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ジョン・クレイグ・ベンター（1946年10月14日 - 2026年4月29日）は、アメリカの科学者、実業家、ゲノム研究者でした。彼は、ヒトゲノムの最初のドラフト配列の1つを主導したことで知られています[ 1 ] [ 2 ]。また、合成染色体で細胞をトランスフェクションした最初のチームを率いたことでも知られています[ 3 ] [ 4 ]。ベンターは、セレラ・ゲノミクス、ゲノム研究所（TIGR）、J・クレイグ・ベンター研究所（JCVI）を設立しました。彼は、ヒューマン・ロンジェビティ社とシンセティック・ゲノミクスの共同創設者でもありました。
ベンターは、タイム誌の2007年と2008年の世界で最も影響力のある100人のリストに名を連ねた。2010年には、イギリスの雑誌ニュー・ステイツマンが彼を「世界で最も影響力のある50人 2010」のリストで14位に挙げた。[ 5 ] 2012年には、ゲノム研究への貢献によりダン・デイビッド賞を受賞した。 [ 6 ] 2013年にはアメリカ哲学協会に選出された。[ 7 ]彼はUSA科学技術フェスティバルの諮問委員会のメンバーだった。 [ 8 ]
ジョン・クレイグ・ベンターは、1946年10月14日、ユタ州ソルトレイクシティで、エリザベスとジョン・ベンターの息子として生まれた。 [ 9 ] [ 10 ]： 14幼少期に家族はカリフォルニア州ミルブレーに引っ越した。[ 11 ]若い頃、彼は学業を真剣に考えず、ボートに乗ったりサーフィンをしたりして水上で過ごすことを好んだ。[ 10 ]： 1-20自伝『A Life Decoded』によると、彼は決して熱心な生徒ではなく、8年生の成績表にはCやDが並んでいた。[ 10 ]： 1-20
ベンターは、自身の思春期の行動は注意欠陥多動性障害（ADHD）の兆候であると考え、後に自身のDNAにADHDに関連する遺伝子変異を発見した。[ 12 ]彼はミルズ高校を卒業した。[ 13 ]彼の父親は59歳で突然心停止により亡くなり、彼は生涯にわたって自身の死を意識するようになった。彼は「不滅を望むなら、人生で何か意味のあることをしなさい」という言葉を引用した。[ 14 ]
彼はベトナム戦争に反対したが、[ 15 ]徴兵を避けるためにアメリカ海軍に入隊した。 [ 16 ]彼は衛生兵の訓練を受け、 1967年から1968年にかけてベトナムのダナン海軍支援基地の野戦病院の集中治療室で衛生兵として1年間勤務した。[ 17 ]テト攻勢の激しさにストレスを感じ、海に泳いで自殺を図ったが、正気に戻って岸に戻った。[ 16 ]何千人もの負傷兵を治療したことで、彼は医学を学びたいという願望を抱くようになった。[ 18 ]
彼は1969年にカリフォルニア州のコミュニティカレッジ、サンマテオカレッジで大学教育を開始し、後にカリフォルニア大学サンディエゴ校に編入し[ 19 ] [ 20 ]、生化学者のネイサン・O・カプランの下で研究を行った。彼は1972年に生化学の理学士号を、 1975年にUCSDで生理学と薬理学の博士号を取得した[ 21 ] [ 22 ] 。
彼はニューヨーク州立大学バッファロー校で准教授、後に教授として勤務した後、1984年に国立衛生研究所（NIH）に入所した。 [ 23 ]
NIH の職員であったベンターは、mRNA の識別方法を学び、それが人間の脳でどのように発現するかについてさらに研究し始めた。ベンターが自動DNA シーケンシングによって発見した短いcDNA配列断片を、彼は発現配列タグ(EST) と名付けた。NIH技術移転局は、ベンターが発見した EST の特許を申請することを決定し、人間の脳における mRNA 発現の研究に基づいて特定された遺伝子を特許化した。ベンターが議会公聴会で NIH の戦略を明らかにしたとき、激しい論争が巻き起こった。[ 24 ] NIH はその後、世論の反発を受けて、この取り組みを中止し、申請していた特許を取り下げた。[ 25 ]
ベンターは、ゲノミクスが医療を根本的に変革する力に情熱を燃やしていた。ベンターは、全ゲノムショットガンシーケンスが有用なヒトゲノムデータを得るための最も速く効果的な方法だと信じていた。[ 26 ]しかし、この方法はヒトゲノムプロジェクトによって却下された。一部の遺伝学者は、ヒトのように複雑なゲノムには十分な精度が得られないこと、物流面でより困難であること、そして費用が大幅にかかることを懸念していた。[ 27 ] [ 28 ]
