Loading article…
| バクテロイデス・テタイオタオミクロン | |
|---|---|
| |
科学的分類 
| |
| ドメイン： | 細菌 |
| 門: | バクテロイデス |
| クラス： | バクテロイジア |
| 注文： | バクテロイデス |
| 家族： | バクテロイデス科 |
| 属: | バクテロイデス |
| 種： | B. テタイオタオミクロン
|
| 二名法名 | |
| バクテロイデス・テタイオタオミクロン （ディスタソ 1912）カステラーニとチャーマーズ 1919
| |
バクテロイデス・テタイオタオミクロンはグラム陰性の偏性嫌気性細菌であり、特に大腸内のヒトの腸内細菌叢の重要なメンバーです。B . テタイオタオミクロンはバクテロイデス属に属し、腸内細菌叢の複雑な微生物群集における役割で知られています。4,779のメンバーからなるそのプロテオームには、人体では消化が難しい食物多糖類を取得して分解するシステムが含まれています。 [1]
この細菌はグリコシド加水分解酵素や多糖類リアーゼなどの酵素をコードしており、セルロースやヘミセルロースなどの食物繊維を発酵性基質に分解することができます。この代謝活動により酢酸やプロピオン酸などの短鎖脂肪酸（SCFA）が生成され、宿主に吸収されて結腸細胞に重要なエネルギー源を提供します。[2]
B. thetaiotaomicronは日和見病原体であり、免疫不全の人では毒性を帯びる可能性がある。B . thetaiotaomicronは他の共生細菌と関連しており、免疫寛容を維持し、腸粘膜における過剰な炎症反応を防ぐために不可欠な制御性T細胞の誘導に関与している。 [3] B. thetaiotaomicronは適応性があり、宿主の免疫系や代謝系と相互作用するため、共生、微生物生態学、腸管宿主相互作用 を研究するためのモデル生物として利用されている。
歴史と分類
バクテロイデス・テタイオタオミクロンは、1912年にバチルス・テタイオタオミクロンという名前で初めて記載され、1919年にバクテロイデス属に移動されました。 [4]種小名はギリシャ語のシータ、イオタ、オミクロンに由来し、原核生物の命名法リストでは「液胞形態に関連する」とされています。[4]この名前は、国際原核生物命名規約で「任意の」種名の例として使用されています。[5] [6]独特の運動性で区別されるバクテロイデス門細菌は、広範囲の生態系、生息地、ライフスタイル、生理学的条件に存在します。[7]バクテロイデス属は、特に西洋文明の人々の腸内で最も顕著な細菌を表しています。ヒトの体内に豊富に存在するが、その分布は個人によって異なり、宿主のゲノム、食事、その他の要因によって影響を受ける可能性がある。[8]
進化
バクテロイデス・テタイオタオミクロンは、ヒトの腸内微生物叢によく見られる細菌で、消化と健康全般をサポートするためにヒトとともに進化してきました。この細菌は、長い時間をかけて複雑な炭水化物を単純な糖に分解する能力を発達させ、宿主が食物からより多くのエネルギーを得るのを助けています。B . テタイオタオミクロンは、ヒトの腸内に存在するさまざまな植物繊維やその他の食物成分を処理できるさまざまな特殊酵素を持っています。これらの適応により、バクテロイデス・テタイオタオミクロンは腸内生態系の重要な一部となり、バランスの取れた微生物叢を維持する上で大きな役割を果たし、自身と宿主の両方に利益をもたらしています。[1]
B. テタイオタオミクロンの進化は、宿主であるヒトの食生活や免疫システムの変化によって形作られ、細菌の遺伝的・機能的特徴に影響を与えてきたようだ。例えば、さまざまな栄養素を検知して反応するのに役立つ遺伝子を持っているため、食生活の変化に対してより耐性がある。バクテロイデス・テタイオタオミクロンは、宿主の生涯のさまざまな時期、特に乳児の離乳期の前後に栄養素を好む。授乳期には、母乳に含まれるオリゴ糖や宿主からのその他の炭水化物が好まれる。離乳期後は、食事に含まれる植物由来の多糖類を好む。[9]また、宿主の免疫システムの調節、炎症の軽減、腸内環境の安定化にも役立つ。この関係は、ヒト宿主とB. thetaiotaomicronの両方が恩恵を受ける複雑な共進化を反映しており、腸内微生物叢とヒトの健康がいかに相互に関連しているのかを示しています。[10] [11]
腸内細菌叢内の協力の進化、特にバクテロイデス・テタイオタオミクロンの進化は、腸内細菌が共存し、さらには宿主と協力するためにどのように適応しているかを浮き彫りにしています。この協力により、 B. テタイオタオミクロンは栄養素にアクセスし、複雑で競争の激しい腸内環境で生き残ることができます。時間の経過とともに、進化的圧力がこの細菌の代謝経路とコミュニケーションメカニズムを形作り、宿主との共生を可能にし、相互関係を通じて微生物の生存と宿主の健康の両方を向上させました。[12]
宿主範囲
