など) ではしばしば -ss- に単純化された。サンスクリット語にはこの規則はない (代わりにバルトロメの法則が優先される) が、イラン語には存在する。 * h₁ed-ti '食べる' > サンスクリット語átti ; * bʰudʰ-to-s > サンスクリット語buddhá、ただしアヴェスター語busta。
共鳴音の後に歯音が続く場合、歯音のうち1つが削除される。どの歯音が削除されたかについては、証拠が食い違っている。
シーブスの法則はs-可動の特徴に関連している。有声または有気破裂音で始まる語根にs-可動が加えられると、その破裂音は無声化される。破裂音が有気音であった場合、一部の分岐では有気性を保持する可能性がある。例えば、 * bʰr̥Hg- > ラテン語fragor、しかし* sbʰr̥Hg- > * sp(ʰ)r̥Hg- > サンスクリット語sphūrjati
棘クラスターとは、歯音破裂音の後に軟口蓋音破裂音が続く一連の音のことです。アナトリア語とトカラ語以外のインド・ヨーロッパ語族では、棘クラスターは音位転換を起こし、多くの場合、歯音も歯擦音化します。たとえば、名詞*dʰéǵʰ-ōm、属格*dʰǵʰ-m-ésに対して、ヒッタイト語ではtēkan、tagnās、dagān、トカラ語ではtkaṃ、tkan- となりますが、これらの形はサンスクリット語ではkṣā́ḥ、古代ギリシア語ではkhthṓnとなります。サンスクリット語ではクラスター*kt がkṣに歯擦音化しますが、ギリシア語では音位転換のみです。
以下の事例は、メタセシスによって生じる可能性のある結果の一部を示している。
棘状子音群は、背側子音を伴うインド・イラン語の歯擦音が、他の特定の語派（特にギリシャ語）の歯茎破裂音に例外的に対応する同族語群の再構築において問題となった。上記の「熊」と「腐敗」はその例である。別の例としては、サンスクリット語のtákṣan「職人」とギリシャ語のtéktōn「大工」がある。喉頭理論の場合と同様に、これらの同族語群は、アナトリア語とトカラ語が印欧祖語と結びつく前に初めて注目され、初期の再構築では、これらの対応関係を説明するために新しい子音系列が想定された。1897 年の Brugmann の体系的な説明では、印欧祖語の子音体系に、背側子音を伴う子音群にのみ現れる一連の歯間音（どこにも直接証拠はない） *kþ *kʰþʰ *gð *gʰðʰ を追加した。「棘」という文字が使われたことから、これらのグループは「棘群」と呼ばれるようになった。
発見されたアナトリア語とトカラ語の証拠は、棘クラスターの元の形が実際には *TK であったことを示唆しており、アナトリア語とトカラ語以外の言語での発展には音位転換が関わっていた。これらの音位転換されたクラスターの 2 番目の要素の慣習的な表記 *þ *ð *ðʰ は今でも見られ、Fortson [ 13 ]を含む一部の人々は、歯間摩擦音が PIE のある段階で関与していたという見解を引き続き保持している。別の解釈 (例えば Vennemann 1989、[ 14 ] Schindler 1991 (非公式かつ未発表) [ 15 ] ) では、これらのセグメントを歯茎破擦音[t͡s d͡z]と特定している。この見解では、棘クラスターは TK > TsK > KTs として発展し、その後、娘言語で様々に発展した。この方法の利点は、最初の変化を上記の歯擦音化規則で特定でき、その後、あらゆる破裂音の前の歯破裂音の破擦音化に適用される範囲が広がることです。メルヒェルトは、楔形文字ルウィ語のīnzagan-「埋葬」、おそらく* h₁en dʰǵʰōm「土の中」からの[ind͡zɡan]を、このプロセスの中間段階を保存していると解釈しました。[ 13 ]
喉頭音理論が発展し、喉頭音の音変化の規則が解明されると、規則には多くの例外があることが明らかになった。特に、語頭以外の音節に現れる「音節的」喉頭音（旧称「schwa indogermanicum」）に関して例外があった。このような音節的喉頭音は、特定の派生言語で単純に削除されたと長らく示唆されてきた。これは特に、PIE の単語dʰugh₂tér-「娘」に基づいている。この単語は、いくつかの分派（例えばゲルマン語派、バルト・スラブ語派）に現れ、「音節的」/h₂/ の本来の /a/ の代わりに母音がない（英語の「daughter」、ゴート語のdaúhtarを参照）。しかし、母音交替の役割をよりよく理解し、どの語根に喉頭音があり、どの語根に喉頭音がないかをより明確に理解することで、この示唆は正しくないことが明らかになった。特に、中間音節の音節喉頭音がほとんどまたはすべての派生言語で消失する場合と、ゲルマン語派やバルト・スラブ語派でさえ消失しない場合がある。
