型番

型番
識別子
エイリアス	USP9X、DFFRX、FAF、FAM、MRX99、MRXS99F、ユビキチン特異的ペプチダーゼ 9、X 連鎖、ユビキチン特異的ペプチダーゼ 9 X 連鎖、XLID99
外部ID	オミム：300072; MGI : 894681;ホモロジーン: 3418;ジーンカード：USP9X; OMA :USP9X - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	X染色体（ヒト）
終わり	41,236,579 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	X染色体（マウス）
終わり	13,039,567 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	中前頭回; ; 二次卵母細胞; ; 小脳の傍小葉; ; 腹直筋の骨格筋組織; ; 小腸; ; 網状部; ; 小腸粘膜; ; 海綿骨; ; 正面ポール; ; 視床の外側核群;
	トップの表現
	二次卵母細胞; ; 性器結節; ; 受精卵; ; 黒質; ; 胎児の尾; ; 海馬歯状回顆粒細胞; ; 松果体; ; 心室帯; ; 上腕三頭筋; ; 一次視覚野;
	参照表現データの詳細
	; ;
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	システイン型ペプチダーゼ活性; 共SMAD結合; ペプチダーゼ活性; タンパク質結合; システイン型エンドペプチダーゼ活性; 加水分解酵素活性; チオール依存性脱ユビキチン化酵素; 脱ユビキチン化酵素活性; Lys48特異的脱ユビキチン化酵素活性;
細胞成分	細胞質; 細胞質; 細胞投影; 膜; 成長円錐;
生物学的プロセス	女性配偶子生成; ユビキチン依存性タンパク質分解プロセス; 染色体分離; ニューロンの移動; RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御; BMPシグナル伝達経路; タンパク質分解; 細胞分裂; 軸索伸展; 細胞周期; トランスフォーミング成長因子β受容体シグナル伝達経路; タンパク質のユビキチン化; タンパク質の脱ユビキチン化; ペルオキシソームへのタンパク質標的化; 概日リズムの調節; リズミカルなプロセス; タンパク質の安定化; タンパク質K48結合脱ユビキチン化; ユビキチン依存性タンパク質分解過程に関与するタンパク質の脱ユビキチン化; DNA脱メチル化の正の制御;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	8239
	22284
	ENSG00000124486
	ENSMUSG00000031010
	Q93008
	P70398
	NM_001039590 ; NM_001039591 ; NM_004652 ; NM_021906
	NM_009481
	NP_001034679 ; NP_001034680
	NP_033507
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

ユビキチンカルボキシル末端加水分解酵素FAF-Xは、ヒトではUSP9X遺伝子によってコードされる酵素である。^[5]^[6]

関数

この遺伝子はペプチダーゼC19 ファミリーのメンバーであり、ユビキチン特異的プロテアーゼに類似したタンパク質をコードします。この遺伝子は X 染色体上にあります。しかし、X 不活性化を免れます。

マウスの2細胞胚からUSP9Xを枯渇させると、胚盤胞の発達が停止し、割球の分割速度が遅くなり、細胞接着が損なわれ、細胞極性が失われます。また、USP9XはNotch、Wnt、EGF、mTORのシグナル伝達経路を介して発達プロセスに影響を及ぼす可能性が高いことも示唆されています。USP9Xは、胚、神経、造血幹細胞を含むマウスおよびヒトの幹細胞の研究で認識されています。^[7]未分化の前駆細胞と幹細胞では高い発現が維持され、分化が進むにつれて減少します。USP9Xは、突然変異によって直接的に、または間接的に多くの神経発達障害や神経変性疾患に関与していると考えられているタンパク質コード遺伝子です。3つの突然変異は、ニューロンの成長と細胞の移動の阻害を介してX連鎖知的障害と関連付けられています。アルツハイマー病、パーキンソン病、ハンチントン病などの神経変性疾患もUSP9Xに関連している。具体的には、USP9Xは、アルツハイマー病やその他のタウオパチーで病的な凝集体を形成する微小管関連タンパク質タウのリン酸化と発現の調節に関与している。^{[8]科学者らは、USP9Xノックアウト雄マウスから海馬ニューロンを単離したノックアウトモデルを作成した。このモデルでは、}野生型と比較して軸索の長さと樹状突起が43%減少していた。^[9]

インタラクション

USP9X は以下と相互作用することが示されています:

