形態学 ストレプトマイセス 属には、好気性 、グラム陽性 、多細胞性、糸状細菌が含まれており、枝分かれした発達した栄養菌糸( 直径0.5~2.0μm)を形成します。基質から有機化合物を回収するのに役立つ複雑な基質菌糸体を形成します。 [ 16 ] 菌糸体とそこから生じる気生菌糸は 運動性はありませんが、胞子の散布によって移動します。[ 16 ] 胞子の表面は、毛状、しわ状、滑らか、棘状、またはいぼ状である場合があります。[ 17 ] 一部の種では、気生菌糸は長くまっすぐな糸状体で構成され、50個以上の胞子がほぼ規則的な間隔で渦巻き状(輪状)に配置されています。輪生菌糸の各枝の先端には散形花序が形成され、その中には球形から楕円形で表面が滑らかまたはしわのある胞子が2~数列連なっている。[ 16 ] 一部の菌株は基質菌糸上に短い胞子の列を形成する。菌核、分生子殻、胞子嚢、およびシンネマ様の構造は一部の菌株によって形成される。
ゲノミクス 「 S. coelicolor 株 A3(2)」の完全なゲノムは 2002 年に公開されました。 [ 18 ] 当時、「S. coelicolor 」のゲノムは、どの 細菌 よりも多くの遺伝子を 含んでいると考えられていました。[ 18 ] 染色体は 8,667,507 bp の 長さで、GC 含量は 72.1% であり、7,825 個のタンパク質コード遺伝子を含むと予測されています。[ 18 ] 分類学的には、「S. coelicolor A3(2)」は S. violaceoruber 種に属し、有効に記載された別の種ではありません。「S. coelicolor A3(2)」は、便宜上S. coelicolor と呼ばれることが多いものの、実際のS. coelicolor (Müller)と混同してはいけません。 [ 19 ] 株A3(2)のトランスクリプトームおよびトランスラトーム解析は2016年に発表された。[ 20 ]
S. avermitilis の最初の完全なゲノム配列は2003 年に完成しました。[ 21 ] これらのゲノムはそれぞれ、ほとんどの細菌ゲノムが環状染色体の形で存在するのとは異なり、線状構造の染色体を形成します。 [ 22 ] ジャガイモそうか病を引き起こす能力を持つ属のメンバーであるS. scabiei のゲノム配列は、ウェルカム トラスト サンガー研究所 で決定されました。10.1 Mbp の長さで 9,107 個の暫定遺伝子をコードしており、おそらく大きな病原性アイランド のために、配列決定された 既知のStreptomyces ゲノムの中で最大です。[ 22 ] [ 23 ]
様々なストレプトマイセス 属のゲノムは、古代の単一遺伝子重複、ブロック重複(主に染色体腕)、および水平遺伝子伝達によって顕著な可塑性を示します。[ 5 ] [ 24 ] 染色体のサイズは5.7~12.1Mbps (平均:8.5Mbps)で、染色体コードタンパク質の数は4983~10,112(平均:7130)で、GC含量は68.8~74.7%(平均:71.7%)と高いです。[ 5 ] この属の95%ソフトコアプロテオームは約2000~2400個のタンパク質で構成されています。[ 5 ] パンゲノムは オープンです。[ 25 ] [ 26 ] さらに、同じ種の株間でもゲノムの可塑性が大きく、補助タンパク質の数(種レベル)は250から3000以上に及ぶことが観察されている。[ 5 ] 興味深いことに、ストレプトマイセス属では、炭水化物活性酵素の数と、細菌間の競争に関連する二次代謝 産物生合成遺伝子クラスター(シデロフォア 、ε-ポリリジン、タイプIIIランティペプチド )の数との間に相関関係が観察されている。[ 5 ] ストレプトマイセス属は、主に炭水化物活性酵素を介して、主要なバイオマス分解者である。[ 27 ] そのため、ストレプトマイセス属は、自らが作り出す栄養豊富な環境で他の細菌との競争を抑制するために、シデロフォアや抗菌剤の武器庫を進化させる必要もある。[ 5 ] いくつかの進化解析により、進化的に安定なゲノム要素の大部分は染色体の中央領域に局在し、進化的に不安定な要素は染色体腕に局在する傾向があることが明らかになった。[ 5 ] [ 28 ] [ 29 ] [ 30 ] [ 31 ] したがって、染色体腕は、種レベルと株レベルの両方で急速な適応を主に担うゲノムの部分として現れる。[ 5 ]
バイオテクノロジー バイオテクノロジー 研究者は、タンパク質の異種発現 にストレプトマイセス 属菌を使用してきました。従来、真核生物 遺伝子の発現には、よく理解されていて扱いやすい大腸菌 が好まれていました。 [ 32 ] [ 33 ] 大腸菌での真 核 生物タンパク質の発現は問題となる場合があります。タンパク質が適切に折り畳まれない場合があり、その結果、不溶性、封入体 への沈着、および製品の生物活性の喪失につながる可能性があります。[ 34 ] 大腸菌 株 は分泌機構を持っていますが、その効率は低く、ペリプラズム空間への分泌をもたらしますが、 ストレプトマイ セス属菌などのグラム陽性細菌による分泌は、細胞 外培地への直接分泌をもたらします。さらに、ストレプトマイセス属菌は、 大腸菌 よりも効率的な分泌機構を持っています。分泌系の特性は、異種発現タンパク質の工業生産において有利であり、その後の精製ステップを簡素化し、収量を増加させる可能性がある。これらの特性などにより、Streptomyces spp.は、 E. coli やBacillus subtilis などの他の細菌に代わる魅力的な選択肢となっている。[ 34 ] さらに、本質的に高いゲノム不安定性は、様々な Streptomycetes ゲノムが、工業用途向けの合成最小ゲノムの構築のために、大規模なゲノム縮小に適している可能性を示唆している。[ 5 ]
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