彼はヒトゲノムプロジェクトの進捗が遅いことを、ショットガンシーケンス法を用いてヒトゲノムのシーケンスを加速させるという自身の関心を継続する機会と捉え、民間部門から資金を募ってセララ・ゲノミクスを設立した。[ 29 ]同社は、ユーザーが料金を支払って購読できるゲノムデータを作成することで、その成果から利益を得ることを計画していた。[ 30 ]その結果、この目標は公的ゲノムプログラムにプレッシャーをかけ、いくつかのグループが完全な配列を作成するために努力を倍増させるように促した。[ 31 ]ベンターの努力は、彼とセララ社のチームが公的資金によるヒトゲノムプロジェクトとともに最初のドラフトヒトゲノムのシーケンスを行った功績を共有したことで、彼に名声をもたらした。[ 32 ]
2000年、国立衛生研究所および米国パブリックゲノムプロジェクトのベンターとフランシス・コリンズは、パブリックゲノムプログラムの終了予定日より3年も早く、ヒトゲノムのマッピングを共同で発表した。[ 33 ]この発表は、米国大統領ビル・クリントンと英国首相トニー・ブレアと共に行われた。[ 34 ]ベンターとコリンズは、 A&Eネットワークから「年間最優秀伝記」賞を共同受賞した。[ 35 ] 2001年2月15日、ヒトゲノムプロジェクトコンソーシアムは、学術誌ネイチャー に最初のヒトゲノムを発表し、その翌日にはセララがサイエンス誌に発表した。 [ 36 ] [ 37 ]ショットガンシーケンシングは、ヒトゲノムプロジェクトが採用したクローンごとの方法よりも精度が劣るという主張もあったが、 [ 38 ]この技術は科学界で広く受け入れられるようになった。[ 39 ]
ベンターは2002年初頭にセララ社から解雇された。[ 40 ]ベンターの経歴によると、解雇の理由は、主要投資家のトニー・ホワイトとの対立であり、具体的にはヒトゲノム配列解読の達成を祝うホワイトハウスの式典への出席を禁じられたことだった。ホワイトは式典で蚊帳の外に置かれ、結果が引き分けとして発表されたことでセララ社の主張が弱まった。ホワイトはセララ社を製薬会社に変えることでこの成果を収益化しようとしたが、ベンターはそれに興味がなく、そのビジネスの経験もなかったため、不要な存在だった。[ 41 ]
グローバル海洋サンプリング探査(GOS) は、海洋微生物群集の遺伝的多様性を評価し、自然の基本的なプロセスにおけるそれらの役割を理解することを目的とした海洋探査ゲノムプロジェクトです。 [ 42 ] 2003 年 8 月にサルガッソ海のパイロットサンプリングプロジェクトとして開始された本格的な探査は、2004 年 3 月 4 日にベンターによって発表されました。ベンターの個人ヨットであるSorcerer IIを使用したこのプロジェクトは、カナダのハリファックスから始まり、世界一周航海を行い、2006 年 1 月に米国に戻りました。[ 43 ]
2005 年 6 月、ベンターは、改変微生物を使用してクリーンな燃料と生化学物質を生産することに特化した企業であるSynthetic Genomics を共同設立した。2009 年 7 月、エクソンモービルは、次世代バイオ燃料の研究開発のために Synthetic Genomics と 6 億ドルの提携を発表した。[ 44 ]ベンターは、バイオ燃料生産のための遺伝子操作された二原子微細藻類 の開発に取り組み続けた。 [ 45 ] [ 46 ] [ 47 ]
ベンターは、おそらくマイコプラズマ・ラボラトリウムと名付けられるであろう、最初の部分合成種の特許を申請した。[ 48 ]この研究の流れは、例えば燃料の生産、医薬品の製造、地球温暖化対策など、特定の反応を実行するように設計された細菌の生産につながった可能性があるという憶測がある。[ 49 ]
2010 年 5 月、ベンター率いる科学者チームが、いわゆる「合成生命」の生産に初めて成功した。[ 50 ] [ 51 ]これは、細菌ゲノム全体を含む非常に長い DNA 分子を合成し、それを別の細胞に導入することによって行われた。これは、 RNA ウイルスゲノムを合成して連結し、細胞溶解液中で「起動」したエッカード・ヴィマーのグループの成果に類似している。[ 52 ]この単細胞生物には、合成生命であることを識別し、子孫を追跡するのに役立つ 4 つの「透かし」[ 53 ]が DNA に書き込まれている。これらの透かしには以下が含まれる。[ 54 ]
2016年3月25日、ベンターは、自由生活する生物の中で最も少ない遺伝子数（473個の遺伝子）を持つ合成ゲノムであるSyn 3.0の形成を報告した。[ 55 ]彼らの目的は、生命を維持するために必要な最小限の遺伝子セットだけを残し、すべての非必須遺伝子を取り除くことであった。この簡素化され、急速に増殖する細胞は、この分野の研究者にとって貴重なツールになると期待されている。[ 56 ]