バクテロイデス・テタイオタオミクロンは、ヒト、牛、豚、ヤギ、マウスから分離されています。[13] [14]バクテロイデス・テタイオタオミクロン株GA17は、特にヒトに関連しています。[15]
ゲノム
B. thetaiotaomicronのゲノムは2003 年に配列決定されました。これは 2 本鎖 DNA の 1 本の環状染色体です。長さは 6.26メガベースですが、異なる遺伝子の数は比較的少ないです。これは、他の原核生物と比較して異常に大きいタンパク質をコードする遺伝子によるものです。[16]このゲノム特性は、属の別のメンバーであるBacteroides fragilisと共有されています。[17]ヒトマイクロバイオームプロジェクト(HMP)による広範な 16S rRNA カウントにより、ゲノムにはデンプン結合タンパク質とともに、グリコシド加水分解酵素(GH) や多糖類リアーゼ (PL) などの多糖類の分解に関連する遺伝子が含まれていることがわかりました。[16] [17] [18]
B. thetaiotaomicronはデンプン利用システム（Sus）を持っており、これにより細菌は複雑な多糖類を細胞表面に結合し、外膜酵素がそれを単糖類に分解することができる。B . thetaiotaomicron またはSusによって消化された多糖類は単糖類に変換され、その後、ヒトの細胞に吸収されて代謝される。[19] [16] Susの利用により、この細菌は複雑な多糖類の発現を調節することができ、環境を調節できない他の細菌よりも優位に立つことができる。[16]
これらの遺伝子はECF型シグマ因子とともに、栄養素の利用可能性と特定の遺伝子の発現を相関させることができる。 [ 16]ゲノムには、シグマ因子や2成分システムなど、細胞外環境の感知と応答に関与するタンパク質をコードする遺伝子も多数含まれている。[16] [20] [21]消化酵素をコードする遺伝子と細胞質外機能シグマ因子およびシグナル伝達システムの共局在により、環境中の栄養素の利用可能性に基づいて遺伝子発現を制御するメカニズムが作り出される。[ 16 ] B. thetaiotaomicronゲノムは多数の小さな非コードRNAをコードしており、これらも制御プロセスで重要な役割を果たしているが、これまでに特徴付けられているものはほとんどない。[22] B. thetaiotaomicronには、33キロベースのプラスミド、63個のトランスポザーゼ、および接合性トランスポゾンCTnDOTの4つの相同体を含む、いくつかの異なるタイプの可動性遺伝要素があります。CTnDOTは抗生物質エリスロマイシンとテトラサイクリンに対する耐性をコードし、バクテロイデス属や他の腸内細菌叢の間で水平伝播します。[16]
代謝
バクテロイデス・テタイオタオミクロンは、アミロース、アミロペクチン、プルランなど、通常は消化できない非常に多様な多糖類を代謝することができます。[20]グリコシド結合の加水分解に使用される酵素群は、原核生物で知られているものの中で最大級であり、生物学的多糖類のほぼすべてのグリコシド結合を加水分解できるとさえ考えられています。 植物性多糖類を分解するヒト腸内細菌叢の主要な生物として、栄養素の利用可能性に応じて、食物由来の炭水化物だけでなく、宿主由来の炭水化物も利用できます。 [23]複雑な植物性多糖類は、小腸で消化吸収される単純な単糖類や二糖類とは異なり、結腸で食料源として利用されるまで残されます。 [19]複雑な多糖類は結腸で発酵され、酢酸やプロピオン酸などの短鎖脂肪酸（SCFA）が生成されます。これらのSCFAは結腸細胞のエネルギー源として機能し、抗炎症作用を持っています[2] B. thetaiotaomicronはまた、糖を代謝するために解糖系、Embden-Meyerhof-Parnas（EMP）経路、および発酵に依存しています[24]
B. thetaiotaomicronは、十分な栄養素を獲得する優れた能力を利用して、ヒトの大腸内の他の多くの腸内細菌を支配することができます。[19]これは、酵素を分解するグリコシルヒドロラーゼ、膜結合タンパク質、および糖特異的トランスポーターの増加の複合効果により可能になります。 [19] B. thetaiotaomicronによって生成されるグリコシルヒドロラーゼは 172 個あり、これは配列が判明している他のどの細菌よりも多く、宿主に加水分解産物を提供する酵素を提供します。[19]すべての B. acteriodes は、炭水化物を標的にして分解するシステムをコードしている遺伝子クラスターを含む多糖類利用遺伝子座 (PUL) を使用します。[25]これらのシステムの一部は、食事に含まれる複合炭水化物を非常に効率的に分解できる炭水化物活性酵素 (CAZymes) です。最も構造が複雑な食事性炭水化物である RG-II を基質として使用する 3 つの異なる PUL が特定されています。 RG-IIデグラドームにはRG-II内の連続グリコシド結合を標的とし、RG-IIの分解を引き起こす23の酵素が含まれています。[25]