ベータカテニン^[10]
マーク4 ^[11]
MLLT4 ^[10]^[12]
ヌアク1 ^[11]
エルグ^[13]
CEP131 ^[14]

USP9X症候群

USP9X遺伝子の変異は、男性と女性の両方で神経発達性USP9X症候群を引き起こすことがわかっています。USP9Xはヒトで進化的に強く保存されており、変異を許容しません。これは、タンパク質のユビキチン化を逆転させ、それによって酵素分解を減らし、それらのタンパク質の寿命を延ばすというUSP9X酵素の重要な役割によるものです。^{[15] X染色体上にあるため、USP9X症候群は男性と比較して女性で異なる症状が現れます。女性では、遺伝子の1つのコピーの機能変異の喪失により}ハプロ不全が発生します。これは、USP9Xが通常は保護的なX不活性化プロセスを逃れるためです。その結果、「キャリア」の女性でも症候群を発症します。

USP9X症候群の女性に見られる変異には、USP9X遺伝子の1つのコピーの全体的または部分的な欠失、およびミスセンス変異または小さなインフレーム欠失変異が含まれます。^[15]女性に見られる症状には、知的障害、顔面異形成、言語障害などがあります。あまり一般的ではない症状には、低身長、脊柱側弯症、多指症、歯列の変化などがあります。^[16]女性は男性よりも症状の範囲が広く、これは男性に比べてUSP9X遺伝子変異の種類が幅広いためと考えられます。女性に時々見られるが男性にはほとんどまたはまったく見られないその他の症状には、股関節形成不全、心臓異形成、聴覚障害、異常な皮膚色素沈着などがあります。^[15]

生き残った男性に見られるUSP9X変異は、脳特有のプロセスのみの機能喪失を引き起こす。なぜなら、この遺伝子の機能が完全に失われると、胎児期に致命的となるからである。男性はX染色体を1本しか持たないため、この遺伝子のヘミ接合体である。罹患した男性に見られる症状には、知的障害、言語、発話、行動、視覚の問題、顔面異形症などがある。具体的な脳異常には、白質障害、薄い脳梁、脳室の拡大などがある。^[17]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000124486 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031010 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Jones MH、Furlong RA、Burkin H、Chalmers IJ、Brown GM、Khwaja O、Affara NA (1996)。「ショウジョウバエの発達遺伝子 fat facets には、X 染色体不活性化を免れ、Yq11.2 に関連配列を持つ Xp11.4 にヒト相同遺伝子がある」。Hum . Mol. Genet . 5 (11): 1695– 701. doi : 10.1093/hmg/5.11.1695 . PMID 8922996。
^ 「Entrez Gene: USP9X ユビキチン特異的ペプチダーゼ 9、X 連鎖」。
^ Murtaza M, Jolly LA, Gecz J, Wood SA (2015-01-01). 「La FAM fatale: USP9X の発達と疾患における役割」.細胞および分子生命科学. 72 (11): 2075– 2089. doi :10.1007/s00018-015-1851-0. ISSN 1420-682X. PMC 4427618. PMID 25672900 .
^ Köglsberger S, Cordero-Maldonado ML, Antony P, Forster JI, Garcia P, Buttini M, Crawford A, Glaab E (2016-12-01). 「ユビキチン特異的ペプチダーゼ9の性別特異的発現がタウ発現およびリン酸化を調節：タウオパチーへの潜在的影響」分子神経生物学. 54 (10): 7979– 7993. doi :10.1007/s12035-016-0299-z. PMC 5684262. PMID 27878758 .
^ 「OMIM エントリ - * 300072 - ユビキチン特異的プロテアーゼ 9、X 連鎖型; USP9X」。www.omim.org。2016年 4 月 12 日閲覧。
