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| 名前 | |
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| IUPAC名
N 6 -メチルアデノシン
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| 体系的なIUPAC名
(2 R ,3 S ,4 R ,5 R )-2-(ヒドロキシメチル)-5-[6-(メチルアミノ)-9 H -プリン-9-イル]オキソラン-2,3-ジオール | |
| その他の名前
メートル6 A
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| 識別子 | |
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3Dモデル（JSmol）
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| チェビ |
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| ケムスパイダー |
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パブケム CID
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| ユニ |
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CompTox ダッシュボード ( EPA )
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| プロパティ | |
| Ｃ１１Ｈ１５Ｎ５Ｏ４ | |
| モル質量 | 281.272 グラムモル−1 |
特に記載がない限り、データは標準状態（25 °C [77 °F]、100 kPa）の材料に関するものです。
インフォボックス参照
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N 6 -メチルアデノシン（ m 6 A）は、1970年代に最初に同定され、部分的に特徴付けられました。 [1] [2] [3] [4] mRNAとDNAに豊富に存在する修飾です。 [5]一部のウイルス[4] [3] [6] [7]およびほとんどの真核生物（哺乳類[2] [1] [8] [9]昆虫[10]植物[11] [12 ] [13]および酵母[14] [15]）に見られます。また、 tRNA、 rRNA、および小さな核RNA（snRNA）のほか、 Xistなどのいくつかの長い非コードRNAにも見られます。 [16] [17]
アデノシンのメチル化は、 S-アデノシル-L-メチオニン（SAM）に結合するサブユニットであるMETTL3を含む大きなm6Aメチルトランスフェラーゼ複合体によって行われます。 [ 18] in vitroでは、このメチルトランスフェラーゼ複合体はGGACUを含むRNAオリゴヌクレオチドを優先的にメチル化し、 [ 19 ]同様の優先性がin vivoでラウス肉腫ウイルスゲノムRNA [20]およびウシプロラクチンmRNAのマッピングされたm6A部位で確認されました。[21]より最近の研究では、METTL14、[22] [23]ウィルムス腫瘍1関連タンパク質（WTAP ）、[22] [24] VIRMA [25]およびMETTL5など、哺乳類のm6Aメチルトランスフェラーゼ複合体の他の主要な構成要素が特徴付けられています。[26] 2010年にmRNA中のm6Aは動的かつ可逆的であるという推測がなされた後、[ 27 ] 2011年に最初のm6A脱メチル化酵素、脂肪量および肥満関連タンパク質（FTO）が発見され[ 28 ]この仮説が確認され、 m6A研究への関心が再燃した。後に2番目のm6A脱メチル化酵素alkBホモログ5（ALKBH5）も発見された。[29]
m 6 Aの生物学的機能は、RNA 上のメチル化アデノシンを特異的に認識する一群の RNA 結合タンパク質を介して媒介されます。これらの結合タンパク質は m 6 A リーダーと名付けられています。YT521 -B 相同 (YTH) ドメインファミリーのタンパク質 ( YTHDF1、YTHDF2、YTHDF3、およびYTHDC1 ) は、直接的な m 6 A リーダーとして特徴付けられ、保存された m 6 A 結合ポケットを持っています。[ 17] [30] [31] [32] [33]インスリン様成長因子 2 mRNA 結合タンパク質1、2 、および3 (IGF2BP1–3) は、新しいクラスの m 6 A リーダーとして報告されています。[34] IGF2BP はK 相同 (KH) ドメインを使用してm6A を含む RNA を選択的に認識し、その翻訳と安定性を促進します。[34]これらのm6Aリーダーは、 m6Aメチルトランスフェラーゼ（ライター）およびデメチラーゼ（イレイザー）とともに、ライターとイレイザーがRNA上のm6Aの分布を決定し、リーダーがm6A依存的な機能を媒介するという、m6A制御の複雑なメカニズムを確立します。m6Aは、 m6Aスイッチと呼ばれる構造スイッチを媒介することも示されています。[35]
mRNAへのm6Aの導入の特異性は、エクソン構造とエクソンジャンクション複合体によって制御される。エクソンジャンクション複合体は、近くのRNAをパッケージングし、m6Aメチルトランスフェラーゼ複合体によるメチル化から保護することにより、エクソン-エクソンジャンクション付近のm6Aメチル化を抑制する。エクソン-エクソンジャンクションおよびエクソンジャンクション複合体から離れた長い内部エクソンおよび末端エクソン内のm6A領域は抑制を免れ、メチルトランスフェラーゼ複合体によってメチル化される可能性がある。[36]
種の分布
酵母
出芽酵母（サッカロミセス・セレビシエ）では、 METTL3の相同遺伝子であるIME4の発現が窒素および発酵性炭素源の飢餓に反応して二倍体細胞で誘導され、mRNAのメチル化と正しい減数分裂および胞子形成の開始に必要である。 [14] [15]減数分裂の重要な初期調節因子であるIME1とIME2のmRNAは、IME4自体の転写物と同様にメチル化の標的であることが知られている。[15]
植物
植物では、 m6Aの大部分はポリ(A)テールの開始点の150ヌクレオチド以内に存在します。[37]
METTL3のシロイヌナズナ相同遺伝子であるMTAの変異は、胚を球状段階で停止させる。成熟した植物におけるm6Aレベルの90%以上の減少は、成長パターンの劇的な変化と花の恒常性異常につながる。[37]
哺乳類