B. thetaiotaomicronは耐気性があり、酸素にさらされても生存はできるが、増殖はできない。真核生物の宿主環境、例えばヒトの腸内では酸素のアクセスが制限されている。過酸化水素などの活性酸素種（ROS）が生成され、代謝に広く使われている鉄補酵素を攻撃して菌叢を脅かす可能性がある。[26]酸素濃度を低下させるために、B. thetaiotaomicronは空気にさらされると過酸化水素などのROSを除去するタンパク質を多数発現する。[26]
ヒトマイクロバイオームにおける役割
バクテロイデス属は、成人の腸内微生物群の約4分の1を占めています。臨床サンプルにおけるバクテロイデス属の長期研究では、バクテロイデス・フラギリスに次いで、 B.テタイオタオミクロンが2番目に多く分離された種でした。[26]腸内の酵素では消化できない植物質を消化できるため、人間にとって非常に重要です。[16]
B. テタイオタオミクロンは片利共生菌、つまり共生菌の一種であり、消化など宿主に重要な利益をもたらす。[16] [17] B. テタイオタオミクロンははるかに多くのグリコシル加水分解酵素を持ち、そのうち61％が外膜または細胞外マトリックスに位置していることから、消化能力は細菌の宿主に何よりも役立つことが示唆されている。[20]グリコシル加水分解酵素は、23の特定の酵素機能を発現し、加水分解の分解産物を宿主または腸内細菌叢の他の微生物に供給する。[19]また、上皮グリカン合成を調節する能力もあり、これは腸管腔内などの周囲の栄養素の利用可能性を感知する能力を伴うプロセスである。環境に栄養素がほとんど存在しない場合でも、栄養素を検出し、グリカンを構築および変更する宿主酵素を展開することができる。この調節メカニズムにより、B. テタイオタオミクロンは好ましい環境条件を維持することができる。[16]
これまでの研究では、 B . テタイオタオミクロンが出生後の腸の発達中に血管新生（新しい血管の形成）を刺激することが示されている。これらの研究では、微生物叢を制御するために無菌マウスを使用し、マウスに特定の細菌であるB. テタイオタオミクロンを接種した。血管新生は、微生物が生成を助ける栄養素を人間が吸収する能力を高めることで、宿主にさらなる利益をもたらす。[16]
B. テタイオタオミクロンは腸内微生物叢の大部分を占め、腸内の粘膜バリアの形成を通じて腸の出生後の発達にも寄与し、宿主微生物叢の恒常性維持に大きな役割を果たしている。 [27] [28]腸上皮と微生物叢の間に位置する粘膜バリアは半透性であり、病原性分子の通過を制限しながら必須栄養素の摂取を可能にする。[27] [29]消化管（GIT）に定着している腸内微生物叢内の細菌の約90％は、バクテロイデス門またはフィルミクテス門に属している。[27] B. テタイオタオミクロンが粘液中の宿主由来の多糖類上で増殖する能力は、GIT内でのその持続性に大きく寄与している。[27]
バクテロイデス属は、独特のリポ多糖類(LPS)を生産する能力があり、糖脂質は特に周囲の細菌を感知することで哺乳類の免疫系と通信することが知られているため、自然免疫を修正する可能性があることを示唆しています。これらの LPS 構造は、O 抗原を示唆するラダーパターンを示していますが、B. テタイオタオミクロンは特に、O 抗原を欠いた小さなリポオリゴ糖 (LOS) を生産します。これらの LPS と LOS の豊富さは、宿主と共生微生物間の通信を可能にする機能があることを示唆しています。[8]
免疫反応における役割
B. テタイオタオミクロンはヒト腸内細菌叢の重要なメンバーであり、免疫応答におけるその役割は複雑です。B.テタイオタオミクロンと免疫システムの相互作用は、腸の恒常性の維持と免疫システムの発達に寄与します。一般的なヒト腸内細菌であるB. テタイオタオミクロンによって生成される細胞外小胞の抗炎症および免疫調節特性は明らかであり、自然免疫細胞との相互作用を制御する分子メカニズムが特定されています。[30] B. テタイオタオミクロンは他の常在細菌と関連しており、免疫寛容を維持し、過剰な炎症反応を防ぐために不可欠な制御性 T 細胞の誘導に関連しています。[3] [31]
外膜小胞（OMV）は、 B. thetaiotaomicronを分解から保護するだけでなく、調節性樹状細胞応答を促進する上でも重要な役割を果たします。健康な腸内のB. thetaiotaomicronのOMVは、結腸樹状細胞（DC）を刺激してIL-10を発現させます。T細胞はIL-10によって刺激され、マクロファージとDCを介して自然免疫系によって発現します。潰瘍性大腸炎（UC）およびクローン病（CD）の患者のB. thetaiotaomicron OMVはIL-10発現を刺激することができず、その結果、調節性DCが失われます。これらの疾患では、B. thetaiotaomicron OMVによってDCの発現量も大幅に減少します。これらの結果は、非活動性疾患の患者でも観察されたため、免疫応答の欠陥は炎症性腸疾患（IBD）に固有のものであることを示しています。[32] [より良い情報源が必要]
