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| COX7B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | COX7B、APLCC、LSDMCA2、シトクロム c オキシダーゼサブユニット 7B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム：300885; MGI : 1913392;ホモロジーン: 1406;ジーンカード：COX7B; OMA :COX7B - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ミトコンドリアのシトクロム c 酸化酵素サブユニット 7B (COX7B) は、ヒトではCOX7B遺伝子によってコードされる酵素です。[5] COX7B は、シトクロム c 酸化酵素(COX)の核コード化サブユニットです。シトクロム c 酸化酵素 (複合体 IV ) は、シトクロム cから分子状酸素への電子の移動を連結し、ミトコンドリア内膜を横切る陽子電気化学的勾配に寄与する多サブユニット酵素複合体であり、ミトコンドリア呼吸鎖の末端酵素として機能します。[6]メダカの研究では、COX7B の破壊が線状皮膚病変を伴う小眼球症(MLS)、小頭症、ミトコンドリア病と関連していることが示されています。臨床的には、COX7Bの変異は、複数の先天異常を伴う線状皮膚欠陥と関連付けられています。[7]
構造
COX7BはX染色体のq腕の21.1番に位置し、3つのエクソンを持っています。[6] COX7B遺伝子は80個のアミノ酸からなる9.2 kDaのタンパク質を生成します。[8] [9] COX7Bはシトクロムc酸化酵素（COX）の核コード化ポリペプチド鎖の1つであり、ミトコンドリア遺伝子によってコード化された3つの触媒サブユニットと核遺伝子によってコード化された複数の構造サブユニットからなるヘテロマー複合体です。COX7Bによってコード化されたタンパク質はシトクロムc酸化酵素VIIbファミリーに属します。COX7Bは、位置1-24の24アミノ酸トランジットペプチドドメイン、位置25-32の8アミノ酸トポロジカルミトコンドリアマトリックスドメイン、位置33-59のらせん状の27アミノ酸膜貫通ドメイン、および位置60-80の21アミノ酸トポロジカル膜間ドメインを持っています。[ 10 ] [11] [12] [ 7 ] COX7Bは、染色体1、2、20、22にいくつかの擬似遺伝子を持つこともあります。[6]
関数
ミトコンドリア呼吸鎖の末端酵素であるシトクロム c 酸化酵素(COX) は、還元されたシトクロム cから酸素への電子伝達を触媒する。ミトコンドリアにコードされている COX のサブユニットは電子伝達に機能し、核にコードされているサブユニットは複合体の調節と組み立てに関与している可能性がある。COX7B核遺伝子はサブユニット 7B をコードしており、これは COX 複合体を取り囲む他のいくつかのタンパク質とともにミトコンドリア内膜に位置する。これはすべての組織に存在し、ウシの COX VIIb タンパク質と非常に類似していることが示されている。 [6] COX7B は、COX の組み立てと活性、ミトコンドリア呼吸鎖の機能、および脊椎動物の中枢神経系の適切な発達に重要であると考えられている。[7] [10] [11]
モデル生物
メダカ（別名メダカ）は日本のメダカで、 COX7B研究のモデル生物として使われてきました。モルフォリノノックダウン技術を用いることで、COX7BはCOXの組み立て、COXの活性、ミトコンドリア呼吸に不可欠であることが示されました。さらに、 COX7Bの相同遺伝子のダウンレギュレーションは、COX7Bの機能不全と線状皮膚病変を伴う小眼球症（MLS）、小頭症、ミトコンドリア疾患との間に関連がある可能性を示唆しています。メダカの研究は、中枢神経系の発達におけるミトコンドリア呼吸鎖複合体の進化的に保存された役割を示唆する可能性もあります。[7]
臨床的意義
COX7Bの変異は、複数の先天異常を伴う線状皮膚欠損と関連している。この疾患は、顔面および頸部の複数の線状皮膚欠損として現れる先天性皮膚無形成症の独特な形態であり、発育不良および低身長、小頭症、顔面異形を伴う。その他の臨床的特徴には、知的障害、爪異栄養症、心臓異常、横隔膜ヘルニア、泌尿生殖器異常、視神経乳頭蒼白および視覚誘発電位異常、脳梁無形成症、およびその他の中枢神経系異常がある。[10] [11]疾患に関連するCOX7B変異には、エクソン3のフレームシフトにつながるヘテロ接合性変異c.196delC 、イントロン1の新規アクセプター部位におけるヘテロ接合性スプライス変異c.41-2A>G、およびエクソン2のヘテロ接合性ナンセンス変異c.55C>Tが含まれます。さらに、メダカを使った実験では、 COX7Bが線状皮膚病変を伴う小眼球症（MLS）というX連鎖性、優性、男性致死性のミトコンドリア疾患と関連している可能性があることが示唆されています。[7]
インタラクション
COX7Bは、3つの共複合体相互作用を含む6つの二元タンパク質間相互作用を持つことが示されています。GNMT 、MYB 、 MT - CO1、HSCB、およびSLC25A13はすべてCOX7Bと相互作用することがわかっています。[13]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000131174 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031231 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ サドロック JE、ライトウラーズ RN、カパルディ RA、ショーン EA (1993 年 2 月)。 「ヒトチトクロムcオキシダーゼのサブユニットVIIbを特定するcDNAの単離」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - 遺伝子の構造と発現。1172 ( 1–2 ): 223– 5.土井:10.1016/0167-4781(93)90301-s。PMID 8382530。