ヒトおよびマウスRNAのm 6 Aマッピングにより、7,000以上のヒト遺伝子の転写産物中に18,000以上のm 6 A部位が特定されており、それらは[G/A/U][G>A]m 6 AC[U>A/C] [16] [17] [38]というコンセンサス配列を持ち、以前に特定されたモチーフと一致している。多くのmRNAにおける個々のm 6 A部位の局在は、ヒトとマウスの間で非常に類似しており、[16] [17]トランスクリプトーム全体の解析により、 m 6 Aは高度に進化的に保存された領域で見つかることが明らかになっている。[16] m 6 Aは長い内部エクソン内に見つかり、3' UTR内および終止コドンの周囲に優先的に濃縮されている。3' UTR内のm 6 Aは、マイクロRNA結合部位の存在とも関連しており、3' UTR内にm 6 A部位を含むmRNAの約2/3には、少なくとも1つのマイクロRNA結合部位もある。[16]すべてのm6A配列データを統合することにより、RMBaseと呼ばれる新しいデータベースは、RNA中のN6-メチルアデノシン（m6A）に対応するヒトおよびマウスゲノムの約200,000の部位を特定し、提供しました。 [ 38]
m6A-CLIP/IP [39] (略してm6A - CLIP )による正確なm6Aマッピングにより、マウスとヒトの複数の組織/培養細胞におけるmRNAの最後のエクソンにm6Aの大部分が位置することが明らかになりました。 [39]また、終止コドンの周囲にm6Aが濃縮されているのは、多くの終止コドンがm6Aが実際に濃縮されている最後のエクソンの開始部周辺に位置していることと偶然です。[39]最後のエクソンにm6Aが多く存在する(>=70%) ため、代替ポリアデニル化を含む3'UTR調節の可能性があります。[39] m6A-CLIPと厳密な細胞分画生化学を組み合わせた研究では、m6A mRNAの修飾は新生pre-mRNAに沈着し、スプライシングには必要ないが、細胞質のターンオーバーを特定することが明らかになりました。[40] [41]
m 6 Aは、発達中および細胞刺激に対する反応の両方で動的調節を受けやすい。マウス脳RNA中のm 6 Aの分析により、m 6 Aレベルは胚発生中は低く、成体になると劇的に増加することが明らかになった。[16] mESCおよびマウスの発達中、FTOはLINE1 RNA m 6 A脱メチル化を媒介し、結果として局所的なクロマチン状態および近傍の遺伝子転写に影響を及ぼすことが示された。 [42]さらに、m 6 Aメチルトランスフェラーゼのサイレンシングは、遺伝子発現および選択的RNAスプライシングパターンに重大な影響を及ぼし、 p53 （ TP53としても知られる）シグナル伝達経路およびアポトーシスの調節をもたらす。[17]
m 6 Aはヒト細胞や植物細胞のRループのRNA成分にも存在し、RNA:DNAハイブリッドの安定性の調節に関与している。Rループレベルを調節してさまざまな結果（Rループの分解と安定化）をもたらすことが報告されている。[43] [44]
生理学的プロセスにおける m 6 A メチル化の重要性は最近実証されました。細胞メチル化の薬理学的阻害、より具体的にはsiRNAを介した m 6 A メチラーゼMettl3のサイレンシングによる m 6 A メチル化の阻害は、概日周期の延長をもたらしました。対照的に、Mettl3の過剰発現は周期の短縮をもたらしました。哺乳類の概日時計は、約 24 時間周期で振動するように厳密に制御された転写フィードバック ループで構成されているため、時計遺伝子転写物内に m 6 A 部位が存在するため、m 6 A 依存性 RNA 処理の摂動に非常に敏感です。 [ 45 ] [ 46]マウス細胞における概日周期に対する全体的なメチル化阻害の影響は、細菌メチル代謝からの酵素の異所性発現によって防ぐことができます。この細菌タンパク質を発現するマウス細胞はメチル代謝の薬理学的阻害に耐性を示し、mRNA m6Aメチル化やタンパク質メチル化の減少は見られなかった。[ 47 ]
臨床的意義
様々な生理学的プロセスにおけるm 6 Aの多様な機能を考慮すると、m 6 A と数多くのヒト疾患との関連が見つかっても不思議ではありません。多くの疾患は、m 6 A の同族因子の突然変異または一塩基多型 (SNP) に起因しています。m 6 A と数多くの癌種との関連は、胃癌、前立腺癌、乳癌、膵臓癌、腎臓癌、中皮腫、肉腫、白血病などの報告で示されています。[48] [49] [50 ] [ 51 ] [52 ] [53] [54] [55] [ 56] [57] [58] [59]より多くのデータが得られれば、m 6 A が癌細胞の増殖に及ぼす影響はさらに深刻になる可能性があります。 METTL3の枯渇は癌細胞のアポトーシスを引き起こし、癌細胞の浸潤性を低下させることが知られていますが、[60] [61]低酸素によるALKBH5の活性化は癌幹細胞の濃縮を引き起こすことが示されている。[62] m 6 Aはエネルギー恒常性と肥満の調節にも示唆されており、FTOはエネルギー代謝と肥満の重要な調節遺伝子です。FTOのSNPは、ヒト集団のボディマス指数と肥満および糖尿病の発症に関連することが示されている。[63] [64] [65] [66] [67] FTOが前脂肪細胞の分化に及ぼす影響が示唆されている。[68] [69] [70] m 6 Aと神経疾患との関連も研究されている。例えば、神経変性疾患は m 6 A の影響を受ける可能性があります。同族ドーパミンシグナル伝達は FTO に依存し、主要なシグナル伝達転写産物の m 6 A メチル化が正しいことが示されているためです。 [71] m 6 Aの潜在的なリーダーであるHNRNPA2B1の変異は、神経変性を引き起こすことが知られています。[72] m 6 A リーダーの新しいクラスである IGF2BP1–3には、発癌機能があります。IGF2BP1–3 のノックダウンまたはノックアウトにより、ヒト癌細胞株における MYC タンパク質発現、細胞増殖、コロニー形成が減少しました。[34] m6A メチルトランスフェラーゼ複合体のメンバーであるZC3H13は、ノックダウンすると大腸癌細胞の増殖を著しく阻害しました。[73]
さらに、m 6 Aはウイルス感染に影響を与えることが報告されています。SV40、アデノウイルス、ヘルペスウイルス、ラウス肉腫ウイルス、インフルエンザウイルスなど多くのRNAウイルスは、ウイルスゲノムRNA上に内部m 6 Aメチル化を含むことが知られています。 [ 74]最近のいくつかの研究では、m 6 A調節因子が、ヒト免疫不全ウイルス（HIV）、B型肝炎ウイルス（HBV）、C型肝炎ウイルス（HCV）、ジカウイルス（ZIKV）などのRNAウイルスの感染、複製、翻訳、輸送の効率を制御していることが明らかになっています。[75] [76] [77] [78] [79] [80]これらの結果は、m 6 Aとその同族因子が、ウイルスのライフサイクルと宿主とウイルスの相互作用の調節に重要な役割を果たしていることを示唆しています。