病理学
B. テタイオタオミクロンも日和見病原体であり、腸内細菌叢にさらされた組織に感染する可能性がある。[26]腸内にいる間、B. テタイオタオミクロンは通常、宿主と有益な関係を維持する。しかし、この種の細菌と効果的に相互作用する能力がない体の他の部位に導入されると、有害な影響を及ぼす可能性がある。消化管が破裂した場合、B. テタイオタオミクロンだけでなく他の腸内細菌も腸から放出される可能性がある。[17]これにより、血流中に細菌が存在する菌血症などの疾患につながる可能性がある。B . テタイオタオミクロンは組織に細菌感染を引き起こし、免疫反応を誘発して膿瘍形成を促進することもある。
B. テタイオタオミクロンは多糖類代謝能力があるため、腸内細菌叢の他の成分の栄養源として貢献しています。例えば、この細菌はシアリダーゼ酵素を発現しますが、シアリン酸を異化することはできません。その結果、その存在により、他の生物がエネルギーとして利用できる腸内のシアリン酸の量が増加します。この特定の能力により、シアリン酸を炭素源として使用するクロストリディオイデス・ディフィシルなどの病原性細菌の増殖が可能になります。 [33]同様に、B. テタイオタオミクロンは、大腸菌などの病原菌の栄養素の利用可能性を高める能力があるため、病原性大腸菌感染を悪化させることが示されています。[34] B. テタイオタオミクロンの酵素特性により、ヒトの腸内の競争的な環境でさらに繁栄することができます。
研究
複雑な多糖類、特に人間が適切に消化できない食物繊維に含まれる多糖類を分解する能力があるため、B. テタイオタオミクロンは人間の腸内細菌叢を理解するためのモデル微生物となっています。[35] B. テタイオタオミクロンは、炎症性腸疾患(IBD) やクローン病などの症状で重要な抗炎症作用に関して、特に腸の健康に重要な役割を果たしています。[36] IBD の一種である大腸炎に関する研究では、 B. テタイオタオミクロンが粘膜バリアを強化し、腸内細菌叢の免疫反応を調節し、 IBD 患者に典型的に見られる腸内細菌叢の異常に対抗することが示されており、慢性炎症の予防におけるB. テタイオタオミクロンの役割が強調されています。[34]マウスの炎症性腸疾患（IBD）の研究では、B. thetaiotaomicronをFaecalibacterium prausnitziiと組み合わせると大腸炎を緩和することがわかりました。Faecalibacterium prausnitziiと組み合わせると、B. thetaiotaomicronは糞便微生物叢移植に使用できる適格な細菌であることが証明され、将来の治療報告全体にわたって有効であることが証明されました。 [37]
ゲノムが完全に配列されているため、B. thetaiotaomicronは遺伝子操作を受けることができます。ゲノムは、宿主と細菌の相互作用、および他の微生物との相互作用を理解するために変更されています。[38] B. thetaiotaomicron は、環境条件に対する反応を長期保存するように操作できることがわかっています。これにより、表面多糖類、コロニー形成、および宿主の全体的な腸の健康の影響を監視できるようになります。 [39]研究では、胆汁にさらされると、B. thetaiotaomicron は生理学的適応を発達させ、コロニー形成能力を高めることができることも示されています。これらの胆汁誘発性適応には、ストレス耐性メカニズムの強化と、最終的には抗生物質などの有害物質に対する交差防御を提供する排出ポンプの生産の増加が含まれます。ただし、これらの適応を可能にするために必要な胆汁濃度は、腸の特定の部分でのみアクセスできます。[40]
バクテロイデス・テタイオタオミクロンは、糞便汚染の指標として評価されている。[41]異なる宿主種の糞便は、さまざまな健康リスクをもたらす。[42]例えば、ヒト由来の腸管ウイルスはほとんどの胃腸疾患の原因であるが、感染性寄生虫は家畜から感染する傾向がある。[43]糞便の起源を特定することは、接触のリスクと汚染の脅威を排除する方法を理解するための第一歩である。特定のB. テタイオタオミクロンマーカー、特にヒト関連のバクテロイデス・テタイオタオミクロン株 GA17 [15]は、糞便汚染の正確な指標であることが判明した。[44] B. テタイオタオミクロンの存在はヒト以外よりもヒトで多く、これはヒトの糞便の存在の良い指標となっている。[45]この検査の精度とサンプル中のB.テタイオタオミクロンの同定にかかる分析時間の短縮により、これらの細菌、あるいはそれらに感染するバクテリオファージ[46]は、将来の糞便汚染の特定における有力候補となる。[44]
