エンシファー・メリロティ

エンシファー・メリロティ
寒天培地上のSinorhizobium meliloti株Rm1021 。
科学的分類
ドメイン：	細菌
門:	シュードモナドタ
クラス：	アルファプロテオバクテリア
注文：	ヒポミクロバイオレ
家族：	根粒菌科
属:	エンシファー
種：	E. メリロティ
二名法名
エンシファー・メリロティ （ダンジャード、1926年）ヤング、2003年
タイプ株
ATCC9930 CCUG 27879 CFBP 5561 CIP 107332 DSM 30135 HAMBI 2148 IAM 12611 ICMP 12623 IFO 14782 JCM 20682 LMG 6133 NBRC 14782 NCAIM B.01520 NCIMB 12075 NRRL L-45 NZP 4027 OUT 30010 USDA 1002
バイオバー
S. m. bv.アカシア[1] S. m. bv.シセリ[2] [3] S. m. bv.ランスロットンセ[4] S. m. bv.メディカギニス[5] S. m. bv.メディテラネンセ[6] S. m. bv.メリロティ S. m. bv.リジデュロイデス[7] S. m.生態型NRR [8]
同義語[9]
リゾビウム・メリロティ・ ダンジャード、1926 Sinorhizobium meliloti (Dangeard、1926) De Lajudie et al.、1994

Ensifer meliloti（旧称Rhizobium melilotiおよびSinorhizobium meliloti） ^[10]は、好気性、グラム陰性、および窒素固定性の細菌種である。S . meliloti は運動性 があり、周毛鞭毛のクラスターを有する。 ^[11] S. meliloti は、アルファルファなどのマメ科植物の宿主のために大気中の窒素をアンモニアに固定する。S . meliloti は、モデルマメ科植物Medicago truncatulaを含む、 Medicago属、 Melilotus 属、 Trigonella 属のマメ科植物と共生関係を形成する。この共生は、根粒と呼ばれる植物器官の発達を促進する。土壌には植物が利用できる窒素の量が限られていることが多いため、 S. melilotiとマメ科植物の宿主との共生関係は農業に応用されている。 ^{[12]これらの技術により無機}窒素肥料の必要性が減ります。 ^[13]

S. melilotiとそのマメ科植物との共生は、植物が根圏に一連のベタインやフラボノイドを分泌することで始まります：4,4′-ジヒドロキシ-2′-メトキシカルコン^[14]、クリソエリオール^[15]、シナロシド^[15]、4′,7-ジヒドロキシフラボン^[14]、6′-O-マロニルオノニン^[16]、リキリチゲニン^[14]、ルテオリン[ ^17]、3′,5-ジメトキシルテオリン^[15] 、 5-メトキシルテオリン [15] 、メディカルピン^{[16] 、スタキドリン [18] 、}およびトリゴネリン^[ 18 ] ^。これらの化合物はS. meliloti を植物の根毛の表面に引き寄せ、そこで細菌がノッド因子を分泌し始めます。これにより、根毛のカールが始まります。その後、根粒菌は根毛に侵入して増殖し、感染糸を形成します。感染糸を通って、細菌は主根に向かって移動します。細菌は新しく形成された根粒内でバクテロイドに成長し、植物の窒素固定を行います。S . meliloti細菌は、共生バクテロイドに分化するまで窒素固定を行いません。バクテロイドは生存のために植物に依存しています。^[19]

S. melilotiの定着後にマメ科植物によって生成されるレグヘモグロビンは、根粒菌が存在する根粒中の遊離酸素と相互作用する。根粒菌はマメ科植物の根粒中の共生体に含まれる。レグヘモグロビンは存在する遊離酸素の量を減らす。酸素は窒素固定を担う根粒菌の窒素固定酵素の機能を阻害する。 ^[20]

S. meliloti ゲノムには、フラジェリンをコードする 4 つの遺伝子が含まれています。これらにはfliC1C2 ～ fliC3C4が含まれます。^[11]ゲノムには 3 つのレプリコンが含まれています。染色体(約 3.7 メガベース)、クロミド(pSymB; 約 1.7 メガベース)、およびプラスミド(pSymA; 約 1.4 メガベース) です。個々の株は追加のアクセサリプラスミドを持っている場合があります。これまでに5 つのS. melilotiゲノムが配列決定されています。Rm1021、 ^[21] AK83、^[22] BL225C、^[22] Rm41、^[23]および SM11 ^{[24]で、1021 は}野生型であると考えられています。S . melilotiによる不定根粒共生は、 pSymA に存在する遺伝子によってもたらされます。^[25]

E. melilotiの遺伝子uvrA、uvrB、uvrCによってコードされるタンパク質は、ヌクレオチド除去修復プロセスによるDNA損傷の修復に利用される。E . melilotiは乾燥耐性細菌である。しかし、uvrA、uvrB、uvrCのいずれかの遺伝子に欠陥があるE. meliloti変異体は、乾燥だけでなく紫外線にも敏感である。^[26] この発見は、野生型E. melilotiの乾燥耐性は、乾燥によって引き起こされるDNA損傷の修復に依存していることを示しています。