m6A修飾はウイルス自体に影響を及ぼすだけでなく、自然免疫反応を阻害することもあります。例えば、HBVでは、m6A修飾が免疫系のパターン認識受容体であるRIG-1によるウイルスの認識を阻害することが示されています。修飾は、ユビキチン化やタンパク質発現レベルの変化などのメカニズムを介して下流のシグナル伝達経路を阻害することもあります。[80]
細菌では
M6A のメチル化は細菌にも広く見られ、 DNA の複製、修復、遺伝子発現、原核生物の防御 などの機能に影響を与えます。
複製において、M6A修飾は開始段階が起こるDNA領域をマークし、大腸菌のDamメチルトランスフェラーゼを介して正確なタイミングを制御します。[81] [82]別の酵素であるDamDNAメチラーゼは、特定のミスマッチを認識することで他の修復タンパク質に影響を与えるM6A修飾を使用してミスマッチ修復を制御します。[83]
DNA保護のいくつかのケースでは、M6Aメチル化（M4C修飾とともに）は、制限修飾システムを介して特定のエンドヌクレアーゼに影響を与え、バクテリオファージの影響を減少させることで、細菌DNAの保護に役割を果たします。そのような役割の1つは、制限酵素（タイプ1制限酵素）が攻撃するのと同じ標的部位を認識するメチルトランスフェラーゼを導入し、それを修飾して、そのような酵素が細菌DNAを攻撃するのを止めることです。[84] [85]
開発中
m 6 A 修飾は、他のエピジェネティックな変化とともに、真核生物の発生において重要な役割を果たすことが示されています。造血幹細胞(HSC)、神経幹細胞 (NSC)、始原生殖細胞(PCG) はすべて、成長および分化の過程で m 6 A 修飾を受けることが示されています。発生段階に応じて、HSC の修飾は、METTL3 の阻害または枯渇を介して上皮から造血への移行に影響を及ぼすことで、幹細胞の分化を促進または阻害することができます。NSC の m 6 A 修飾は、脳の大きさ、ニューロン形成、長期記憶、および学習能力の変化を引き起こす可能性があります。これらの変化は、多くの場合、METTLまたはYTHDFリーダーとライターのいずれかの阻害によって引き起こされます。生殖系では、m 6 A 修飾は母性から接合子への mRNA の移行を妨害し、配偶子形成と生殖能力の両方に悪影響を及ぼすことが示されています。 NSCと同様に、METTLファミリーおよびYTHDFファミリーのタンパク質の阻害は、これらの変化の触媒となることが多い。[86]
参考文献
- ^ ab Adams JM、Cory S (1975 年5 月)。 「マウス骨髄腫 mRNA の修飾ヌクレオシドと奇妙な 5' 末端」。Nature . 255 ( 5503): 28–33。Bibcode : 1975Natur.255 ... 28A。doi : 10.1038/255028a0。PMID 1128665。S2CID 4199864 。
- ^ ab Desrosiers R, Friderici K, Rottman F (1974年10月). 「Novikoff肝癌細胞由来のメッセンジャーRNAにおけるメチル化ヌクレオシドの同定」.米国科学アカデミー紀要. 71 (10): 3971–3975. Bibcode :1974PNAS...71.3971D. doi : 10.1073 /pnas.71.10.3971 . PMC 434308. PMID 4372599.
- ^ ab アローニ Y、ダール R、クーリー G (1979 年 10 月)。 「核サルウイルス 40 RNA のメチル化」。ウイルス学ジャーナル。32 (1): 52-60。土井：10.1128/JVI.32.1.52-60.1979。PMC 353526。PMID 232187。
- ^ ab Beemon K、Keith J (1977 年6月)。「ラウス肉腫ウイルスゲノムにおけるN6-メチルアデノシンの局在」。分子生物学ジャーナル。113 (1): 165–179。doi :10.1016/0022-2836(77)90047-X。PMID 196091 。
- ^ Ji P、Wang X、Xie N、Li Y ( 2018 )。「RNAとDNAのN6-メチルアデノシン：幹細胞の運命決定に関与するエピトランスクリプトミクスとエピジェネティクスのプレーヤー」。Stem Cells International。2018 ：3256524。doi：10.1155 / 2018/ 3256524。PMC 6199872。PMID 30405719。
- ^ Courtney DG、Kennedy EM、Dumm RE、Bogerd HP、Tsai K、Heaton NS、Cullen BR（2017年9月）。「インフルエンザAウイルス遺伝子発現および複製のエピトランスクリプトーム強化」。Cell Host & Microbe。22（3）：377–386.e5。doi ： 10.1016/ j.chom.2017.08.004。PMC 5615858。PMID 28910636。
- ^ Gokhale NS、McIntyre AB、 McFadden MJ、Roder AE、Kennedy EM、Gandara JA、他 (2016 年 11 月)。「フラビウイルス科ウイルス RNA ゲノムの N6-メチルアデノシンが感染を制御する」。Cell Host & Microbe。20 ( 5 ): 654–665。doi :10.1016/j.chom.2016.09.015。PMC 5123813。PMID 27773535 。
- ^ Wei CM、Gershowitz A、 Moss B（1976年1月）。「HeLa細胞mRNAの5'末端および内部メチル化ヌクレオチド配列」。生化学。15 （2）：397–401。doi ：10.1021/bi00647a024。PMID 174715 。
- ^ Perry RP、Kelley DE、Friderici K、Rottman F (1975年4月)。「L細胞メッセンジャーRNAのメチル化成分：5'末端の異常なクラスターの証拠」。Cell.4 (4):387–394.doi: 10.1016 / 0092-8674 ( 75 ) 90159-2.PMID1168101。
- ^ Levis R, Penman S (1978年4月). 「双翅目ショウジョウバエの細胞のポリ(A)+細胞質メッセンジャーRNAおよびポリ(A)+およびポリ(A)-異種核RNAの5'末端構造」.分子生物学ジャーナル. 120 (4): 487–515. doi :10.1016/0022-2836(78)90350-9. PMID 418182.