このことから、PIEには共時的な「喉頭音削除」規則がいくつか存在し、特定の文脈では音節喉頭音が祖語の段階でも削除されていたという、より最近の考え方が生まれた。例えば、 * dʰugh̥₂tér-の場合、PIEには「強い」語幹* dʰugh̥₂tér-と「弱い」語幹* dʰugtr-の交替があり、後者の文脈では削除規則によって喉頭音が削除されたが、前者の文脈では削除されなかったと考えられる。娘言語における喉頭音を持つ形式（古代ギリシア語thugátēr、サンスクリット語duhitṛ）や喉頭音を持たない形式（ゴート語dauhtar、リトアニア語duktė̃）は、どちらか一方の祖語の類推による一般化によるものである。
これは新しい分野であり、その結果、削除規則の数と性質について合意が得られていません。さまざまな規則が提案されています。Ringe [ 16 ]は、次の 3 つの規則を最も可能性の高い候補として挙げています (C = 任意の子音、V = 任意の母音、H = 任意の喉頭音、R = 任意の共鳴音)。
これは喉頭音消失の根底にある実際の音韻規則の正確かつ完全な記述であるとは考えにくい。これらの規則は喉頭音消失のあらゆる可能性のあるケースを網羅しているわけではない（そのため、他にも多くの規則が提案されている）。例えば、願望接尾辞 *-h₁s- および *-h₁sy- の喉頭音は、阻害音の後では消失するが、共鳴音の後では消失しないように見える。いずれにせよ、特定の喉頭音消失が原言語の規則によるものか、後世の類推によるものかを判断するのは難しい。さらに、上記の規則群は共時的な音韻規則として、言語横断的な観点から予想されるよりも複雑であり、規則の一部がすでに「形態化」されている（o-段階名詞形成規則やy-現在形形成規則など、特定の構造の形態に組み込まれている）ことを示唆している。上述の、願望を表す接尾辞における喉頭音の脱落は、そのような形態化の一例と言えるだろう。
インド・ヨーロッパ祖語の語根は、ほとんどが(*s)(C)CVC(C)または(H)(C)CVC(C)という音節構造を持ち、[ 17 ] C は任意の子音、[ 18 ] V は任意の母音または音節子音、H は任意の喉頭音です。VC - のように見える語根は実際には HVC - であり(例*h₁es-、「である」)、CV - のように見える語根はCVH -です(例*steh₂-、「立つ」)。ただし、場合によっては、特に *h₁- で始まる語根の場合、見かけ上の VC- の語根の前に喉頭音が存在することを証明できないことがあります。インド・ヨーロッパ祖語では、語根の音節の先頭に*r-だけが存在することはほとんどなかったと考えられます (見かけ上の出現例は*Hr-でした)。喉頭音で終わる語根は、後の言語の子孫が*ḱerh₂-「混ぜる」のように二音節語根を生じ、それが後にギリシャ語でkeraになったことから、二音節語根と呼ばれることがある。[ 17 ]しかし、印欧祖語自体では、語根は常に単音節であった。語根は通常、音高階層に従っていたため、**ḱret- は語根になり得るが、**ḱetr- はなり得ない。語根にどのような子音が含まれるかを規定する制約もある。語根は 2 つ以上の有声子音を持つことはできない (例**gerd-は不可能)。また、語根は無声子音と有気子音の両方を持つことはできない (例**gʰet-は不可能)。ただし、語根が*s-で始まる場合は例外である(例*steygʰ-「行進する、上昇する」)。[ 17 ]
名詞接尾辞は、ほぼ常に-VC-または-CVC- の音節構造を持ちます。より複雑な構造も可能ですが、通常は母音がない（破母音化）（例：*-tuh₂t-）ものの、非常にまれです。母音の後に2つの子音が続く接尾辞は、常に*-tで終わります（例：*- ent-、*-went-）。
名詞の格語尾はほとんどの場合 - (C)(V)Cまたは - (C)Vの形をとりますが、例外のほとんどは複数形に現れます (例: *óHom )。動詞の語尾は通常 -(C)CV の形をとります (例: *-mi )。
インド・ヨーロッパ語族の母音交替は、インド・ヨーロッパ祖語における母音交替（すなわち、関連語の母音の変異、または同一語の異なる活用）の体系である。これは多くの形態論的プロセスで用いられ、通常は語尾の活用に付随する形で現れた。今日では、インド・ヨーロッパ語族において最も一般的な母音交替の源となっている。
インド・ヨーロッパ祖語の母音には、5つの異なる段階、つまり形態があり、以下の通りであった。
音節に単純な*eが含まれている場合は「e 級」または「完全級」と呼ばれ、音節に*ē が含まれている場合は「長母音 e 級」と呼ばれます。同様に、音節に*oが含まれている場合は「o 級」と呼ばれ、音節に*ō が含まれている場合は「長母音 o 級」と呼ばれます。音節に母音がまったく含まれていない場合は「ゼロ級」（「∅ 級」と表記されることもあります）と呼ばれます。母音 *u と *i はこのように交互に変化しないため、「非母音交替」または「母音交替しない」と呼ばれることが多く、場合によっては母音として全く呼ばれないこともあります。[ 18 ]
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