シノリゾビウム・メリロティに感染するバクテリオファージはいくつか報告されている：^[27] Φ1、^[28] Φ1A、^{[29 ]} Φ2A 、[29] Φ3A、^[30] Φ4 (=ΦNM8)、^[31] Φ5 ^t (=ΦNM3)、^[31] Φ6 (=ΦNM4)、 [ ^31] Φ7 (=ΦNM9) 、[ ^31] Φ7a、^[28] Φ9 (=ΦCM2)、^{[ 31]} Φ11 (=ΦCM9)、 [31] Φ12 (=ΦCM6)、^[31] Φ13、^[32] Φ16、^[32] Φ16-3、 [ ^33] Φ16a、^[32] Φ16B、^[30] Φ27、^[28] Φ32、^[33] Φ36、^【33】 Φ38、^【33】 Φ43、^【28】 Φ70、^【28】 Φ72、^【33】 Φ111 、 ^【33】 Φ143、^【33】 Φ145、^【33】 Φ147、^【33】 Φ151、^【33】 Φ152、^【33】 Φ160、^【33】 Φ161、^［33］ Φ166、^［33］ Φ2011、^［34］ ΦA3、^［28］ ΦA8、^［28］ ΦA161、^［34］ ΦAL1、^［35］ ΦCM1、^［34］ ΦCM3、^［34］ ΦCM4、^［34］ ΦCM5、^［34］ ΦCM7、^［34］ ΦCM8、^［34］ ΦCM20、^[34] ΦCM21、^【34】 ΦDF2、^【35】 Φf2D、^【35】 ΦF4、^【36】 ΦFAR、^【35】 ΦFM1、^【34】 ΦK1、^【37】 ΦL1、^【32】 ΦL3、^【32】 ΦL5 、^【32】 ΦL7、^【32】 ΦL10、^【32】 ΦL20、^【32】 ΦL21、^【32】 ΦL29、【^32】ΦL31、^{【32】ΦL32、【32】} ΦL53 、^【32】 ΦL54、^【32】 ΦL55、^【32】 ΦL56、^【32】 ΦL57、^【32】 ΦL60、^【32】 ΦL61、^【32】 ΦL62、^[32] ΦLO0、^[35] ΦLS5B、^[34] ΦM1、^{[27] [38]} ΦM1、^{[27] [39]} ΦM1-5、^[34] ΦM2、^[40]ΦM3、^[28] ΦM4、^[28] ΦM5、^{[27] [ 28] [41]} ΦM5（=ΦF20）、^{[27] [38]} ΦM5N1、^[34] ΦM6、^[38] ΦM7、^[38] ΦM8、^[40] ΦM9、^[38] ΦM10、^[38] ΦM11、^[38] ΦM11S、^[34] ΦM12、^{[38] [42]} ΦM14、^[38] ΦM14S、^[34] ΦM19、^[43] ΦM20S、^{[34] [44]} ΦM23S、^[34] ΦM26S、^[34] ΦM27S、^[34] ΦMl、^[45] ΦMM1C、^[34] ΦMM1H、^[34] ΦMP1、^{[46] ΦMP2}、[ 46] ΦMP3、 ^[46] ΦMP4、^[46] ΦN2、^[28] ΦN3、^[28] ΦN4、^[28] ΦN9、^[28] ΦNM1、^{[34] [44]} ΦNM2、^{[34] [44]} ΦNM6、^{[34] [44]} ΦNM7、^{[34] [44]} ΦP6、^[36] ΦP10、^[36] ΦP33、^[36] ΦP45、^[36] ΦPBC5、^[47] ΦRm108、^[48] ΦRmp26、^[49] ΦRmp36、^[49] ΦRmp38、^[49] ΦRmp46、^[49] ΦRmp50、^[49] ΦRmp52、^{[49] ΦRmp61、[49} ] ΦRmp64 、^[49] ΦRmp67、^[49] ΦRmp79、^[49] ΦRmp80、^[49] ΦRmp85、^[49] ΦRmp86、^[49] ΦRmp88、^[49] ΦRmp90、^[49] ΦRmp145、^[49] ΦSP、^[28] ΦSSSS304、^[50] ΦSSSS305、^[50] ΦSSSS307、^[50] ΦSSSS308、^[50]および ΦT1。^[28]これらのうち、ΦM5、^[41] ΦM12、^[42] Φ16-3 ^[51]およびΦPBC5 ^[47]が配列決定されている。

2020 年 3 月現在、国際ウイルス分類委員会(ICTV) は、マスター種リスト 2019.v1 (#35) に以下の種を承認しています。

• 界:デュプロドナウイルス科、界:フンゴンウイルス科、門:ウロウイルス亜科

• 目:カウドウイルス目、科:ミオウイルス科、属:エムドデカウイルス属(旧称M12 ウイルス)

• 種：シノリゾビウムウイルスM7（別名ΦM7）^[38]
• 種：シノリゾビウムウイルスM12（別名DNAファージΦM12、基準種）^[38]
• 種：シノリゾビウムウイルスN3（別名ΦN3）^[28]

• シノリゾビウム・メリロティゲノムプロジェクト
• シノリゾビウム メリロティ 1021 ゲノム ページ