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| エイリアス | TARDBP、ALS10、TDP-43、TAR DNA結合タンパク質 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム：605078; MGI : 2387629;ホモロジーン: 7221;ジーンカード：TARDBP; OMA :TARDBP - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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トランザクティブ応答DNA結合タンパク質43 kDa（TAR DNA結合タンパク質43またはTDP-43）は、ヒトではTARDBP遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5]
構造
TDP-43 は 414アミノ酸残基から成り、4 つのドメインから構成されています。1 つは残基 1～76 にまたがる N 末端ドメイン (NTD) で、明確な折り畳み構造を持ち、二量体またはオリゴマーを形成することが示されている[6] [7] 、もう 1 つは残基 106～176 にまたがる2 つの高度に保存された折り畳みRNA 認識モチーフ(RRM1) と残基 191～259 にまたがる 2 つの折り畳み RNA 認識モチーフ (RRM2) で、標的RNAとDNAに結合するのに必要である[8]、もう 1 つは残基 274～414 にまたがる非構造化 C 末端ドメイン (CTD) で、グリシンに富む領域を含み、タンパク質間相互作用に関与し、家族性筋萎縮性側索硬化症に関連する変異のほとんどを抱えている[9 ]
大きな可溶化タグを除いたタンパク質全体が精製されている。[10]全長タンパク質は二量体である。[10]二量体は2つのNTDドメイン間の自己相互作用により形成され、[6] [7]二量体化が伝播して高次オリゴマーを形成する可能性がある。[6]
このタンパク質配列には、核局在シグナル（NLS、残基82〜98）、以前の核輸出シグナル（NES残基239〜250）、および3つの推定カスパーゼ3切断部位（残基13、89、219）も含まれています。[10]
2021年12月にTDP-43の構造がクライオ電子顕微鏡法で解明された[11] [12]が、その後まもなく、 FTLD-TDPの文脈では、関与するタンパク質はTDP-43ではなく、 TMEM106B（これもクライオ電子顕微鏡法で解明されている）である可能性があると主張された[13] [14] 。
N末端ドメイン（NTD）
残基1と76の間に位置するNTDは、TDP-43の重合に関与している。[15]確かに、NTD間の頭同士の相互作用によって二量体が形成され、こうして得られたポリマーはpre-mRNA スプライシングを可能にする。[16]しかし、さらなるオリゴマー化はより毒性の蓄積をもたらす。二量体、より大きな形態、または単に安定化したモノマーへのこの重合プロセスは、モノマー、ホモ二量体、オリゴマー間のTDP-43構造平衡に依存している。したがって、TDP-43病変細胞では、TDP-43の過剰発現により、NTDが凝集する傾向が強くなる。これとは対照的に、正常細胞では、TDP-43の正常レベルによりNTDが折り畳まれ、凝集体やポリマーの形成が防止される。
最近では、このドメインはユビキチン様構造を持つことが判明しました。ユビキチン-1と27.6%の相同性を持ち、 β1 -β2- α1 -β3-β4-β5-β6 + 2* SO 4 2-フォームを持ちます。[17]ユビキチン様ドメインは通常、RNA / DNAに対する親和性が高いことが知られています。しかし、TDP-43のユニークなケースでは、ユビキチン様NTDがssDNAに直接結合します。この相互作用により、前述の構造平衡が非凝集型にシフトします。[18]
[1,80]に広がるドメインはソレノイドのような構造を持ち、凝集しやすいC末端領域間の相互作用を立体的に阻害する。[16]
これらすべてから、NTDとRNA認識モチーフ（後に定義される）が核酸と協調的に相互作用してTDP-43の生理学的機能を果たす可能性が示唆される。[19]
ミトコンドリア局在シグナル
TDP-43のアミノ酸配列には6つのミトコンドリア局在シグナル[20]がありますが、ミトコンドリア局在に必須なのはM1、M3、M5のみであることが示されています。実際、それらの除去はミトコンドリア局在の減少につながります。
これらの局在配列は次のアミノ酸に存在します。
M1：[35、41]、M2：[105、112]、M3：[146-150]、M4：[228、235]、M5：[294、300]、M6：[228、236]。
核局在シグナル（NLS）
核局在シグナル（NLS）ドメインは残基82と98の間に位置し、ALSにおいて極めて重要であり、このドメインの枯渇または変異（特にA90V）によってそれが証明され、核からの機能喪失を引き起こし、凝集を促進し、この2つのプロセスはTDP-43の毒性機能獲得につながる可能性が非常に高い。[16]
したがって、TDP-43の核局在は、その生理学的機能を果たすために絶対的に重要であることに留意することが極めて重要である。[19]
RNA認識モチーフ