参考文献
- ^ ab Comstock LE 、Coyne MJ (2003年10月)。「Bacteroides thetaiotaomicron : 動的でニッチに適応したヒト共生菌」。BioEssays。25 ( 10 ): 926–9。doi :10.1002/bies.10350。PMID 14505359 。
- ^ ab Lovegrove A, Edwards CH, De Noni I, Patel H, El SN, Grassby T, et al. (2017年1月). 「食品、消化、健康における多糖類の役割」.食品科学と栄養学の批評的レビュー. 57 (2). 国立医学図書館: 237–253. doi :10.1080/10408398.2014.939263. PMC 5152545. PMID 25921546 .
- ^ ab Wegorzewska MM、Glowacki RW、Hsieh SA、Donermeyer DL、Hickey CA、Horvath SC、et al. (2019年2月)。「食事はバクテロイデス・テタイオタオミクロン抗原の発現を制御することで結腸T細胞反応を調節する」。Science Immunology。4 ( 32 ) 。doi : 10.1126 /sciimmunol.aau9079。PMC 6550999。PMID 30737355。
- ^ ab "Bacteroides".命名法で定められた原核生物名の一覧。 2018年5月20日閲覧。
- ^ Oren A、Vandamme P、 Schink B（2016年6月）。「原核生物の属名と種名におけるギリシャ語の語源の使用に関する注記」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology。66（6）：2129–40。doi ：10.1099/ ijsem.0.001063。PMID 27055242 。
- ^ Trüper HG (1999年4月). 「原核生物に名前を付けるには？：原核生物の命名法に関する語源的考察、提案、実践的アドバイス」FEMS微生物学レビュー. 23 (2): 231–249. doi : 10.1111/j.1574-6976.1999.tb00397.x .
- ^ Hahnke RL, Meier-Kolthoff JP, García-López M, Mukherjee S, Huntemann M, Ivanova NN, et al. (2016-12-20). 「バクテロイデス属のゲノムに基づく分類」. Frontiers in Microbiology . 7 : 2003. doi : 10.3389/fmicb.2016.02003 . PMC 5167729. PMID 28066339 .
- ^ ab Jacobson AN、Choudhury BP、 Fischbach MA（2018年3月）。Relman DA（編）。「Bacteroides thetaiotaomicronからのリポオリゴ糖の生合成」。mBio。9 （ 2）。doi ： 10.1128 / mBio.02289-17。PMC 5850320。PMID 29535205。
- ^ Bjursell MK、Martens EC、Gordon JI (2006 年 11 月)。「成人の腸内共生菌 Bacteroides thetaiotaomicronの授乳期への適応に関する機能ゲノムおよび代謝研究」。The Journal of Biological Chemistry。281 ( 47): 36269–79。doi : 10.1074/ jbc.M606509200。PMID 16968696 。
- ^ Hooper LV、Wong MH、Thelin A、Hansson L、Falk PG、Gordon JI (2001 年 2 月)。「腸管における共生宿主-微生物関係の分子解析」。Science 291 ( 5505 ) : 881–4。Bibcode : 2001Sci ...291..881H。doi :10.1126/science.291.5505.881。PMID 11157169 。
- ^ Xu J, Bjursell MK, Himrod J, Deng S, Carmichael LK, Chiang HC, et al. (2003年3月). 「ヒトとバクテロイデス・テタイオタオミクロンの共生に関するゲノム的考察」. Science . 299 (5615). ニューヨーク、NY: 2074–6. Bibcode :2003Sci...299.2074X. doi :10.1126/science.1080029. PMID 12663928.