^ ab Taya S, Yamamoto T, Kanai-Azuma M, Wood SA, Kaibuchi K (1999年12月). 「脱ユビキチン化酵素Famはβ-カテニンと相互作用し、これを安定化する」. Genes Cells . 4 (12): 757– 67. doi : 10.1046/j.1365-2443.1999.00297.x . PMID 10620020. S2CID 85747886.
^ ab Al-Hakim AK、Zagorska A、Chapman L、Deak M、Peggie M、Alessi DR (2008年4月)。「USP9Xおよび非定型Lys(29)/Lys(33)結合ポリユビキチン鎖によるAMPK関連キナーゼの制御」(PDF)。Biochem . J. 411 ( 2): 249– 60. doi :10.1042/BJ20080067. PMID 18254724. S2CID 13038944.
^ 田谷 S、山本 T、加納 K、川野 Y、岩松 A、土屋 T、田中 K、金井東 M、Wood SA、Mattick JS、貝渕 K (1998 年 8 月)。「Ras ターゲット AF-6 は、fam 脱ユビキチン化酵素の基質です。」Ｊ．セルバイオル．142 (4): 1053–62 .土井:10.1083/jcb.142.4.1053。PMC 2132865。PMID 9722616。
^ Wang S, Kollipara RK, Srivastava N, Li R, Ravindranathan P, Hernandez E, Freeman E, Humphries CG, Kapur P, Lotan Y, Fazli L, Gleave ME, Plymate SR, Raj GV, Hsieh JT, Kittler R (2014). 「前立腺がんにおける脱ユビキチン化酵素阻害による発がん性転写因子ERGの除去」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 111 (11): 4251– 6. Bibcode :2014PNAS..111.4251W. doi : 10.1073/pnas.1322198111 . PMC 3964108 . PMID 24591637.
^ Li X, Song N, Liu L, Liu X, Ding X, Song X, Yang S, Shan L, Zhou X (2017-03-31). 「USP9X は中心体の複製を制御し、乳がんの発がんを促進する」. Nature Communications . 8 :14866 . Bibcode :2017NatCo...814866L. doi :10.1038/ncomms14866. ISSN 2041-1723. PMC 5380967. PMID 28361952 .
^ abc ジョリー LA、パーネル E、ガードナー AE、コルベット MA、ペレスフラド LA、ショー M、レスカ G、キーガン C、シュナイダー MC、グリフィン E、マイヤー F、キス C、ゲリン A、クロスビー K、ローゼンバウム K (2020) -12-09)。「ミスセンス変異によるUSP9X女性症候群への寄与」。npj ゲノム医療。5 (1): 53.土井:10.1038/s41525-020-00162-9。ISSN 2056-7944。PMC 7725775。PMID 33298948。
^ “USP9X”. Simons Searchlight . 2023年2月22日閲覧。
^ Johnson BV, Kumar R, Oishi S, Alexander S, Kasherman M, Vega MS, Ivancevic A, Gardner A, Domingo D, Corbett M, Parnell E, Yoon S, Oh T, Lines M, Lefroy H (2020-01-15). 「USP9X機能の部分的喪失は、TGFβシグナル伝達に収束する男性の神経発達および行動障害につながる」。生物精神医学。87 ( 2 ): 100– 112。doi : 10.1016 /j.biopsych.2019.05.028。ISSN 0006-3223。PMC 6925349。PMID 31443933。