RNA認識モチーフは残基105から181の範囲にあり、多くのhnRNPと同様に、TDP-43のRRMは、その機能を果たすために最も重要である高度に保存されたモチーフを包含している。両方のRRMは、β1-α1-β2-β3-α2-β4-β5というパターンに従っており、[16]これにより、mRNA / DNAの3'UTR（非翻訳末端領域）末端のU G / T Gリピート上のRNAとDNAの両方に結合することができる。[15]
これらの配列は主に、mRNA の処理、RNA のエクスポート、RNA の安定化を保証します。特にこれらの配列のおかげで、TDP-43 は自身の mRNA に結合し、自身の溶解性と重合を制御します。
RM2 について
RRM2は残基181から261までの範囲に広がっています。病理学的状態では、アポトーシスに関与する因子であるp65/NF-kBに結合することが顕著であり、そのため潜在的な治療標的となっています。さらに、D169G変異を伴う可能性があり、毒性封入体の形成を制御するための重要な切断部位が変化します。[21]
核輸出シグナル（NES）
核輸出シグナルは残基239と251の配列の間に位置し、TDP-43のシャトル機能に役割を果たしていると考えられており、最近予測アルゴリズムを使用して発見されました。[22]
不規則なグリシンリッチC末端ドメイン（CTD）
不規則グリシンリッチC末端ドメインは残基277と414の間に位置している。他の70種のRNA結合タンパク質と同様に、TDP-43は酵母プリオン配列に似たQ / Nリッチドメイン[344、366]を有する。この配列はプリオン様ドメイン（PLD）と呼ばれている。[23]
PLDは複雑性の低い配列であり、液-液相転移（LLP）を介して遺伝子制御を媒介し、RNP顆粒の組み立てを促進することが報告されている。[16]これらの顕微鏡で見えるRNP顆粒の形成は、より効果的な遺伝子制御プロセスを誘導すると考えられている。[24]
ここで注目すべきは、LLP は溶液を 2 つの異なる液相に分離し、それによって顆粒を形成する可逆的な現象であるということです。
TDP-43タンパク質グリシンリッチ領域（GRR）内の変異は、最近、さまざまな神経変性疾患に寄与する可能性がある関連因子として特定されており、最も顕著で一般的な神経変性疾患はALSであり、家族性ALSを引き起こす変異の約10％はTDP-43タンパク質に認定されています[25]
このCTDはTDP-43の病原性挙動において重要な役割を果たすことがしばしば報告されています。
RNPs顆粒はストレス反応において役割を果たしている可能性があり、そのため老化や持続ストレスにより、LLPが不可逆的な液体-固体相分離に変化し、ALSニューロンで特に見られる病理学的凝集体になる可能性がある。[26]
CTDの無秩序な構造は、アミロイド様のβシートを多く含む本格的な構造に変化し、プリオン様の特性を獲得する可能性がある。[16]
さらに、CTF は病気のニューロンによく見られる因子であり、毒性が高いと言われています。
しかし、いくつかの点については必ずしも合意が得られていないことに注意する必要がある。実際、TDP-43は疎水性構造のため分析が難しく、一部はやや曖昧なままである。リン酸化、メチル化、さらには結合の正確な部位は、まだ少しわかりにくい。[16]
関数
TDP-43は、染色体に組み込まれたTAR DNAに結合し、HIV-1の転写を抑制する転写抑制因子である。さらに、このタンパク質はCFTR遺伝子の交互スプライシングを制御する。特に、TDP-43は、CFTR遺伝子のイントロン8/エクソン9接合部とアポA-II遺伝子のイントロン2/エクソン3領域に結合するスプライシング因子である。[27] [28]同様の疑似遺伝子が20番染色体に存在する。[29]
TDP-43はDNAとRNAの両方に結合し、転写抑制、premRNAスプライシング、翻訳調節において複数の機能を持つことが示されています。最近の研究では、トランスクリプトーム全体の結合部位が特徴付けられ、ニューロン内で何千ものRNAがTDP-43に結合していることが明らかになりました。[30]
TDP-43はもともと、染色体に組み込まれたトランス活性化応答要素（TAR）DNAに結合し、HIV-1の転写を抑制する転写抑制因子として同定されました。[5]また、CFTR遺伝子とアポA-II遺伝子の交互スプライシングを制御することも報告されています。[31] [32]
脊髄運動ニューロンでは、TDP-43はヒトでは低分子量ニューロフィラメント（hNFL）mRNA結合タンパク質であることも示されています。[22]また、海馬ニューロンの樹状突起におけるニューロン活動応答因子であることも示されており、ニューロンにおけるmRNAの安定性、輸送、局所翻訳の調節に役割を果たしている可能性があることを示唆しています。[33]
亜鉛イオンは細胞内の内因性TDP-43の凝集を誘導できることが実証されている。[34]さらに、亜鉛はTDP-43のRNA結合ドメインに結合し、試験管内でアミロイド様凝集体の形成を誘導する可能性がある。[35]
DNA修復
TDP-43タンパク質は、多能性幹細胞由来の運動ニューロンにおけるDNA二本鎖切断（DSB）を修復する非相同末端結合（NHEJ）酵素経路の重要な要素である。[36] TDP-43はDSBに急速にリクルートされ、そこでXRCC4 - DNAリガーゼタンパク質複合体 のさらなるリクルートのための足場として機能し、その後DNA切断を封印する。TDP-43が枯渇したヒト神経幹細胞由来の運動ニューロン、および散発性ALS患者の脊髄標本では、DSBの蓄積が顕著で、NHEJのレベルが低下している。[36]