- ^ Nichols JL (1979). 「トウモロコシのポリ(A)含有RNA」. Plant Science Letters . 15 (4): 357–361. doi :10.1016/0304-4211(79)90141-X.
- ^ Kennedy TD、Lane BG (1979 年 6 月)。「小麦胚リボ核酸。XIII. 吸収小麦胚からのバルクポリ (AR) リッチ RNA 中のメチル置換ヌクレオシド成分と 5' 末端ジヌクレオチド配列」。Canadian Journal of Biochemistry。57 ( 6 ): 927–931。doi :10.1139/o79-112。PMID 476526。
- ^ Zhong S、Li H、Bodi Z、Button J、Vespa L、Herzog M、Fray RG (2008 年 5 月)。「MTA は、シロイヌナズナのメッセンジャー RNA アデノシンメチラーゼであり、性別特異的スプライシング因子の相同体と相互作用します」。The Plant Cell。20 ( 5 ) : 1278–1288。doi :10.1105/ tpc.108.058883。PMC 2438467。PMID 18505803 。
- ^ ab Clancy MJ、Shambaugh ME、Timpte CS、Bokar JA (2002 年 10 月)。「Saccharomyces cerevisiae の胞子形成誘導により mRNA に N6-メチルアデノシンが形成される: IME4 遺伝子の活性の潜在的メカニズム」。Nucleic Acids Research。30 ( 20 ) : 4509–4518。doi :10.1093/nar/gkf573。PMC 137137。PMID 12384598 。
- ^ abc Bodi Z、Button JD、Grierson D、Fray RG（2010年9月）。「mRNAメチル化の酵母ターゲット」。核酸研究。38 （16）： 5327–5335。doi ： 10.1093 /nar/gkq266。PMC 2938207。PMID 20421205。
- ^ abcdef Meyer KD、Saletore Y、Zumbo P、Elemento O、Mason CE、Jaffrey SR（2012年6月）。「mRNAメチル化の包括的分析により、3' UTRと終止コドン付近の濃縮が明らかになった」。Cell . 149 （7 ）：1635–1646。doi ： 10.1016 /j.cell.2012.05.003。PMC 3383396。PMID 22608085。
- ^ abcde Dominissini D, Moshitch-Moshkovitz S, Schwartz S, Salmon-Divon M, Ungar L, Osenberg S, et al. (2012年4月). 「m6A-seqで明らかにされたヒトおよびマウスのm6A RNAメチロームのトポロジー」. Nature . 485 (7397): 201–206. Bibcode :2012Natur.485..201D. doi :10.1038/nature11112. PMID 22575960. S2CID 3517716.
- ^ Bokar JA、Shambaugh ME、Polayes D 、 Matera AG、Rottman FM (1997 年 11 月)。「ヒト mRNA (N6-アデノシン)-メチルトランスフェラーゼの AdoMet 結合サブユニットの精製および cDNA クローニング」。RNA。3 ( 11 ): 1233–1247。PMC 1369564。PMID 9409616。
- ^ Harper JE、Miceli SM、Roberts RJ 、 Manley JL (1990 年 10 月)。「in vitro でのヒトmRNA N6-アデノシンメチラーゼの配列特異性」。核酸研究。18 (19): 5735–5741。doi : 10.1093 / nar /18.19.5735。PMC 332308。PMID 2216767。
- ^ Kane SE、Beemon K (1985 年 9 月)。「Rous 肉腫ウイルス RNA における m6A の正確な局在によりメチル化部位のクラスター化が明らかに: RNA 処理への影響」。分子細胞 生物学。5 (9): 2298–2306。doi :10.1128/ mcb.5.9.2298。PMC 366956。PMID 3016525。
- ^ Horowitz S, Horowitz A, Nilsen TW, Munns TW, Rottman FM (1984年9月). 「ウシプロラクチンmRNAにおけるN6-メチルアデノシン残基のマッピング」.米国科学アカデミー紀要. 81 (18): 5667–5671. Bibcode :1984PNAS...81.5667H. doi : 10.1073/pnas.81.18.5667 . PMC 391771. PMID 6592581 .
- ^ ab Liu J, Yue Y, Han D, Wang X, Fu Y, Zhang L, et al. (2014年2月). 「METTL3-METTL14複合体は哺乳類の核RNA N6-アデノシンメチル化を媒介する」. Nature Chemical Biology . 10 (2): 93–95. doi :10.1038/nchembio.1432. PMC 3911877. PMID 24316715 .
- ^ Wang Y、Li Y、Toth JI 、Petroski MD、 Zhang Z、Zhao JC (2014年2月)。「N6-メチルアデノシン修飾は胚性幹細胞の発達調節因子を不安定にする」。Nature Cell Biology。16 ( 2 ): 191–198。doi :10.1038/ncb2902。PMC 4640932。PMID 24394384。
- ^ Ping XL、Sun BF、Wang L、Xiao W、Yang X、Wang WJ、et al. (2014年2月)。「哺乳類WTAPはRNA N6-メチルアデノシンメチルトランスフェラーゼの調節サブユニットである」。Cell Research。24 ( 2 ) : 177–189。doi :10.1038 / cr.2014.3。PMC 3915904。PMID 24407421。
- ^ Schwartz S, Mumbach MR, Jovanovic M, Wang T, Maciag K, Bushkin GG, et al. (2014年7月). 「m6Aライターの摂動により、内部および5'部位での2つの異なるクラスのmRNAメチル化が明らかになった」. Cell Reports . 8 (1): 284–296. doi :10.1016/j.celrep.2014.05.048. PMC 4142486. PMID 24981863 .