さらに読む

D'Andrea A、Pellman D (1998)。「脱ユビキチン化酵素：新しいクラスの生物学的調節因子」。Crit . Rev. Biochem. Mol. Biol . 33 (5): 337– 52. doi :10.1080/10409239891204251. PMID 9827704。
Andersson B、Wentland MA、Ricafrente JY、Liu W、Gibbs RA (1996)。「改良されたショットガンライブラリ構築のための「ダブルアダプター」法」。Anal . Biochem . 236 (1): 107– 13. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474。
Yu W、Andersson B、Worley KC、Muzny DM、Ding Y、Liu W、Ricafrente JY、Wentland MA、Lennon G、Gibbs RA (1997)。「大規模連結cDNAシーケンシング」。Genome Res . 7 (4): 353–8 . doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174 。
ディアスネト E、コレア RG、ヴェルジョフスキーアルメイダ S、ブリオネス MR、永井 MA、ダシウバ W、ザーゴ MA、ボルディン S、コスタ FF、ゴールドマン GH、カルヴァーリョ AF、松隈 A、バイア GS、シンプソン DH、ブランスタイン A、デオリベイラ PS、ブッチャー P、ヨンギニール CV、オヘア MJ、ソアレス F、ブレンターニRR、レイス LF、デ・ソウザ SJ、シンプソン AJ (2000)。「ORF 発現配列タグを使用したヒトトランスクリプトームのショットガンシーケンス」。手順国立アカド。科学。アメリカ。97 (7): 3491– 6. Bibcode :2000PNAS...97.3491D。土井：10.1073/pnas.97.7.3491。PMC 16267。PMID 10737800。
Murray RZ、Jolly LA、Wood SA (2004)。「FAM 脱ユビキチン化酵素は上皮細胞内のタンパク質輸送の複数のポイントに局在し、そこで E カドヘリンおよびベータカテニンと結合する」。Mol . Biol. Cell . 15 (4): 1591– 9. doi :10.1091/mbc.E03-08-0630. PMC 379258. PMID 14742711 。
ボウメースター T、バウハ A、ラフナー H、アングランド PO、ベルガミニ G、クロートン K、クルシア C、エバーハルト D、ガグヌール J、ギデリ S、ホップ C、ヒューセ B、マンガーノ R、ミション AM、シルル M、シュレーグル J、シュワブ M 、スタイン MA、バウアー A、カサリ G、ドリューズ G、ギャビン AC、ジャクソン DB、ジョバティG、ノイバウアー G、リック J、クスター B、スーパーティフルガ G (2004)。「ヒト TNF-α/NF-κ B シグナル伝達経路の物理的および機能的マップ」。ナット。セルバイオル。6 (2): 97–105。土井:10.1038/ncb1086。PMID 14743216。S2CID 11683986 。
Fu GK、Wang JT、Yang J、Au-Young J、Stuve LL (2004)。「部分遺伝子のハイスループット拡張クローニングのためのcDNA末端の環状迅速増幅」。ゲノミクス。84 ( 1 ): 205– 10。doi :10.1016/ j.ygeno.2004.01.011。PMID 15203218 。
Rush J、Moritz A、Lee KA、Guo A、Goss VL、Spek EJ、Zhang H、Zha XM、Polakiewicz RD、Comb MJ (2005)。「がん細胞におけるチロシンリン酸化の免疫親和性プロファイリング」。Nat . Biotechnol . 23 (1): 94– 101. doi :10.1038/nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
Al-Hakim AK、Göransson O、Deak M、Toth R、Campbell DG、Morrice NA、Prescott AR、Alessi DR (2005)。「14-3-3 は LKB1 と連携して QSK と SIK の活性と局在を調節する」。J . Cell Sci . 118 (Pt 23): 5661– 73. doi :10.1242/jcs.02670. PMID 16306228. S2CID 17404931。
木村和也、若松A、鈴木裕、太田隆、西川隆、山下R、山本J、関根正、釣谷和、若栗博、石井S、杉山隆、斉藤和久、磯野裕、入江R、櫛田直、米山隆、大塚 R、神田 K、横井 T、近藤 H、我妻 M、村川 K、石田 S、石橋 T、高橋-藤井 A、棚瀬 T、永井 K、菊池 H、中井 K、磯貝哲、菅野 S (2006) 「転写調節の多様化: ヒト遺伝子の推定上の代替プロモーターの大規模な同定と特性評価」。ゲノム解析16 (1): 55–65。土井:10.1101/gr.4039406。PMC 1356129。PMID 16344560。
Beausoleil SA、Villén J、Gerber SA、Rush J、Gygi SP (2006)。「高スループットタンパク質リン酸化分析および部位局在化のための確率ベースのアプローチ」Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285– 92. doi :10.1038/nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
Mouchantaf R、Azakir BA、McPherson PS、Millard SM、Wood SA、Angers A (2006)。「ユビキチンリガーゼitchは、生体内および生体外で自己ユビキチン化されるが、脱ユビキチン化酵素FAM/USP9Xとの相互作用により分解から保護される」（PDF）。J . Biol. Chem . 281（50）： 38738– 47。doi：10.1074 /jbc.M605959200。PMID 17038327。
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). 「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」. Cell . 127 (3): 635–48 . doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000124486 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031010 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid8922996-5] Jones MH、Furlong RA、Burkin H、Chalmers IJ、Brown GM、Khwaja O、Affara NA (1996)。「ショウジョウバエの発達遺伝子 fat facets には、X 染色体不活性化を免れ、Yq11.2 に関連配列を持つ Xp11.4 にヒト相同遺伝子がある」。Hum . Mol. Genet . 5 (11): 1695– 701. doi : 10.1093/hmg/5.11.1695 . PMID 8922996。

[entrez-6] 「Entrez Gene: USP9X ユビキチン特異的ペプチダーゼ 9、X 連鎖」。

[7] Murtaza M, Jolly LA, Gecz J, Wood SA (2015-01-01). 「La FAM fatale: USP9X の発達と疾患における役割」.細胞および分子生命科学. 72 (11): 2075– 2089. doi :10.1007/s00018-015-1851-0. ISSN 1420-682X. PMC 4427618. PMID 25672900 .