臨床的意義
TDP-43の過剰リン酸化、ユビキチン化、切断された形態（病的TDP43として知られる）は、ユビキチン陽性、タウ、αシヌクレイン陰性前頭側頭型認知症（FTLD-TDP、以前はFTLD-Uと呼ばれていました[37]）および筋萎縮性側索硬化症（ALS）における主要な疾患タンパク質です。[38] [39] TDP-43タンパク質のレベルの上昇は、慢性外傷性脳症と診断された個人でも特定されており、ALSとの関連も示唆されているため、複数回の脳震盪やその他のタイプの頭部損傷を経験したアスリートは、脳症と運動ニューロン疾患（ALS）の両方のリスクが高いと推論されています。[40] TDP-43の異常は、アルツハイマー病患者の重要なサブセットでも発生し、臨床的および神経病理学的特徴指標と相関しています。[41]誤って折り畳まれたTDP-43は、認知症の一種である大脳辺縁系優位の加齢性TDP-43脳症（LATE）を患う85歳以上の高齢者の脳で発見されています。新しいモノクローナル抗体2G11と2H1は、過剰リン酸化エピトープに依存せずに、神経変性疾患全体で発生するさまざまなTDP-43封入体タイプを特定するために開発されました。[42]これらの抗体は、RRM2ドメイン（アミノ酸残基198〜216）内のエピトープに対して作製されました。[42]
TARDBP遺伝子の変異は、前頭側頭葉変性症や筋萎縮性側索硬化症（ALS）などの神経変性疾患に関連している。 [43]特に、TDP-43変異体M337VおよびQ331Kは、ALSにおける役割について研究されている。[44] [45] [46] TDP-43の異常な誤局在と細胞質凝集は、TDP-43病理を伴うFTLD（FTLD-TDP）の特徴であるが、最近の研究では、ヒトのFTLD-TDP脳に見られるアミロイド線維は、TDP-43ではなく、膜貫通リソソームタンパク質TMEM106bで構成されていることが示唆されている。 [47]細胞質TDP-43病理は、多系統タンパク質症の主な組織病理学的特徴である。[48] C末端領域の凝集に重要な役割を果たすN末端ドメインは、2つの負に帯電したループを持つ新しい構造をしています。[49]最近の研究では、細胞ストレスが生体内の脊髄運動ニューロンにおけるTDP-43の異常な細胞質誤局在を引き起こす可能性があることが実証されており、散発性ALS患者におけるTDP-43病理がどのように発症するかについての洞察が得られています。[50]
数字
(B) TDP-43 タンパク質は RNA 代謝の媒介に不可欠です。核内では、TDP-43はメッセンジャーRNA（mRNA）の転写とスプライシング、RNAの安定性（pA）の維持、核への輸送に重要です。さらに、TDP-43はマイクロRNA（miRNA）の生合成と長い非コードRNA（lncRNA）の処理を制御します。主に核内に存在しますが、TDP-43は核と細胞質の間を往復します。細胞質では、TDP-43はmRNAの安定性、翻訳、ストレスおよびリボ核タンパク質（RNP）輸送顆粒の形成に関与しています。de Boer et al.、2020によるレビューより。[51]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000120948 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000041459 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ ab Ou SH、Wu F、Harrich D、García-Martínez LF、Gaynor RB (1995 年 6 月)。「ヒト免疫不全ウイルス 1 型 TAR DNA 配列モチーフに結合する新規細胞タンパク質 TDP-43 のクローニングと特性評価」。Journal of Virology。69 ( 6 ) : 3584–3596。doi :10.1128/JVI.69.6.3584-3596.1995。PMC 189073。PMID 7745706 。
- ^ abc Afroz T、Hock EM、Ernst P、Foglieni C、Jambeau M、Gilhespy LA、他 (2017 年 6 月)。「ALS 関連タンパク質 TDP-43 の機能的かつ動的重合は、その病的な凝集を抑制する」。Nature Communications。8 ( 1 ): 45。Bibcode : 2017NatCo ... 8 ...45A。doi : 10.1038/s41467-017-00062-0。PMC 5491494。PMID 28663553。
- ^ ab Wang A, Conicella AE, Schmidt HB, Martin EW, Rhoads SN, Reeb AN, et al. (2018年3月). 「単一のN末端リン酸化物質がTDP-43の重合、相分離、およびRNAスプライシングを阻害する」. The EMBO Journal . 37 (5): e97452. doi :10.15252/embj.201797452. PMC 5830921. PMID 29438978 .