- ^ van Tran N、Ernst FG、Hawley BR、Zorbas C、Ulryck N、Hackert P、et al. (2019年9月)。「ヒト18S rRNA m6AメチルトランスフェラーゼMETTL5はTRMT112によって安定化される」。核酸研究。47 ( 15 ): 7719–7733。doi :10.1093 / nar/gkz619。PMC 6735865。PMID 31328227 。
- ^ He C (2010年12月). 「グランドチャレンジ解説: RNAエピジェネティクス?」Nature Chemical Biology . 6 (12): 863–865. doi :10.1038/nchembio.482. PMID 21079590.
- ^ Jia G, Fu Y, Zhao X, Dai Q, Zheng G, Yang Y, et al. (2011年10月). 「核RNA中のN6-メチルアデノシンは肥満関連FTOの主要基質である」Nature Chemical Biology . 7 (12): 885–887. doi :10.1038/nchembio.687. PMC 3218240. PMID 22002720 .
- ^ Zheng G、Dahl JA、Niu Y、Fedorcsak P、Huang CM、Li CJ、他 (2013 年 1 月)。「ALKBH5 は、RNA 代謝とマウスの生殖能力に影響を与える哺乳類の RNA 脱メチル化酵素です」。Molecular Cell . 49 (1): 18–29. doi :10.1016/j.molcel.2012.10.015. PMC 3646334 . PMID 23177736。
- ^ Wang X, Lu Z, Gomez A, Hon GC, Yue Y, Han D, et al. (2014年1月). 「N6-メチルアデノシン依存性メッセンジャーRNA安定性調節」. Nature . 505 (7481): 117–120. Bibcode :2014Natur.505..117W. doi :10.1038/nature12730. PMC 3877715. PMID 24284625 .
- ^ Wang X, Zhao BS, Roundtree IA, Lu Z, Han D, Ma H, et al. (2015年6月). 「N(6)-メチルアデノシンはメッセンジャーRNAの翻訳効率を調節する」. Cell . 161 ( 6): 1388–1399. doi :10.1016/j.cell.2015.05.014. PMC 4825696. PMID 26046440.
- ^ Xu C, Wang X, Liu K, Roundtree IA, Tempel W, Li Y, et al. (2014年11月). 「YTHDC1 YTHドメインによるm6A RNAの選択的結合の構造的基礎」. Nature Chemical Biology . 10 (11): 927–929. doi :10.1038/nchembio.1654. PMID 25242552.
- ^ Xiao W, Adhikari S, Dahal U, Chen YS, Hao YJ, Sun BF, et al. (2016年2月). 「核m(6)AリーダーYTHDC1がmRNAスプライシングを制御する」. Molecular Cell . 61 (4): 507–519. doi : 10.1016/j.molcel.2016.01.012 . PMID 26876937.
- ^ abc Huang H, Weng H, Sun W, Qin X, Shi H, Wu H, et al. (2018年3月). 「IGF2BPタンパク質によるRNA N6-メチルアデノシンの認識はmRNAの安定性と翻訳を促進する」Nature Cell Biology . 20 (3): 285–295. doi :10.1038/s41556-018-0045-z. PMC 5826585 . PMID 29476152.
- ^ Liu N, Dai Q, Zheng G, He C, Parisien M, Pan T (2015年2月). 「N(6)-メチルアデノシン依存性RNA構造スイッチがRNA-タンパク質相互作用を制御する」. Nature . 518 (7540): 560–564. Bibcode :2015Natur.518..560L. doi :10.1038/nature14234. PMC 4355918. PMID 25719671 .
- ^ He PC, Wei J, Dou X, Harada BT, Zhang Z, Ge R, et al. (2023年2月). 「エクソン構造がmRNA m6A抑制と遺伝子発現を制御する」. Science . 379 (6633): 677–682. Bibcode :2023Sci...379..677H. doi :10.1126/science.abj9090. PMC 9990141. PMID 36705538 .
- ^ ab Bodi Z、Zhong S、Mehra S、Song J、Graham N、Li H、et al. (2012)。「アラビドプシスmRNAのアデノシンメチル化は3'末端と関連しており、レベルの低下は発達障害を引き起こす」 。Frontiers in Plant Science。3 : 48。doi : 10.3389 / fpls.2012.00048。PMC 3355605。PMID 22639649。
- ^ ab Sun WJ、Li JH、Liu S、Wu J、Zhou H、Qu LH、Yang JH (2016 年 1 月)。「RMBase: ハイスループット シーケンス データから RNA 修飾のランドスケープをデコードするためのリソース」。核酸研究。44 ( D1): D259 – D265。doi : 10.1093/nar/gkv1036。PMC 4702777。PMID 26464443 。
- ^ abcd Ke S、Alemu EA、Mertens C、Gantman EC、Fak JJ、Mele A、et al. (2015 年 10 月)。「m6A 残基の大部分は最後のエクソンにあり、3' UTR 調節の可能性を秘めている」。遺伝子 と発達。29 ( 19 ): 2037–2053。doi :10.1101/gad.269415.115。PMC 4604345。PMID 26404942。
- ^ Ke S、Pandya-Jones A、Saito Y、Fak JJ、Vågbø CB、Geula S、et al. (2017年5月)。「m6A mRNA修飾は新生pre-mRNAに蓄積され、スプライシングには必要ないが、細胞質ターンオーバーを指定する」。遺伝子と発達。31 ( 10): 990–1006。doi : 10.1101 /gad.301036.117。PMC 5495127。PMID 28637692。
- ^ Rosa-Mercado NA、Withers JB、 Steitz JA (2017年5月)。「m6A論争の解決：成熟mRNAのメチル化は動的ではないが、ターンオーバーを加速する」。遺伝子 と発達。31 (10): 957–958。doi : 10.1101/gad.302695.117。PMC 5495124。PMID 28637691。
- ^ Wei J, Yu X, Yang L, Liu X, Gao B, Huang B, et al. (2022年5月). 「FTOはmESCとマウスの発達においてLINE1 m6Aの脱メチル化とクロマチン調節を仲介する」. Science . 376 (6596): 968–973. Bibcode :2022Sci...376..968W. doi :10.1126/science.abe9582. PMC 9746489. PMID 35511947 .
