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微生物集団生物学は、集団生物学の原理を微生物に応用したものです。
他の生物学分野との区別
微生物集団生物学は、実際には、細菌、古細菌、微小真菌（酵母など）、その他の微小真核生物（「原生動物」や 藻類など）、およびウイルスの生態と進化を理解することを目的とした集団生態学と集団遺伝学の応用です。
微生物集団生物学には、微生物の共進化や捕食者と被食者の相互作用など、微生物間の群集相互作用（群集生態学）の進化と生態学も含まれる。さらに、微生物集団生物学では、微生物とより巨視的な生物との相互作用（例：宿主と寄生者の相互作用）も考慮するが、厳密には、これは巨視的な生物というよりも微視的な観点からのものであるべきである。微生物集団生物学の多くは、微生物進化生態学とも呼ばれることがある。一方、微生物集団生物学者は通常（微生物生態学者とは異なり）、生態系の生物的要素と非生物的要素の間の 栄養循環とエネルギー移動を研究する生態系生態学における微生物の役割の問題にはあまり関心がない。
微生物集団生物学には、分子進化や系統発生の側面が含まれる場合があります。ただし、厳密に言えば、これらの重点は、微視的生物と巨視的生物の両方に当てはまるより普遍的な真実を理解する手段としてではなく、微生物の進化と生態学の問題を理解するために用いられるべきです。したがって、そのような取り組みにおける微生物は、単なる分子または進化的還元主義モデルシステムとしてではなく、生物として認識されるべきです。したがって、RNAのin vitro進化の研究は 微生物集団生物学ではなく、そうでなければ非微生物配列の系統発生のin silico生成も、いずれかの側面が何らかの形で（特に意図せずに）実際の微生物集団の進化に類似している場合でも、微生物集団生物学ではありません。
微生物集団生物学には、より一般的な生態学的および進化論的仮説の検証が含まれることがあります (実際に含まれることが多い)。ここでも、微生物にいくらか重点を置くことが重要です。なぜなら、この「質問主導型」微生物集団生物学は、ある時点で微生物を使用する集団生物学に変わるからです。これらの潜在的に異なる重点の出発点はいくぶん恣意的であるため、微生物集団生物学の分野が何を構成し、何を構成しないかについては、あいまいで普遍的に受け入れられているわけではない境界が存在します。
微生物集団生物学ゴードン会議
微生物集団生物学ゴードン研究会議は奇数年に一度、これまでニューイングランド（通常はニューハンプシャー）で開催されています。2007 年の会議 Web ページでは、会議について次のように紹介されています。
微生物集団生物学は、微生物科学およびそれ以外の分野のさまざまな最先端の問題を扱っています。進化生物学にしっかりと根ざし、強力な統合的アプローチを採用したこの会議では、適応のダイナミクスと遺伝学から、突然変異率の進化、群集生態学、進化ゲノミクス、利他主義、疫学まで、さまざまなトピックを取り上げてきました。
この会議は決して退屈ではありません。生物学における最も重要かつ論争の多い問題のいくつかがここで徹底的に議論されたからです。
会議の履歴はここでご覧いただけます。
次回の微生物集団生物学ゴードン会議は 2025 年に予定されています。過去 (および将来) の会議に関する情報は次のようにまとめられます。
参照
外部リンク
- 微生物集団生物学
- ファージ会議
- ヒトマイクロバイオームプロジェクト