- ^ アルカルデ AI、バルシーナ Y、ララルデ J、イルンダイン A (1986 年 3 月)。 「ラット小腸における糖輸送に及ぼすフロレチンにおけるカルシウムの役割」。Revista Espanola de Fisiologia。42 (1): 23-28。土井：10.1038/nsmb.2698。PMID 2424061。S2CID 13783277 。
- ^ Conicella AE、Zerze GH、Mittal J、Fawzi NL（2016年9月）。「ALS変異はTDP-43の低複雑性C末端ドメインにおけるαヘリカル構造を介した相分離を破壊する」。構造。24 （9）：1537–1549。doi ：10.1016/ j.str.2016.07.007。PMC 5014597。PMID 27545621。
- ^ abc Vivoli Vega M、Nigro A、Luti S、Capitini C、Fani G、Gonnelli L、et al. (2019年10月)。「神経変性に関連する可溶性ヒト全長TDP-43の単離および特性評価」。FASEB ジャーナル。33 ( 10 ):10780–10793。doi : 10.1096 /fj.201900474R。PMID 31287959。
- ^ Arseni D, Hasegawa M, Murzin AG, Kametani F, Arai M, Yoshida M, Ryskeldi-Falcon B (2022年1月). 「FTLDを伴うALSの病理学的TDP-43フィラメントの構造」. Nature . 601 (7891): 139–143. Bibcode :2022Natur.601..139A. doi :10.1038/s41586-021-04199-3. PMC 7612255. PMID 34880495 .
- ^ 「ALSタンパク質が明らかに」www.science.org . 2022年4月4日閲覧。
- ^ Jiang YX、Cao Q、Sawaya MR、Abskharon R、Ge P、DeTure M、et al. (2022年3月). 「FTLD-TDP疾患のアミロイド線維はTDP-43ではなくTMEM106Bで構成されている」。Nature . 605 ( 7909): 304–309. doi :10.1038/s41586-022-04670-9. PMC 9844993. PMID 35344984. S2CID 247777613 .
- ^ 「前頭側頭型認知症：私たちが考えていたタンパク質ではない」www.science.org 。 2022年4月4日閲覧。
- ^ ab Qin H, Lim LZ, Wei Y, Song J (2014年12月). 「TDP-43 N末端は、ssDNAへの結合によってシフトできる、新しいユビキチン様フォールドとその平衡状態の非フォールド形態をコードしている」。Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 111 (52): 18619–18624. Bibcode :2014PNAS..11118619Q. doi : 10.1073/pnas.1413994112 . PMC 4284588 . PMID 25503365.
- ^ abcdefg Prasad A、Bharathi V、Sivalingam V、Girdhar A、Patel BK (2019-02-14)。「TDP-43ミスフォールディングの分子メカニズムと筋萎縮性側索硬化症の病理」。分子神経 科学のフロンティア。12 :25。doi : 10.3389 / fnmol.2019.00025。PMC 6382748。PMID 30837838。
- ^ 「TARDBP TAR DNA結合タンパク質[ホモサピエンス（ヒト）] - 遺伝子 - NCBI」。www.ncbi.nlm.nih.gov 。 2021年12月13日閲覧。
- ^ Qin H, Lim LZ, Wei Y, Song J (2014年12月). 「TDP-43 N末端は、ssDNAへの結合によってシフトできる、新しいユビキチン様フォールドとその平衡状態の非フォールド形態をコードしている」。Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 111 (52): 18619–18624. Bibcode :2014PNAS..11118619Q. doi : 10.1073/pnas.1413994112 . PMC 4284588 . PMID 25503365.