- ^ アバキール A、ジャイルズ TC、クリスティーニ A、フォスター JM、ダイ N、スターザック M、他。 （2020年1月）。 「N6-メチルアデノシンはヒト細胞におけるRNA:DNAハイブリッドの安定性を調節します。」自然遺伝学。52 (1): 48-55。土井：10.1038/s41588-019-0549-x。PMC 6974403。PMID 31844323。
- ^ Abakir, A., Ruzov, A. Rループ制御におけるN6-メチルアデノシンの二重機能のモデル。Nat Genet (2024)。https://doi.org/10.1038/s41588-024-01905-5
- ^ Fustin JM、Doi M、Yamaguchi Y、Hida H、Nishimura S、Yoshida M、et al. (2013年11月)。「RNAメチル化依存性RNA処理が概日時計の速度を制御する」。Cell . 155 (4): 793–806. doi : 10.1016 /j.cell.2013.10.026 . PMID 24209618。
- ^ Hastings MH (2013年11月). 「m(6)A mRNAのメチル化：新たな概日リズムのペースセッター」. Cell . 155 (4): 740–741. doi : 10.1016/j.cell.2013.10.028 . PMID 24209613.
- ^ Fustin JM、Ye S、Rakers C、Kaneko K 、 Fukumoto K、Yamano M、et al. (2020年5月)。「メチル化欠損は細菌からヒトまで生物学的リズムを乱す」。Communications Biology。3 ( 1 ) : 211。doi : 10.1038/ s42003-020-0942-0。PMC 7203018。PMID 32376902。
- ^ Akilzhanova A、Nurkina Z、Momynaliev K、Ramanculov E、Zhumadilov Z、Rakhypbekov T、他 (2013 年 9 月)。「カザフスタンの乳がん患者におけるホモシステイン濃度の遺伝子プロファイルと決定要因」。抗がん研究。33 (9): 4049–4059。PMID 24023349 。
- ^ Reddy SM、Sadim M、Li J、Yi N、Agarwal S、Mantzoros CS、Kaklamani VG（2013年8月）。「乳がんと診断された患者の体重増加の臨床的および遺伝的予測因子」。British Journal of Cancer。109（4）：872–881。doi ：10.1038/ bjc.2013.441。PMC 3749587。PMID 23922112。
- ^ Heiliger KJ、Hess J、Vitagliano D、Salerno P、Braselmann H、Salvatore G、他 (2012 年 6 月)。「Trk-T1 トランスジェニックマウスで特定された甲状腺腫瘍形成の新規候補遺伝子」。 内分泌関連がん。19 ( 3): 409–421。doi : 10.1530/ERC-11-0387。PMID 22454401。
- ^ Ortega A、Niksic M、Bachi A、Wilm M、Sánchez L、Hastie N、Valcárcel J (2003年1月)。「選択的プレmRNAスプライシングにおける女性致死性(2)D/Wilms腫瘍抑制因子1関連タンパク質の生化学的機能」。The Journal of Biological Chemistry。278 ( 5): 3040–3047。doi : 10.1074/jbc.M210737200。hdl : 10261 / 162976。PMID 12444081。
- ^ Jin DI, Lee SW, Han ME, Kim HJ, Seo SA, Hur GY, et al. (2012年12月). 「神経膠芽腫におけるウィルムス腫瘍1関連タンパク質の発現と役割」. Cancer Science . 103 (12): 2102–2109. doi : 10.1111/cas.12022 . PMC 7659328. PMID 22957919.
- ^ Lin Y, Ueda J, Yagyu K, Ishii H, Ueno M, Egawa N, et al. (2013年7月). 「脂肪量および肥満関連遺伝子の変異と膵臓がんリスクとの関連：日本における症例対照研究」BMC Cancer . 13 :337. doi : 10.1186/1471-2407-13-337 . PMC 3716552 . PMID 23835106.
- ^ Casalegno-Garduño R、Schmitt A、Wang X、Xu X、Schmitt M (2010 年 10 月)。「白血病の免疫療法の新たな標的としてのウィルムス腫瘍 1」。移植手続き。42 (8): 3309–3311。doi : 10.1016 /j.transproceed.2010.07.034。PMID 20970678 。
- ^ Linnebacher M、Wienck A、Boeck I、Klar E (2010-03-18)。「U79260(FTO)の(-1)フレームによって生成されるMSI-H腫瘍特異的細胞傷害性T細胞エピトープの同定」。Journal of Biomedicine & Biotechnology。2010 : 841451。doi : 10.1155 /2010/ 841451。PMC 2842904。PMID 20339516。
- ^ Machiela MJ、Lindström S、Allen NE、Haiman CA、Albanes D、Barricarte A、他 (2012 年 12 月)。「乳がんおよび前立腺がんコホートコンソーシアムにおける 2 型糖尿病感受性変異体と進行性前立腺がんリスクの関連」。American Journal of Epidemiology。176 ( 12 ) : 1121–1129。doi :10.1093/aje/kws191。PMC 3571230。PMID 23193118 。
- ^ Long J, Zhang B, Signorello LB, Cai Q, Deming-Halverson S, Shrubsole MJ, et al. (2013-04-08). 「ゲノムワイド関連研究で特定されたアフリカ系アメリカ人女性の乳がんリスク変異体の評価」. PLOS ONE . 8 (4): e58350. Bibcode :2013PLoSO...858350L. doi : 10.1371/journal.pone.0058350 . PMC 3620157. PMID 23593120 .