2018年8月、ベンターはJ・クレイグ・ベンター研究所での仕事に専念したいとして、理事長を退任した。[ 57 ]彼は理事会の科学顧問として留任した。[ 58 ]
2006年、ベンターは合成生物学の研究を行う非営利団体であるJ・クレイグ・ベンター研究所（JCVI）を設立した。[ 59 ]ラホヤとメリーランド州ロックビルに施設があり、[ 60 ] 200人以上の従業員を抱えている。[ 61 ]
2022年4月、ベンターはラホヤのJCVI施設をカリフォルニア大学サンディエゴ校に2500万ドルで売却した。ベンターは、J・クレイグ・ベンター研究所としても知られる別の非営利研究グループを率い続け、引退するつもりはないと強調した。複数の新しい施設職員の採用により、ベンター研究所は建物が手狭になり、2025年に新しい場所に移転した。[ 14 ]
2007年9月4日、サム・レヴィ率いるチームは、ベンター自身のDNA配列という、ヒト個人のゲノムとしては初めてのものの1つを公開した。[ 62 ]ベンターのゲノムに含まれる配列の一部は、湿った耳垢[ 63 ]、反社会的行動、アルツハイマー病、心血管疾患のリスク増加[ 10 ]と関連している。
ヒト参照ゲノムブラウザーは、ベンターのゲノムのナビゲーションと分析のためのウェブアプリケーションです。HuRefデータベースは、マイクロ流体サンガーシーケンスを使用してシーケンスされた約3200万のDNAリードで構成され、4528の足場に組み立てられ、ゲノム分析によって特定された410万のDNA変異が含まれています。これらの変異には、一塩基多型（SNP）、ブロック置換、短いおよび長い挿入および欠失、挿入、欠失、逆位、コピー数変化などの構造的変異が含まれます。[ 64 ]
このブラウザにより、科学者は HuRef ゲノムアセンブリと配列のバリエーションをナビゲートし、 NCBIおよびEnsemblアノテーションのコンテキストで NCBI ヒトビルド 36 アセンブリと比較することができました。このブラウザは、NCBI と HuRef のコンセンサス配列、HuRef アセンブリの配列多重アライメント、Ensembl および dbSNP アノテーション、HuRef バリアント、および基となるバリアントの証拠と機能分析の比較ビューを提供します。このインターフェースは、二倍体ゲノム配列を推測できるハプロタイプブロックと、バリアントと遺伝子アノテーションの関係も表します。バリアントと遺伝子アノテーションの表示は、dbSNP、Ensembl、Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM)、およびGene Ontology (GO) などの外部の公開リソースにリンクされています。[ 64 ]
ユーザーは、HUGO遺伝子名、Ensembl、dbSNP識別子、HuRefコンティグまたはスキャフォールドの位置、またはNCBI染色体の位置を使用してHuRefゲノムを検索できます。その後、シンプルで直感的なパンとズームコントロールを使用して任意のゲノム領域を閲覧できます。さらに、特定の遺伝子座に関連するデータをエクスポートして、さらに分析できます。[ 64 ]
2014年3月4日、ベンターと共同創設者のピーター・ディアマンディス、ロバート・ハリリは、健康で「高性能」な人間の寿命を延ばすことに重点を置いた企業、Human Longevity , Inc.の設立を発表した。 [ 65 ] [ 66 ]発表当時、同社はすでに7,000万ドルのベンチャー資金を調達しており、これは18か月間続くと予想されていた 。[ 65 ] [ 66 ]ベンターは、2018年5月に引退するまで会長兼最高経営責任者（CEO）を務めた。同社は、当初はがんゲノムとがん患者のゲノム に重点を置き、年間40,000のゲノムをシーケンスする計画だった。 [ 65 ]
2016年、ベンター氏は同社が開発した診断方法を用いて検査を受けた。その結果、従来のPSA検査では見逃されていた前立腺がんの腫瘍が発見された。腫瘍は手術によって無事に摘出された。[ 67 ]
ヒューマン・ロンジェビティ社は2018年にベンター氏を相手取り、企業秘密を盗んだとして訴訟を起こした。ベンター氏が競合事業を始めるために利用できる貴重な情報を含む会社のコンピューターを持ち去ったという主張がなされた。[ 68 ]この訴訟は最終的にカリフォルニア州の裁判官によって却下された。その理由は、ヒューマン・ロンジェビティ社が企業秘密が盗まれた場合に企業または個人が訴訟を起こすために必要な法的基準を満たす事例を提示できなかったためである。[ 69 ]
