ウマゴヤシ

ウマゴヤシ
保全状況
軽度懸念  （IUCN 3.1）[1]
科学的分類
王国：	植物界
クレード:	維管束植物
クレード:	被子植物
クレード:	真正双子
クレード:	ロシド
注文：	ファバレス
家族：	マメ科
亜科:	マメ科
属:	メディカゴ
種：	M. トランカトゥラ
二名法名
ウマゴヤシ ガートン。
同義語
Medicago tribuloides Desr. Medicago tribuloides var. breviaculeata Mors Medicago truncatula var. breviaculeata (モリス) アーブ。 Medicago truncatula var.ロンギアキュレア タ アーブ。 Medicago truncatula var. tribuloides (Desr.) Burnat Medicago truncatula f. tricycla Nègre Medicago truncatula var.トリシクラ (ネグル) ハイン

Medicago truncatula、バレルクローバー、 ^[2] 強棘メディック、 ^[3] バレルメディック、またはバレルメディックは、地中海地域原産の小型の一年生マメ科植物で、ゲノム研究に使用されています。背が低く、クローバーに似た植物で、高さは10～60センチメートル (3.9～23.6インチ) で、3出葉があります。各小葉は丸みを帯び、長さは1～2センチメートル (0.39～0.79インチ) で、中央に黒点があることが多いです。花は黄色で、単独で、または2～5個が集まって小さな花序に咲きます。果実は小さく、とげのある鞘です。

この種は、二倍体ゲノムが小さく、自家受粉性があり、世代時間が短く、種子生産量が多く、遺伝子組み換えが容易で、ゲノム配列が解読されているため、マメ科生物学のモデル生物として研究されている。 ^[4]

M. truncatula は、窒素固定根粒菌（Sinorhizobium melilotiおよびSinorhizobium medicae）およびRhizophagus irregressalis（以前はGlomus intraradicesとして知られていた）を含むアーバスキュラー菌根菌と共生関係を形成します。モデル植物であるArabidopsis thalianaはどちらの共生関係も形成しないため、M. truncatula はこれらのプロセスを研究するための重要なツールとなります。

オーストラリアでは重要な飼料作物種でもあります。

M. truncatula栽培品種A17のゲノムのドラフト配列は2011年にNature誌に掲載されました。^[4]

シーケンシングは、オクラホマ大学（米国）、J.クレイグ・ベンター研究所 （米国）、ジェノスコープ（フランス）、サンガーセンター（英国）の研究者を含む国際研究機関のパートナーシップによって実施されました。パートナー機関には、ミネソタ大学（米国）、カリフォルニア大学デービス校（米国）、国立ゲノム資源センター（米国）、ジョン・イネス・センター（英国）、国立農学研究所（フランス）、ミュンヘンタンパク質配列情報センター（ドイツ）、ワーゲニンゲン大学（オランダ）、ゲント大学（ベルギー）が含まれます。Medicago truncatulaシーケンシングコンソーシアムは、サミュエル・ロバーツ・ノーブル財団からのシード助成金により2001年に発足しました。2003年には、国立科学財団と欧州連合第6次フレームワークプログラムが資金の大部分を提供し始めました。2009年までに、ゲノムアセンブリの84％が完了しました。^[5]

M. truncatulaのゲノム配列のアセンブリは、細菌人工染色体（BAC）に基づいて行われた。これは、ヒト、ショウジョウバエ（Drosophila melanogaster）、モデル植物（Arabidopsis thaliana）のゲノムの配列決定に使用されたのと同じアプローチである。2013年7月、ゲノムのバージョン4.0がリリースされた。^{[6]このバージョンでは、}ショットガンシーケンスから得られた配列とBACベースの配列アセンブリが組み合わされており、以前にマッピングされた配列のギャップを埋めるのに役立っています。

国際メディカゴ遺伝子注釈グループ (IMGAG) として知られる並行グループは、ゲノム配列内の推定遺伝子配列の識別と記述を担当しています。

アムステルダム自由大学の研究者トビー・キアーズ氏とその同僚は、 M. truncatula を使って植物と菌類の共生関係を研究し、共生関係にあるパートナーが良いトレーダー/サプライヤーと悪いトレーダー/サプライヤーを区別できるかどうかを調べました。標識された炭素を使用してアーバスキュラー菌根系を流れる栄養源を追跡することで、研究者は植物がより寛大な菌類に実際に多くの炭素を与えていたことを証明しました。植物が菌類に与える炭素の量を制限することで、研究者は菌類がより寛大な植物により多くのリンを渡していることも実証しました。^[7]

質量分析によるプロテオーム研究は、Wienkoop et al 2004とLarrainzar et al 2007によって実施されている。^[8]

• ゲノミクス

Courty, Pierre Emmanuel; Smith, Penelope; Koegel , Sally; Redecker, Dirk; Wipf, Daniel (2015 年 6 月 1 日)。「有益な植物の根と微生物の相互作用における無機窒素の吸収と輸送」。植物科学の批評的レビュー。34 ( 1–3): 4–16。doi :10.1080/07352689.2014.897897。S2CID  85772198。

• Medicago truncatulaコンソーシアム
• Medicago truncatula ハップマップ プロジェクト
• TIGR のゲノムブラウザと遺伝子インデックスへのリンク
• サミュエル・ロバーツ・ノーブル財団のメディカゴ遺伝子発現アトラス
• Provart Lab の Bio-Array Resource ウェブサイトにある Medicago Gene Expression Atlas プロジェクトの遺伝子発現データ用の Medicago truncatula eFP ブラウザー ビューアー
• INRA Medicago truncatula ストックセンター – フランス
• Choi, Hong-Kyu; Mun, Jeong-Hwan; Kim, Dong-Jin; Zhu, Hongyan; Baek, Jong-Min; Mudge, Joanne; Roe, Bruce; Ellis, Noel; Doyle, Jeff; Kiss, Gyorgy B.; Young, Nevin D.; Cook, Douglas R. (2004 年 10 月 26 日)。「作物とモデルマメ科植物種間のゲノム保全の推定」。米国科学 アカデミー紀要。101 ( 43): 15289–15294。Bibcode : 2004PNAS..10115289C。doi : 10.1073/ pnas.0402251101。PMC 524433。PMID 15489274。 
• ヤング、ネビン D.キャノン、スティーブン B.佐藤秀星；キム・ドンジン；クック、ダグラス R.タウン、クリス D.ロー、ブルース A.田畑 聡 (2005 年 4 月 1 日) 「Medicago truncatula と Lotus japonicus の遺伝子空間の配列決定」。植物生理学。137 (4): 1174–1181。土井：10.1104/pp.104.057034。PMC  1088310。PMID  15824279。
• NCGR
• モデルマメ科植物Medicago truncatulaに関する欧州研究プログラム
• なぜmedicago truncatulaを配列するのですか?

Wikispeciesには、Medicago truncatulaに関する情報があります。