- ^ Rakoff-Nahoum S 、Foster KR、 Comstock LE (2016年5月) 。「腸内微生物叢内の協力の進化」。Nature . 533 ( 7602 ): 255–9。Bibcode :2016Natur.533..255R。doi :10.1038/nature17626。PMC 4978124。PMID 27111508。
- ^ Porter NT、Luis AS、 Martens EC（2018年11月）。「Bacteroides thetaiotaomicron」。Trends in Microbiology。26（11）：966–7。doi ：10.1016/j.tim.2018.08.005。PMID 30193959 。
- ^ Li H, Wang XK, Tang M, Lei L, Li JR, Sun H, et al. (2024). 「Bacteroides thetaiotaomicron は、腸内微生物組成、腸内肝臓葉酸、不飽和脂肪酸代謝の調節を通じてマウスの脂肪肝を改善する」。Gut Microbes . 16 (1): 2304159. doi :10.1080/19490976.2024.2304159. PMC 10824146. PMID 38277137 .
- ^ ab Ballesté E、Blanch AR、Mendez J、Sala-Comorera L、Maunula L、Monteiro S、他。 （2021年）。 「バクテリオファージは、水中に存在するヒトウイルスを正確に推定することができます。」微生物学のフロンティア。12 : 619495.doi : 10.3389 /fmicb.2021.619495。PMC 8128106。PMID 34012424。
- ^ abcdefghijkl Xu J、Bjursell MK、Himrod J、Deng S、Carmichael LK、Chiang HC、他。 (2003 年 3 月)。 「ヒトとバクテロイデス・シータイオタオーミクロンの共生のゲノム的見解」。科学。299 (5615): 2074–6。Bibcode :2003Sci...299.2074X。土井：10.1126/science.1080029。PMID 12663928。S2CID 34071235 。
- ^ abcd Wexler HM (2007 年 10 月). 「バクテロイデス: 良い点、悪い点、そして本質」.臨床微生物学レビュー. 20 (4): 593–621. doi :10.1128/CMR.00008-07. PMC 2176045. PMID 17934076 .
- ^ Ye M、Yu J、Shi X、Zhu J、Gao X、Liu W (2021)。「ヒト腸内細菌バクテロイデス・テタイオタオミクロンによる多糖類の分解：進歩と展望」。食品科学と栄養学の批評的レビュー。61 (21): 3569–88。doi :10.1080/10408398.2020.1803198。PMID 32779480 。
- ^ abcdef Comstock LE 、 Coyne MJ (2003年10月)。「Bacteroides thetaiotaomicron: 動的でニッチに適応したヒト共生菌」。BioEssays 25 ( 10): 926–9. doi :10.1002/bies.10350. PMID 14505359。
- ^ abc Xu J、Chiang HC、Bjursell MK 、 Gordon JI (2004 年 1 月)。「ヒト腸内共生菌からのメッセージ: 感受性は共有の前提条件」。Trends in Microbiology。12 (1): 21–28。doi : 10.1016 /j.tim.2003.11.007。PMID 14700548 。
- ^ Flint HJ、Bayer EA、Rincon MT、Lamed R、White BA（2008年2月）。「腸内細菌による多糖類の利用：ゲノム解析から得られる新たな知見の可能性」。Nature Reviews 。微生物学。6（2）：121–131。doi ：10.1038/nrmicro1817。PMID 18180751。S2CID 10400358 。
- ^ Ryan D、Jenniches L、 Reichardt S、Barquist L、Westermann AJ (2020年7月)。「高解像度のトランスクリプトームマップが腸内微生物Bacteroides thetaiotaomicronの代謝の小さなRNA調節を識別」。Nature Communications。11 ( 1 ) : 3557。Bibcode :2020NatCo..11.3557R。doi : 10.1038 / s41467-020-17348-5。PMC 7366714。PMID 32678091。