- ^ ab Ratti A, Buratti E (2016年8月). 「TDP-43およびFUS/TLSタンパク質の生理機能と病理生物学」. Journal of Neurochemistry . 138 (Suppl 1): 95–111. doi : 10.1111/jnc.13625 . PMID 27015757. S2CID 12679353.
- ^ Huang C、Yan S、Zhang Z（2020年10月） 。「TDP-43、ミトコンドリア、オートファジーのバランスを維持する：神経変性疾患の有望な治療戦略」。Translational Neurodegeneration。9 （ 1 ）：40。doi ：10.1186 /s40035-020-00219- w。PMC 7597011。PMID 33126923。
- ^ Pozzi S、Thammisetty SS、Codron P、Rahimian R、Plourde KV、Soucy G、他 (2019 年 2 月)。「TAR DNA 結合タンパク質 43 を標的とする抗体のウイルス媒介送達により、関連する神経病理が緩和される」。The Journal of Clinical Investigation。129 ( 4 ): 1581–1595。doi :10.1172/JCI123931。PMC 6436898。PMID 30667370 。
- ^ ab Strong MJ、Volkening K、Hammond R、Yang W、Strong W、Leystra-Lantz C、Shoesmith C (2007 年 6 月)。「TDP43 はヒト低分子量ニューロフィラメント (hNFL) mRNA 結合タンパク質です」。 分子細胞神経科学。35 (2): 320–327。doi : 10.1016 /j.mcn.2007.03.007。PMID 17481916。S2CID 42553015 。
- ^ Nonaka T, Masuda-Suzukake M, Arai T, Hasegawa Y, Akatsu H, Obi T, et al. (2013年7月). 「病的脳からの病理学的TDP-43凝集体のプリオン様特性」. Cell Reports . 4 (1): 124–134. doi : 10.1016/j.celrep.2013.06.007 . PMID 23831027.
- ^ Fan AC、Leung AK (2016)。「RNA 顆粒と疾患: ALS および FTLD におけるストレス顆粒の事例研究」。Yeo GW (編) 著。RNAプロセッシング。実験医学および生物学の進歩。第 907 巻。Cham: Springer International Publishing。pp. 263–296。doi :10.1007/978-3-319-29073-7_11。ISBN 978-3-319-29071-3. PMC 5247449 . PMID 27256390.
- ^ Suk TR、Rousseaux MW（2020年8月）。 「 筋萎縮性側索硬化症におけるTDP- 43の誤局在化の役割」。分子神経変性。15 （1） ： 45。doi ：10.1186 / s13024-020-00397-1。PMC 7429473。PMID 32799899。S2CID 221129473 。
- ^ Hennig S, Kong G, Mannen T, Sadowska A, Kobelke S, Blythe A, et al. (2015年8月). 「RNA結合タンパク質のプリオン様ドメインは、核下パラスペックルの形成に必須である」. The Journal of Cell Biology . 210 (4): 529–539. doi :10.1083/jcb.201504117. PMC 4539981. PMID 26283796 .
- ^ Buratti E、Dörk T、Zuccato E、Pagani F、Romano M、Baralle FE (2001 年 4 月)。 「核因子TDP-43およびSRタンパク質は、インビトロおよびインビボでのCFTRエクソン9スキッピングを促進します。」EMBO ジャーナル。20 (7): 1774 ～ 1784 年。土井：10.1093/emboj/20.7.1774。PMC 145463。PMID 11285240。
- ^ Kuo PH、Doudeva LG、Wang YT、Shen CK 、 Yuan HS（2009年4月）。「核酸結合およびドメイン相互作用におけるTDP-43の構造的洞察」。 核酸研究。37 （ 6 ）：1799–1808。doi ：10.1093/nar/gkp013。PMC 2665213。PMID 19174564。
- ^ 遺伝子の結果
- ^ Sephton CF, Cenik C, Kucukural A, Dammer EB, Cenik B, Han Y, et al. (2011年1月). 「TDP-43含有リボ核タンパク質複合体の神経RNA標的の同定」. The Journal of Biological Chemistry . 286 (2): 1204–1215. doi : 10.1074 /jbc.M110.190884 . PMC 3020728. PMID 21051541.
