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国際原核生物命名規約（ICNP）または原核生物規約（旧称：国際細菌命名規約（ICNB）または細菌学規約（BC））は、細菌と古細菌の学名を規定している。[1] [2]これは、細菌の分類群をその相対的な順位に従って命名するための規則を示している。そのため、生物学の命名規約の1つである。
もともと国際植物命名規約は細菌を扱っており、1975 年の国際植物会議で削除されるまで細菌への言及が残されていました。細菌の命名に関する初期の規約は 1947 年の第 4 回国際微生物学会議で承認されましたが、後に廃止されました。
書籍として印刷される最新版は1990年改訂版であるが[3] 、この本は現在の規則を反映しているわけではない。2008年改訂版と2022年改訂版は、International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSEM)に掲載されている。[2]規則は、国際原核生物分類学委員会(ICSP、旧国際細菌分類学委員会、ICSB) によって管理されている。
細菌名の基準は1980年を起点とした承認リスト[4]です。新しい細菌名はICSPによって命名規則に準拠しているかどうか審査され、 IJSEMに掲載されます。
シアノバクテリア
1975年以降、ほとんどの細菌は細菌学コードの対象となっていた。しかし、シアノバクテリアは依然として植物学コードの対象となっていた。1999年以降、シアノバクテリアは植物学コードと細菌学コードの両方の対象となった。この状況により、シアノバクテリアの命名上の問題が発生している。[5] [6] 2020年までに、この状況を解決するための3つの提案があった。
- 細菌学コードからシアノバクテリアを除外する。[7]
- 細菌学のコードをすべてのシアノバクテリアに適用する。[8]
- 植物学コードに基づく有効な出版物は、細菌学コードに基づく有効な出版物として扱う。[9]
2021年にICSPは3つの提案について正式な投票を行い、3番目の選択肢が選ばれました。[10]
タイプ株
2001 年以降、新しい細菌種または古細菌種が記載される場合、タイプ株を指定する必要があります。[11]タイプ株とは、その生物の学名が正式に付けられた生きた培養物です。新しい種名が有効に公表されるためには、タイプ株が少なくとも 2 つの異なる国の公共培養コレクションに寄託されている必要があります。 [12] 2001 年以前は、種は説明、保存された標本、またはイラストを使用して分類することもできました。[11]各原核生物種には 1 つのタイプ株がありますが、異なる培養コレクションが同じ株に固有の名前を指定する場合があります。例えば、大腸菌の基準株（元々はU5/41株）は、アメリカタイプカルチャーコレクションではATCC 11775 、ドイツ微生物・細胞培養コレクションではDSM 30083 、日本微生物コレクションではJCM 1649 、ベルギー微生物協調コレクションではLMG 2092と呼ばれています。[13] [14]原核生物種が研究室で培養できない場合（したがって培養コレクションに寄託できない場合）、暫定的な候補名が与えられることがありますが、有効に公表されたとは見なされません。[15]
バージョン
- Buchanan, RE、および Ralph St. John-Brooks。(1947 年 6 月) (編集者)。細菌命名法の提案。国際細菌命名法委員会が第 3 回国際微生物学会議で承認した提案から作成。総会で出版が承認されました。61 ページ。アイオワ州立大学出版局、アイオワ州エイムズ。USA Hathi Trust。
- Buchanan RE, St , John-Brooks R., Breed RS (1948). 「国際細菌学命名規約」. Journal of Bacteriology . 55 (3): 287–306. doi : 10.1128 /jb.55.3.287-306.1948 . PMC 518444. PMID 16561459.
{{cite journal}}: CS1 maint: 複数の名前: 著者リスト (リンク)1949年に再版、Journal of General Microbiology 3、444-462。 - 国際細菌命名委員会 (1958 年 6 月)。細菌およびウイルスの命名に関する国際規約。エイムズ、アイオワ州立大学出版局。BHL。
- Lapage, SP, Sneath, PHA, Lessel, EF, Skerman, VBD, Seeliger, HPR & Clark, WA (1975).国際細菌命名規約1975 年改訂版. アメリカ微生物学会、ワシントン DC
- Lapage, SP, Sneath, PHA, Lessel, EF, Skerman, VBD, Seeliger, HPR & Clark, WA (1992).国際細菌命名規約. 細菌学規約. 1990 年改訂版. アメリカ微生物学会、ワシントン DC リンク.