- ^ Sonnenburg JL、Xu J、Leip DD、Chen CH、Westover BP 、Weatherford J、他 (2005 年 3 月)。「腸管適応細菌共生菌による生体内グリカン採集」。Science。307 ( 5717 ) : 1955–9。Bibcode : 2005Sci ...307.1955S。doi :10.1126/science.1109051。PMID 15790854。S2CID 13588903 。
- ^ Oliphant K、Allen - Vercoe E（2019年6月）。「ヒト腸内微生物叢による主要栄養素代謝：主要な発酵副産物と宿主の健康への影響」。マイクロバイオーム 。7 （ 1 ）：91。doi ：10.1186 /s40168-019-0704-8。PMC 6567490。PMID 31196177。
- ^ ab トロヴァン F、コヘイア VG、ロレンソ FM、リベイロ DO、カルヴァーリョ AL、パルマ AS、他。 (2023-01-02)。 「バクテロイデス シータイオタオーミクロンの炭水化物結合モジュールの構造は、ヒトのマイクロバイオームによる複雑なペクチン多糖の認識についての新たな洞察を提供します。」構造生物学ジャーナル。7 : 100084.土井: 10.1016/j.yjsbx.2022.100084。PMC 9843283。PMID 36660365。
- ^ abcd Mishra S, Imlay JA (2013年12月). 「嫌気性細菌、Bacteroides thetaiotaomicronは酵素群を利用して過酸化水素を除去する」.分子微生物学. 90 (6): 1356–71. doi :10.1111/mmi.12438. PMC 3882148. PMID 24164536 .
- ^ abcd Wrzosek L、Miquel S、Noordine ML、Bouet S、Joncquel Chevalier-Curt M、Robert V、他 (2013 年 5 月)。「Bacteroides thetaiotaomicron と Faecalibacterium prausnitzii は、ノトバイオートモデルげっ歯類の結腸上皮における粘液グリカンの生成と杯細胞の発生に影響を与える 」。BMC Biology。11 : 61。doi : 10.1186 / 1741-7007-11-61。PMC 3673873。PMID 23692866。
- ^ Xu J, Gordon JI (2003年9月). 「汝の共生者を敬え」.米国科学アカデミー紀要. 100 (18): 10452–9. doi : 10.1073/pnas.1734063100 . PMC 193582. PMID 12923294 .
- ^ Vancamelbeke M、Vermeire S（2017年9月）。「腸管バリア：健康と疾患における基本的な役割」消化器病学と肝臓病学の専門家レビュー。11 （9）：821–834。doi ： 10.1080 / 17474124.2017.1343143。PMC 6104804。PMID 28650209。
- ^ フォンセカ S、カルヴァーリョ AL、ミケル＝クロペス A、ジョーンズ EJ、ジュオデイキス R、ステンツ R、他。 (2022-11-10)。 「ヒトの腸内共生細菌バクテロイデス・シータイオタオーミクロンによって産生される細胞外小胞は、自然免疫細胞からの抗炎症反応を誘発します。」微生物学のフロンティア。13 : 1050271.doi : 10.3389 / fmicb.2022.1050271。PMC 9684339。PMID 36439842。
- ^ Wu HJ、 Wu E (2012年1月)。「免疫恒常性と自己免疫における腸内細菌叢の役割」。Gut Microbes。3 ( 1):4–14。doi : 10.4161 / gmic.19320。PMC 3337124。PMID 22356853。
- ^ Durant L, Stentz R, Noble A, Brooks J, Gicheva N, Reddi D, et al. (2020年6月). 「バクテロイデス・テタイオタオミクロン由来の外膜小胞は、健康な場合には制御性樹状細胞反応を促進するが、炎症性腸疾患の場合は促進しない」。Microbiome . 8 ( 1): 88. doi : 10.1186/s40168-020-00868-z . PMC 7282036. PMID 32513301 .