- ^ Kaklamani V、Yi N、Sadim M、Siziopikou K、Zhang K、Xu Y、他 (2011 年 4 月)。「乳がんリスクにおける脂肪量と肥満関連遺伝子 (FTO) の役割 」。BMC Medical Genetics。12 : 52。doi : 10.1186 / 1471-2350-12-52。PMC 3089782。PMID 21489227。
- ^ Pierce BL、Austin MA、Ahsan H (2011 年 6 月)。「2 型糖尿病の遺伝的感受性変異と膵臓がんリスクの関連研究: PanScan-I データの分析」。Cancer Causes & Control。22 ( 6 ): 877–883。doi : 10.1007/s10552-011-9760-5。PMC 7043136。PMID 21445555。
- ^ Bokar JA (2005-01-01)。「真核生物mRNAにおけるメチル化ヌクレオシドの生合成と機能的役割」。Grosjean H (編)。「RNA機能の修正と編集による微調整」。Topics in Current Genetics。第12巻。Springer Berlin Heidelberg。pp. 141–177。doi :10.1007/ b106365。ISBN 9783540244950。
- ^ Lin S、Choe J、Du P、Triboulet R、Gregory RI（2016 年5月）。「m(6)AメチルトランスフェラーゼMETTL3はヒト癌細胞における翻訳を促進する」。 分子細胞。62（3）：335–345。doi ：10.1016/ j.molcel.2016.03.021。PMC 4860043。PMID 27117702。
- ^ Zhang C, Samanta D, Lu H, Bullen JW, Zhang H, Chen I, et al. (2016年4月). 「低酸素症は、HIF依存性およびALKBH5媒介によるNANOG mRNAのm⁶A脱メチル化によって乳がん幹細胞表現型を誘導する」。米国科学 アカデミー紀要。113 (14): E2047 –E2056。Bibcode :2016PNAS..113E2047Z。doi : 10.1073 / pnas.1602883113。PMC 4833258。PMID 27001847。
- ^ Loos RJ、Yeo GS (2014 年1 月)。「FTO の全体像: GWASで初めて特定された肥満遺伝子」。Nature Reviews。内分泌学。10 (1 ) : 51–61。doi : 10.1038 /nrendo.2013.227。PMC 4188449。PMID 24247219 。
- ^ Frayling TM、Timpson NJ、Weedon MN、Zeggini E、Freathy RM、Lindgren CM、他 (2007 年 5 月)。「FTO 遺伝子の一般的な変異はボディマス指数と関連しており、小児および成人の肥満の原因となる」。Science。316 ( 5826 ) : 889–894。Bibcode : 2007Sci ...316..889F。doi : 10.1126 /science.11 41634。PMC 2646098。PMID 17434869。
- ^ Wang L、Yu Q、Xiong Y、Liu L、Zhang X、Zhang Z、et al. (2013)。「FTO遺伝子の変異rs1421085が3～6歳の中国人小児の小児肥満に寄与」。肥満研究と臨床実践。7 ( 1 ): e14–e22。doi :10.1016/ j.orcp.2011.12.007。PMID 24331679 。
- ^ Kalnina I、Zaharenko L、Vaivade I、Rovite V、Nikitina-Zake L、Peculis R、他 (2013 年 9 月)。「FTO および TMEM18 付近の多型は 2 型糖尿病と関連し、糖尿病診断時の年齢を若くする傾向がある」。Gene . 527 ( 2): 462–468. doi :10.1016/j.gene.2013.06.079. PMID 23860325。
- ^ Karra E、O'Daly OG、Choudhury AI、Yousseif A、Millership S、Neary MT、他 (2013 年 8 月)。「FTO、グレリン、および脳の食物刺激応答障害の関連性」。The Journal of Clinical Investigation。123 ( 8 ): 3539–3551。doi :10.1172/jci44403。PMC 3726147。PMID 23867619。
- ^ Zhao X、Yang Y、Sun BF、Shi Y 、 Yang X、Xiao W、他 (2014 年 12 月)。「FTO 依存性の N6-メチルアデノシンの脱メチル化は mRNA スプライシングを制御し、脂肪生成に必要である」。Cell Research。24 ( 12 ) : 1403–1419。doi :10.1038/ cr.2014.151。PMC 4260349。PMID 25412662。
- ^ Merkestein M、Laber S、McMurray F、Andrew D、Sachse G、Sanderson J、他 (2015 年 4 月)。「FTO は有糸分裂クローンの拡大を制御することで脂肪生成に影響を与える」。Nature Communications。6 : 6792。Bibcode : 2015NatCo ... 6.6792M。doi : 10.1038/ncomms7792。PMC 4410642。PMID 25881961。
- ^ Zhang M, Zhang Y, Ma J, Guo F, Cao Q, Zhang Y, et al. (2015-07-28). 「FTO (脂肪量および肥満関連タンパク質) の脱メチル化活性は前脂肪細胞の分化に必要である」. PLOS ONE . 10 (7): e0133788. Bibcode :2015PLoSO..1033788Z. doi : 10.1371/journal.pone.0133788 . PMC 4517749. PMID 26218273 .