- Parker, CT, Tindall, BJ & Garrity, GM, 編 (2019). 原核生物命名法の国際規約. 原核生物規約 (2008 年改訂版).国際系統進化微生物学ジャーナル69(1A): S1–S111. doi: 10.1099/ijsem.0.000778
- Oren, Aharon; Arahal, David R.; Göker, Markus; Moore, Edward RB; Rossello-Mora, Ramon; Sutcliffe, Iain C. (2023年5月1日). 「原核生物の国際命名規約。原核生物規約（2022年改訂版）」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 73 (5a). doi : 10.1099/ijsem.0.005585 . hdl : 10261/338243 . PMID 37219928.
参照
参考文献
- ^ 「ホーム」. the-icsp.org .
- ^ ab PHA Sneath、2003。細菌学コードの短い歴史 URL 2012-05-24にWayback Machineでアーカイブ
- ^ ラパージュ、SP;スニース、PHA;レッセル、EF;スカーマン、VBD;シーリガー、HPR;ワシントン州クラーク（1992 年 3 月 5 日）。命名規則と推奨事項。 ASMプレス – ncbi.nlm.nih.gov経由。
- ^ VBD Skerman、Vicki McGowan、PHA Sneath、1989年。細菌名の承認リスト、改訂版ワシントン（DC）：ASM Press
- ^ Oren, A. (2011). 「International Bulletin of Bacteriological Nomenclature and Taxonomy / International Journal of Systematic Bacteriology / International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology に掲載されたシアノバクテリアの系統学と命名法」(PDF) . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 61 (1): 10–15. doi : 10.1099/ijs.0.018838-0 . PMID 21097637. S2CID 206169872.
- ^ Oren A 、Ventura S. (2017) 。「「原核生物」コードと「植物学」コードによるシアノバクテリア命名の現状」Antonie van Leeuwenhoek。110 ( 10): 1257–1269。doi : 10.1007 /s10482-017-0848-0。PMID 28243951。S2CID 23489558。
- ^ Oren A, Garrity GM. (2014). 「原核生物命名規約の一般的考慮事項5および原則2の変更提案」Int J Syst Evol Microbiol . 64 (1): 309–10. doi :10.1099/ijs.0.059568-0. PMID 24408952.
- ^ Pinevich AV. (2015). 「国際植物命名規約 (ICBN)/国際藻類・菌類・植物命名規約 (ICN) に基づいて有効に公表されているものも含め、酸素発生型光合成細菌 (シアノバクテリア) の名称に国際原核生物命名規約 (ICNP) を一貫して適用する提案、および ICNP の原則 2 を変更する提案」。Int J Syst Evol Microbiol . 65 (3): 1070–4. doi : 10.1099/ijs.0.000034 . PMID 25505344.
- ^ Oren A. (2020). 「原核生物命名法におけるシアノバクテリアの地位を解決するための原核生物命名法の国際規約の規則を改正する3つの代替案」Int J Syst Evol Microbiol . 70 (7): 4406–4408. doi : 10.1099/ijsem.0.004268 . PMID 32602831. S2CID 220270571.
- ^ Oren A, Arahal DR, Rosselló-Móra R, Sutcliffe IC, Moore ERB. (2021). 「原核生物命名規約の一般考慮事項5および規則18a、24a、30の改正により、原核生物命名法におけるシアノバクテリアの地位が解決される」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 71 (8): 004939. doi : 10.1099/ijsem.0.004939 . PMID 34342563. S2CID 236884663.
- ^ ab 原核生物法（2008年改訂版）、規則18a。
- ^ 原核生物法（2008年改訂）、規則30。
- ^ Euzéby JP, Parte AC. 「大腸菌」。命名法で定められた原核生物名の一覧（LPSN） 。 2022年6月21日閲覧。
- ^ Reimer LC、Sardà Carbasse J、Koblitz J、Ebeling C、Podstawka A、Overmann J. 「大腸菌 U5/41」。バックダイブ。2022 年6 月 21 日に取得。
- ^ 原核生物コード（2008年改訂版）、付録11。