[8] Köglsberger S, Cordero-Maldonado ML, Antony P, Forster JI, Garcia P, Buttini M, Crawford A, Glaab E (2016-12-01). 「ユビキチン特異的ペプチダーゼ9の性別特異的発現がタウ発現およびリン酸化を調節：タウオパチーへの潜在的影響」分子神経生物学. 54 (10): 7979– 7993. doi :10.1007/s12035-016-0299-z. PMC 5684262. PMID 27878758 .

[9] 「OMIM エントリ - * 300072 - ユビキチン特異的プロテアーゼ 9、X 連鎖型; USP9X」。www.omim.org。2016年 4 月 12 日閲覧。

[pmid10620020-10] Taya S, Yamamoto T, Kanai-Azuma M, Wood SA, Kaibuchi K (1999年12月). 「脱ユビキチン化酵素Famはβ-カテニンと相互作用し、これを安定化する」. Genes Cells . 4 (12): 757– 67. doi : 10.1046/j.1365-2443.1999.00297.x . PMID 10620020. S2CID 85747886.

[pmid18254724-11] Al-Hakim AK、Zagorska A、Chapman L、Deak M、Peggie M、Alessi DR (2008年4月)。「USP9Xおよび非定型Lys(29)/Lys(33)結合ポリユビキチン鎖によるAMPK関連キナーゼの制御」(PDF)。Biochem . J. 411 ( 2): 249– 60. doi :10.1042/BJ20080067. PMID 18254724. S2CID 13038944.

[pmid9722616-12] 田谷 S、山本 T、加納 K、川野 Y、岩松 A、土屋 T、田中 K、金井東 M、Wood SA、Mattick JS、貝渕 K (1998 年 8 月)。「Ras ターゲット AF-6 は、fam 脱ユビキチン化酵素の基質です。」Ｊ．セルバイオル．142 (4): 1053–62 .土井:10.1083/jcb.142.4.1053。PMC 2132865。PMID 9722616。

[pmid24591637-13] Wang S, Kollipara RK, Srivastava N, Li R, Ravindranathan P, Hernandez E, Freeman E, Humphries CG, Kapur P, Lotan Y, Fazli L, Gleave ME, Plymate SR, Raj GV, Hsieh JT, Kittler R (2014). 「前立腺がんにおける脱ユビキチン化酵素阻害による発がん性転写因子ERGの除去」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 111 (11): 4251– 6. Bibcode :2014PNAS..111.4251W. doi : 10.1073/pnas.1322198111 . PMC 3964108 . PMID 24591637.

[14] Li X, Song N, Liu L, Liu X, Ding X, Song X, Yang S, Shan L, Zhou X (2017-03-31). 「USP9X は中心体の複製を制御し、乳がんの発がんを促進する」. Nature Communications . 8 :14866 . Bibcode :2017NatCo...814866L. doi :10.1038/ncomms14866. ISSN 2041-1723. PMC 5380967. PMID 28361952 .

[:0-15] ジョリー LA、パーネル E、ガードナー AE、コルベット MA、ペレスフラド LA、ショー M、レスカ G、キーガン C、シュナイダー MC、グリフィン E、マイヤー F、キス C、ゲリン A、クロスビー K、ローゼンバウム K (2020) -12-09)。「ミスセンス変異によるUSP9X女性症候群への寄与」。npj ゲノム医療。5 (1): 53.土井:10.1038/s41525-020-00162-9。ISSN 2056-7944。PMC 7725775。PMID 33298948。

[16] “USP9X”. Simons Searchlight . 2023年2月22日閲覧。

[17] Johnson BV, Kumar R, Oishi S, Alexander S, Kasherman M, Vega MS, Ivancevic A, Gardner A, Domingo D, Corbett M, Parnell E, Yoon S, Oh T, Lines M, Lefroy H (2020-01-15). 「USP9X機能の部分的喪失は、TGFβシグナル伝達に収束する男性の神経発達および行動障害につながる」。生物精神医学。87 ( 2 ): 100– 112。doi : 10.1016 /j.biopsych.2019.05.028。ISSN 0006-3223。PMC 6925349。PMID 31443933。