- ^ Hess ME、Hess S、Meyer KD、Verhagen LA、Koch L、Brönneke HS、他 (2013 年 8 月)。「脂肪量と肥満関連遺伝子 (Fto) はドーパミン作動性中脳回路の活動を調節する」。Nature Neuroscience。16 ( 8 ) : 1042–1048。doi :10.1038/nn.3449。PMID 23817550。S2CID 11452560 。
- ^ Kim HJ、 Kim NC、Wang YD、Scarborough EA、Moore J、Diaz Z、他 (2013 年 3 月)。「hnRNPA2B1 および hnRNPA1 のプリオン様ドメインの変異が多系統タンパク質障害および ALS を引き起こす」。Nature . 495 ( 7442 ) : 467–473。Bibcode :2013Natur.495..467K。doi :10.1038/nature11922。PMC 3756911。PMID 23455423 。
- ^ Wang ZL、Li B、Luo YX、Lin Q、Liu SR、Zhang XQ、他 (2018年1月)。「ヒトがんにおけるRNA結合タンパク質の包括的なゲノム特性評価」。Cell Reports . 22 (1): 286–298. doi : 10.1016/j.celrep.2017.12.035 . PMID 29298429。
- ^ Narayan P、Rottman FM (1992)。「mRNA のメチル化」。Nord FF (編)。酵素学および分子生物学の関連分野の進歩。酵素学および分子生物学の関連分野の進歩。第 65 巻。pp. 255–285。doi : 10.1002/ 9780470123119.ch7。ISBN 9780470123119. PMID 1315118。
- ^ Kennedy EM、Bogerd HP、Kornepati AV、Kang D、Ghoshal D、Marshall JB、他 (2016年5月)。「HIV-1 mRNAの転写後m(6)A編集はウイルス遺伝子発現を増強する」。Cell Host & Microbe。19 ( 5 ): 675–685。doi : 10.1016 /j.chom.2016.04.002。PMC 4867121。PMID 27117054。
- ^ Tirumuru N, Zhao BS, Lu W, Lu Z, He C, Wu L (2016年7月). 「HIV-1 RNAのN(6)-メチルアデノシンはウイルス感染とHIV-1 Gagタンパク質発現を制御する」. eLife . 5. doi : 10.7554/eLife.15528 . PMC 4961459. PMID 27371828 .
- ^ Lichinchi G、Gao S、Saletore Y、Gonzalez GM、Bansal V、Wang Y、他 (2016年2月)。「T細胞のHIV-1感染中のヒトおよびウイルスのm(6)A RNAメチロームのダイナミクス」。Nature Microbiology . 1 (4): 16011. doi :10.1038/nmicrobiol.2016.11. PMC 6053355 . PMID 27572442。
- ^ Lichinchi G、Zhao BS、Wu Y、Lu Z、Qin Y、He C、Rana TM（2016年11月）。「ジカウイルス感染時のヒトおよびウイルスRNAメチル化のダイナミクス」。Cell Host & Microbe。20（5）：666–673。doi ： 10.1016 /j.chom.2016.10.002。PMC 5155635。PMID 27773536。
- ^ Gokhale NS、McIntyre AB、 McFadden MJ、Roder AE、Kennedy EM、Gandara JA、他 (2016 年 11 月)。「フラビウイルス科ウイルス RNA ゲノムの N6-メチルアデノシンが感染を制御する」。Cell Host & Microbe。20 ( 5 ): 654–665。doi :10.1016/j.chom.2016.09.015。PMC 5123813。PMID 27773535 。
- ^ ab Moon, Jae-Su; Lee, Wooseong; Cho, Yong-Hee; Kim, Yonghyo; Kim, Geon-Woo (2024-02-28). 「B型肝炎ウイルスのライフサイクルの制御におけるN6-メチルアデノシンRNAメチル化の重要性」。Journal of Microbiology and Biotechnology . 34 (2): 233–239. doi :10.4014/jmb.2309.09013. ISSN 1738-8872. PMC 10940779 . PMID 37942519.
- ^ O'Brown, Zach Klapholz; Greer, Eric Lieberman (2016)、Jeltsch, Albert; Jurkowska, Renata Z. (編)、「N6-メチルアデニン: 保存された動的な DNA マーク」、DNA メチルトランスフェラーゼ - 役割と機能、vol. 945、Cham: Springer International Publishing、pp. 213–246、doi :10.1007/978-3-319-43624-1_10、ISBN 978-3-319-43624-1、PMC 5291743、PMID 27826841、2024-04-07取得
- ^ バルザローロ、メラニア;エンゲルス、サンダー。デ・ヨング、アンジャ・J。フランケ、カトカ。ヴァン・デン・バーグ、ティモ・Ｋ．ギュレン師、ムハメット F.アンドレア・アブブラッサー。ヤンセン、イーディス M.ファン・スティーンセル、バス;ウォーカーズ、モニカ C. (2021 年 3 月)。 「m6A メチル化は、配列特異的な方法でサイトゾル dsDNA 認識を強化します。」オープンバイオロジー。11 (3)。土井：10.1098/rsob.210030。ISSN 2046-2441。PMC 8101014。PMID 33715389。
- ^ ラグナタン、ナリーニ;ゴスワミ、サヤンタン。リーラ、ジャクー・Ｋ．パンディヤン、アプラタ。ゴウリシャンカール、ジャヤラマン（2019）。 「異常な染色体複製の防止における大腸菌Dam DNAメチラーゼの新たな役割」。核酸研究。47 (11): 5698–5711。土井：10.1093/nar/gkz242。PMC 6582345。PMID 30957852 。2024-04-07に取得。
- ^ Blow, Matthew J.; Clark, Tyson A.; Daum, Chris G.; Deutschbauer, Adam M.; Fomenkov, Alexey; Fries, Roxanne; Froula, Jeff; Kang, Dongwan D.; Malmstrom, Rex R.; Morgan, Richard D.; Posfai, Janos; Singh, Kanwar; Visel, Axel; Wetmore, Kelly; Zhao, Zhiying (2016-02-12). 「原核生物のエピゲノムランドスケープ」. PLOS Genetics . 12 (2): e1005854. doi : 10.1371/journal.pgen.1005854 . ISSN 1553-7404. PMC 4752239 . PMID 26870957.
- ^ Loenen, WAM; Dryden, DTF; Raleigh, EA; Wilson, GG (2014-01-01). 「タイプI制限酵素とその関連酵素」. Nucleic Acids Research . 42 (1): 20–44. doi :10.1093/nar/gkt847. ISSN 0305-1048. PMC 3874165. PMID 24068554 .
- ^ ジャン、シューリン;劉白陽。ニー、ジー。デュアン、リンカン。シオン、秋霞。ジン、ジシアン。ヤン、クイピン。チェン、ヨンビン(2021-02-21)。 「生物学的機能と疾患におけるm6A修飾の役割」。シグナル伝達と標的療法。6 (1): 74.土井:10.1038/s41392-020-00450-x。ISSN 2059-3635。PMC 7897327。PMID 33611339。