- ^ Bäumler AJ 、Sperandio V（2016年7月）。 「腸内微生物叢と病原細菌の相互作用」。Nature . 535（7610）：85–93。Bibcode ：2016Natur.535...85B。doi ：10.1038/nature18849。PMC 5114849。PMID 27383983。
- ^ ab Curtis MM、Hu Z、Klimko C、Narayanan S、Deberardinis R、Sperandio V (2014 年 12 月)。「腸内常在菌 Bacteroides thetaiotaomicron は代謝ランドスケープの変化により腸管感染を悪化させる」。Cell Host & Microbe。16 ( 6 ): 759–769。doi :10.1016/j.chom.2014.11.005。PMC 4269104。PMID 25498343。
- ^ Ravcheev DA、Godzik A、Osterman AL 、 Rodionov DA (2013 年 12 月)。「ヒト腸内細菌 Bacteroides thetaiotaomicron における多糖類の利用: 代謝および調節ネットワークの比較ゲノミクス再構築」。BMC Genomics。14 : 873。doi : 10.1186 / 1471-2164-14-873。PMC 3878776。PMID 24330590。
- ^ Delday M、Mulder I、Logan ET 、 Grant G（2019年1月）。「Bacteroides thetaiotaomicronはクローン病の前臨床モデルにおける結腸の炎症を軽減する」。 炎症性腸疾患。25 （1）：85–96。doi ： 10.1093/ibd/ izy281。PMC 6290787。PMID 30215718。
- ^ Xu B, Fu Y, Yin N, Qin W, Huang Z, Xiao W, et al. (2024年5月). 「Bacteroides thetaiotaomicronとFaecalibacterium prausnitziiは、大腸炎を緩和するための糞便微生物叢移植の主要成分として機能した」Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol . 326 (5): G607–G621. doi :10.1152/ajpgi.00303.2023. PMC 11376976 . PMID 38502145.
- ^ Lai Y、Hayashi N、Lu TK (2022 年 10 月). 「ヒトの腸内共生バクテロイデス・シータイオタオミクロンを合成生物学で操作する」。ケミカルバイオロジーにおける現在の見解。70 : 102178.土井:10.1016/j.cbpa.2022.102178. PMID 35759819。
- ^ Mimee M、Tucker AC、Voigt CA、Lu TK (2015 年 7 月)。 「ヒト常在細菌 Bacteroides thetaiotaomicron をプログラミングして、マウスの腸内細菌叢における刺激を感知し、それに反応させる」。Cell Systems。1 ( 1 ) : 62–71。doi :10.1016/ j.cels.2015.06.001。PMC 4762051。PMID 26918244。
- ^ Béchon N, Mihajlovic J, Lopes AA, Vendrell-Fernández S, Deschamps J, Briandet R, et al. (2022年2月). 「Bacteroides thetaiotaomicronは広範囲に分布する細胞外DNaseを利用して胆汁依存性バイオフィルム形成を促進する」。米国科学アカデミー紀要。119 (7). Bibcode :2022PNAS..11911228B. doi : 10.1073/pnas.2111228119 . PMC 8851478 . PMID 35145026.
- ^ Aslan A 、Rose JB (2013 年 1 月)。「下水マーカーとしての Bacteroides thetaiotaomicron alpha-1-6 マンナナーゼ遺伝子の宿主特異性の評価」。応用微生物学論文集。56 ( 1 ) : 51–56。doi :10.1111/lam.12013。PMID 23078617 。
- ^ Santiago-Rodriguez TM、 Hollister EB（2023年1月）。「糞便汚染源を追跡するためのツールとしてのウイルスメタゲノミクス：ワンヘルスアプローチ」。 ウイルス。15 （1）：236。doi ： 10.3390 / v15010236。PMC 9863393。PMID 36680277。
- ^ Holcomb DA 、Stewart JR (2020-09-01)。「糞便汚染の微生物指標：水質評価における最近の進歩と課題」。Current Environmental Health Reports。7 ( 3): 311–324。Bibcode :2020CEHR .... 7..311H。doi : 10.1007 / s40572-020-00278-1。ISSN 2196-5412。PMC 7458903。PMID 32542574。
- ^ ab Zlender T、Rupnik M (2023)。「ヒト以外の糞便汚染源 を特定するための分子マーカーの概要」。Frontiers in Microbiology。14 : 1256174。doi : 10.3389 / fmicb.2023.1256174。PMC 10701406。PMID 38075863。
- ^ Carson CA、Christiansen JM、Yampara-Iquise H、Benson VW、Baffaut C、Davis JV、他 (2005 年 8 月)。「ヒト糞便に対する Bacteroides thetaiotaomicron マーカーの特異性」。応用環境微生物学。71 (8): 4945–9。Bibcode : 2005ApEnM..71.4945C。doi : 10.1128 /AEM.71.8.4945-4949.2005。PMC 1183297。PMID 16085903。
- ^ Méndez J, García-Aljaro C, Muniesa M, Pascual-Benito M, Ballesté E, López P, et al. (2022年1月). 「Bacteroides thetaiotaomicron 株 GA17 に感染する体細胞性大腸菌ファージとバクテリオファージを使用した水域の人為汚染のモデリング」. Journal of Environmental Management . 301 : 113802. Bibcode :2022JEnvM.30113802M. doi :10.1016/j.jenvman.2021.113802. hdl : 2445/194493 . PMID 34638039.