Human Longevityの使命は、ゲノミクス、メタボロミクス、マイクロバイオミクス、プロテオミクスからの高解像度ビッグデータ診断と幹細胞療法の使用により、健康な人間の寿命を延ばすことである。[ 70 ]
ベンターは3冊の本を執筆しており、その1冊目は自伝『A Life Decoded 』である。[ 10 ]ベンターの2冊目の著書『Life at the Speed of Light』では、コンピュータプログラミングとDNAシーケンシングによる生命の遺伝子プログラミングという、これまで異質だった2つの科学分野が融合しつつあるのはこの世代であるという理論を発表した。[ 71 ]この点に関する彼の見解は、未来学者レイ・カーツワイルから称賛された。ベンターの最新作は、デイビッド・ユーイング・ダンカンとの共著『The Voyage of Sorcerer II: The Expedition that Unlocked the Secrets of the Ocean's Microbiome』で、世界の海洋から微生物を採取し、そのDNAを解読した15年間にわたるグローバル海洋サンプリング探査の詳細が記されている。 [ 72 ]
ベンターはバーバラ・レイ・ベンターと12年間結婚していた。[ 73 ] [ 74 ]二人の間にはクリストファーという息子がいた。その後、クレア・M・フレイザーと結婚し[ 75 ] [ 22 ]、2005年まで結婚生活を続けた。[ 76 ] 2008年後半にはヘザー・コワルスキーと結婚し[ 77 ] 、カリフォルニア州サンディエゴのラホヤ地区に住んでいた。[ 77 ]ベンターは無神論者だった。[ 78 ]
ベンターは2022年に75歳で、メインの研究棟を2500万ドルでUCSDに売却した。[ 79 ]研究所はスペースが手狭になり、2025年5月にはサンディエゴのダウンタウンにある新しい施設に移転することが発表された。[ 80 ]メリーランド州ロックビルにあるベンター研究所のキャンパスも拡張された。2022年、彼は引退するつもりはないと語っていた。[ 14 ]ラホヤの自宅の他に、カリフォルニア州ボレゴスプリングスに牧場を、メイン州の2つの小さな町に家を所有していた。彼はセーリングや、彼が「究極の自由」と呼んだシーラスSR22T飛行機の操縦に参加していた。[ 14 ]
ベンターは2026年4月29日、カリフォルニア州サンディエゴで79歳で亡くなった。[ 81 ]彼は最近診断された癌の治療の副作用のために入院していた。[ 82 ] [ 67 ]
ベンターは、同僚から遺伝子配列決定の先駆者であり異端児とみなされている。[ 81 ] [ 83 ]彼は、その後配列決定の時間とコストを削減するのに役立ったショットガン配列決定法を考案したとされている。[ 84 ]ベンターは、ヒトゲノム計画に後期段階で参加したが、商業的なつながりを利用して迅速に推進することで、計画を世間の注目を集め、計画の結果を自由に利用できるようにして医学研究を拡大するのに貢献した。[ 84 ]ベンターは、自身の研究所で行った研究により、合成生物学の分野の先駆者ともみなされている。[ 83 ]
ベンターは、Wired [ 85 ] 、The Economist [ 86 ]、オーストラリアの科学雑誌Cosmos [ 87 ] [ 88 ] 、The Atlantic [ 89 ]など、いくつかの雑誌で記事の対象となっている。ベンターと彼の研究は、2001 年のNOVAスペシャル「生命の暗号を解読する」 の焦点の一部であった。 [ 90 ] [ 91 ]ベンターは、 Time誌の「2008 年のあらゆることトップ 10」の記事で取り上げられた。 [ 92 ] 2008 年の科学的発見トップ 10 の 3 位は、まったく新しい細菌の遺伝情報を作成するために必要な 582,000 塩基対をつなぎ合わせた彼の研究の概要を説明した記事だった。[ 93 ]
ベンターは科学雑誌に200以上の論文を発表した。[ 112 ]
私は長年、ベトナム戦争への関与を招いた政府の政策によって破壊されたり傷つけられたりした人々の人生に意味を見出そうと努めてきました。
Celera で発表したゲノムは 5 人のゲノムの合成でした。
... 2002 年に Celera を退社した後、ベンターは、そこで配列決定されたゲノムの大部分が自分のものであると発表しました。
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