- ^ Buratti E、Baralle FE（2001年9月）。「CFTRエクソン9の新規スプライシング調節因子である核因子TDP-43のRNA結合特性の特性と機能的意味」。The Journal of Biological Chemistry。276（39）：36337–36343。doi ：10.1074/ jbc.M104236200。PMID 11470789。
- ^ Mercado PA、Ayala YM、Romano M、Buratti E、Baralle FE (2005-10-12)。「TDP 43 の枯渇は、ヒト apoA-II 遺伝子におけるエクソンおよびイントロンのスプライシングエンハンサーの必要性を無視する」。 核酸研究。33 ( 18 ) : 6000–6010。doi :10.1093/nar/gki897。PMC 1270946。PMID 16254078。 （この論文には現在懸念の表明があります。doi :10.1093/nar/gkad113、PMID36772831 を参照してください）
- ^ Wang IF、Wu LS、Chang HY、Shen CK（2008年5月）。「FTLD-Uの特徴的なタンパク質であるTDP-43は、神経活動応答因子である」。Journal of Neurochemistry。105 （3）：797–806。doi ： 10.1111 /j.1471-4159.2007.05190.x。PMID 18088371。S2CID 41139555 。
- ^ Caragounis A、Price KA、Soon CP、Filiz G、Masters CL、Li QX、他 (2010 年 5 月)。「亜鉛は内因性 TDP-43 の枯渇と凝集を誘発する」。フリーラジカル生物学と医学。48 (9): 1152–1161。doi :10.1016/ j.freeradbiomed.2010.01.035。PMID 20138212 。
- ^ Garnier C, Devred F, Byrne D, Puppo R, Roman AY, Malesinski S, et al. (2017年7月). 「TDP-43のRNA認識モチーフへの亜鉛の結合はアミロイド様凝集体の形成を誘導する」. Scientific Reports . 7 (1): 6812. Bibcode :2017NatSR...7.6812G. doi :10.1038/s41598-017-07215-7. PMC 5533730. PMID 28754988 .
- ^ ab Mitra J, Guerrero EN, Hegde PM, Liachko NF, Wang H, Vasquez V, et al. (2019年3月). 「運動ニューロン疾患に伴う核TDP-43の喪失はDNA二本鎖切断修復障害と関連している」。米国科学 アカデミー紀要。116 ( 10 ): 4696–4705。Bibcode :2019PNAS..116.4696M。doi : 10.1073/ pnas.1818415116。PMC 6410842。PMID 30770445。
- ^ Mackenzie IR, Neumann M, Baborie A, Sampathu DM, Du Plessis D, Jaros E, et al. (2011年7月). 「FTLD-TDP病理の調和された分類システム」. Acta Neuropathologica . 122 (1): 111–113. doi :10.1007/s00401-011-0845-8. PMC 3285143. PMID 21644037 .
- ^ Bräuer S、Zimyanin V、Hermann A（2018 年4月）。「筋萎縮性側索硬化症 における疾患関連タンパク質のプリオン様特性」。Journal of Neural Transmission。125（4）：591–613。doi ： 10.1007 /s00702-018-1851-y。PMID 29417336。S2CID 3895544 。
- ^ Lau DH、Hartopp N、Welsh NJ、Mueller S、Glennon EB、Mórotz GM、他 (2018 年 2 月)。「前頭側頭型認知症および関連する筋萎縮性側索硬化症における ER-ミトコンドリアシグナル伝達の破壊」。Cell Death & Disease。9 ( 3 ): 327。doi : 10.1038 /s41419-017-0022-7。PMC 5832427。PMID 29491392。
- ^ Schwarz, Alan . 「研究によると、脳外傷はALSに似た症状を引き起こす可能性がある」、ニューヨークタイムズ、2010年8月18日。2010年8月18日にアクセス。
- ^ Tremblay C, St-Amour I, Schneider J, Bennett DA, Calon F (2011 年 9 月). 「軽度認知障害およびアルツハイマー病におけるトランザクティブ レスポンス DNA 結合タンパク質 43 の蓄積」. Journal of Neuropathology and Experimental Neurology . 70 (9): 788–798. doi :10.1097/nen.0b013e31822c62cf. PMC 3197017. PMID 21865887 .