- ^ abcd 「Entrez Gene: COX7B シトクロム c オキシダーゼ サブユニット VIIb」。
この記事には、パブリック ドメインであるこのソースからのテキストが組み込まれています。
- ^ abcde Indrieri A、van Rahden VA、Tiranti V、Morleo M、Iaconis D、Tammaro R、D'Amato I、Conte I、Maystadt I、Demuth S、Zvulunov A、Kutsche K、Zeviani M、Franco B (2012 年 11 月)。「COX7B の変異により線状皮膚病変を伴う小眼球症が引き起こされる、従来とは異なるミトコンドリア疾患」。American Journal of Human Genetics。91 ( 5): 942– 9。doi :10.1016/ j.ajhg.2012.09.016。PMC 3487127。PMID 23122588。
- ^ Yao, Daniel. 「心臓オルガネラタンパク質アトラス知識ベース (COPaKB) —— タンパク質情報」.amino.heartproteome.org . 2018年8月6日閲覧。[永久リンク切れ ]
- ^ Zong NC、Li H、Li H、Lam MP、Jimenez RC、Kim CS、Deng N、Kim AK、Choi JH、Zelaya I、Liem D、Meyer D、Odeberg J、Fang C、Lu HJ、Xu T、Weiss J、Duan H、Uhlen M、Yates JR、Apweiler R、Ge J、Hermjakob H、Ping P (2013 年 10 月)。「専門的な知識ベースによる心臓プロテオーム生物学と医学の統合」。Circulation Research。113 ( 9 ) : 1043– 53。doi : 10.1161 /CIRCRESAHA.113.301151。PMC 4076475。PMID 23965338。
- ^ abc 「COX7B - シトクロムc酸化酵素サブユニット7B、ミトコンドリア前駆体 - Homo sapiens (ヒト) - COX7B遺伝子とタンパク質」uniprot.org 。 2018年8月6日閲覧。 この記事には、CC BY 4.0 ライセンスに基づいて利用可能なテキストが組み込まれています。
- ^ abc 「UniProt: ユニバーサルタンパク質知識ベース」。核酸研究。45 (D1): D158 – D169 。 2017年1月。doi : 10.1093 /nar/gkw1099。PMC 5210571。PMID 27899622 。
- ^ Van Kuilenburg AB、Van Beeumen JJ、Van der Meer NM、Muijsers AO (1992 年 1 月)。「ヒトシトクロム c 酸化酵素のサブユニット VIIa、b、c。ヒト心臓におけるサブユニット VIIa の「心臓型」および「肝臓型」アイソフォームの同定」。European Journal of Biochemistry。203 ( 1– 2 ): 193– 9。doi : 10.1111 /j.1432-1033.1992.tb19847.x。PMID 1309697 。
- ^ 「検索語 COX7B で 6 つのバイナリ相互作用が見つかりました」。IntAct分子相互作用データベース。EMBL-EBI。2018年 8 月 25 日閲覧。
外部リンク
- UCSC ゲノム ブラウザのヒト COX7B ゲノムの位置と COX7B 遺伝子の詳細ページ。
さらに読む
- Lenka N、Vijayasarathy C、Mullick J、Avadhani NG (1998)。哺乳類シトクロム c 酸化酵素複合体をコードする核遺伝子の構造構成と転写制御。核酸研究と分子生物学の進歩。第 61 巻。pp. 309– 44。doi : 10.1016 / S0079-6603(08)60830-2。ISBN 978-0-12-540061-9. PMID 9752724。
- Stroh A、Kadenbach B (1986年4 月)。「シトクロム c 酸化酵素サブユニットにおける -SH 基の組織特異的および種特異的な分布」。European Journal of Biochemistry。156 ( 1): 199– 204。doi : 10.1111/j.1432-1033.1986.tb09568.x。PMID 3007143 。
- Possekel S、Marsac C、 Kadenbach B (1996 年 8 月)。「シトクロム c 酸化酵素関連リー症候群患者の線維芽細胞の生化学分析」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Basis of Disease。1316 ( 3): 153– 9。doi : 10.1016/ 0925-4439 (96)00005-1。PMID 8781533。
- ナイトマンス LG、ターンマン JW、ムイセルス AO、シュパイジャー D、ファン デン ボガート C (1998 年 6 月)。 「ヒト培養細胞におけるチトクロム-cオキシダーゼの集合」。欧州生化学ジャーナル。254 (2): 389–94 .土井: 10.1046/j.1432-1327.1998.2540389.x。PMID 9660196。
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