- ^ ab Trejo-Lopez JA、Sorrentino ZA、Riffe CJ 、 Lloyd GM、Labuzan SA、Dickson DW、et al. (2020年11月)。「ヒトTDP-43タンパク質のRRM2ドメインを標的とする新規モノクローナル抗体」。Neuroscience Letters。738 : 135353。doi : 10.1016 / j.neulet.2020.135353。PMC 7924408。PMID 32905837。
- ^ Kwong LK、Neumann M、Sampathu DM、Lee VM、Trojanowski JQ (2007 年 7 月)。「TDP-43 タンパク質症: 散発性および家族性前頭側頭葉変性症および運動ニューロン疾患の主な形態の根底にある神経病理学」。Acta Neuropathologica。114 ( 1 ) : 63–70。doi : 10.1007 /s00401-007-0226-5。PMID 17492294。S2CID 20773388 。
- ^ Sreedharan J, Blair IP, Tripathi VB, Hu X, Vance C, Rogelj B, et al. (2008年3月). 「家族性および散発性筋萎縮性側索硬化症におけるTDP-43変異」. Science . 319 ( 5870): 1668–1672. Bibcode :2008Sci...319.1668S. doi :10.1126/science.1154584. PMC 7116650. PMID 18309045. S2CID 28744172.
- ^ Gendron TF、Rademakers R、Petrucelli L (2013)。「TDP-43タンパク質障害におけるTARDBP変異分析と変異TDP-43の毒性の解明」。Journal of Alzheimer's Disease。33 ( Suppl 1): S35–S45。doi : 10.3233 / JAD -2012-129036。PMC 3532959。PMID 22751173。
- ^ Babić Leko M、Župunski V、Kirincich J、Smilović D、Hortobágyi T、Hof PR、Šimić G (2019)。「C9orf72ヘキサヌクレオチドリピート伸長に関連する神経変性の分子メカニズム」。行動神経 学。2019 ： 2909168。doi ：10.1155 /2019/ 2909168。PMC 6350563。PMID 30774737。
- ^ Jiang YX、Cao Q、Sawaya MR、Abskharon R、Ge P、DeTure M、et al. (2022年5月). 「FTLD-TDPのアミロイド線維はTMEM106Bで構成されており、TDP-43ではない」。Nature . 605 ( 7909): 304–309. Bibcode :2022Natur.605..304J. doi :10.1038/s41586-022-04670-9. PMC 9844993. PMID 35344984 .
- ^ Kim HJ、 Kim NC、Wang YD、Scarborough EA、Moore J、Diaz Z、他 (2013 年 3 月)。「hnRNPA2B1 および hnRNPA1 のプリオン様ドメインの変異が多系統タンパク質障害および ALS を引き起こす」。Nature . 495 ( 7442 ) : 467–473。Bibcode :2013Natur.495..467K。doi :10.1038/nature11922。PMC 3756911。PMID 23455423 。
- ^ 。モンペアン M、ロマーノ V、パントーハ＝ウセダ D、ストゥアーニ C、バラーレ FE、ブラッティ E、ローランツ DV (2016 年 4 月)。 「高解像度のTDP-43 N末端ドメイン構造」。FEBS ジャーナル。283 (7): 1242–1260。土井：10.1111/febs.13651。hdl : 10261/162654。PMID 26756435。
- ^ Svahn AJ、Don EK、Badrock AP、Cole NJ、Graeber MB、Yerbury JJ、他 (2018 年 9 月)。「TDP-43 の核細胞質輸送をリアルタイムで研究: ミクログリア機能障害により変性運動ニューロンにおける TDP-43 の軸索拡散が発生」Acta Neuropathologica . 136 (3): 445–459. doi :10.1007/s00401-018-1875-2. PMC 6096729 . PMID 29943193.
- ^ デ・ブールEM、オリエVK、ウィリアムズT、ベイカーMR、デ・オリベイラHM、ポルヴィコスキーT、シルスビーM、メノンP、ファンデンボスM、ハリデーGM、ファンデンバーグLH、ヴァンデンボッシュL、ファンダムP、キーナンMC、ヴァンエスMA、ヴチッチS（2020年11月）。 「TDP-43タンパク症：神経変性疾患の新たな波」。神経学、脳神経外科、精神医学のジャーナル。92 (1):86-95。土井：10.1136/jnnp-2020-322983。PMC 7803890。PMID 33177049。
さらに読む
- Kwong LK、Neumann M、Sampathu DM、Lee VM、Trojanowski JQ (2007 年 7 月)。「TDP-43 タンパク質症: 散発性および家族性前頭側頭葉変性症および運動ニューロン疾患の主な形態の根底にある神経病理学」。Acta Neuropathologica。114 ( 1 ) : 63–70。doi : 10.1007 /s00401-007-0226-5。PMID 17492294。S2CID 20773388。
- Maruyama K, Sugano S (1994年1月). 「オリゴキャッピング: 真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」. Gene . 138 (1–2): 171–174. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Tokai N, Fujimoto-Nishiyama A, Toyoshima Y, Yonemura S, Tsukita S, Inoue J, Yamamota T (1996 年 2 月)。「Kid は、新しいキネシン様 DNA 結合タンパク質で、染色体と有糸分裂紡錘体に局在しています」。The EMBO Journal。15 ( 3 ) : 457–467。doi :10.1002/ j.1460-2075.1996.tb00378.x。PMC 449964。PMID 8599929。
- Bonaldo MF、 Lennon G、Soares MB (1996 年 9 月)。「正規化と減算: 遺伝子発見を容易にする 2 つのアプローチ」。ゲノム研究。6 (9): 791–806。doi : 10.1101/ gr.6.9.791。PMID 8889548 。
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997年10月). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–156. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Hartley JL、Temple GF、 Brasch MA (2000 年 11 月)。「in vitro部位特異的組み換えを用いた DNA クローニング」。ゲノム研究。10 ( 11): 1788–1795。doi :10.1101/gr.143000。PMC 310948。PMID 11076863。
- Wiemann S、Weil B、Wellenreuther R、Gassenhuber J、Glassl S、Ansorge W、他 (2001 年 3 月)。「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログに向けて: 500 個の新規完全タンパク質コーディングヒト cDNA の配列決定と分析」。ゲノム 研究。11 ( 3 ): 422–435。doi :10.1101/ gr.GR1547R。PMC 311072。PMID 11230166。
- Buratti E、Dörk T、Zuccato E、Pagani F、Romano M、Baralle FE (2001 年 4 月)。 「核因子TDP-43およびSRタンパク質は、インビトロおよびインビボでのCFTRエクソン9スキッピングを促進します。」EMBO ジャーナル。20 (7): 1774 ～ 1784 年。土井：10.1093/emboj/20.7.1774。PMC 145463。PMID 11285240。
- Buratti E、Baralle FE (2001 年 9 月)。「CFTR エクソン 9 の新規スプライシング制御因子である核因子 TDP-43 の RNA 結合特性の特性と機能的意味」。The Journal of Biological Chemistry。276 ( 39): 36337–36343。doi : 10.1074/ jbc.M104236200。PMID 11470789。
- Wang IF、Reddy NM、Shen CK (2002 年 10 月)。「真核生物の核小体の高次配列」。米国科学アカデミー紀要。99 ( 21 ) : 13583–13588。Bibcode : 2002PNAS... 9913583W。doi : 10.1073 / pnas.212483099。PMC 129717。PMID 12361981。
- Lehner B、 Sanderson CM (2004 年 7月)。「ヒト mRNA分解 のためのタンパク質相互作用フレームワーク」。ゲノム研究。14 (7): 1315–1323。doi :10.1101/gr.2122004。PMC 442147。PMID 15231747。
- Wiemann S、Arlt D、Huber W、Wellenreuther R、 Schleeger S 、 Mehrle A、他 (2004 年 10 月)。「ORFeome から生物学へ: 機能ゲノミクス パイプライン」。ゲノム研究。14 ( 10B): 2136–2144。doi :10.1101/gr.2576704。PMC 528930。PMID 15489336 。
- Buratti E、Brindisi A、Giombi M、Tisminetzky S、Ayala YM、Baralle FE (2005 年 11 月)。「TDP-43 は C 末端テールを介して異種核リボ核タンパク質 A/B に結合する: 嚢胞性線維症膜コンダクタンス制御因子エクソン 9 スプライシングの阻害に重要な領域」。The Journal of Biological Chemistry。280 ( 45): 37572–37584。doi : 10.1074/ jbc.M505557200。PMID 16157593。
- Stelzl U、Worm U、Lalowski M、Haenig C、Brembeck FH、Goehler H、他 (2005 年 9 月)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワーク: プロテオームの注釈付けのためのリソース」。Cell . 122 (6): 957–968. doi :10.1016/j.cell.2005.08.029. hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 . PMID 16169070. S2CID 8235923.
- Rual JF、Venkatesan K、Hao T、Hirozane - Kishikawa T、Dricot A、Li N、他 (2005 年 10 月)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオーム規模のマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–1178。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi :10.1038/nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
- Mehrle A、Rosenfelder H、Schupp I、del Val C、Arlt D、Hahne F、他 (2006 年 1 月)。「2006 年の LIFEdb データベース」。核酸研究。34 (データベース 号): D415–D418。doi :10.1093/nar/gkj139。PMC 1347501。PMID 16381901。
外部リンク
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